RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000469521.5

TRAPPC10-208, Transcript of trafficking protein particle complex 10, humanhuman

TSL 5

Gene TRAPPC10, Length 759 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC10-208ENST00000469521 IGF2BP3O00425 579 aaKnown RBP eCLIP23.05■■□□□ 1.28
TRAPPC10-208ENST00000469521 RAB11FIP3O75154 756 aa23.05■■□□□ 1.28
TRAPPC10-208ENST00000469521 CAPN15O75808 1086 aa23.05■■□□□ 1.28
TRAPPC10-208ENST00000469521 ZAP70P43403 619 aa23.05■■□□□ 1.28
TRAPPC10-208ENST00000469521 NAA16Q6N069 864 aaPredicted RBP23.05■■□□□ 1.28
TRAPPC10-208ENST00000469521 ERO1BQ86YB8 467 aa23.05■■□□□ 1.28
TRAPPC10-208ENST00000469521 CNKSR2Q8WXI2 1034 aa23.05■■□□□ 1.28
TRAPPC10-208ENST00000469521 ZKSCAN4Q969J2 545 aaPredicted RBP23.05■■□□□ 1.28
TRAPPC10-208ENST00000469521 ABHD8Q96I13 439 aa23.05■■□□□ 1.28
TRAPPC10-208ENST00000469521 MS4A4AQ96JQ5 239 aa23.05■■□□□ 1.28
TRAPPC10-208ENST00000469521 IL1RAPL2Q9NP60 686 aa23.05■■□□□ 1.28
TRAPPC10-208ENST00000469521 DDX4Q9NQI0 724 aaKnown RBP23.05■■□□□ 1.28
TRAPPC10-208ENST00000469521 ZNF112Q9UJU3 913 aa23.05■■□□□ 1.28
TRAPPC10-208ENST00000469521 GTF2A2P52657 109 aa23.04■■□□□ 1.28
TRAPPC10-208ENST00000469521 OTUD7BQ6GQQ9 843 aa23.04■■□□□ 1.28
TRAPPC10-208ENST00000469521 CLASRPQ8N2M8 674 aaKnown RBP23.04■■□□□ 1.28
TRAPPC10-208ENST00000469521 NOL10Q9BSC4 688 aaKnown RBP23.04■■□□□ 1.28
TRAPPC10-208ENST00000469521 PICALMQ13492 652 aa23.03■■□□□ 1.28
TRAPPC10-208ENST00000469521 DGKZQ13574 1117 aa23.03■■□□□ 1.28
TRAPPC10-208ENST00000469521 NOL9Q5SY16 702 aaKnown RBP23.03■■□□□ 1.28
TRAPPC10-208ENST00000469521 ZSCAN29Q8IWY8 852 aaPredicted RBP23.03■■□□□ 1.28
TRAPPC10-208ENST00000469521 MCOLN1Q9GZU1 580 aa23.03■■□□□ 1.28
TRAPPC10-208ENST00000469521 PIH1D3Q9NQM4 214 aaKnown RBP23.03■■□□□ 1.28
TRAPPC10-208ENST00000469521 GPR25O00155 361 aa23.02■■□□□ 1.28
TRAPPC10-208ENST00000469521 INPP5BP32019 993 aa23.02■■□□□ 1.28
TRAPPC10-208ENST00000469521 PPIL2Q13356 520 aa23.02■■□□□ 1.28
TRAPPC10-208ENST00000469521 SH3BP5LQ7L8J4 393 aa23.02■■□□□ 1.28
TRAPPC10-208ENST00000469521 ZNF296Q8WUU4 475 aaPredicted RBP23.02■■□□□ 1.28
TRAPPC10-208ENST00000469521 DDTLA6NHG4 134 aaPredicted RBP23.01■■□□□ 1.27
TRAPPC10-208ENST00000469521 APBB1O00213 710 aa23.01■■□□□ 1.27
TRAPPC10-208ENST00000469521 BAG3O95817 575 aa23.01■■□□□ 1.27
