RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000439890.3

NANOGP9-201, Transcript of Nanog homeobox pseudogene 9, humanhuman

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Gene NANOGP9, Length 892 nt, Biotype processed pseudogene.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NANOGP9-201ENST00000439890 SPINK2P20155 84 aa8.75□□□□□ -1.01
NANOGP9-201ENST00000439890 HOXA10P31260 410 aaPredicted RBP8.75□□□□□ -1.01
NANOGP9-201ENST00000439890 GP2P55259 537 aaKnown RBP8.75□□□□□ -1.01
NANOGP9-201ENST00000439890 ENOX2Q16206 610 aaKnown RBP8.75□□□□□ -1.01
NANOGP9-201ENST00000439890 NXPE4Q6UWF7 544 aa8.75□□□□□ -1.01
NANOGP9-201ENST00000439890 ZAR1Q86SH2 424 aa8.75□□□□□ -1.01
NANOGP9-201ENST00000439890 EZH1Q92800 747 aaPredicted RBP8.75□□□□□ -1.01
NANOGP9-201ENST00000439890 KCNB2Q92953 911 aa8.75□□□□□ -1.01
NANOGP9-201ENST00000439890 CCDC86Q9H6F5 360 aaKnown RBP8.75□□□□□ -1.01
NANOGP9-201ENST00000439890 TMEM39AQ9NV64 488 aa8.75□□□□□ -1.01
NANOGP9-201ENST00000439890 ANGEL1Q9UNK9 670 aaKnown RBP8.75□□□□□ -1.01
NANOGP9-201ENST00000439890 CEP170Q5SW79 1584 aa8.74□□□□□ -1.01
NANOGP9-201ENST00000439890 GSTP1P09211 210 aaKnown RBP8.74□□□□□ -1.01
NANOGP9-201ENST00000439890 XRCC5P13010 732 aaKnown RBP8.74□□□□□ -1.01
NANOGP9-201ENST00000439890 ADMP35318 185 aa8.74□□□□□ -1.01
NANOGP9-201ENST00000439890 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP8.74□□□□□ -1.01
NANOGP9-201ENST00000439890 CPSF6Q16630 551 aaKnown RBP eCLIP8.74□□□□□ -1.01
NANOGP9-201ENST00000439890 SHISA5Q8N114 240 aa8.74□□□□□ -1.01
NANOGP9-201ENST00000439890 SEMA6CQ9H3T2 930 aa8.74□□□□□ -1.01
NANOGP9-201ENST00000439890 FMN1Q68DA7 1419 aa8.73□□□□□ -1.01
NANOGP9-201ENST00000439890 FAM170BA6NMN3 283 aa8.73□□□□□ -1.01
NANOGP9-201ENST00000439890 CYP26A1O43174 497 aa8.73□□□□□ -1.01
NANOGP9-201ENST00000439890 WNT11O96014 354 aa8.73□□□□□ -1.01
NANOGP9-201ENST00000439890 SLFN14P0C7P3 912 aa8.73□□□□□ -1.01
NANOGP9-201ENST00000439890 IRAK1P51617 712 aa8.73□□□□□ -1.01
NANOGP9-201ENST00000439890 ATP2B2Q01814 1243 aa8.73□□□□□ -1.01
NANOGP9-201ENST00000439890 DSC3Q14574 896 aa8.73□□□□□ -1.01
NANOGP9-201ENST00000439890 DUSP27Q5VZP5 1158 aa8.73□□□□□ -1.01
NANOGP9-201ENST00000439890 DTX1Q86Y01 620 aa8.73□□□□□ -1.01
NANOGP9-201ENST00000439890 ACSS3Q9H6R3 686 aa8.73□□□□□ -1.01
