RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489783.1

SHOC2-206, Transcript of SHOC2, leucine rich repeat scaffold protein, human

TSL 2

Gene SHOC2, Length 749 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SHOC2-206	ENST00000489783	BICC1	Q9H694	974 aa	Known RBP	28.09	■■■□□ 2.09
SHOC2-206	ENST00000489783	AFG3L2	Q9Y4W6	797 aa		28.09	■■■□□ 2.09
SHOC2-206	ENST00000489783	DOCK3	Q8IZD9	2030 aa		28.09	■■■□□ 2.09
SHOC2-206	ENST00000489783	PTPRA	P18433	802 aa		28.08	■■■□□ 2.09
SHOC2-206	ENST00000489783	LRIT3	Q3SXY7	679 aa		28.08	■■■□□ 2.09
SHOC2-206	ENST00000489783	XRN2	Q9H0D6	950 aa	Known RBP eCLIP	28.08	■■■□□ 2.09
SHOC2-206	ENST00000489783	SYN1	P17600	705 aa		28.07	■■■□□ 2.08
SHOC2-206	ENST00000489783	FGFR2	P21802	821 aa		28.07	■■■□□ 2.08
SHOC2-206	ENST00000489783	RABL6	Q3YEC7	729 aa	Predicted RBP	28.07	■■■□□ 2.08
SHOC2-206	ENST00000489783	CCDC184	Q52MB2	194 aa		28.07	■■■□□ 2.08
SHOC2-206	ENST00000489783	SCYL3	Q8IZE3	742 aa		28.07	■■■□□ 2.08
SHOC2-206	ENST00000489783	ANKRD44	Q8N8A2	993 aa		28.07	■■■□□ 2.08
SHOC2-206	ENST00000489783	KLHDC4	Q8TBB5	520 aa		28.07	■■■□□ 2.08
SHOC2-206	ENST00000489783	USP40	Q9NVE5	1235 aa		28.07	■■■□□ 2.08
SHOC2-206	ENST00000489783	SLC45A1	Q9Y2W3	748 aa		28.07	■■■□□ 2.08
SHOC2-206	ENST00000489783	UNC80	Q8N2C7	3258 aa		28.06	■■■□□ 2.08
SHOC2-206	ENST00000489783	WDR66	Q8TBY9	1149 aa		28.06	■■■□□ 2.08
SHOC2-206	ENST00000489783	COL25A1	Q9BXS0	654 aa	Predicted RBP	28.06	■■■□□ 2.08
SHOC2-206	ENST00000489783	ATRNL1	Q5VV63	1379 aa		28.06	■■■□□ 2.08
SHOC2-206	ENST00000489783	SLURP2	P0DP57	97 aa		28.05	■■■□□ 2.08
SHOC2-206	ENST00000489783	MAGEA10	P43363	369 aa	Predicted RBP	28.05	■■■□□ 2.08
SHOC2-206	ENST00000489783	ANKRD13C	Q8N6S4	541 aa		28.05	■■■□□ 2.08
SHOC2-206	ENST00000489783	SMCR8	Q8TEV9	937 aa	Predicted RBP	28.05	■■■□□ 2.08
SHOC2-206	ENST00000489783	COA7	Q96BR5	231 aa		28.05	■■■□□ 2.08
SHOC2-206	ENST00000489783	PICK1	Q9NRD5	415 aa		28.05	■■■□□ 2.08
SHOC2-206	ENST00000489783	UTY	O14607	1347 aa		28.04	■■■□□ 2.08
SHOC2-206	ENST00000489783	IFIT1	P09914	478 aa	Known RBP	28.04	■■■□□ 2.08
SHOC2-206	ENST00000489783	SPINK5	Q9NQ38	1064 aa	Predicted RBP	28.04	■■■□□ 2.08
SHOC2-206	ENST00000489783	KIF16B	Q96L93	1317 aa		28.03	■■■□□ 2.08
SHOC2-206	ENST00000489783	PRDX5	P30044	214 aa		28.03	■■■□□ 2.08
SHOC2-206	ENST00000489783	TDH	Q8IZJ6	230 aa		28.03	■■■□□ 2.08
SHOC2-206	ENST00000489783	ANKLE1	Q8NAG6	615 aa		28.03	■■■□□ 2.08