TRAPPC10-208ENST00000469521 PLCG2P16885 1265 aa23.01■■□□□ 1.27
TRAPPC10-208ENST00000469521 MAP3K10Q02779 954 aa23.01■■□□□ 1.27
TRAPPC10-208ENST00000469521 PPATQ06203 517 aa23.01■■□□□ 1.27
TRAPPC10-208ENST00000469521 TMED8Q6PL24 325 aaPredicted RBP23.01■■□□□ 1.27
TRAPPC10-208ENST00000469521 BRI3BPQ8WY22 251 aa23.01■■□□□ 1.27
TRAPPC10-208ENST00000469521 PTPN18Q99952 460 aa23.01■■□□□ 1.27
TRAPPC10-208ENST00000469521 CCL15-CCL14A0A0B4J2E2 113 aa23■■□□□ 1.27
TRAPPC10-208ENST00000469521 CCL15Q16663 113 aa23■■□□□ 1.27
TRAPPC10-208ENST00000469521 CTU1Q7Z7A3 348 aaKnown RBP23■■□□□ 1.27
TRAPPC10-208ENST00000469521 ADGRA1Q86SQ6 560 aa23■■□□□ 1.27
TRAPPC10-208ENST00000469521 TEX11Q8IYF3 940 aa23■■□□□ 1.27
TRAPPC10-208ENST00000469521 AATFQ9NY61 560 aaKnown RBP eCLIP23■■□□□ 1.27
TRAPPC10-208ENST00000469521 SIPA1L1O43166 1804 aa23■■□□□ 1.27
TRAPPC10-208ENST00000469521 ATAD5Q96QE3 1844 aa23■■□□□ 1.27
TRAPPC10-208ENST00000469521 PHF20L1A8MW92 1017 aa22.99■■□□□ 1.27
TRAPPC10-208ENST00000469521 IRF6O14896 467 aa22.99■■□□□ 1.27
TRAPPC10-208ENST00000469521 IFIT2P09913 472 aaKnown RBP22.99■■□□□ 1.27
TRAPPC10-208ENST00000469521 CETPP11597 493 aa22.99■■□□□ 1.27
TRAPPC10-208ENST00000469521 PPP4CP60510 307 aa22.99■■□□□ 1.27
TRAPPC10-208ENST00000469521 SNAPC2Q13487 334 aa22.99■■□□□ 1.27
TRAPPC10-208ENST00000469521 SH3RF3Q8TEJ3 882 aaPredicted RBP22.99■■□□□ 1.27
TRAPPC10-208ENST00000469521 PPIL4Q8WUA2 492 aaKnown RBP eCLIP22.99■■□□□ 1.27
TRAPPC10-208ENST00000469521 OSBPL5Q9H0X9 879 aaPredicted RBP22.99■■□□□ 1.27
TRAPPC10-208ENST00000469521 R3HDMLQ9H3Y0 253 aa22.99■■□□□ 1.27
TRAPPC10-208ENST00000469521 PHIPQ8WWQ0 1821 aa22.98■■□□□ 1.27
TRAPPC10-208ENST00000469521 IDH1O75874 414 aaKnown RBP22.98■■□□□ 1.27
TRAPPC10-208ENST00000469521 RRP1P56182 461 aaKnown RBP22.98■■□□□ 1.27
TRAPPC10-208ENST00000469521 CRHR2Q13324 411 aa22.98■■□□□ 1.27
TRAPPC10-208ENST00000469521 TBC1D12O60347 775 aa22.97■■□□□ 1.27
TRAPPC10-208ENST00000469521 FKTNO75072 461 aa22.97■■□□□ 1.27
TRAPPC10-208ENST00000469521 TTF1Q15361 905 aaPredicted RBP22.97■■□□□ 1.27
TRAPPC10-208ENST00000469521 CERS3Q8IU89 383 aa22.97■■□□□ 1.27
TRAPPC10-208ENST00000469521 SCYL3Q8IZE3 742 aa22.97■■□□□ 1.27
TRAPPC10-208ENST00000469521 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP22.97■■□□□ 1.27
TRAPPC10-208ENST00000469521 ZCCHC17Q9NP64 241 aaKnown RBP22.97■■□□□ 1.27
