RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000395787.3

APIP-201, Transcript of APAF1 interacting protein, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene APIP, Length 1,366 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APIP-201ENST00000395787 ZKSCAN4Q969J2 545 aaPredicted RBP23.35■■□□□ 1.33
APIP-201ENST00000395787 LRRCC1Q9C099 1032 aa23.35■■□□□ 1.33
APIP-201ENST00000395787 WDHD1O75717 1129 aaPredicted RBP23.34■■□□□ 1.33
APIP-201ENST00000395787 MAP3K12Q12852 859 aa23.34■■□□□ 1.33
APIP-201ENST00000395787 OTUD5Q96G74 571 aa23.34■■□□□ 1.33
APIP-201ENST00000395787 PIH1D3Q9NQM4 214 aaKnown RBP23.34■■□□□ 1.33
APIP-201ENST00000395787 TBC1D8O95759 1140 aa23.33■■□□□ 1.33
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APIP-201ENST00000395787 AATFQ9NY61 560 aaKnown RBP eCLIP23.33■■□□□ 1.33
APIP-201ENST00000395787 CYP7A1P22680 504 aa23.32■■□□□ 1.32
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APIP-201ENST00000395787 SH3RF3Q8TEJ3 882 aaPredicted RBP23.31■■□□□ 1.32
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APIP-201ENST00000395787 ZNF112Q9UJU3 913 aa23.29■■□□□ 1.32
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APIP-201ENST00000395787 CCL15Q16663 113 aa23.28■■□□□ 1.32
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APIP-201ENST00000395787 CRBNQ96SW2 442 aa23.27■■□□□ 1.32
APIP-201ENST00000395787 PICK1Q9NRD5 415 aa23.27■■□□□ 1.32
APIP-201ENST00000395787 TESPA1A2RU30 521 aaPredicted RBP23.27■■□□□ 1.31
APIP-201ENST00000395787 IGF2BP3O00425 579 aaKnown RBP eCLIP23.27■■□□□ 1.31
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APIP-201ENST00000395787 TGFBRAP1Q8WUH2 860 aa23.27■■□□□ 1.31
APIP-201ENST00000395787 GPATCH3Q96I76 525 aa23.27■■□□□ 1.31
APIP-201ENST00000395787 XPO5Q9HAV4 1204 aaKnown RBP eCLIP23.27■■□□□ 1.317e-7■■■■■ 34.3
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APIP-201ENST00000395787 TRIM34Q9BYJ4 488 aa23.26■■□□□ 1.31
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APIP-201ENST00000395787 BOLA2Q9H3K6 86 aa23.26■■□□□ 1.31
APIP-201ENST00000395787 ZBTB47Q9UFB7 747 aaPredicted RBP23.26■■□□□ 1.31
APIP-201ENST00000395787 COL2A1P02458 1487 aaPredicted RBP23.25■■□□□ 1.31
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APIP-201ENST00000395787 USP5P45974 858 aa23.25■■□□□ 1.31
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APIP-201ENST00000395787 MAPKAPK5Q8IW41 473 aa23.25■■□□□ 1.31
APIP-201ENST00000395787 PCDHB15Q9Y5E8 787 aa23.25■■□□□ 1.31
APIP-201ENST00000395787 MYH1P12882 1939 aa23.25■■□□□ 1.31
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APIP-201ENST00000395787 HERC5Q9UII4 1024 aaKnown RBP23.22■■□□□ 1.31
APIP-201ENST00000395787 FLT1P17948 1338 aa23.22■■□□□ 1.31
APIP-201ENST00000395787 ATAD5Q96QE3 1844 aa23.21■■□□□ 1.31
APIP-201ENST00000395787 MAGEB6P1A0A0J9YX57 407 aa23.21■■□□□ 1.31
APIP-201ENST00000395787 HLA-DOAP06340 250 aa23.21■■□□□ 1.31
APIP-201ENST00000395787 TAF1CQ15572 869 aaPredicted RBP23.21■■□□□ 1.31
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