RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000417536.5

SH3BP1-202, Transcript of SH3 domain binding protein 1, humanhuman

TSL 2

Gene SH3BP1, Length 2,858 nt, Biotype nonsense mediated decay.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1-202ENST00000417536 SLC39A14Q15043 492 aa21.59■■□□□ 1.05
SH3BP1-202ENST00000417536 VPS37DQ86XT2 251 aa21.59■■□□□ 1.05
SH3BP1-202ENST00000417536 KIF18AQ8NI77 898 aa21.59■■□□□ 1.05
SH3BP1-202ENST00000417536 CCNL1Q9UK58 526 aaPredicted RBP21.59■■□□□ 1.05
SH3BP1-202ENST00000417536 RIC1Q4ADV7 1423 aa21.59■■□□□ 1.05
SH3BP1-202ENST00000417536 BTAF1O14981 1849 aa21.59■■□□□ 1.05
SH3BP1-202ENST00000417536 ZMYM6O95789 1325 aa21.58■■□□□ 1.05
SH3BP1-202ENST00000417536 MICU3Q86XE3 530 aa21.58■■□□□ 1.05
SH3BP1-202ENST00000417536 RIPOR2Q9Y4F9 1068 aa21.58■■□□□ 1.05
SH3BP1-202ENST00000417536 MYH7P12883 1935 aa21.58■■□□□ 1.05
SH3BP1-202ENST00000417536 SYKP43405 635 aa21.58■■□□□ 1.05
SH3BP1-202ENST00000417536 E4F1Q66K89 784 aaPredicted RBP21.58■■□□□ 1.05
SH3BP1-202ENST00000417536 KRT40Q6A162 431 aa21.58■■□□□ 1.05
SH3BP1-202ENST00000417536 SLC51AQ86UW1 340 aa21.58■■□□□ 1.05
SH3BP1-202ENST00000417536 SMARCC1Q92922 1105 aaPredicted RBP21.58■■□□□ 1.05
SH3BP1-202ENST00000417536 COL4A1P02462 1669 aa21.58■■□□□ 1.04
SH3BP1-202ENST00000417536 MYH3P11055 1940 aa21.58■■□□□ 1.04
SH3BP1-202ENST00000417536 ANKRD18BA2A2Z9 1011 aa21.58■■□□□ 1.04
SH3BP1-202ENST00000417536 B4E1Z4 1266 aa21.58■■□□□ 1.04
SH3BP1-202ENST00000417536 ERVV-1B6SEH8 477 aa21.58■■□□□ 1.04
SH3BP1-202ENST00000417536 SFPQP23246 707 aaKnown RBP eCLIP21.58■■□□□ 1.04
SH3BP1-202ENST00000417536 CDC27P30260 824 aa21.58■■□□□ 1.04
SH3BP1-202ENST00000417536 PLA2G12BQ9BX93 195 aa21.58■■□□□ 1.04
SH3BP1-202ENST00000417536 WDR19Q8NEZ3 1342 aa21.57■■□□□ 1.04
SH3BP1-202ENST00000417536 UTP14CQ5TAP6 766 aaKnown RBP21.57■■□□□ 1.04
SH3BP1-202ENST00000417536 QTRT2Q9H974 415 aaKnown RBP21.57■■□□□ 1.04
SH3BP1-202ENST00000417536 PIH1D3Q9NQM4 214 aaKnown RBP21.57■■□□□ 1.04
SH3BP1-202ENST00000417536 C4AP0C0L4 1744 aa21.57■■□□□ 1.04
SH3BP1-202ENST00000417536 C4BP0C0L5 1744 aa21.57■■□□□ 1.04
SH3BP1-202ENST00000417536 PDE8AO60658 829 aa21.57■■□□□ 1.04
SH3BP1-202ENST00000417536 ATP1A3P13637 1013 aa21.57■■□□□ 1.04
