RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428120.5

FAAP20-209, Transcript of FA core complex associated protein 20, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene FAAP20, Length 2,313 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAAP20-209ENST00000428120 HOXA10P31260 410 aaPredicted RBP27.11■■□□□ 1.93
FAAP20-209ENST00000428120 CTR9Q6PD62 1173 aa27.11■■□□□ 1.93
FAAP20-209ENST00000428120 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP27.11■■□□□ 1.93
FAAP20-209ENST00000428120 ANAPC4Q9UJX5 808 aa27.11■■□□□ 1.93
FAAP20-209ENST00000428120 CCDC88AQ3V6T2 1871 aa27.1■■□□□ 1.93
FAAP20-209ENST00000428120 BBOX1O75936 387 aa27.1■■□□□ 1.93
FAAP20-209ENST00000428120 LDHBP07195 334 aaKnown RBP27.1■■□□□ 1.93
FAAP20-209ENST00000428120 SART3Q15020 963 aaKnown RBP27.1■■□□□ 1.93
FAAP20-209ENST00000428120 WDR66Q8TBY9 1149 aa27.1■■□□□ 1.93
FAAP20-209ENST00000428120 CRNKL1Q9BZJ0 848 aaKnown RBP27.1■■□□□ 1.93
FAAP20-209ENST00000428120 GOLGA6L4A6NEF3 574 aa27.1■■□□□ 1.93
FAAP20-209ENST00000428120 WTAPQ15007 396 aa27.1■■□□□ 1.93
FAAP20-209ENST00000428120 DIXDC1Q155Q3 683 aa27.1■■□□□ 1.93
FAAP20-209ENST00000428120 SLC4A8Q2Y0W8 1093 aa27.1■■□□□ 1.93
FAAP20-209ENST00000428120 SPTY2D1Q68D10 685 aaPredicted RBP27.1■■□□□ 1.93
FAAP20-209ENST00000428120 FAM217BQ9NTX9 383 aaPredicted RBP27.1■■□□□ 1.93
FAAP20-209ENST00000428120 LIG1P18858 919 aa27.09■■□□□ 1.93
FAAP20-209ENST00000428120 RNF214Q8ND24 703 aa27.09■■□□□ 1.93
FAAP20-209ENST00000428120 DCP1AQ9NPI6 582 aaPredicted RBP27.09■■□□□ 1.93
FAAP20-209ENST00000428120 POLLQ9UGP5 575 aa27.09■■□□□ 1.93
FAAP20-209ENST00000428120 ERICH2A1L162 156 aa27.08■■□□□ 1.93
FAAP20-209ENST00000428120 NLGN1Q8N2Q7 840 aa27.08■■□□□ 1.93
FAAP20-209ENST00000428120 FBXO18Q8NFZ0 1043 aa27.08■■□□□ 1.93
FAAP20-209ENST00000428120 UBAC1Q9BSL1 405 aa27.08■■□□□ 1.93
FAAP20-209ENST00000428120 CFAP45Q9UL16 551 aa27.08■■□□□ 1.93
FAAP20-209ENST00000428120 ATP2B4P23634 1241 aa27.08■■□□□ 1.93
FAAP20-209ENST00000428120 MSL1Q68DK7 614 aa27.08■■□□□ 1.93
FAAP20-209ENST00000428120 ESR2Q92731 530 aa27.08■■□□□ 1.93
FAAP20-209ENST00000428120 PGBD1Q96JS3 809 aa27.08■■□□□ 1.93
FAAP20-209ENST00000428120 CD209Q9NNX6 404 aa27.08■■□□□ 1.93
FAAP20-209ENST00000428120 MYH2Q9UKX2 1941 aa27.07■■□□□ 1.92
