RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000476204.5

HOXB-AS3-208, HOXB cluster antisense RNA 3, humanhuman

TSL 4

Gene HOXB-AS3, Length 539 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB-AS3-208ENST00000476204 STRBPQ96SI9 672 aaKnown RBP23.3■■□□□ 1.32
HOXB-AS3-208ENST00000476204 PUS7LQ9H0K6 701 aaKnown RBP23.3■■□□□ 1.32
HOXB-AS3-208ENST00000476204 RPAP1Q9BWH6 1393 aaPredicted RBP23.29■■□□□ 1.32
HOXB-AS3-208ENST00000476204 PICALMQ13492 652 aa23.29■■□□□ 1.32
HOXB-AS3-208ENST00000476204 OSBP2Q969R2 916 aa23.29■■□□□ 1.32
HOXB-AS3-208ENST00000476204 OSBPL5Q9H0X9 879 aaPredicted RBP23.29■■□□□ 1.32
HOXB-AS3-208ENST00000476204 MAST2Q6P0Q8 1798 aa23.28■■□□□ 1.32
HOXB-AS3-208ENST00000476204 MBD4O95243 580 aa23.28■■□□□ 1.32
HOXB-AS3-208ENST00000476204 FMR1Q06787 632 aaKnown RBP eCLIP23.28■■□□□ 1.32
HOXB-AS3-208ENST00000476204 MCMDC2Q4G0Z9 681 aa23.28■■□□□ 1.32
HOXB-AS3-208ENST00000476204 DLK2Q6UY11 383 aa23.28■■□□□ 1.32
HOXB-AS3-208ENST00000476204 TTC6Q86TZ1 520 aa23.28■■□□□ 1.32
HOXB-AS3-208ENST00000476204 HHIPL1Q96JK4 782 aa23.28■■□□□ 1.32
HOXB-AS3-208ENST00000476204 DDX4Q9NQI0 724 aaKnown RBP23.28■■□□□ 1.32
HOXB-AS3-208ENST00000476204 PI4KBQ9UBF8 816 aa23.28■■□□□ 1.32
HOXB-AS3-208ENST00000476204 TAOK2Q9UL54 1235 aa23.28■■□□□ 1.32
HOXB-AS3-208ENST00000476204 TBC1D12O60347 775 aa23.27■■□□□ 1.32
HOXB-AS3-208ENST00000476204 MFAP1P55081 439 aaKnown RBP23.27■■□□□ 1.32
HOXB-AS3-208ENST00000476204 MAP3K10Q02779 954 aa23.27■■□□□ 1.32
HOXB-AS3-208ENST00000476204 TTLL12Q14166 644 aaPredicted RBP23.27■■□□□ 1.32
HOXB-AS3-208ENST00000476204 MAP3K11Q16584 847 aa23.27■■□□□ 1.32
HOXB-AS3-208ENST00000476204 GIMAP6Q6P9H5 292 aa23.27■■□□□ 1.32
HOXB-AS3-208ENST00000476204 ZFPM1Q8IX07 1006 aa23.27■■□□□ 1.32
HOXB-AS3-208ENST00000476204 ARMT1Q9H993 441 aa23.27■■□□□ 1.32
HOXB-AS3-208ENST00000476204 IREB2P48200 963 aaKnown RBP23.26■■□□□ 1.31
HOXB-AS3-208ENST00000476204 BMP2KLQ5H9B9 411 aa23.26■■□□□ 1.31
HOXB-AS3-208ENST00000476204 MAPKAPK5Q8IW41 473 aa23.26■■□□□ 1.31
HOXB-AS3-208ENST00000476204 LCORLQ8N3X6 602 aa23.26■■□□□ 1.31
HOXB-AS3-208ENST00000476204 DIAPH3Q9NSV4 1193 aa23.26■■□□□ 1.31
HOXB-AS3-208ENST00000476204 ABT1Q9ULW3 272 aaKnown RBP23.26■■□□□ 1.31
HOXB-AS3-208ENST00000476204 TLL2Q9Y6L7 1015 aa23.26■■□□□ 1.31