SH3BP1-202ENST00000417536 CCDC150Q8NCX0 1101 aa21.57■■□□□ 1.04
SH3BP1-202ENST00000417536 UTP14AQ9BVJ6 771 aaKnown RBP21.57■■□□□ 1.04
SH3BP1-202ENST00000417536 OGFRQ9NZT2 677 aa21.57■■□□□ 1.04
SH3BP1-202ENST00000417536 ABCC12Q96J65 1359 aa21.56■■□□□ 1.04
SH3BP1-202ENST00000417536 SH2B2O14492 632 aaPredicted RBP21.56■■□□□ 1.04
SH3BP1-202ENST00000417536 APOA5Q6Q788 366 aa21.56■■□□□ 1.04
SH3BP1-202ENST00000417536 DDX60Q8IY21 1712 aaKnown RBP21.56■■□□□ 1.04
SH3BP1-202ENST00000417536 MYL10Q9BUA6 226 aa21.56■■□□□ 1.04
SH3BP1-202ENST00000417536 INCENPQ9NQS7 918 aa21.56■■□□□ 1.04
SH3BP1-202ENST00000417536 ZNF532Q9HCE3 1301 aa21.55■■□□□ 1.04
SH3BP1-202ENST00000417536 FANCCQ00597 558 aa21.55■■□□□ 1.04
SH3BP1-202ENST00000417536 ERFEQ4G0M1 354 aa21.55■■□□□ 1.04
SH3BP1-202ENST00000417536 TBC1D9BQ66K14 1250 aa21.55■■□□□ 1.04
SH3BP1-202ENST00000417536 SHC4Q6S5L8 630 aa21.55■■□□□ 1.04
SH3BP1-202ENST00000417536 PPP1R13BQ96KQ4 1090 aa21.55■■□□□ 1.04
SH3BP1-202ENST00000417536 CLIC6Q96NY7 704 aa21.55■■□□□ 1.04
SH3BP1-202ENST00000417536 KCND1Q9NSA2 647 aa21.55■■□□□ 1.04
SH3BP1-202ENST00000417536 NFXL1Q6ZNB6 911 aa21.55■■□□□ 1.04
SH3BP1-202ENST00000417536 CDHR2Q9BYE9 1310 aa21.55■■□□□ 1.04
SH3BP1-202ENST00000417536 AKAP11Q9UKA4 1901 aa21.55■■□□□ 1.04
SH3BP1-202ENST00000417536 IGSF3O75054 1194 aa21.54■■□□□ 1.04
SH3BP1-202ENST00000417536 PNOCQ13519 176 aa21.54■■□□□ 1.04
SH3BP1-202ENST00000417536 UBE2Q2LH0YL09 131 aa21.54■■□□□ 1.04
SH3BP1-202ENST00000417536 CDKL5O76039 1030 aa21.54■■□□□ 1.04
SH3BP1-202ENST00000417536 NTSR2O95665 410 aa21.54■■□□□ 1.04
SH3BP1-202ENST00000417536 ELF2Q15723 593 aa21.54■■□□□ 1.04
SH3BP1-202ENST00000417536 CPLX2Q6PUV4 134 aaKnown RBP21.54■■□□□ 1.04
SH3BP1-202ENST00000417536 NPHP1O15259 732 aa21.54■■□□□ 1.04
SH3BP1-202ENST00000417536 GTPBP4Q9BZE4 634 aaKnown RBP21.54■■□□□ 1.04
SH3BP1-202ENST00000417536 WWC3Q9ULE0 1092 aa21.54■■□□□ 1.04
SH3BP1-202ENST00000417536 IQSEC3Q9UPP2 1182 aaPredicted RBP21.54■■□□□ 1.04
SH3BP1-202ENST00000417536 MYO5AQ9Y4I1 1855 aaKnown RBP21.53■■□□□ 1.04
SH3BP1-202ENST00000417536 PHKA1P46020 1223 aa21.53■■□□□ 1.04
SH3BP1-202ENST00000417536 PTPAQ15257 358 aa21.53■■□□□ 1.04
SH3BP1-202ENST00000417536 ERO1AQ96HE7 468 aa21.53■■□□□ 1.04