SHOC2-206	ENST00000489783	PUM3	Q15397	648 aa	Known RBP	28.02	■■■□□ 2.08
SHOC2-206	ENST00000489783	SH3BP5L	Q7L8J4	393 aa		28.02	■■■□□ 2.08
SHOC2-206	ENST00000489783	NBPF3	Q9H094	633 aa		28.02	■■■□□ 2.08
SHOC2-206	ENST00000489783	FRMD4A	Q9P2Q2	1039 aa	Predicted RBP	28.02	■■■□□ 2.08
SHOC2-206	ENST00000489783	TRIM32	Q13049	653 aa		28.01	■■■□□ 2.07
SHOC2-206	ENST00000489783	TRIM75P	A6NK02	468 aa		28	■■■□□ 2.07
SHOC2-206	ENST00000489783	RGS3	P49796	1198 aa		28	■■■□□ 2.07
SHOC2-206	ENST00000489783	MAP3K10	Q02779	954 aa		28	■■■□□ 2.07
SHOC2-206	ENST00000489783	CCDC84	Q86UT8	332 aa	Predicted RBP	28	■■■□□ 2.07
SHOC2-206	ENST00000489783	SALL2	Q9Y467	1007 aa	Predicted RBP	28	■■■□□ 2.07
SHOC2-206	ENST00000489783	ZEB1	P37275	1124 aa	Predicted RBP	27.99	■■■□□ 2.07
SHOC2-206	ENST00000489783	NCBP3	Q53F19	620 aa	Known RBP	27.99	■■■□□ 2.07
SHOC2-206	ENST00000489783	TREML2	Q5T2D2	321 aa		27.99	■■■□□ 2.07
SHOC2-206	ENST00000489783	AGTPBP1	Q9UPW5	1226 aa		27.99	■■■□□ 2.07
SHOC2-206	ENST00000489783	HMGCR	P04035	888 aa		27.98	■■■□□ 2.07
SHOC2-206	ENST00000489783	WDR63	Q8IWG1	891 aa		27.98	■■■□□ 2.07
SHOC2-206	ENST00000489783	UBE2O	Q9C0C9	1292 aa	Known RBP	27.98	■■■□□ 2.07
SHOC2-206	ENST00000489783	C11orf49	Q9H6J7	331 aa		27.98	■■■□□ 2.07
SHOC2-206	ENST00000489783	GJD2	Q9UKL4	321 aa		27.98	■■■□□ 2.07
SHOC2-206	ENST00000489783	LRRFIP2	Q9Y608	721 aa	Known RBP	27.98	■■■□□ 2.07
SHOC2-206	ENST00000489783	RPTOR	Q8N122	1335 aa		27.97	■■■□□ 2.07
SHOC2-206	ENST00000489783	LDHB	P07195	334 aa	Known RBP	27.97	■■■□□ 2.07
SHOC2-206	ENST00000489783	FAM110C	Q1W6H9	321 aa		27.97	■■■□□ 2.07
SHOC2-206	ENST00000489783	IDI2	Q9BXS1	227 aa		27.97	■■■□□ 2.07
SHOC2-206	ENST00000489783	PTPRF	P10586	1907 aa		27.96	■■■□□ 2.07
SHOC2-206	ENST00000489783	DDTL	A6NHG4	134 aa	Predicted RBP	27.96	■■■□□ 2.07
SHOC2-206	ENST00000489783	CTNND1	O60716	968 aa	Known RBP	27.96	■■■□□ 2.07
SHOC2-206	ENST00000489783	ENTPD3	O75355	529 aa		27.96	■■■□□ 2.07
SHOC2-206	ENST00000489783	SLC5A1	P13866	664 aa		27.96	■■■□□ 2.07
SHOC2-206	ENST00000489783	LPIN2	Q92539	896 aa		27.96	■■■□□ 2.07
SHOC2-206	ENST00000489783	HMX1	Q9NP08	348 aa	Predicted RBP	27.96	■■■□□ 2.07
SHOC2-206	ENST00000489783	PHF6	Q8IWS0	365 aa	Known RBP eCLIP	27.95	■■■□□ 2.06
SHOC2-206	ENST00000489783	OGDHL	Q9ULD0	1010 aa		27.95	■■■□□ 2.06
SHOC2-206	ENST00000489783	ZSCAN29	Q8IWY8	852 aa	Predicted RBP	27.94	■■■□□ 2.06
