RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492185.5

NELFE-211, Transcript of negative elongation factor complex member E, humanhuman

TSL 2

Gene NELFE, Length 1,786 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NELFE-211ENST00000492185 NTRK3Q16288 839 aa23.36■■□□□ 1.33
NELFE-211ENST00000492185 CCDC183Q5T5S1 534 aa23.36■■□□□ 1.33
NELFE-211ENST00000492185 CRNKL1Q9BZJ0 848 aaKnown RBP23.36■■□□□ 1.33
NELFE-211ENST00000492185 ATP8A2Q9NTI2 1148 aa23.36■■□□□ 1.33
NELFE-211ENST00000492185 SYCE3A1L190 88 aa23.35■■□□□ 1.33
NELFE-211ENST00000492185 CPLX1O14810 134 aa23.35■■□□□ 1.33
NELFE-211ENST00000492185 ZBTB43O43298 467 aa23.35■■□□□ 1.33
NELFE-211ENST00000492185 CTR9Q6PD62 1173 aa23.35■■□□□ 1.33
NELFE-211ENST00000492185 CDKL5O76039 1030 aa23.35■■□□□ 1.33
NELFE-211ENST00000492185 SBK1Q52WX2 424 aa23.35■■□□□ 1.33
NELFE-211ENST00000492185 SP8Q8IXZ3 490 aa23.35■■□□□ 1.33
NELFE-211ENST00000492185 FBXO18Q8NFZ0 1043 aa23.35■■□□□ 1.33
NELFE-211ENST00000492185 CD209Q9NNX6 404 aa23.35■■□□□ 1.33
NELFE-211ENST00000492185 DCP1AQ9NPI6 582 aaPredicted RBP23.35■■□□□ 1.33
NELFE-211ENST00000492185 DDX52Q9Y2R4 599 aaKnown RBP eCLIP23.35■■□□□ 1.33
NELFE-211ENST00000492185 CDK5RAP2Q96SN8 1893 aa23.34■■□□□ 1.33
NELFE-211ENST00000492185 LDHBP07195 334 aaKnown RBP23.34■■□□□ 1.33
NELFE-211ENST00000492185 CDC27P30260 824 aa23.34■■□□□ 1.33
NELFE-211ENST00000492185 SART3Q15020 963 aaKnown RBP23.34■■□□□ 1.33
NELFE-211ENST00000492185 RAB11FIP4Q86YS3 637 aa23.34■■□□□ 1.33
NELFE-211ENST00000492185 TMTC2Q8N394 836 aa23.34■■□□□ 1.33
NELFE-211ENST00000492185 TBC1D16Q8TBP0 767 aa23.34■■□□□ 1.33
NELFE-211ENST00000492185 QSER1Q2KHR3 1735 aa23.33■■□□□ 1.33
NELFE-211ENST00000492185 MINDY4BA8MYZ0 360 aa23.33■■□□□ 1.33
NELFE-211ENST00000492185 PPP4CP60510 307 aa23.33■■□□□ 1.33
NELFE-211ENST00000492185 SEC23AQ15436 765 aa23.33■■□□□ 1.33
NELFE-211ENST00000492185 DZIP1Q86YF9 867 aaKnown RBP23.33■■□□□ 1.33
NELFE-211ENST00000492185 ESR2Q92731 530 aa23.33■■□□□ 1.33
NELFE-211ENST00000492185 SPATA32Q96LK8 384 aa23.33■■□□□ 1.33
NELFE-211ENST00000492185 GPR101Q96P66 508 aaPredicted RBP23.33■■□□□ 1.33
NELFE-211ENST00000492185 AATFQ9NY61 560 aaKnown RBP eCLIP23.33■■□□□ 1.33
NELFE-211ENST00000492185 TFIP11Q9UBB9 837 aaKnown RBP23.33■■□□□ 1.33
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NELFE-211ENST00000492185 CFAP45Q9UL16 551 aa23.33■■□□□ 1.33
NELFE-211ENST00000492185 STK36Q9NRP7 1315 aa23.33■■□□□ 1.32
NELFE-211ENST00000492185 ORC4O43929 436 aa23.32■■□□□ 1.32
NELFE-211ENST00000492185 SRGNP10124 158 aa23.32■■□□□ 1.32
NELFE-211ENST00000492185 NFXL1Q6ZNB6 911 aa23.32■■□□□ 1.32
NELFE-211ENST00000492185 C8orf76Q96K31 380 aa23.32■■□□□ 1.32
NELFE-211ENST00000492185 MKRN1Q9UHC7 482 aaKnown RBP23.32■■□□□ 1.32
NELFE-211ENST00000492185 RCOR1Q9UKL0 485 aa23.32■■□□□ 1.32
NELFE-211ENST00000492185 GOLGA8AA7E2F4 631 aa23.32■■□□□ 1.32
NELFE-211ENST00000492185 SMIM22K7EJ46 135 aa23.32■■□□□ 1.32
NELFE-211ENST00000492185 LETM1O95202 739 aaPredicted RBP23.32■■□□□ 1.32
NELFE-211ENST00000492185 GSTO1P78417 241 aa23.32■■□□□ 1.32
NELFE-211ENST00000492185 WTAPQ15007 396 aa23.32■■□□□ 1.32
NELFE-211ENST00000492185 RRP12Q5JTH9 1297 aaKnown RBP23.32■■□□□ 1.32