NANOGP9-201ENST00000439890 LRRC4CQ9HCJ2 640 aa8.73□□□□□ -1.01
NANOGP9-201ENST00000439890 PPP1R9AQ9ULJ8 1098 aa8.73□□□□□ -1.01
NANOGP9-201ENST00000439890 CHD1O14646 1710 aa8.73□□□□□ -1.01
NANOGP9-201ENST00000439890 MAP3K1Q13233 1512 aa8.73□□□□□ -1.01
NANOGP9-201ENST00000439890 FOSL1P15407 271 aa8.72□□□□□ -1.01
NANOGP9-201ENST00000439890 ID3Q02535 119 aa8.72□□□□□ -1.01
NANOGP9-201ENST00000439890 SULF2Q8IWU5 870 aa8.72□□□□□ -1.01
NANOGP9-201ENST00000439890 WDR89Q96FK6 387 aaPredicted RBP8.72□□□□□ -1.01
NANOGP9-201ENST00000439890 ATXN3LQ9H3M9 355 aa8.72□□□□□ -1.01
NANOGP9-201ENST00000439890 CBX8Q9HC52 389 aa8.72□□□□□ -1.01
NANOGP9-201ENST00000439890 TMPRSS2O15393 492 aa8.71□□□□□ -1.02
NANOGP9-201ENST00000439890 CYP27A1Q02318 531 aa8.71□□□□□ -1.02
NANOGP9-201ENST00000439890 ACSBG1Q96GR2 724 aa8.71□□□□□ -1.02
NANOGP9-201ENST00000439890 OAS3Q9Y6K5 1087 aaKnown RBP8.71□□□□□ -1.02
NANOGP9-201ENST00000439890 FHOD3Q2V2M9 1422 aa8.71□□□□□ -1.02
NANOGP9-201ENST00000439890 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa8.71□□□□□ -1.02
NANOGP9-201ENST00000439890 RNGTTO60942 597 aaKnown RBP8.7□□□□□ -1.02
NANOGP9-201ENST00000439890 GSTT1P30711 240 aa8.7□□□□□ -1.02
NANOGP9-201ENST00000439890 MCTP1Q6DN14 999 aa8.7□□□□□ -1.02
NANOGP9-201ENST00000439890 ZNF765Q7L2R6 523 aa8.7□□□□□ -1.02
NANOGP9-201ENST00000439890 FBF1Q8TES7 1133 aa8.7□□□□□ -1.02
NANOGP9-201ENST00000439890 KRT82Q9NSB4 513 aa8.7□□□□□ -1.02
NANOGP9-201ENST00000439890 FYCO1Q9BQS8 1478 aa8.7□□□□□ -1.02
NANOGP9-201ENST00000439890 KIAA0556O60303 1618 aa8.69□□□□□ -1.02
NANOGP9-201ENST00000439890 ZNF862O60290 1169 aa8.69□□□□□ -1.02
NANOGP9-201ENST00000439890 ADAMTS4O75173 837 aa8.69□□□□□ -1.02
NANOGP9-201ENST00000439890 MAP1SQ66K74 1059 aaPredicted RBP8.69□□□□□ -1.02
NANOGP9-201ENST00000439890 ALG1LQ6GMV1 187 aa8.69□□□□□ -1.02
NANOGP9-201ENST00000439890 TPTE2Q6XPS3 522 aa8.69□□□□□ -1.02
NANOGP9-201ENST00000439890 ASB16Q96NS5 453 aa8.69□□□□□ -1.02
NANOGP9-201ENST00000439890 SETDB2Q96T68 719 aa8.69□□□□□ -1.02
NANOGP9-201ENST00000439890 CRIM1Q9NZV1 1036 aa8.69□□□□□ -1.02
NANOGP9-201ENST00000439890 DYNC1LI2O43237 492 aaPredicted RBP8.68□□□□□ -1.02
NANOGP9-201ENST00000439890 FMR1Q06787 632 aaKnown RBP eCLIP8.68□□□□□ -1.02
NANOGP9-201ENST00000439890 FANCD2OSQ96PS1 177 aa8.68□□□□□ -1.02
