RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000485621.1

TRAPPC10-211, Transcript of trafficking protein particle complex 10, humanhuman

TSL 2

Gene TRAPPC10, Length 537 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC10-211ENST00000485621 ZSCAN29Q8IWY8 852 aaPredicted RBP10.17□□□□□ -0.78
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TRAPPC10-211ENST00000485621 PCOLCE2Q9UKZ9 415 aa10.17□□□□□ -0.78
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TRAPPC10-211ENST00000485621 GSTT1P30711 240 aa10.16□□□□□ -0.78
TRAPPC10-211ENST00000485621 COL19A1Q14993 1142 aa10.16□□□□□ -0.78
TRAPPC10-211ENST00000485621 ZNF574Q6ZN55 896 aaPredicted RBP10.16□□□□□ -0.78
TRAPPC10-211ENST00000485621 C3orf58Q8NDZ4 430 aa10.16□□□□□ -0.78
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TRAPPC10-211ENST00000485621 CD8BP10966 210 aa10.07□□□□□ -0.8
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TRAPPC10-211ENST00000485621 FUT4P22083 530 aa10.03□□□□□ -0.8
TRAPPC10-211ENST00000485621 NTF4P34130 210 aa10.03□□□□□ -0.8
TRAPPC10-211ENST00000485621 HEXIM2Q96MH2 286 aaKnown RBP10.03□□□□□ -0.8
TRAPPC10-211ENST00000485621 PRDM10Q9NQV6 1147 aa10.03□□□□□ -0.8
TRAPPC10-211ENST00000485621 FANCGO15287 622 aa10.02□□□□□ -0.81
TRAPPC10-211ENST00000485621 PAPLNO95428 1278 aa10.02□□□□□ -0.81
TRAPPC10-211ENST00000485621 LDHBP07195 334 aaKnown RBP10.02□□□□□ -0.81
TRAPPC10-211ENST00000485621 PI4K2BQ8TCG2 481 aa10.02□□□□□ -0.81
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