HOXB-AS3-208ENST00000476204 SLC4A4Q9Y6R1 1079 aa23.26■■□□□ 1.31
HOXB-AS3-208ENST00000476204 PATL2C9JE40 543 aaKnown RBP23.25■■□□□ 1.31
HOXB-AS3-208ENST00000476204 HLA-DOAP06340 250 aa23.25■■□□□ 1.31
HOXB-AS3-208ENST00000476204 GSPT1P15170 499 aaKnown RBP23.25■■□□□ 1.31
HOXB-AS3-208ENST00000476204 DEFB115Q30KQ5 88 aa23.25■■□□□ 1.31
HOXB-AS3-208ENST00000476204 SLFNL1Q499Z3 407 aa23.25■■□□□ 1.31
HOXB-AS3-208ENST00000476204 SAPCD2Q86UD0 394 aa23.25■■□□□ 1.31
HOXB-AS3-208ENST00000476204 AMOTL1Q8IY63 956 aa23.25■■□□□ 1.31
HOXB-AS3-208ENST00000476204 RUFY2Q8WXA3 655 aa23.25■■□□□ 1.31
HOXB-AS3-208ENST00000476204 CSRNP1Q96S65 589 aa23.25■■□□□ 1.31
HOXB-AS3-208ENST00000476204 TRPM7Q96QT4 1865 aa23.25■■□□□ 1.31
HOXB-AS3-208ENST00000476204 ATRNL1Q5VV63 1379 aa23.25■■□□□ 1.31
HOXB-AS3-208ENST00000476204 COL2A1P02458 1487 aaPredicted RBP23.24■■□□□ 1.31
HOXB-AS3-208ENST00000476204 DDTLA6NHG4 134 aaPredicted RBP23.24■■□□□ 1.31
HOXB-AS3-208ENST00000476204 GPAA1O43292 621 aa23.24■■□□□ 1.31
HOXB-AS3-208ENST00000476204 USP2O75604 605 aaPredicted RBP23.24■■□□□ 1.31
HOXB-AS3-208ENST00000476204 CHGBP05060 677 aa23.24■■□□□ 1.31
HOXB-AS3-208ENST00000476204 ZNF341Q9BYN7 854 aa23.24■■□□□ 1.31
HOXB-AS3-208ENST00000476204 NACAP1Q9BZK3 213 aa23.24■■□□□ 1.31
HOXB-AS3-208ENST00000476204 MKRN1Q9UHC7 482 aaKnown RBP23.24■■□□□ 1.31
HOXB-AS3-208ENST00000476204 HERC5Q9UII4 1024 aaKnown RBP23.24■■□□□ 1.31
HOXB-AS3-208ENST00000476204 FLT1P17948 1338 aa23.24■■□□□ 1.31
HOXB-AS3-208ENST00000476204 MYH7P12883 1935 aa23.23■■□□□ 1.31
HOXB-AS3-208ENST00000476204 SH3BP5LQ7L8J4 393 aa23.23■■□□□ 1.31
HOXB-AS3-208ENST00000476204 DCP1AQ9NPI6 582 aaPredicted RBP23.23■■□□□ 1.31
HOXB-AS3-208ENST00000476204 ANGEL1Q9UNK9 670 aaKnown RBP23.23■■□□□ 1.31
HOXB-AS3-208ENST00000476204 POLR3DP05423 398 aaPredicted RBP23.22■■□□□ 1.31
HOXB-AS3-208ENST00000476204 HUNKP57058 714 aa23.22■■□□□ 1.31
HOXB-AS3-208ENST00000476204 MAP3K9P80192 1104 aa23.22■■□□□ 1.31
HOXB-AS3-208ENST00000476204 LDLRAD1Q5T700 205 aa23.22■■□□□ 1.31
HOXB-AS3-208ENST00000476204 ANKRD13AQ8IZ07 590 aa23.22■■□□□ 1.31
HOXB-AS3-208ENST00000476204 MCM9Q9NXL9 1143 aa23.22■■□□□ 1.31
HOXB-AS3-208ENST00000476204 APPP05067 770 aa23.21■■□□□ 1.31
HOXB-AS3-208ENST00000476204 NMIQ13287 307 aaPredicted RBP23.21■■□□□ 1.31
