RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000469140.2

MTA1-209, Transcript of metastasis associated 1, human

TSL 5

Gene MTA1, Length 1,666 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MTA1-209	ENST00000469140	MCM9	Q9NXL9	1143 aa		27.93	■■■□□ 2.06
MTA1-209	ENST00000469140	AK2	P54819	239 aa		27.92	■■■□□ 2.06
MTA1-209	ENST00000469140	CTDSPL2	Q05D32	466 aa		27.92	■■■□□ 2.06
MTA1-209	ENST00000469140	ANKRD1	Q15327	319 aa		27.92	■■■□□ 2.06
MTA1-209	ENST00000469140	MFSD6	Q6ZSS7	791 aa		27.92	■■■□□ 2.06
MTA1-209	ENST00000469140	AMOTL1	Q8IY63	956 aa		27.92	■■■□□ 2.06
MTA1-209	ENST00000469140	CNNM2	Q9H8M5	875 aa		27.92	■■■□□ 2.06
MTA1-209	ENST00000469140	CDC42EP5	Q6NZY7	148 aa		27.91	■■■□□ 2.06
MTA1-209	ENST00000469140	ZBTB12	Q9Y330	459 aa	Predicted RBP	27.91	■■■□□ 2.06
MTA1-209	ENST00000469140	TIAM2	Q8IVF5	1701 aa		27.91	■■■□□ 2.06
MTA1-209	ENST00000469140	USP17L8	P0C7I0	530 aa		27.91	■■■□□ 2.06
MTA1-209	ENST00000469140	PC	P11498	1178 aa	Known RBP	27.91	■■■□□ 2.06
MTA1-209	ENST00000469140	RPS12	P25398	132 aa	Known RBP	27.91	■■■□□ 2.06
MTA1-209	ENST00000469140	EXOSC10	Q01780	885 aa	Known RBP	27.91	■■■□□ 2.06
MTA1-209	ENST00000469140	COL9A3	Q14050	684 aa	Predicted RBP	27.91	■■■□□ 2.06
MTA1-209	ENST00000469140	MAPKAPK5	Q8IW41	473 aa		27.91	■■■□□ 2.06
MTA1-209	ENST00000469140	SLC3A2	P08195	630 aa	Known RBP	27.9	■■■□□ 2.06
MTA1-209	ENST00000469140	CFAP100	Q494V2	611 aa		27.9	■■■□□ 2.06
MTA1-209	ENST00000469140	MB21D2	Q8IYB1	491 aa	Predicted RBP	27.9	■■■□□ 2.06
MTA1-209	ENST00000469140	KRT23	Q9C075	422 aa		27.9	■■■□□ 2.06
MTA1-209	ENST00000469140	FLT1	P17948	1338 aa		27.89	■■■□□ 2.06
MTA1-209	ENST00000469140	YBX3	P16989	372 aa	Known RBP eCLIP	27.89	■■■□□ 2.06	2e-7	■■■□□ 17.3
MTA1-209	ENST00000469140	MCM5	P33992	734 aa		27.89	■■■□□ 2.06
MTA1-209	ENST00000469140	C12orf60	Q5U649	245 aa		27.89	■■■□□ 2.06
MTA1-209	ENST00000469140	WDR19	Q8NEZ3	1342 aa		27.89	■■■□□ 2.05
MTA1-209	ENST00000469140	WDHD1	O75717	1129 aa	Predicted RBP	27.88	■■■□□ 2.05
MTA1-209	ENST00000469140	LIMCH1	Q9UPQ0	1083 aa		27.88	■■■□□ 2.05
MTA1-209	ENST00000469140	BAZ2A	Q9UIF9	1905 aa	Known RBP	27.88	■■■□□ 2.05
MTA1-209	ENST00000469140	CYP2D7	A0A087X1C5	515 aa		27.87	■■■□□ 2.05
MTA1-209	ENST00000469140	NEDD4	P46934	1319 aa		27.87	■■■□□ 2.05
MTA1-209	ENST00000469140	FGR	P09769	529 aa		27.87	■■■□□ 2.05