NANOGP9-201ENST00000439890 EMILIN2Q9BXX0 1053 aa8.68□□□□□ -1.02
NANOGP9-201ENST00000439890 KRTAP4-8Q9BYQ9 185 aa8.68□□□□□ -1.02
NANOGP9-201ENST00000439890 SSU72Q9NP77 194 aaKnown RBP8.68□□□□□ -1.02
NANOGP9-201ENST00000439890 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa8.68□□□□□ -1.02
NANOGP9-201ENST00000439890 DISP1Q96F81 1524 aa8.68□□□□□ -1.02
NANOGP9-201ENST00000439890 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP8.68□□□□□ -1.02
NANOGP9-201ENST00000439890 PATL2C9JE40 543 aaKnown RBP8.67□□□□□ -1.02
NANOGP9-201ENST00000439890 FBXO24O75426 580 aa8.67□□□□□ -1.02
NANOGP9-201ENST00000439890 HCLS1P14317 486 aaPredicted RBP8.67□□□□□ -1.02
NANOGP9-201ENST00000439890 ARNTP27540 789 aa8.67□□□□□ -1.02
NANOGP9-201ENST00000439890 MSMPQ1L6U9 139 aa8.67□□□□□ -1.02
NANOGP9-201ENST00000439890 KIF4BQ2VIQ3 1234 aa8.67□□□□□ -1.02
NANOGP9-201ENST00000439890 VSIG10LQ86VR7 867 aa8.67□□□□□ -1.02
NANOGP9-201ENST00000439890 SMYD4Q8IYR2 804 aaPredicted RBP8.67□□□□□ -1.02
NANOGP9-201ENST00000439890 SYNGAP1Q96PV0 1343 aa8.67□□□□□ -1.02
NANOGP9-201ENST00000439890 GSX1Q9H4S2 264 aaPredicted RBP8.67□□□□□ -1.02
NANOGP9-201ENST00000439890 SPG7Q9UQ90 795 aa8.67□□□□□ -1.02
NANOGP9-201ENST00000439890 CFAP43Q8NDM7 1665 aa8.66□□□□□ -1.02
NANOGP9-201ENST00000439890 TIAM1Q13009 1591 aa8.66□□□□□ -1.02
NANOGP9-201ENST00000439890 NME2P22392 152 aa8.66□□□□□ -1.02
NANOGP9-201ENST00000439890 CDK5R2Q13319 367 aa8.66□□□□□ -1.02
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NANOGP9-201ENST00000439890 STK35Q8TDR2 534 aa8.66□□□□□ -1.02
NANOGP9-201ENST00000439890 GATA6Q92908 595 aa8.66□□□□□ -1.02
NANOGP9-201ENST00000439890 PCGF6Q9BYE7 350 aa8.66□□□□□ -1.02
NANOGP9-201ENST00000439890 CEP44Q9C0F1 390 aa8.66□□□□□ -1.02
NANOGP9-201ENST00000439890 SRCIN1Q9C0H9 1055 aa8.66□□□□□ -1.02
NANOGP9-201ENST00000439890 PICK1Q9NRD5 415 aa8.66□□□□□ -1.02
NANOGP9-201ENST00000439890 WWC3Q9ULE0 1092 aa8.66□□□□□ -1.02
NANOGP9-201ENST00000439890 SAMM50Q9Y512 469 aa8.66□□□□□ -1.02
NANOGP9-201ENST00000439890 SHROOM2Q13796 1616 aa8.65□□□□□ -1.02
NANOGP9-201ENST00000439890 CYP27C1Q4G0S4 372 aa8.65□□□□□ -1.02
NANOGP9-201ENST00000439890 TP53INP2Q8IXH6 220 aa8.65□□□□□ -1.02
NANOGP9-201ENST00000439890 C1GALT1Q9NS00 363 aa8.65□□□□□ -1.02
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