RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000411651.6

SUMO3-204, Transcript of small ubiquitin-like modifier 3, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene SUMO3, Length 1,921 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUMO3-204ENST00000411651 FAM217BQ9NTX9 383 aaPredicted RBP23.49■■□□□ 1.35
SUMO3-204ENST00000411651 CDC27P30260 824 aa23.49■■□□□ 1.35
SUMO3-204ENST00000411651 IARSP41252 1262 aaKnown RBP23.49■■□□□ 1.35
SUMO3-204ENST00000411651 MICU3Q86XE3 530 aa23.49■■□□□ 1.35
SUMO3-204ENST00000411651 CCDC39Q9UFE4 941 aa23.49■■□□□ 1.35
SUMO3-204ENST00000411651 CCDC88AQ3V6T2 1871 aa23.48■■□□□ 1.35
SUMO3-204ENST00000411651 NR1I2O75469 434 aa23.48■■□□□ 1.35
SUMO3-204ENST00000411651 GUCY1B3Q02153 619 aa23.48■■□□□ 1.35
SUMO3-204ENST00000411651 CRY2Q49AN0 593 aa23.48■■□□□ 1.35
SUMO3-204ENST00000411651 ADALQ6DHV7 355 aa23.48■■□□□ 1.35
SUMO3-204ENST00000411651 LINC00301Q8NCQ3 95 aa23.48■■□□□ 1.35
SUMO3-204ENST00000411651 FAM200AQ8TCP9 573 aa23.48■■□□□ 1.35
SUMO3-204ENST00000411651 ZNF384Q8TF68 577 aa23.48■■□□□ 1.35
SUMO3-204ENST00000411651 ALG1Q9BT22 464 aa23.48■■□□□ 1.35
SUMO3-204ENST00000411651 XDHP47989 1333 aa23.47■■□□□ 1.35
SUMO3-204ENST00000411651 WTIPA6NIX2 430 aaPredicted RBP23.47■■□□□ 1.35
SUMO3-204ENST00000411651 NPHP1O15259 732 aa23.47■■□□□ 1.35
SUMO3-204ENST00000411651 SENP2Q9HC62 589 aa23.47■■□□□ 1.35
SUMO3-204ENST00000411651 NOL7Q9UMY1 257 aaKnown RBP23.47■■□□□ 1.35
SUMO3-204ENST00000411651 RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 228 aaKnown RBP23.47■■□□□ 1.35
SUMO3-204ENST00000411651 FMNL1O95466 1100 aaPredicted RBP23.47■■□□□ 1.35
SUMO3-204ENST00000411651 FOSBP53539 338 aa23.47■■□□□ 1.35
SUMO3-204ENST00000411651 TYRO3Q06418 890 aa23.47■■□□□ 1.35
SUMO3-204ENST00000411651 CCDC73Q6ZRK6 1079 aa23.47■■□□□ 1.35
SUMO3-204ENST00000411651 SDR42E1Q8WUS8 393 aa23.47■■□□□ 1.35
SUMO3-204ENST00000411651 ATP8A2Q9NTI2 1148 aa23.47■■□□□ 1.35
SUMO3-204ENST00000411651 KLRK1P26718 216 aa23.46■■□□□ 1.35
SUMO3-204ENST00000411651 MECOMQ03112 1051 aa23.46■■□□□ 1.35
SUMO3-204ENST00000411651 FAM160A1Q05DH4 1040 aa23.46■■□□□ 1.35
SUMO3-204ENST00000411651 ECM29Q5VYK3 1845 aa23.46■■□□□ 1.35
SUMO3-204ENST00000411651 SSRP1Q08945 709 aaKnown RBP23.45■■□□□ 1.35
SUMO3-204ENST00000411651 PRR5LQ6MZQ0 368 aa23.45■■□□□ 1.35
SUMO3-204ENST00000411651 CCAR1Q8IX12 1150 aaKnown RBP23.45■■□□□ 1.35
SUMO3-204ENST00000411651 ENGASEQ8NFI3 743 aa23.45■■□□□ 1.35
SUMO3-204ENST00000411651 WDR66Q8TBY9 1149 aa23.45■■□□□ 1.35
SUMO3-204ENST00000411651 UBAC1Q9BSL1 405 aa23.45■■□□□ 1.35
SUMO3-204ENST00000411651 CRNKL1Q9BZJ0 848 aaKnown RBP23.45■■□□□ 1.35
SUMO3-204ENST00000411651 LAMB1P07942 1786 aa23.45■■□□□ 1.34
SUMO3-204ENST00000411651 U2AF2P26368 475 aaKnown RBP eCLIP23.45■■□□□ 1.34
SUMO3-204ENST00000411651 SEC23AQ15436 765 aa23.45■■□□□ 1.34
SUMO3-204ENST00000411651 RTN1Q16799 776 aa23.45■■□□□ 1.34
SUMO3-204ENST00000411651 TPRNQ4KMQ1 711 aa23.45■■□□□ 1.34
SUMO3-204ENST00000411651 SBK1Q52WX2 424 aa23.45■■□□□ 1.34
SUMO3-204ENST00000411651 INCENPQ9NQS7 918 aa23.45■■□□□ 1.34
SUMO3-204ENST00000411651 MRVI1Q9Y6F6 885 aa23.45■■□□□ 1.34
SUMO3-204ENST00000411651 DLEC1Q9Y238 1755 aa23.44■■□□□ 1.34
SUMO3-204ENST00000411651 RANBP6O60518 1105 aaKnown RBP23.44■■□□□ 1.34
SUMO3-204ENST00000411651 GYS1P13807 737 aa23.44■■□□□ 1.34
