RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000464936.5

CEP170-209, Transcript of centrosomal protein 170, human

TSL 5

Gene CEP170, Length 741 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CEP170-209	ENST00000464936	DDB1	Q16531	1140 aa		6.51	□□□□□ -1.37
CEP170-209	ENST00000464936	NKAPL	Q5M9Q1	402 aa		6.51	□□□□□ -1.37
CEP170-209	ENST00000464936	DHX32	Q7L7V1	743 aa	Known RBP	6.51	□□□□□ -1.37
CEP170-209	ENST00000464936	RGL4	Q8IZJ4	473 aa		6.51	□□□□□ -1.37
CEP170-209	ENST00000464936	ABTB2	Q8N961	1025 aa		6.51	□□□□□ -1.37
CEP170-209	ENST00000464936	TP53INP1	Q96A56	240 aa		6.51	□□□□□ -1.37
CEP170-209	ENST00000464936	NUDT16	Q96DE0	195 aa	Known RBP	6.51	□□□□□ -1.37
CEP170-209	ENST00000464936	MPHOSPH9	Q99550	1183 aa		6.51	□□□□□ -1.37
CEP170-209	ENST00000464936	PDGFD	Q9GZP0	370 aa	Predicted RBP	6.51	□□□□□ -1.37
CEP170-209	ENST00000464936	MTFR1L	Q9H019	292 aa		6.51	□□□□□ -1.37
CEP170-209	ENST00000464936	ZFAT	Q9P243	1243 aa		6.51	□□□□□ -1.37
CEP170-209	ENST00000464936	DMGDH	Q9UI17	866 aa	Known RBP	6.51	□□□□□ -1.37
CEP170-209	ENST00000464936	ATP7B	P35670	1465 aa		6.51	□□□□□ -1.37
CEP170-209	ENST00000464936	DLC1	Q96QB1	1528 aa		6.5	□□□□□ -1.37
CEP170-209	ENST00000464936	CRYBG1	Q9Y4K1	1723 aa		6.5	□□□□□ -1.37
CEP170-209	ENST00000464936	EIF2AK2	P19525	551 aa	Known RBP	6.5	□□□□□ -1.37
CEP170-209	ENST00000464936	C11orf91	Q3C1V1	193 aa		6.5	□□□□□ -1.37
CEP170-209	ENST00000464936	PRSS36	Q5K4E3	855 aa		6.5	□□□□□ -1.37
CEP170-209	ENST00000464936	PERM1	Q5SV97	790 aa		6.5	□□□□□ -1.37
CEP170-209	ENST00000464936	TOM1L2	Q6ZVM7	507 aa		6.5	□□□□□ -1.37
CEP170-209	ENST00000464936	WFDC8	Q8IUA0	241 aa		6.5	□□□□□ -1.37
CEP170-209	ENST00000464936	CCER1	Q8TC90	406 aa	Predicted RBP	6.5	□□□□□ -1.37
CEP170-209	ENST00000464936	IFT43	Q96FT9	208 aa		6.5	□□□□□ -1.37
CEP170-209	ENST00000464936	PRIMPOL	Q96LW4	560 aa		6.5	□□□□□ -1.37
CEP170-209	ENST00000464936	EFCC1	Q9HA90	598 aa		6.5	□□□□□ -1.37
CEP170-209	ENST00000464936	MTMR7	Q9Y216	660 aa		6.5	□□□□□ -1.37
CEP170-209	ENST00000464936	CHD4	Q14839	1912 aa		6.5	□□□□□ -1.37
CEP170-209	ENST00000464936	CPD	O75976	1380 aa		6.49	□□□□□ -1.37
CEP170-209	ENST00000464936	PRMT3	O60678	531 aa		6.49	□□□□□ -1.37
CEP170-209	ENST00000464936	GRN	P28799	593 aa	Known RBP	6.49	□□□□□ -1.37
CEP170-209	ENST00000464936	NRG1	Q02297	640 aa	Predicted RBP	6.49	□□□□□ -1.37
CEP170-209	ENST00000464936	PLAUR	Q03405	335 aa		6.49	□□□□□ -1.37