MTA1-209	ENST00000469140	FBXL16	Q8N461	479 aa		27.87	■■■□□ 2.05
MTA1-209	ENST00000469140	TMX3	Q96JJ7	454 aa		27.87	■■■□□ 2.05
MTA1-209	ENST00000469140	TCEANC2	Q96MN5	208 aa		27.87	■■■□□ 2.05
MTA1-209	ENST00000469140	ADAMTSL1	Q8N6G6	1762 aa		27.86	■■■□□ 2.05
MTA1-209	ENST00000469140	POLR3D	P05423	398 aa	Predicted RBP	27.86	■■■□□ 2.05
MTA1-209	ENST00000469140	MTMR14	Q8NCE2	650 aa		27.86	■■■□□ 2.05
MTA1-209	ENST00000469140	PCDHAC2	Q9Y5I4	1007 aa		27.86	■■■□□ 2.05
MTA1-209	ENST00000469140	CDK5RAP2	Q96SN8	1893 aa		27.85	■■■□□ 2.05
MTA1-209	ENST00000469140	NPM3	O75607	178 aa	Known RBP	27.85	■■■□□ 2.05
MTA1-209	ENST00000469140	FGD1	P98174	961 aa		27.85	■■■□□ 2.05
MTA1-209	ENST00000469140	DLGAP5	Q15398	846 aa		27.85	■■■□□ 2.05
MTA1-209	ENST00000469140		Q6ZUG5	572 aa		27.85	■■■□□ 2.05
MTA1-209	ENST00000469140	DPF2	Q92785	391 aa		27.85	■■■□□ 2.05
MTA1-209	ENST00000469140	ZSCAN31	Q96LW9	406 aa	Predicted RBP	27.85	■■■□□ 2.05
MTA1-209	ENST00000469140	IDI2	Q9BXS1	227 aa		27.85	■■■□□ 2.05
MTA1-209	ENST00000469140	AGXT2	Q9BYV1	514 aa		27.85	■■■□□ 2.05
MTA1-209	ENST00000469140	TACC3	Q9Y6A5	838 aa		27.85	■■■□□ 2.05
MTA1-209	ENST00000469140	NAV1	Q8NEY1	1877 aa		27.85	■■■□□ 2.05
MTA1-209	ENST00000469140	SPDYE2B	A6NHP3	402 aa		27.84	■■■□□ 2.05
MTA1-209	ENST00000469140		B4E1Z4	1266 aa		27.84	■■■□□ 2.05
MTA1-209	ENST00000469140	SPDYE6	P0CI01	402 aa		27.84	■■■□□ 2.05
MTA1-209	ENST00000469140	CYP2D6	P10635	497 aa		27.84	■■■□□ 2.05
MTA1-209	ENST00000469140	TOB2	Q14106	344 aa	Predicted RBP	27.84	■■■□□ 2.05
MTA1-209	ENST00000469140	NOL8	Q76FK4	1167 aa	Known RBP	27.84	■■■□□ 2.05
MTA1-209	ENST00000469140	PRMT6	Q96LA8	375 aa	Predicted RBP	27.84	■■■□□ 2.05
MTA1-209	ENST00000469140	INCENP	Q9NQS7	918 aa		27.84	■■■□□ 2.05
MTA1-209	ENST00000469140	ROBO3	Q96MS0	1386 aa		27.84	■■■□□ 2.05
MTA1-209	ENST00000469140	PRC1	O43663	620 aa		27.84	■■■□□ 2.05
MTA1-209	ENST00000469140	NT5C2	P49902	561 aa		27.84	■■■□□ 2.05
MTA1-209	ENST00000469140	PDE4B	Q07343	736 aa		27.84	■■■□□ 2.05
MTA1-209	ENST00000469140	PICALM	Q13492	652 aa		27.84	■■■□□ 2.05
MTA1-209	ENST00000469140	SAP30BP	Q9UHR5	308 aa	Known RBP	27.84	■■■□□ 2.05
MTA1-209	ENST00000469140	FOCAD	Q5VW36	1801 aa		27.83	■■■□□ 2.05
MTA1-209	ENST00000469140	LAMB1	P07942	1786 aa		27.83	■■■□□ 2.05
MTA1-209	ENST00000469140	HSP90AA1	P07900	732 aa	Known RBP	27.83	■■■□□ 2.05
