RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000411827.1

CDC42-204, Transcript of cell division cycle 42, humanhuman

TSL 3

Gene CDC42, Length 597 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC42-204ENST00000411827 NBPF9Q3BBW0 867 aa22.23■■□□□ 1.15
CDC42-204ENST00000411827 TTC6Q86TZ1 520 aa22.23■■□□□ 1.15
CDC42-204ENST00000411827 TAF1DQ9H5J8 278 aaPredicted RBP22.23■■□□□ 1.15
CDC42-204ENST00000411827 PPP2R3BQ9Y5P8 575 aa22.23■■□□□ 1.15
CDC42-204ENST00000411827 CEP350Q5VT06 3117 aa22.23■■□□□ 1.15
CDC42-204ENST00000411827 PRKAB2O43741 272 aa22.22■■□□□ 1.15
CDC42-204ENST00000411827 C1QTNF8P60827 252 aa22.22■■□□□ 1.15
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CDC42-204ENST00000411827 VPS53Q5VIR6 699 aa22.22■■□□□ 1.15
CDC42-204ENST00000411827 SDR42E1Q8WUS8 393 aa22.22■■□□□ 1.15
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CDC42-204ENST00000411827 HOOK2Q96ED9 719 aa22.22■■□□□ 1.15
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CDC42-204ENST00000411827 MCM9Q9NXL9 1143 aa22.21■■□□□ 1.15
CDC42-204ENST00000411827 ANAPC4Q9UJX5 808 aa22.21■■□□□ 1.15
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CDC42-204ENST00000411827 KRT32Q14532 448 aa22.2■■□□□ 1.14
CDC42-204ENST00000411827 TRPM4Q8TD43 1214 aa22.2■■□□□ 1.14
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CDC42-204ENST00000411827 USP17L12C9JPN9 530 aa22.19■■□□□ 1.14
CDC42-204ENST00000411827 USP17L21D6R901 530 aa22.19■■□□□ 1.14
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CDC42-204ENST00000411827 POLR3DP05423 398 aaPredicted RBP22.19■■□□□ 1.14
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CDC42-204ENST00000411827 FAM198AQ9UFP1 575 aa22.19■■□□□ 1.14
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CDC42-204ENST00000411827 C12orf60Q5U649 245 aa22.18■■□□□ 1.14
CDC42-204ENST00000411827 CTR9Q6PD62 1173 aa22.18■■□□□ 1.14
CDC42-204ENST00000411827 FOXP4Q8IVH2 680 aaPredicted RBP22.18■■□□□ 1.14
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CDC42-204ENST00000411827 EHD4Q9H223 541 aa22.18■■□□□ 1.14
CDC42-204ENST00000411827 PI4KBQ9UBF8 816 aa22.18■■□□□ 1.14
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CDC42-204ENST00000411827 C22orf23Q9BZE7 217 aa22.17■■□□□ 1.14
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CDC42-204ENST00000411827 CREB3L3Q68CJ9 461 aa22.16■■□□□ 1.14
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CDC42-204ENST00000411827 CNNM2Q9H8M5 875 aa22.16■■□□□ 1.14
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CDC42-204ENST00000411827 SLC27A2O14975 620 aa22.15■■□□□ 1.14
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CDC42-204ENST00000411827 DEFB129Q9H1M3 183 aa22.15■■□□□ 1.14
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CDC42-204ENST00000411827 SUPT20HL1Q3ZLR7 823 aa22.14■■□□□ 1.13
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CDC42-204ENST00000411827 TBC1D12O60347 775 aa22.13■■□□□ 1.13
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CDC42-204ENST00000411827 PALD1Q9ULE6 856 aa22.13■■□□□ 1.13
CDC42-204ENST00000411827 FGRP09769 529 aa22.12■■□□□ 1.13
CDC42-204ENST00000411827 MFSD6Q6ZSS7 791 aa22.12■■□□□ 1.13
CDC42-204ENST00000411827 STAG1Q8WVM7 1258 aa22.12■■□□□ 1.13
CDC42-204ENST00000411827 CSRNP1Q96S65 589 aa22.12■■□□□ 1.13
CDC42-204ENST00000411827 TM6SF1Q9BZW5 370 aa22.12■■□□□ 1.13
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