SH3BP1-202ENST00000417536 HSD3B7Q9H2F3 369 aa21.53■■□□□ 1.04
SH3BP1-202ENST00000417536 KIF2AO00139 706 aaPredicted RBP21.53■■□□□ 1.04
SH3BP1-202ENST00000417536 ZBTB43O43298 467 aa21.53■■□□□ 1.04
SH3BP1-202ENST00000417536 SLU7O95391 586 aaKnown RBP21.53■■□□□ 1.04
SH3BP1-202ENST00000417536 TTF1Q15361 905 aaPredicted RBP21.53■■□□□ 1.04
SH3BP1-202ENST00000417536 KMT5BQ4FZB7 885 aa21.53■■□□□ 1.04
SH3BP1-202ENST00000417536 SYT10Q6XYQ8 523 aa21.53■■□□□ 1.04
SH3BP1-202ENST00000417536 JMYQ8N9B5 988 aa21.53■■□□□ 1.04
SH3BP1-202ENST00000417536 TIGD1Q96MW7 591 aa21.53■■□□□ 1.04
SH3BP1-202ENST00000417536 DDX41Q9UJV9 622 aaKnown RBP21.53■■□□□ 1.04
SH3BP1-202ENST00000417536 HPSEQ9Y251 543 aa21.53■■□□□ 1.04
SH3BP1-202ENST00000417536 IKBKBO14920 756 aa21.52■■□□□ 1.04
SH3BP1-202ENST00000417536 PDE6AP16499 860 aa21.52■■□□□ 1.04
SH3BP1-202ENST00000417536 GTF2E1P29083 439 aaPredicted RBP21.52■■□□□ 1.04
SH3BP1-202ENST00000417536 IARSP41252 1262 aaKnown RBP21.52■■□□□ 1.04
SH3BP1-202ENST00000417536 LRRC4BQ9NT99 713 aa21.52■■□□□ 1.04
SH3BP1-202ENST00000417536 TUBE1Q9UJT0 475 aa21.52■■□□□ 1.04
SH3BP1-202ENST00000417536 COL5A3P25940 1745 aaPredicted RBP21.52■■□□□ 1.04
SH3BP1-202ENST00000417536 GOLGA8AA7E2F4 631 aa21.52■■□□□ 1.04
SH3BP1-202ENST00000417536 RANBP6O60518 1105 aaKnown RBP21.52■■□□□ 1.04
SH3BP1-202ENST00000417536 PPP6R2O75170 966 aa21.52■■□□□ 1.04
SH3BP1-202ENST00000417536 DPF2Q92785 391 aa21.52■■□□□ 1.04
SH3BP1-202ENST00000417536 UTRNP46939 3433 aa21.51■■□□□ 1.03
SH3BP1-202ENST00000417536 TRIM29Q14134 588 aa21.51■■□□□ 1.03
SH3BP1-202ENST00000417536 UBE3CQ15386 1083 aa21.51■■□□□ 1.03
SH3BP1-202ENST00000417536 CCDC102BQ68D86 513 aa21.51■■□□□ 1.03
SH3BP1-202ENST00000417536 ZNF397Q8NF99 534 aaPredicted RBP21.51■■□□□ 1.03
SH3BP1-202ENST00000417536 MAP3K14Q99558 947 aa21.51■■□□□ 1.03
SH3BP1-202ENST00000417536 NRDCO43847 1150 aa21.51■■□□□ 1.03
SH3BP1-202ENST00000417536 TRIM37O94972 964 aa21.51■■□□□ 1.03
SH3BP1-202ENST00000417536 SERPINC1P01008 464 aa21.51■■□□□ 1.03
SH3BP1-202ENST00000417536 PTPN21Q16825 1174 aa21.51■■□□□ 1.03
SH3BP1-202ENST00000417536 TMEM67Q5HYA8 995 aa21.51■■□□□ 1.03
SH3BP1-202ENST00000417536 VGLL2Q8N8G2 317 aa21.51■■□□□ 1.03
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