NELFE-211ENST00000492185 CPLX2Q6PUV4 134 aaKnown RBP23.32■■□□□ 1.32
NELFE-211ENST00000492185 RBSNQ9H1K0 784 aa23.32■■□□□ 1.32
NELFE-211ENST00000492185 ATP6V0A2Q9Y487 856 aa23.32■■□□□ 1.32
NELFE-211ENST00000492185 SLC12A7Q9Y666 1083 aa23.32■■□□□ 1.32
NELFE-211ENST00000492185 CCDC69A6NI79 296 aa23.31■■□□□ 1.32
NELFE-211ENST00000492185 USP17L12C9JPN9 530 aa23.31■■□□□ 1.32
NELFE-211ENST00000492185 USP17L21D6R901 530 aa23.31■■□□□ 1.32
NELFE-211ENST00000492185 PPEF1O14829 653 aaPredicted RBP23.31■■□□□ 1.32
NELFE-211ENST00000492185 NPR1P16066 1061 aa23.31■■□□□ 1.32
NELFE-211ENST00000492185 GRIK5Q16478 980 aa23.31■■□□□ 1.32
NELFE-211ENST00000492185 MICU3Q86XE3 530 aa23.31■■□□□ 1.32
NELFE-211ENST00000492185 JAG2Q9Y219 1238 aa23.31■■□□□ 1.32
NELFE-211ENST00000492185 NAV1Q8NEY1 1877 aa23.31■■□□□ 1.32
NELFE-211ENST00000492185 CYP2D7A0A087X1C5 515 aa23.3■■□□□ 1.32
NELFE-211ENST00000492185 PPFIA3O75145 1194 aa23.3■■□□□ 1.32
NELFE-211ENST00000492185 ARPP21Q9UBL0 812 aaPredicted RBP23.3■■□□□ 1.32
NELFE-211ENST00000492185 IFNAR1P17181 557 aa23.29■■□□□ 1.32
NELFE-211ENST00000492185 FOSBP53539 338 aa23.29■■□□□ 1.32
NELFE-211ENST00000492185 PGBD1Q96JS3 809 aa23.29■■□□□ 1.32
NELFE-211ENST00000492185 ZNF396Q96N95 335 aaPredicted RBP23.29■■□□□ 1.32
NELFE-211ENST00000492185 RGS17Q9UGC6 210 aaPredicted RBP23.29■■□□□ 1.32
NELFE-211ENST00000492185 FAM205AQ6ZU69 1335 aa23.29■■□□□ 1.32
NELFE-211ENST00000492185 DDX60LQ5H9U9 1706 aaKnown RBP23.29■■□□□ 1.32
NELFE-211ENST00000492185 RANBP6O60518 1105 aaKnown RBP23.29■■□□□ 1.32
NELFE-211ENST00000492185 RXRAP19793 462 aa23.29■■□□□ 1.32
NELFE-211ENST00000492185 NT5C2P49902 561 aa23.29■■□□□ 1.32
NELFE-211ENST00000492185 TOMM22Q9NS69 142 aa23.29■■□□□ 1.32
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NELFE-211ENST00000492185 LDHCP07864 332 aa23.28■■□□□ 1.32
NELFE-211ENST00000492185 MMP10P09238 476 aa23.28■■□□□ 1.32
NELFE-211ENST00000492185 NASPP49321 788 aaPredicted RBP23.28■■□□□ 1.32
NELFE-211ENST00000492185 GUCY1B3Q02153 619 aa23.28■■□□□ 1.32
NELFE-211ENST00000492185 SYNE3Q6ZMZ3 975 aa23.28■■□□□ 1.32
NELFE-211ENST00000492185 CERS3Q8IU89 383 aa23.28■■□□□ 1.32
NELFE-211ENST00000492185 UBAC1Q9BSL1 405 aa23.28■■□□□ 1.32
NELFE-211ENST00000492185 MYL10Q9BUA6 226 aa23.28■■□□□ 1.32
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NELFE-211ENST00000492185 ZKSCAN3Q9BRR0 538 aa23.27■■□□□ 1.32
NELFE-211ENST00000492185 TSPY26PQ9H489 355 aa23.27■■□□□ 1.32
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NELFE-211ENST00000492185 FMNL1O95466 1100 aaPredicted RBP23.27■■□□□ 1.32
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NELFE-211ENST00000492185 OTUD7BQ6GQQ9 843 aa23.27■■□□□ 1.32
NELFE-211ENST00000492185 ZNF654Q8IZM8 581 aa23.27■■□□□ 1.32
NELFE-211ENST00000492185 FAM163AQ96GL9 167 aaPredicted RBP23.27■■□□□ 1.32
NELFE-211ENST00000492185 USP28Q96RU2 1077 aa23.27■■□□□ 1.32
NELFE-211ENST00000492185 ZSCAN10Q96SZ4 725 aaPredicted RBP23.27■■□□□ 1.32
NELFE-211ENST00000492185 TNKSO95271 1327 aa23.27■■□□□ 1.32
NELFE-211ENST00000492185 MYH6P13533 1939 aa23.26■■□□□ 1.31
NELFE-211ENST00000492185 FOCADQ5VW36 1801 aa23.26■■□□□ 1.31
NELFE-211ENST00000492185 LIG1P18858 919 aa23.26■■□□□ 1.31
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