SHOC2-206	ENST00000489783	PHIP	Q8WWQ0	1821 aa		27.94	■■■□□ 2.06
SHOC2-206	ENST00000489783	DDX4	Q9NQI0	724 aa	Known RBP	27.93	■■■□□ 2.06
SHOC2-206	ENST00000489783	PFAS	O15067	1338 aa		27.92	■■■□□ 2.06
SHOC2-206	ENST00000489783	EYA2	O00167	538 aa		27.92	■■■□□ 2.06
SHOC2-206	ENST00000489783	RFX5	P48382	616 aa	Predicted RBP	27.92	■■■□□ 2.06
SHOC2-206	ENST00000489783	DDX60L	Q5H9U9	1706 aa	Known RBP	27.92	■■■□□ 2.06
SHOC2-206	ENST00000489783	RFX7	Q2KHR2	1363 aa		27.91	■■■□□ 2.06
SHOC2-206	ENST00000489783	DOCK2	Q92608	1830 aa		27.91	■■■□□ 2.06
SHOC2-206	ENST00000489783	PNMA3	Q9UL41	463 aa		27.91	■■■□□ 2.06
SHOC2-206	ENST00000489783	SALL1	Q9NSC2	1324 aa		27.91	■■■□□ 2.06
SHOC2-206	ENST00000489783	MYH13	Q9UKX3	1938 aa		27.9	■■■□□ 2.06
SHOC2-206	ENST00000489783	ATG9A	Q7Z3C6	839 aa		27.9	■■■□□ 2.06
SHOC2-206	ENST00000489783	TRIB2	Q92519	343 aa		27.9	■■■□□ 2.06
SHOC2-206	ENST00000489783	GUCD1	Q96NT3	240 aa		27.9	■■■□□ 2.06
SHOC2-206	ENST00000489783	POTEB2	H3BUK9	544 aa		27.89	■■■□□ 2.06
SHOC2-206	ENST00000489783	GCLC	P48506	637 aa	Predicted RBP	27.89	■■■□□ 2.06
SHOC2-206	ENST00000489783	PROCA1	Q8NCQ7	364 aa	Predicted RBP	27.89	■■■□□ 2.06
SHOC2-206	ENST00000489783	GAK	O14976	1311 aa		27.89	■■■□□ 2.05
SHOC2-206	ENST00000489783	SPP2	Q13103	211 aa		27.88	■■■□□ 2.05
SHOC2-206	ENST00000489783	DOCK1	Q14185	1865 aa		27.88	■■■□□ 2.05
SHOC2-206	ENST00000489783	MAP3K21	Q5TCX8	1036 aa		27.88	■■■□□ 2.05
SHOC2-206	ENST00000489783	USP44	Q9H0E7	712 aa		27.88	■■■□□ 2.05
SHOC2-206	ENST00000489783	MDM2	Q00987	491 aa	Predicted RBP	27.87	■■■□□ 2.05
SHOC2-206	ENST00000489783	PICALM	Q13492	652 aa		27.87	■■■□□ 2.05
SHOC2-206	ENST00000489783	ASCC2	Q9H1I8	757 aa	Predicted RBP	27.87	■■■□□ 2.05
SHOC2-206	ENST00000489783	GNL3L	Q9NVN8	582 aa	Known RBP	27.87	■■■□□ 2.05
SHOC2-206	ENST00000489783	FAM196B	A6NMK8	535 aa		27.86	■■■□□ 2.05
SHOC2-206	ENST00000489783	COL6A1	P12109	1028 aa		27.86	■■■□□ 2.05
SHOC2-206	ENST00000489783	PHKA1	P46020	1223 aa		27.86	■■■□□ 2.05
SHOC2-206	ENST00000489783	DENND2A	Q9ULE3	1009 aa		27.86	■■■□□ 2.05
SHOC2-206	ENST00000489783	LAMA2	P24043	3122 aa	Known RBP	27.85	■■■□□ 2.05
SHOC2-206	ENST00000489783	CYP2B6	P20813	491 aa		27.85	■■■□□ 2.05
SHOC2-206	ENST00000489783	HMGCS2	P54868	508 aa		27.85	■■■□□ 2.05
SHOC2-206	ENST00000489783	LRRC26	Q2I0M4	334 aa		27.85	■■■□□ 2.05

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 11.2 ms