TRAPPC10-208ENST00000469521 NDUFB9Q9Y6M9 179 aa22.97■■□□□ 1.27
TRAPPC10-208ENST00000469521 PTPRFP10586 1907 aa22.97■■□□□ 1.27
TRAPPC10-208ENST00000469521 MAP3K12Q12852 859 aa22.96■■□□□ 1.27
TRAPPC10-208ENST00000469521 ANTXR1Q9H6X2 564 aa22.96■■□□□ 1.27
TRAPPC10-208ENST00000469521 KCNH4Q9UQ05 1017 aa22.96■■□□□ 1.27
TRAPPC10-208ENST00000469521 MYH7P12883 1935 aa22.95■■□□□ 1.26
TRAPPC10-208ENST00000469521 FLT1P17948 1338 aa22.95■■□□□ 1.26
TRAPPC10-208ENST00000469521 CYP7A1P22680 504 aa22.95■■□□□ 1.26
TRAPPC10-208ENST00000469521 DDX60LQ5H9U9 1706 aaKnown RBP22.95■■□□□ 1.26
TRAPPC10-208ENST00000469521 MAGEB6Q8N7X4 407 aa22.95■■□□□ 1.26
TRAPPC10-208ENST00000469521 LRRCC1Q9C099 1032 aa22.95■■□□□ 1.26
TRAPPC10-208ENST00000469521 MYH1P12882 1939 aa22.94■■□□□ 1.26
TRAPPC10-208ENST00000469521 PKN2Q16513 984 aaKnown RBP22.94■■□□□ 1.26
TRAPPC10-208ENST00000469521 FAM43AQ8N2R8 423 aa22.94■■□□□ 1.26
TRAPPC10-208ENST00000469521 DHX36Q9H2U1 1008 aaKnown RBP22.94■■□□□ 1.26
TRAPPC10-208ENST00000469521 PICK1Q9NRD5 415 aa22.94■■□□□ 1.26
TRAPPC10-208ENST00000469521 CTNND1O60716 968 aaKnown RBP22.93■■□□□ 1.26
TRAPPC10-208ENST00000469521 TAF1CQ15572 869 aaPredicted RBP22.93■■□□□ 1.26
TRAPPC10-208ENST00000469521 HERC5Q9UII4 1024 aaKnown RBP22.93■■□□□ 1.26
TRAPPC10-208ENST00000469521 NAV1Q8NEY1 1877 aa22.93■■□□□ 1.26
TRAPPC10-208ENST00000469521 TGFBRAP1Q8WUH2 860 aa22.92■■□□□ 1.26
TRAPPC10-208ENST00000469521 XPO5Q9HAV4 1204 aaKnown RBP eCLIP22.92■■□□□ 1.26
TRAPPC10-208ENST00000469521 ZFYVE28Q9HCC9 887 aa22.92■■□□□ 1.26
TRAPPC10-208ENST00000469521 BTBD19C9JJ37 291 aa22.91■■□□□ 1.26
TRAPPC10-208ENST00000469521 PTPRAP18433 802 aa22.91■■□□□ 1.26
TRAPPC10-208ENST00000469521 MAPKAPK5Q8IW41 473 aa22.91■■□□□ 1.26
TRAPPC10-208ENST00000469521 DNAJC2Q99543 621 aaKnown RBP22.91■■□□□ 1.26
TRAPPC10-208ENST00000469521 DCTPP1Q9H773 170 aa22.91■■□□□ 1.26
TRAPPC10-208ENST00000469521 PI4KBQ9UBF8 816 aa22.91■■□□□ 1.26
TRAPPC10-208ENST00000469521 CCDC85CA6NKD9 419 aa22.9■■□□□ 1.26
TRAPPC10-208ENST00000469521 GOLIM4O00461 696 aa22.9■■□□□ 1.26
TRAPPC10-208ENST00000469521 CXCL11O14625 94 aa22.9■■□□□ 1.26
TRAPPC10-208ENST00000469521 SLURP2P0DP57 97 aa22.9■■□□□ 1.26
TRAPPC10-208ENST00000469521 ATP5JP18859 108 aa22.9■■□□□ 1.26
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