CEP170-209	ENST00000464936	SLC15A2	Q16348	729 aa		6.49	□□□□□ -1.37
CEP170-209	ENST00000464936	PCSK7	Q16549	785 aa		6.49	□□□□□ -1.37
CEP170-209	ENST00000464936	CCDC27	Q2M243	656 aa		6.49	□□□□□ -1.37
CEP170-209	ENST00000464936	MSL1	Q68DK7	614 aa		6.49	□□□□□ -1.37
CEP170-209	ENST00000464936	TXNRD3	Q86VQ6	643 aa		6.49	□□□□□ -1.37
CEP170-209	ENST00000464936	NLRP13	Q86W25	1043 aa		6.49	□□□□□ -1.37
CEP170-209	ENST00000464936	FMR1NB	Q8N0W7	255 aa	Predicted RBP	6.49	□□□□□ -1.37
CEP170-209	ENST00000464936	SMG9	Q9H0W8	520 aa	Known RBP	6.49	□□□□□ -1.37
CEP170-209	ENST00000464936	UTP3	Q9NQZ2	479 aa	Known RBP eCLIP	6.49	□□□□□ -1.37
CEP170-209	ENST00000464936	RTCB	Q9Y3I0	505 aa	Known RBP	6.49	□□□□□ -1.37
CEP170-209	ENST00000464936	CRB1	P82279	1406 aa		6.49	□□□□□ -1.37
CEP170-209	ENST00000464936	ACE	P12821	1306 aa		6.49	□□□□□ -1.37
CEP170-209	ENST00000464936	MYOM1	P52179	1685 aa		6.49	□□□□□ -1.37
CEP170-209	ENST00000464936	KAT6B	Q8WYB5	2073 aa		6.48	□□□□□ -1.37
CEP170-209	ENST00000464936	ZBTB42	B2RXF5	422 aa		6.48	□□□□□ -1.37
CEP170-209	ENST00000464936	GC	P02774	474 aa		6.48	□□□□□ -1.37
CEP170-209	ENST00000464936	ATP2B4	P23634	1241 aa		6.48	□□□□□ -1.37
CEP170-209	ENST00000464936	ARID4A	P29374	1257 aa	Predicted RBP	6.48	□□□□□ -1.37
CEP170-209	ENST00000464936	WEE1	P30291	646 aa		6.48	□□□□□ -1.37
CEP170-209	ENST00000464936	ADGRE1	Q14246	886 aa		6.48	□□□□□ -1.37
CEP170-209	ENST00000464936	TXNRD1	Q16881	649 aa		6.48	□□□□□ -1.37
CEP170-209	ENST00000464936	LENG1	Q96BZ8	264 aa	Predicted RBP	6.48	□□□□□ -1.37
CEP170-209	ENST00000464936		J3QW42	95 aa		6.47	□□□□□ -1.37
CEP170-209	ENST00000464936	XYLB	O75191	536 aa		6.47	□□□□□ -1.37
CEP170-209	ENST00000464936	POLD1	P28340	1107 aa		6.47	□□□□□ -1.37
CEP170-209	ENST00000464936	IREB2	P48200	963 aa	Known RBP	6.47	□□□□□ -1.37
CEP170-209	ENST00000464936	GDF6	Q6KF10	455 aa	Predicted RBP	6.47	□□□□□ -1.37
CEP170-209	ENST00000464936	PTF1A	Q7RTS3	328 aa		6.47	□□□□□ -1.37
CEP170-209	ENST00000464936	TREML1	Q86YW5	311 aa		6.47	□□□□□ -1.37
CEP170-209	ENST00000464936	NSUN5	Q96P11	429 aa	Known RBP	6.47	□□□□□ -1.37
CEP170-209	ENST00000464936	LPIN3	Q9BQK8	851 aa		6.47	□□□□□ -1.37
CEP170-209	ENST00000464936	CDK19	Q9BWU1	502 aa		6.47	□□□□□ -1.37
CEP170-209	ENST00000464936	LRFN2	Q9ULH4	789 aa		6.47	□□□□□ -1.37
CEP170-209	ENST00000464936	USP19	O94966	1318 aa		6.47	□□□□□ -1.37
CEP170-209	ENST00000464936	COL5A2	P05997	1499 aa	Predicted RBP	6.47	□□□□□ -1.37
