RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000460766.5

IMP4-208, Transcript of IMP4, U3 small nucleolar ribonucleoprotein, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene IMP4, Length 2,379 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IMP4-208ENST00000460766 U2AF2P26368 475 aaKnown RBP eCLIP23.66■■□□□ 1.381e-7■■■□□ 17.4
IMP4-208ENST00000460766 ZNF592Q92610 1267 aa23.66■■□□□ 1.38
IMP4-208ENST00000460766 CLIC6Q96NY7 704 aa23.66■■□□□ 1.38
IMP4-208ENST00000460766 MAP3K14Q99558 947 aa23.66■■□□□ 1.38
IMP4-208ENST00000460766 GNL3Q9BVP2 549 aaKnown RBP eCLIP23.66■■□□□ 1.38
IMP4-208ENST00000460766 IFNKQ9P0W0 207 aa23.66■■□□□ 1.38
IMP4-208ENST00000460766 SMTNL1A8MU46 457 aa23.65■■□□□ 1.38
IMP4-208ENST00000460766 CCZ1BP86790 482 aa23.65■■□□□ 1.38
IMP4-208ENST00000460766 CCZ1P86791 482 aaPredicted RBP23.65■■□□□ 1.38
IMP4-208ENST00000460766 MIGA1Q8NAN2 632 aa23.65■■□□□ 1.38
IMP4-208ENST00000460766 ACSBG1Q96GR2 724 aa23.65■■□□□ 1.38
IMP4-208ENST00000460766 XPO4Q9C0E2 1151 aaKnown RBP23.65■■□□□ 1.38
IMP4-208ENST00000460766 TIGD1Q96MW7 591 aa23.65■■□□□ 1.38
IMP4-208ENST00000460766 LRP2BPQ9P2M1 347 aa23.65■■□□□ 1.38
IMP4-208ENST00000460766 CTIFO43310 598 aaKnown RBP23.64■■□□□ 1.38
IMP4-208ENST00000460766 GSDMDP57764 484 aa23.64■■□□□ 1.38
IMP4-208ENST00000460766 HPSEQ9Y251 543 aa23.64■■□□□ 1.38
IMP4-208ENST00000460766 PAXBP1Q9Y5B6 917 aa23.64■■□□□ 1.38
IMP4-208ENST00000460766 FMNL1O95466 1100 aaPredicted RBP23.64■■□□□ 1.37
IMP4-208ENST00000460766 GNAT2P19087 354 aa23.64■■□□□ 1.37
IMP4-208ENST00000460766 SART3Q15020 963 aaKnown RBP23.64■■□□□ 1.37
IMP4-208ENST00000460766 CEP135Q66GS9 1140 aa23.64■■□□□ 1.37
IMP4-208ENST00000460766 NIP7Q9Y221 180 aaKnown RBP eCLIP23.64■■□□□ 1.37
IMP4-208ENST00000460766 CCDC82Q8N4S0 544 aa23.63■■□□□ 1.37
IMP4-208ENST00000460766 STK36Q9NRP7 1315 aa23.63■■□□□ 1.37
IMP4-208ENST00000460766 COL14A1Q05707 1796 aaKnown RBP23.63■■□□□ 1.37
IMP4-208ENST00000460766 GUCY1A2P33402 732 aa23.63■■□□□ 1.37
IMP4-208ENST00000460766 WTAPQ15007 396 aa23.63■■□□□ 1.37
IMP4-208ENST00000460766 PARP10Q53GL7 1025 aa23.63■■□□□ 1.37
IMP4-208ENST00000460766 STAG1Q8WVM7 1258 aa23.63■■□□□ 1.37
