RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000488576.5

FAM107B-222, Transcript of family with sequence similarity 107 member B, human

TSL 4

Gene FAM107B, Length 552 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
FAM107B-222	ENST00000488576	ZP2	Q05996	745 aa		4.66	□□□□□ -1.66
FAM107B-222	ENST00000488576	TTLL4	Q14679	1199 aa		4.66	□□□□□ -1.66
FAM107B-222	ENST00000488576	KIAA0319	Q5VV43	1072 aa		4.66	□□□□□ -1.66
FAM107B-222	ENST00000488576	FYB2	Q5VWT5	728 aa		4.66	□□□□□ -1.66
FAM107B-222	ENST00000488576	PRR23B	Q6ZRT6	265 aa		4.66	□□□□□ -1.66
FAM107B-222	ENST00000488576	TTLL10	Q6ZVT0	673 aa		4.66	□□□□□ -1.66
FAM107B-222	ENST00000488576	TOP6BL	Q8N6T0	577 aa		4.66	□□□□□ -1.66
FAM107B-222	ENST00000488576	ZC3H12C	Q9C0D7	883 aa	Known RBP	4.66	□□□□□ -1.66
FAM107B-222	ENST00000488576	PCOLCE2	Q9UKZ9	415 aa		4.66	□□□□□ -1.66
FAM107B-222	ENST00000488576	SNX11	Q9Y5W9	270 aa		4.66	□□□□□ -1.66
FAM107B-222	ENST00000488576	ZNF862	O60290	1169 aa		4.65	□□□□□ -1.67
FAM107B-222	ENST00000488576	GLI1	P08151	1106 aa		4.65	□□□□□ -1.67
FAM107B-222	ENST00000488576	C1QTNF9	P0C862	333 aa		4.65	□□□□□ -1.67
FAM107B-222	ENST00000488576	HCLS1	P14317	486 aa	Predicted RBP	4.65	□□□□□ -1.67
FAM107B-222	ENST00000488576	AFM	P43652	599 aa		4.65	□□□□□ -1.67
FAM107B-222	ENST00000488576	MPZL3	Q6UWV2	235 aa		4.65	□□□□□ -1.67
FAM107B-222	ENST00000488576	ASB11	Q8WXH4	323 aa		4.65	□□□□□ -1.67
FAM107B-222	ENST00000488576	PBXIP1	Q96AQ6	731 aa		4.65	□□□□□ -1.67
FAM107B-222	ENST00000488576	CCDC87	Q9NVE4	849 aa		4.65	□□□□□ -1.67
FAM107B-222	ENST00000488576	RAPGEFL1	Q9UHV5	662 aa		4.65	□□□□□ -1.67
FAM107B-222	ENST00000488576	PCDHGC5	Q9Y5F6	944 aa		4.65	□□□□□ -1.67
FAM107B-222	ENST00000488576	KRT1	P04264	644 aa		4.64	□□□□□ -1.67
FAM107B-222	ENST00000488576	KIF4B	Q2VIQ3	1234 aa		4.64	□□□□□ -1.67
FAM107B-222	ENST00000488576	USPL1	Q5W0Q7	1092 aa		4.64	□□□□□ -1.67
FAM107B-222	ENST00000488576	HEXIM2	Q96MH2	286 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
FAM107B-222	ENST00000488576	KRTAP17-1	Q9BYP8	105 aa		4.64	□□□□□ -1.67
FAM107B-222	ENST00000488576	EHD4	Q9H223	541 aa		4.64	□□□□□ -1.67
FAM107B-222	ENST00000488576	NFIB	O00712	420 aa		4.63	□□□□□ -1.67
FAM107B-222	ENST00000488576	NEFM	P07197	916 aa		4.63	□□□□□ -1.67
FAM107B-222	ENST00000488576	ZNF157	P51786	506 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
FAM107B-222	ENST00000488576	PTPN12	Q05209	780 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
FAM107B-222	ENST00000488576	ISL2	Q96A47	359 aa		4.63	□□□□□ -1.67
FAM107B-222	ENST00000488576	KIRREL1	Q96J84	757 aa		4.63	□□□□□ -1.67