CEP170-209	ENST00000464936	PHRF1	Q9P1Y6	1649 aa	Known RBP	6.47	□□□□□ -1.37
CEP170-209	ENST00000464936	CASZ1	Q86V15	1759 aa		6.46	□□□□□ -1.37
CEP170-209	ENST00000464936	EXOC5	O00471	708 aa		6.46	□□□□□ -1.38
CEP170-209	ENST00000464936	MAP3K6	O95382	1288 aa		6.46	□□□□□ -1.38
CEP170-209	ENST00000464936	FOXD4L6	Q3SYB3	417 aa	Predicted RBP	6.46	□□□□□ -1.38
CEP170-209	ENST00000464936	FOXD4L3	Q6VB84	417 aa	Predicted RBP	6.46	□□□□□ -1.38
CEP170-209	ENST00000464936	MARCH10	Q8NA82	808 aa	Predicted RBP	6.46	□□□□□ -1.38
CEP170-209	ENST00000464936	DCAF11	Q8TEB1	546 aa		6.46	□□□□□ -1.38
CEP170-209	ENST00000464936	MKNK1	Q9BUB5	465 aa		6.46	□□□□□ -1.38
CEP170-209	ENST00000464936	PARP4	Q9UKK3	1724 aa	Known RBP	6.46	□□□□□ -1.38
CEP170-209	ENST00000464936	GOLGB1	Q14789	3259 aa	Known RBP	6.46	□□□□□ -1.38
CEP170-209	ENST00000464936	RGPD3	A6NKT7	1758 aa	Predicted RBP	6.46	□□□□□ -1.38
CEP170-209	ENST00000464936	RGPD4	Q7Z3J3	1758 aa		6.46	□□□□□ -1.38
CEP170-209	ENST00000464936	POLR3A	O14802	1390 aa	Predicted RBP	6.45	□□□□□ -1.38
CEP170-209	ENST00000464936	MAP3K5	Q99683	1374 aa		6.45	□□□□□ -1.38
CEP170-209	ENST00000464936	ITSN1	Q15811	1721 aa		6.45	□□□□□ -1.38
CEP170-209	ENST00000464936	OPLAH	O14841	1288 aa		6.45	□□□□□ -1.38
CEP170-209	ENST00000464936	GRIN3B	O60391	1043 aa		6.45	□□□□□ -1.38
CEP170-209	ENST00000464936	GHRH	P01286	108 aa		6.45	□□□□□ -1.38
CEP170-209	ENST00000464936	PSAP	P07602	524 aa		6.45	□□□□□ -1.38
CEP170-209	ENST00000464936	FKBP5	Q13451	457 aa	Predicted RBP	6.45	□□□□□ -1.38
CEP170-209	ENST00000464936	NBPF11	Q86T75	865 aa		6.45	□□□□□ -1.38
CEP170-209	ENST00000464936	TRPM4	Q8TD43	1214 aa		6.45	□□□□□ -1.38
CEP170-209	ENST00000464936	AATK	Q6ZMQ8	1374 aa		6.44	□□□□□ -1.38
CEP170-209	ENST00000464936	ADGRB1	O14514	1584 aa		6.44	□□□□□ -1.38
CEP170-209	ENST00000464936	GPLD1	P80108	840 aa		6.44	□□□□□ -1.38
CEP170-209	ENST00000464936	OCLN	Q16625	522 aa		6.44	□□□□□ -1.38
CEP170-209	ENST00000464936	COX20	Q5RI15	118 aa		6.44	□□□□□ -1.38
CEP170-209	ENST00000464936	FBXO11	Q86XK2	927 aa		6.44	□□□□□ -1.38
CEP170-209	ENST00000464936	WFDC12	Q8WWY7	111 aa		6.44	□□□□□ -1.38
CEP170-209	ENST00000464936	PLD4	Q96BZ4	506 aa		6.44	□□□□□ -1.38
CEP170-209	ENST00000464936	ACSBG1	Q96GR2	724 aa		6.44	□□□□□ -1.38
CEP170-209	ENST00000464936	FRRS1L	Q9P0K9	344 aa		6.44	□□□□□ -1.38

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