FAAP20-209ENST00000428120 KLRG2A4D1S0 409 aaPredicted RBP27.07■■□□□ 1.92
FAAP20-209ENST00000428120 CRAMP1Q96RY5 1269 aa27.07■■□□□ 1.92
FAAP20-209ENST00000428120 TSPY26PQ9H489 355 aa27.07■■□□□ 1.92
FAAP20-209ENST00000428120 MAST2Q6P0Q8 1798 aa27.07■■□□□ 1.92
FAAP20-209ENST00000428120 UBE2Q2LH0YL09 131 aa27.07■■□□□ 1.92
FAAP20-209ENST00000428120 RANBP6O60518 1105 aaKnown RBP27.07■■□□□ 1.92
FAAP20-209ENST00000428120 NTRK3Q16288 839 aa27.07■■□□□ 1.92
FAAP20-209ENST00000428120 C15orf52Q6ZUT6 534 aaKnown RBP27.07■■□□□ 1.92
FAAP20-209ENST00000428120 TBC1D16Q8TBP0 767 aa27.07■■□□□ 1.92
FAAP20-209ENST00000428120 USP28Q96RU2 1077 aa27.07■■□□□ 1.92
FAAP20-209ENST00000428120 C6orf229H3BNL8 230 aa27.06■■□□□ 1.92
FAAP20-209ENST00000428120 CDKL5O76039 1030 aa27.06■■□□□ 1.92
FAAP20-209ENST00000428120 CYP2D6P10635 497 aa27.06■■□□□ 1.92
FAAP20-209ENST00000428120 CPLX2Q6PUV4 134 aaKnown RBP27.06■■□□□ 1.92
FAAP20-209ENST00000428120 SYNE3Q6ZMZ3 975 aa27.06■■□□□ 1.92
FAAP20-209ENST00000428120 MYH15Q9Y2K3 1946 aa27.06■■□□□ 1.92
FAAP20-209ENST00000428120 POLR3DP05423 398 aaPredicted RBP27.06■■□□□ 1.92
FAAP20-209ENST00000428120 GIMAP6Q6P9H5 292 aa27.06■■□□□ 1.92
FAAP20-209ENST00000428120 ALG1Q9BT22 464 aa27.06■■□□□ 1.92
FAAP20-209ENST00000428120 TNKSO95271 1327 aa27.05■■□□□ 1.92
FAAP20-209ENST00000428120 ANKRD31Q8N7Z5 1873 aa27.05■■□□□ 1.92
FAAP20-209ENST00000428120 PPEF1O14829 653 aaPredicted RBP27.05■■□□□ 1.92
FAAP20-209ENST00000428120 MMP10P09238 476 aa27.05■■□□□ 1.92
FAAP20-209ENST00000428120 OLFM4Q6UX06 510 aa27.05■■□□□ 1.92
FAAP20-209ENST00000428120 IARSP41252 1262 aaKnown RBP27.04■■□□□ 1.92
FAAP20-209ENST00000428120 CMTR1Q8N1G2 835 aaKnown RBP27.04■■□□□ 1.92
FAAP20-209ENST00000428120 NUP133Q8WUM0 1156 aa27.04■■□□□ 1.92
FAAP20-209ENST00000428120 DUOX1Q9NRD9 1551 aa27.04■■□□□ 1.92
FAAP20-209ENST00000428120 HMGB2P26583 209 aaKnown RBP27.04■■□□□ 1.92
FAAP20-209ENST00000428120 CCDC82Q8N4S0 544 aa27.04■■□□□ 1.92
FAAP20-209ENST00000428120 BICD2Q8TD16 824 aa27.04■■□□□ 1.92
FAAP20-209ENST00000428120 ATP8A2Q9NTI2 1148 aa27.04■■□□□ 1.92
FAAP20-209ENST00000428120 PODXL2Q9NZ53 605 aa27.04■■□□□ 1.92
FAAP20-209ENST00000428120 SH3RF3Q8TEJ3 882 aaPredicted RBP27.03■■□□□ 1.92
FAAP20-209ENST00000428120 SLC26A6Q9BXS9 759 aa27.03■■□□□ 1.92