FAM107B-222	ENST00000488576	SSU72	Q9NP77	194 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
FAM107B-222	ENST00000488576	KRT82	Q9NSB4	513 aa		4.63	□□□□□ -1.67
FAM107B-222	ENST00000488576	GSTP1	P09211	210 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
FAM107B-222	ENST00000488576	INHBB	P09529	407 aa		4.62	□□□□□ -1.67
FAM107B-222	ENST00000488576	HNRNPU	Q00839	825 aa	Known RBP eCLIP	4.62	□□□□□ -1.67
FAM107B-222	ENST00000488576	TMEM67	Q5HYA8	995 aa		4.62	□□□□□ -1.67
FAM107B-222	ENST00000488576	FAM214B	Q7L5A3	538 aa		4.62	□□□□□ -1.67
FAM107B-222	ENST00000488576	AMIGO3	Q86WK7	504 aa		4.62	□□□□□ -1.67
FAM107B-222	ENST00000488576	PHF6	Q8IWS0	365 aa	Known RBP eCLIP	4.62	□□□□□ -1.67
FAM107B-222	ENST00000488576	SPACA3	Q8IXA5	215 aa		4.62	□□□□□ -1.67
FAM107B-222	ENST00000488576	FBXO15	Q8NCQ5	510 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
FAM107B-222	ENST00000488576	ABCB6	Q9NP58	842 aa		4.62	□□□□□ -1.67
FAM107B-222	ENST00000488576	GTF2IRD1	Q9UHL9	959 aa		4.62	□□□□□ -1.67
FAM107B-222	ENST00000488576	NPIPB6	E9PJ23	425 aa		4.61	□□□□□ -1.67
FAM107B-222	ENST00000488576	IGF2BP3	O00425	579 aa	Known RBP eCLIP	4.61	□□□□□ -1.67
FAM107B-222	ENST00000488576	SSFA2	P28290	1259 aa		4.61	□□□□□ -1.67
FAM107B-222	ENST00000488576	FAAP100	Q0VG06	881 aa		4.61	□□□□□ -1.67
FAM107B-222	ENST00000488576	SF3B2	Q13435	895 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
FAM107B-222	ENST00000488576	RPS26P11	Q5JNZ5	115 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
FAM107B-222	ENST00000488576	CYFIP1	Q7L576	1253 aa		4.61	□□□□□ -1.67
FAM107B-222	ENST00000488576	NPHS2	Q9NP85	383 aa		4.61	□□□□□ -1.67
FAM107B-222	ENST00000488576	CTSW	P56202	376 aa		4.6	□□□□□ -1.67
FAM107B-222	ENST00000488576	FKBP4	Q02790	459 aa	Known RBP eCLIP	4.6	□□□□□ -1.67
FAM107B-222	ENST00000488576	NKPD1	Q17RQ9	610 aa		4.6	□□□□□ -1.67
FAM107B-222	ENST00000488576	DIRC2	Q96SL1	478 aa		4.6	□□□□□ -1.67
FAM107B-222	ENST00000488576	NSUN3	Q9H649	340 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
FAM107B-222	ENST00000488576	PITPNM2	Q9BZ72	1349 aa		4.6	□□□□□ -1.67
FAM107B-222	ENST00000488576	TMEM238L	A0A1B0GVL6	79 aa		4.59	□□□□□ -1.67
FAM107B-222	ENST00000488576	NEFL	P07196	543 aa		4.59	□□□□□ -1.67
FAM107B-222	ENST00000488576	TMEM253	P0C7T8	217 aa		4.59	□□□□□ -1.67
FAM107B-222	ENST00000488576	CLCN7	P51798	805 aa		4.59	□□□□□ -1.67
FAM107B-222	ENST00000488576	PRPF40B	Q6NWY9	871 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
FAM107B-222	ENST00000488576	RNF214	Q8ND24	703 aa		4.59	□□□□□ -1.67