IMP4-208ENST00000460766 WASF1Q92558 559 aa23.63■■□□□ 1.37
IMP4-208ENST00000460766 TRMT1Q9NXH9 659 aaKnown RBP23.63■■□□□ 1.37
IMP4-208ENST00000460766 IMPACTQ9P2X3 320 aa23.63■■□□□ 1.37
IMP4-208ENST00000460766 IQSEC3Q9UPP2 1182 aaPredicted RBP23.63■■□□□ 1.37
IMP4-208ENST00000460766 ERICH2A1L162 156 aa23.62■■□□□ 1.37
IMP4-208ENST00000460766 CAMTA2O94983 1202 aa23.62■■□□□ 1.37
IMP4-208ENST00000460766 IFNAR1P17181 557 aa23.62■■□□□ 1.37
IMP4-208ENST00000460766 NCAPHQ15003 741 aa23.62■■□□□ 1.37
IMP4-208ENST00000460766 RESP18Q5W5W9 173 aa23.62■■□□□ 1.37
IMP4-208ENST00000460766 TMC6Q7Z403 805 aa23.62■■□□□ 1.37
IMP4-208ENST00000460766 CCDC112Q8NEF3 446 aa23.62■■□□□ 1.37
IMP4-208ENST00000460766 CCDC94Q9BW85 323 aaPredicted RBP23.62■■□□□ 1.37
IMP4-208ENST00000460766 OSBPL5Q9H0X9 879 aaPredicted RBP23.62■■□□□ 1.37
IMP4-208ENST00000460766 LMOD1P29536 600 aaPredicted RBP23.62■■□□□ 1.37
IMP4-208ENST00000460766 CHRNDQ07001 517 aa23.62■■□□□ 1.37
IMP4-208ENST00000460766 PNOCQ13519 176 aa23.62■■□□□ 1.37
IMP4-208ENST00000460766 RTN1Q16799 776 aa23.62■■□□□ 1.37
IMP4-208ENST00000460766 NOSTRINQ8IVI9 506 aa23.62■■□□□ 1.37
IMP4-208ENST00000460766 PNPLA7Q6ZV29 1317 aa23.61■■□□□ 1.37
IMP4-208ENST00000460766 BTBD18B2RXH4 712 aa23.61■■□□□ 1.37
IMP4-208ENST00000460766 PTPN14Q15678 1187 aa23.61■■□□□ 1.37
IMP4-208ENST00000460766 TRIM22Q8IYM9 498 aa23.61■■□□□ 1.37
IMP4-208ENST00000460766 EIF4ENIF1Q9NRA8 985 aaKnown RBP23.61■■□□□ 1.37
IMP4-208ENST00000460766 LOC102724428A0A0B4J2F2 783 aa23.6■■□□□ 1.37
IMP4-208ENST00000460766 CUTAO60888 179 aa23.6■■□□□ 1.37
IMP4-208ENST00000460766 SIK1P57059 783 aa23.6■■□□□ 1.37
IMP4-208ENST00000460766 SAFBQ15424 915 aaKnown RBP eCLIP23.6■■□□□ 1.37
IMP4-208ENST00000460766 CMTR1Q8N1G2 835 aaKnown RBP23.6■■□□□ 1.37
IMP4-208ENST00000460766 TUBE1Q9UJT0 475 aa23.6■■□□□ 1.37
IMP4-208ENST00000460766 KCNJ14Q9UNX9 436 aa23.6■■□□□ 1.37
IMP4-208ENST00000460766 ARAP2Q8WZ64 1704 aa23.6■■□□□ 1.37
IMP4-208ENST00000460766 DDB1Q16531 1140 aa23.6■■□□□ 1.37
IMP4-208ENST00000460766 NTSR2O95665 410 aa23.59■■□□□ 1.37
IMP4-208ENST00000460766 MMP1P03956 469 aa23.59■■□□□ 1.37
IMP4-208ENST00000460766 DIS3L2Q8IYB7 885 aaKnown RBP23.59■■□□□ 1.37