FAAP20-209ENST00000428120 MCM9Q9NXL9 1143 aa27.03■■□□□ 1.92
FAAP20-209ENST00000428120 KIF28PB7ZC32 967 aa27.02■■□□□ 1.92
FAAP20-209ENST00000428120 ZBTB22O15209 634 aa27.02■■□□□ 1.92
FAAP20-209ENST00000428120 CAMK4Q16566 473 aa27.02■■□□□ 1.92
FAAP20-209ENST00000428120 ZNF654Q8IZM8 581 aa27.02■■□□□ 1.92
FAAP20-209ENST00000428120 ENAHQ8N8S7 591 aaPredicted RBP27.02■■□□□ 1.92
FAAP20-209ENST00000428120 ZNF396Q96N95 335 aaPredicted RBP27.02■■□□□ 1.92
FAAP20-209ENST00000428120 RTN4Q9NQC3 1192 aaKnown RBP27.02■■□□□ 1.92
FAAP20-209ENST00000428120 DACT1Q9NYF0 836 aa27.02■■□□□ 1.92
FAAP20-209ENST00000428120 USP17L8P0C7I0 530 aa27.02■■□□□ 1.92
FAAP20-209ENST00000428120 SEC23AQ15436 765 aa27.02■■□□□ 1.92
FAAP20-209ENST00000428120 RTN1Q16799 776 aa27.02■■□□□ 1.92
FAAP20-209ENST00000428120 SRGNP10124 158 aa27.01■■□□□ 1.91
FAAP20-209ENST00000428120 ZSCAN10Q96SZ4 725 aaPredicted RBP27.01■■□□□ 1.91
FAAP20-209ENST00000428120 RIMBP2O15034 1052 aa27.01■■□□□ 1.91
FAAP20-209ENST00000428120 IL1R1P14778 569 aa27.01■■□□□ 1.91
FAAP20-209ENST00000428120 KIF23Q02241 960 aaPredicted RBP27■■□□□ 1.91
FAAP20-209ENST00000428120 TMTC2Q8N394 836 aa27■■□□□ 1.91
FAAP20-209ENST00000428120 RCOR1Q9UKL0 485 aa27■■□□□ 1.91
FAAP20-209ENST00000428120 LETM1O95202 739 aaPredicted RBP27■■□□□ 1.91
FAAP20-209ENST00000428120 USP5P45974 858 aa27■■□□□ 1.91
FAAP20-209ENST00000428120 FAM47AQ5JRC9 791 aa27■■□□□ 1.91
FAAP20-209ENST00000428120 SP8Q8IXZ3 490 aa27■■□□□ 1.91
FAAP20-209ENST00000428120 ANP32BQ92688 251 aaKnown RBP27■■□□□ 1.91
FAAP20-209ENST00000428120 MTA3Q9BTC8 594 aa27■■□□□ 1.91
FAAP20-209ENST00000428120 ARPP21Q9UBL0 812 aaPredicted RBP27■■□□□ 1.91
FAAP20-209ENST00000428120 PARP3Q9Y6F1 533 aa27■■□□□ 1.91
FAAP20-209ENST00000428120 NR1I2O75469 434 aa26.99■■□□□ 1.91
FAAP20-209ENST00000428120 FGRP09769 529 aa26.99■■□□□ 1.91
FAAP20-209ENST00000428120 SSRP1Q08945 709 aaKnown RBP26.99■■□□□ 1.91
FAAP20-209ENST00000428120 KRT40Q6A162 431 aa26.99■■□□□ 1.91
FAAP20-209ENST00000428120 DDX52Q9Y2R4 599 aaKnown RBP eCLIP26.99■■□□□ 1.911e-7■■□□□ 11.9
FAAP20-209ENST00000428120 ECM29Q5VYK3 1845 aa26.99■■□□□ 1.91
FAAP20-209ENST00000428120 NMT2O60551 498 aa26.99■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 43.8 ms