FAM107B-222	ENST00000488576	KCNB2	Q92953	911 aa		4.59	□□□□□ -1.67
FAM107B-222	ENST00000488576	CARS2	Q9HA77	564 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
FAM107B-222	ENST00000488576	CD320	Q9NPF0	282 aa		4.59	□□□□□ -1.67
FAM107B-222	ENST00000488576	ANO2	Q9NQ90	1003 aa		4.59	□□□□□ -1.67
FAM107B-222	ENST00000488576	PRDM10	Q9NQV6	1147 aa		4.59	□□□□□ -1.67
FAM107B-222	ENST00000488576	C19orf73	Q9NVV2	129 aa		4.59	□□□□□ -1.67
FAM107B-222	ENST00000488576	GNAT3	A8MTJ3	354 aa		4.58	□□□□□ -1.68
FAM107B-222	ENST00000488576	CPNE3	O75131	537 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
FAM107B-222	ENST00000488576	ABL1	P00519	1130 aa		4.58	□□□□□ -1.68
FAM107B-222	ENST00000488576	ERVK-24	P63145	666 aa		4.58	□□□□□ -1.68
FAM107B-222	ENST00000488576	ZNF211	Q13398	564 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
FAM107B-222	ENST00000488576	KCNA10	Q16322	511 aa		4.58	□□□□□ -1.68
FAM107B-222	ENST00000488576	ZC3H12A	Q5D1E8	599 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
FAM107B-222	ENST00000488576	CIAPIN1	Q6FI81	312 aa		4.58	□□□□□ -1.68
FAM107B-222	ENST00000488576	ATG14	Q6ZNE5	492 aa		4.58	□□□□□ -1.68
FAM107B-222	ENST00000488576	PDZD3	Q86UT5	571 aa		4.58	□□□□□ -1.68
FAM107B-222	ENST00000488576	MTMR7	Q9Y216	660 aa		4.58	□□□□□ -1.68
FAM107B-222	ENST00000488576	GADD45B	O75293	160 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
FAM107B-222	ENST00000488576	GDNF	P39905	211 aa		4.57	□□□□□ -1.68
FAM107B-222	ENST00000488576	ORC1	Q13415	861 aa		4.57	□□□□□ -1.68
FAM107B-222	ENST00000488576	KCNK12	Q9HB15	430 aa		4.57	□□□□□ -1.68
FAM107B-222	ENST00000488576	GPN3	Q9UHW5	284 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
FAM107B-222	ENST00000488576	JAG2	Q9Y219	1238 aa		4.57	□□□□□ -1.68
FAM107B-222	ENST00000488576	TCAF2	A6NFQ2	919 aa		4.56	□□□□□ -1.68
FAM107B-222	ENST00000488576	HOXA5	P20719	270 aa		4.56	□□□□□ -1.68
FAM107B-222	ENST00000488576	PPP2R3A	Q06190	1150 aa		4.56	□□□□□ -1.68
FAM107B-222	ENST00000488576	STK35	Q8TDR2	534 aa		4.56	□□□□□ -1.68
FAM107B-222	ENST00000488576	C20orf173	Q96LM9	149 aa		4.56	□□□□□ -1.68
FAM107B-222	ENST00000488576	FOXQ1	Q9C009	403 aa		4.56	□□□□□ -1.68
FAM107B-222	ENST00000488576	EPB41L4B	Q9H329	900 aa		4.56	□□□□□ -1.68
FAM107B-222	ENST00000488576	ATP13A1	Q9HD20	1204 aa		4.56	□□□□□ -1.68
FAM107B-222	ENST00000488576	DCP1A	Q9NPI6	582 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
FAM107B-222	ENST00000488576	BRPF3	Q9ULD4	1205 aa		4.56	□□□□□ -1.68
FAM107B-222	ENST00000488576	TRAK1	Q9UPV9	953 aa		4.56	□□□□□ -1.68

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