MTA1-209	ENST00000469140	DDX4	Q9NQI0	724 aa	Known RBP	27.83	■■■□□ 2.05
MTA1-209	ENST00000469140	TOMM22	Q9NS69	142 aa		27.83	■■■□□ 2.05
MTA1-209	ENST00000469140	SMIM22	K7EJ46	135 aa		27.82	■■■□□ 2.04
MTA1-209	ENST00000469140	ORC4	O43929	436 aa		27.82	■■■□□ 2.04
MTA1-209	ENST00000469140	ANTXR2	P58335	489 aa		27.82	■■■□□ 2.04
MTA1-209	ENST00000469140	ZNF280A	P59817	542 aa	Predicted RBP	27.82	■■■□□ 2.04
MTA1-209	ENST00000469140	CHST3	Q7LGC8	479 aa		27.82	■■■□□ 2.04
MTA1-209	ENST00000469140	ESR2	Q92731	530 aa		27.82	■■■□□ 2.04
MTA1-209	ENST00000469140	OSBPL5	Q9H0X9	879 aa	Predicted RBP	27.82	■■■□□ 2.04
MTA1-209	ENST00000469140	SH2B1	Q9NRF2	756 aa	Predicted RBP	27.82	■■■□□ 2.04
MTA1-209	ENST00000469140	DDX52	Q9Y2R4	599 aa	Known RBP eCLIP	27.82	■■■□□ 2.04
MTA1-209	ENST00000469140	GJA3	Q9Y6H8	435 aa		27.82	■■■□□ 2.04
MTA1-209	ENST00000469140	DICER1	Q9UPY3	1922 aa	Known RBP	27.82	■■■□□ 2.04
MTA1-209	ENST00000469140	DDX60L	Q5H9U9	1706 aa	Known RBP	27.82	■■■□□ 2.04
MTA1-209	ENST00000469140	KDM4A	O75164	1064 aa		27.81	■■■□□ 2.04
MTA1-209	ENST00000469140	RRP12	Q5JTH9	1297 aa	Known RBP	27.81	■■■□□ 2.04
MTA1-209	ENST00000469140	TTC6	Q86TZ1	520 aa		27.81	■■■□□ 2.04
MTA1-209	ENST00000469140	STK11IP	Q8N1F8	1099 aa		27.81	■■■□□ 2.04
MTA1-209	ENST00000469140	MTA3	Q9BTC8	594 aa		27.81	■■■□□ 2.04
MTA1-209	ENST00000469140	LRRC2	Q9BYS8	371 aa		27.81	■■■□□ 2.04
MTA1-209	ENST00000469140	TDRD3	Q9H7E2	651 aa	Known RBP	27.81	■■■□□ 2.04
MTA1-209	ENST00000469140	ZSWIM5	Q9P217	1185 aa		27.81	■■■□□ 2.04
MTA1-209	ENST00000469140	ZNF541	Q9H0D2	1346 aa		27.81	■■■□□ 2.04
MTA1-209	ENST00000469140	GMPS	P49915	693 aa	Predicted RBP	27.81	■■■□□ 2.04
MTA1-209	ENST00000469140	PLCD1	P51178	756 aa		27.81	■■■□□ 2.04
MTA1-209	ENST00000469140	CUL4A	Q13619	759 aa		27.81	■■■□□ 2.04
MTA1-209	ENST00000469140	CYB5R4	Q7L1T6	521 aa		27.81	■■■□□ 2.04
MTA1-209	ENST00000469140	TMEM87B	Q96K49	555 aa		27.81	■■■□□ 2.04
MTA1-209	ENST00000469140	ZNF287	Q9HBT7	754 aa		27.81	■■■□□ 2.04
MTA1-209	ENST00000469140	NFIA	Q12857	509 aa		27.8	■■■□□ 2.04
MTA1-209	ENST00000469140	BRF1	Q92994	677 aa		27.8	■■■□□ 2.04
MTA1-209	ENST00000469140	LARP6	Q9BRS8	491 aa	Known RBP	27.8	■■■□□ 2.04
MTA1-209	ENST00000469140	TMOD2	Q9NZR1	351 aa		27.8	■■■□□ 2.04
MTA1-209	ENST00000469140	TPCN1	Q9ULQ1	816 aa		27.8	■■■□□ 2.04

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