HOXB-AS3-208ENST00000476204 METTL16Q86W50 562 aaKnown RBP23.21■■□□□ 1.31
HOXB-AS3-208ENST00000476204 CCDC102AQ96A19 550 aa23.21■■□□□ 1.31
HOXB-AS3-208ENST00000476204 KLRG1Q96E93 195 aa23.21■■□□□ 1.31
HOXB-AS3-208ENST00000476204 SEC62Q99442 399 aaKnown RBP23.21■■□□□ 1.31
HOXB-AS3-208ENST00000476204 ZNF112Q9UJU3 913 aa23.21■■□□□ 1.31
HOXB-AS3-208ENST00000476204 PALD1Q9ULE6 856 aa23.21■■□□□ 1.31
HOXB-AS3-208ENST00000476204 RASSF10A6NK89 507 aa23.2■■□□□ 1.3
HOXB-AS3-208ENST00000476204 GSG1L2A8MUP6 293 aa23.2■■□□□ 1.3
HOXB-AS3-208ENST00000476204 UBE2Q2LH0YL09 131 aa23.2■■□□□ 1.3
HOXB-AS3-208ENST00000476204 M0R2C6 588 aa23.2■■□□□ 1.3
HOXB-AS3-208ENST00000476204 PRKAB2O43741 272 aa23.2■■□□□ 1.3
HOXB-AS3-208ENST00000476204 PRKG1Q13976 671 aa23.2■■□□□ 1.3
HOXB-AS3-208ENST00000476204 SBK1Q52WX2 424 aa23.2■■□□□ 1.3
HOXB-AS3-208ENST00000476204 MIGA2Q7L4E1 593 aa23.2■■□□□ 1.3
HOXB-AS3-208ENST00000476204 SDR42E1Q8WUS8 393 aa23.2■■□□□ 1.3
HOXB-AS3-208ENST00000476204 SLC10A4Q96EP9 437 aa23.2■■□□□ 1.3
HOXB-AS3-208ENST00000476204 FAM227BQ96M60 508 aa23.2■■□□□ 1.3
HOXB-AS3-208ENST00000476204 TRIM34Q9BYJ4 488 aa23.2■■□□□ 1.3
HOXB-AS3-208ENST00000476204 AK9Q5TCS8 1911 aa23.2■■□□□ 1.3
HOXB-AS3-208ENST00000476204 CHMLP26374 656 aa23.19■■□□□ 1.3
HOXB-AS3-208ENST00000476204 ECE1P42892 770 aa23.19■■□□□ 1.3
HOXB-AS3-208ENST00000476204 RGMBQ6NW40 437 aa23.19■■□□□ 1.3
HOXB-AS3-208ENST00000476204 CWC27Q6UX04 472 aaKnown RBP23.19■■□□□ 1.3
HOXB-AS3-208ENST00000476204 IFNL3Q8IZI9 196 aa23.19■■□□□ 1.3
HOXB-AS3-208ENST00000476204 EHD4Q9H223 541 aa23.19■■□□□ 1.3
HOXB-AS3-208ENST00000476204 XPO5Q9HAV4 1204 aaKnown RBP eCLIP23.19■■□□□ 1.3
HOXB-AS3-208ENST00000476204 CDAN1Q8IWY9 1227 aa23.18■■□□□ 1.3
HOXB-AS3-208ENST00000476204 CRACR2BQ8N4Y2 399 aaPredicted RBP23.18■■□□□ 1.3
HOXB-AS3-208ENST00000476204 SAP30BPQ9UHR5 308 aaKnown RBP23.18■■□□□ 1.3
HOXB-AS3-208ENST00000476204 SERPINB13Q9UIV8 391 aa23.18■■□□□ 1.3
HOXB-AS3-208ENST00000476204 USP17L12C9JPN9 530 aa23.17■■□□□ 1.3
HOXB-AS3-208ENST00000476204 USP17L21D6R901 530 aa23.17■■□□□ 1.3
HOXB-AS3-208ENST00000476204 ALX1Q15699 326 aa23.17■■□□□ 1.3
HOXB-AS3-208ENST00000476204 CASC1Q6TDU7 716 aa23.17■■□□□ 1.3
HOXB-AS3-208ENST00000476204 DDX55Q8NHQ9 600 aaKnown RBP eCLIP23.17■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.3 ms