SUMO3-204ENST00000411651 TRIM29Q14134 588 aa23.44■■□□□ 1.34
SUMO3-204ENST00000411651 KRT40Q6A162 431 aa23.44■■□□□ 1.34
SUMO3-204ENST00000411651 RAB11FIP4Q86YS3 637 aa23.44■■□□□ 1.34
SUMO3-204ENST00000411651 QTRT2Q9H974 415 aaKnown RBP23.44■■□□□ 1.34
SUMO3-204ENST00000411651 ORC4O43929 436 aa23.43■■□□□ 1.34
SUMO3-204ENST00000411651 ME1P48163 572 aa23.43■■□□□ 1.34
SUMO3-204ENST00000411651 ST5P78524 1137 aa23.43■■□□□ 1.34
SUMO3-204ENST00000411651 SNW1Q13573 536 aaKnown RBP23.43■■□□□ 1.34
SUMO3-204ENST00000411651 TRIM22Q8IYM9 498 aa23.43■■□□□ 1.34
SUMO3-204ENST00000411651 MRPS27Q92552 414 aaKnown RBP23.43■■□□□ 1.34
SUMO3-204ENST00000411651 FTOQ9C0B1 505 aaKnown RBP eCLIP23.43■■□□□ 1.341e-10■□□□□ 10.5
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SUMO3-204ENST00000411651 CEBPZQ03701 1054 aaKnown RBP23.43■■□□□ 1.34
SUMO3-204ENST00000411651 STK38Q15208 465 aa23.43■■□□□ 1.34
SUMO3-204ENST00000411651 RRP12Q5JTH9 1297 aaKnown RBP23.43■■□□□ 1.34
SUMO3-204ENST00000411651 OTUD7BQ6GQQ9 843 aa23.43■■□□□ 1.34
SUMO3-204ENST00000411651 CERS3Q8IU89 383 aa23.43■■□□□ 1.34
SUMO3-204ENST00000411651 TDRD7Q8NHU6 1098 aaKnown RBP23.43■■□□□ 1.34
SUMO3-204ENST00000411651 TOMM22Q9NS69 142 aa23.43■■□□□ 1.34
SUMO3-204ENST00000411651 TFCP2L1Q9NZI6 479 aa23.43■■□□□ 1.34
SUMO3-204ENST00000411651 PCDHA7Q9UN72 937 aa23.43■■□□□ 1.34
SUMO3-204ENST00000411651 MINDY4BA8MYZ0 360 aa23.42■■□□□ 1.34
SUMO3-204ENST00000411651 PPFIA3O75145 1194 aa23.42■■□□□ 1.34
SUMO3-204ENST00000411651 DYNLL1P63167 89 aaKnown RBP23.42■■□□□ 1.34
SUMO3-204ENST00000411651 CAMK4Q16566 473 aa23.42■■□□□ 1.34
SUMO3-204ENST00000411651 ANO1Q5XXA6 986 aa23.42■■□□□ 1.34
SUMO3-204ENST00000411651 CTR9Q6PD62 1173 aa23.42■■□□□ 1.34
SUMO3-204ENST00000411651 SASS6Q6UVJ0 657 aa23.42■■□□□ 1.34
SUMO3-204ENST00000411651 ZNF654Q8IZM8 581 aa23.42■■□□□ 1.34
SUMO3-204ENST00000411651 KIF28PB7ZC32 967 aa23.41■■□□□ 1.34
SUMO3-204ENST00000411651 SPTLC2O15270 562 aa23.41■■□□□ 1.34
SUMO3-204ENST00000411651 KINO60870 393 aaKnown RBP23.41■■□□□ 1.34
SUMO3-204ENST00000411651 MSNP26038 577 aaKnown RBP23.41■■□□□ 1.34
SUMO3-204ENST00000411651 ZNF804AQ7Z570 1209 aa23.41■■□□□ 1.34
SUMO3-204ENST00000411651 DDX52Q9Y2R4 599 aaKnown RBP eCLIP23.41■■□□□ 1.34
SUMO3-204ENST00000411651 TNKSO95271 1327 aa23.41■■□□□ 1.34
SUMO3-204ENST00000411651 DEXIO95424 95 aa23.41■■□□□ 1.34
SUMO3-204ENST00000411651 SLC3A2P08195 630 aaKnown RBP23.41■■□□□ 1.34
SUMO3-204ENST00000411651 CALM1P0DP23 149 aa23.41■■□□□ 1.34
SUMO3-204ENST00000411651 CALM2P0DP24 149 aa23.41■■□□□ 1.34
SUMO3-204ENST00000411651 CALM3P0DP25 149 aa23.41■■□□□ 1.34
SUMO3-204ENST00000411651 RXRAP19793 462 aa23.41■■□□□ 1.34
SUMO3-204ENST00000411651 HOXA10P31260 410 aaPredicted RBP23.41■■□□□ 1.34
SUMO3-204ENST00000411651 IQCA1Q86XH1 822 aa23.41■■□□□ 1.34
SUMO3-204ENST00000411651 FANCBQ8NB91 859 aa23.41■■□□□ 1.34
SUMO3-204ENST00000411651 RPGRQ92834 1020 aaKnown RBP23.41■■□□□ 1.34
SUMO3-204ENST00000411651 PHKBQ93100 1093 aa23.41■■□□□ 1.34
SUMO3-204ENST00000411651 ANKIB1Q9P2G1 1089 aa23.41■■□□□ 1.34
SUMO3-204ENST00000411651 USP25Q9UHP3 1055 aa23.41■■□□□ 1.34
SUMO3-204ENST00000411651 ZKSCAN5Q9Y2L8 839 aa23.41■■□□□ 1.34
SUMO3-204ENST00000411651 PPP6R2O75170 966 aa23.4■■□□□ 1.34
SUMO3-204ENST00000411651 PRDX5P30044 214 aa23.4■■□□□ 1.34
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