IMP4-208ENST00000460766 PDCL2Q8N4E4 241 aa23.59■■□□□ 1.37
IMP4-208ENST00000460766 ABCF2Q9UG63 623 aa23.59■■□□□ 1.37
IMP4-208ENST00000460766 KCNH3Q9ULD8 1083 aa23.59■■□□□ 1.37
IMP4-208ENST00000460766 CYP7A1P22680 504 aa23.59■■□□□ 1.37
IMP4-208ENST00000460766 CNNM3Q8NE01 707 aa23.59■■□□□ 1.37
IMP4-208ENST00000460766 NUP133Q8WUM0 1156 aa23.59■■□□□ 1.37
IMP4-208ENST00000460766 IKBKBO14920 756 aa23.58■■□□□ 1.37
IMP4-208ENST00000460766 ITPK1Q13572 414 aa23.58■■□□□ 1.37
IMP4-208ENST00000460766 LONRF3Q496Y0 759 aa23.58■■□□□ 1.37
IMP4-208ENST00000460766 SPECC1Q5M775 1068 aa23.58■■□□□ 1.37
IMP4-208ENST00000460766 PPP4R3BQ5MIZ7 849 aa23.58■■□□□ 1.37
IMP4-208ENST00000460766 CCAR2Q8N163 923 aaKnown RBP23.58■■□□□ 1.37
IMP4-208ENST00000460766 KRI1Q8N9T8 703 aaKnown RBP23.58■■□□□ 1.37
IMP4-208ENST00000460766 ANKRD7Q92527 254 aa23.58■■□□□ 1.37
IMP4-208ENST00000460766 DOT1LQ8TEK3 1739 aa23.58■■□□□ 1.37
IMP4-208ENST00000460766 FAM237AA0A1B0GTK4 181 aa23.58■■□□□ 1.37
IMP4-208ENST00000460766 ATP1A3P13637 1013 aa23.58■■□□□ 1.37
IMP4-208ENST00000460766 FANCCQ00597 558 aa23.58■■□□□ 1.37
IMP4-208ENST00000460766 NYAP1Q6ZVC0 841 aa23.58■■□□□ 1.37
IMP4-208ENST00000460766 SDR42E1Q8WUS8 393 aa23.58■■□□□ 1.37
IMP4-208ENST00000460766 RNF41Q9H4P4 317 aaPredicted RBP23.58■■□□□ 1.37
IMP4-208ENST00000460766 MINDY4BA8MYZ0 360 aa23.57■■□□□ 1.36
IMP4-208ENST00000460766 PPARAQ07869 468 aa23.57■■□□□ 1.36
IMP4-208ENST00000460766 METTL16Q86W50 562 aaKnown RBP23.57■■□□□ 1.36
IMP4-208ENST00000460766 CCDC150Q8NCX0 1101 aa23.57■■□□□ 1.36
IMP4-208ENST00000460766 UBAC1Q9BSL1 405 aa23.57■■□□□ 1.36
IMP4-208ENST00000460766 SFPQP23246 707 aaKnown RBP eCLIP23.57■■□□□ 1.36
IMP4-208ENST00000460766 ARMCX5Q6P1M9 558 aa23.57■■□□□ 1.36
IMP4-208ENST00000460766 KRBA2Q6ZNG9 492 aa23.57■■□□□ 1.36
IMP4-208ENST00000460766 ADGRA1Q86SQ6 560 aa23.57■■□□□ 1.36
IMP4-208ENST00000460766 PLCH1Q4KWH8 1693 aa23.56■■□□□ 1.36
IMP4-208ENST00000460766 NCBP1Q09161 790 aaKnown RBP23.56■■□□□ 1.36
IMP4-208ENST00000460766 TMTC2Q8N394 836 aa23.56■■□□□ 1.36
IMP4-208ENST00000460766 RAI14Q9P0K7 980 aa23.56■■□□□ 1.36
IMP4-208ENST00000460766 NID2Q14112 1375 aa23.56■■□□□ 1.36
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