RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000384376.1

RNU6-434P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 434, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-434P, Length 107 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-434P-201ENST00000384376 LMNB2Q03252 620 aa5.03□□□□□ -1.6
RNU6-434P-201ENST00000384376 CAMK2GQ13555 558 aaPredicted RBP5.03□□□□□ -1.6
RNU6-434P-201ENST00000384376 LRFN4Q6PJG9 635 aa5.03□□□□□ -1.6
RNU6-434P-201ENST00000384376 HS2ST1Q7LGA3 356 aa5.03□□□□□ -1.6
RNU6-434P-201ENST00000384376 METTL16Q86W50 562 aaKnown RBP5.03□□□□□ -1.6
RNU6-434P-201ENST00000384376 TRIM42Q8IWZ5 723 aa5.03□□□□□ -1.6
RNU6-434P-201ENST00000384376 FBLIM1Q8WUP2 373 aa5.03□□□□□ -1.6
RNU6-434P-201ENST00000384376 EZH1Q92800 747 aaPredicted RBP5.03□□□□□ -1.6
RNU6-434P-201ENST00000384376 ACSBG1Q96GR2 724 aa5.03□□□□□ -1.6
RNU6-434P-201ENST00000384376 METTL5Q9NRN9 209 aaKnown RBP5.03□□□□□ -1.6
RNU6-434P-201ENST00000384376 GGT7Q9UJ14 662 aa5.03□□□□□ -1.6
RNU6-434P-201ENST00000384376 HIF3AQ9Y2N7 669 aa5.03□□□□□ -1.6
RNU6-434P-201ENST00000384376 RAXQ9Y2V3 346 aa5.03□□□□□ -1.6
RNU6-434P-201ENST00000384376 CSADQ9Y600 493 aa5.03□□□□□ -1.6
RNU6-434P-201ENST00000384376 DCDC2CA8MYV0 355 aa5.02□□□□□ -1.61
RNU6-434P-201ENST00000384376 GFRA2O00451 464 aa5.02□□□□□ -1.61
RNU6-434P-201ENST00000384376 GAS2O43903 313 aaKnown RBP5.02□□□□□ -1.61
RNU6-434P-201ENST00000384376 NEFMP07197 916 aa5.02□□□□□ -1.61
RNU6-434P-201ENST00000384376 MAP4P27816 1152 aaKnown RBP5.02□□□□□ -1.61
RNU6-434P-201ENST00000384376 NTF4P34130 210 aa5.02□□□□□ -1.61
RNU6-434P-201ENST00000384376 ERVK-24P63145 666 aa5.02□□□□□ -1.61
RNU6-434P-201ENST00000384376 HDLBPQ00341 1268 aaKnown RBP5.02□□□□□ -1.61
RNU6-434P-201ENST00000384376 FAM160A1Q05DH4 1040 aa5.02□□□□□ -1.61
RNU6-434P-201ENST00000384376 PWP1Q13610 501 aa5.02□□□□□ -1.61
RNU6-434P-201ENST00000384376 PPM1JQ5JR12 505 aa5.02□□□□□ -1.61
RNU6-434P-201ENST00000384376 BNC2Q6ZN30 1099 aaPredicted RBP5.02□□□□□ -1.61
RNU6-434P-201ENST00000384376 C12orf40Q86WS4 652 aa5.02□□□□□ -1.61
RNU6-434P-201ENST00000384376 JARID2Q92833 1246 aaPredicted RBP5.02□□□□□ -1.61
RNU6-434P-201ENST00000384376 MIR1-1HGQ9H1L0 117 aa5.02□□□□□ -1.61
RNU6-434P-201ENST00000384376 ACSS3Q9H6R3 686 aa5.02□□□□□ -1.61
RNU6-434P-201ENST00000384376 KCNQ5Q9NR82 932 aa5.02□□□□□ -1.61
RNU6-434P-201ENST00000384376 KIR2DP1A0A0G2JNF4 349 aaPredicted RBP5.01□□□□□ -1.61
RNU6-434P-201ENST00000384376 HMX2A2RU54 273 aa5.01□□□□□ -1.61
RNU6-434P-201ENST00000384376 FAM221AA4D161 298 aa5.01□□□□□ -1.61
RNU6-434P-201ENST00000384376 F13A1P00488 732 aa5.01□□□□□ -1.61
RNU6-434P-201ENST00000384376 NFICP08651 508 aa5.01□□□□□ -1.61
RNU6-434P-201ENST00000384376 USP11P51784 963 aa5.01□□□□□ -1.61
RNU6-434P-201ENST00000384376 RACK1P63244 317 aaKnown RBP5.01□□□□□ -1.61
RNU6-434P-201ENST00000384376 TTLL4Q14679 1199 aa5.01□□□□□ -1.61
RNU6-434P-201ENST00000384376 C9orf131Q5VYM1 1079 aa5.01□□□□□ -1.61
RNU6-434P-201ENST00000384376 FBXL19Q6PCT2 694 aa5.01□□□□□ -1.61
RNU6-434P-201ENST00000384376 SEZ6L2Q6UXD5 910 aa5.01□□□□□ -1.61
RNU6-434P-201ENST00000384376 BEND4Q6ZU67 534 aa5.01□□□□□ -1.61
RNU6-434P-201ENST00000384376 CYFIP1Q7L576 1253 aa5.01□□□□□ -1.61
RNU6-434P-201ENST00000384376 CCDC84Q86UT8 332 aaPredicted RBP5.01□□□□□ -1.61
RNU6-434P-201ENST00000384376 CLEC10AQ8IUN9 316 aa5.01□□□□□ -1.61
RNU6-434P-201ENST00000384376 RNF34Q969K3 372 aa5.01□□□□□ -1.61
RNU6-434P-201ENST00000384376 PLPPR2Q96GM1 343 aa5.01□□□□□ -1.61
RNU6-434P-201ENST00000384376 FAM83CQ9BQN1 747 aa5.01□□□□□ -1.61
RNU6-434P-201ENST00000384376 ATXN3LQ9H3M9 355 aa5.01□□□□□ -1.61
RNU6-434P-201ENST00000384376 SEMA6CQ9H3T2 930 aa5.01□□□□□ -1.61
RNU6-434P-201ENST00000384376 C7orf69Q9H7B7 122 aa5.01□□□□□ -1.61
RNU6-434P-201ENST00000384376 ADAMTS1Q9UHI8 967 aa5.01□□□□□ -1.61
RNU6-434P-201ENST00000384376 DYNC1LI2O43237 492 aaPredicted RBP5□□□□□ -1.61
RNU6-434P-201ENST00000384376 GREM1O60565 184 aa5□□□□□ -1.61
RNU6-434P-201ENST00000384376 CILPO75339 1184 aa5□□□□□ -1.61
RNU6-434P-201ENST00000384376 HCLS1P14317 486 aaPredicted RBP5□□□□□ -1.61
RNU6-434P-201ENST00000384376 RAB6AP20340 208 aa5□□□□□ -1.61
RNU6-434P-201ENST00000384376 EIF4A3P38919 411 aaKnown RBP5□□□□□ -1.61
RNU6-434P-201ENST00000384376 ZNF394Q53GI3 561 aa5□□□□□ -1.61
RNU6-434P-201ENST00000384376 WIPI1Q5MNZ9 446 aaPredicted RBP5□□□□□ -1.61
RNU6-434P-201ENST00000384376 UBE3DQ7Z6J8 389 aa5□□□□□ -1.61
RNU6-434P-201ENST00000384376 SHISA5Q8N114 240 aa5□□□□□ -1.61
RNU6-434P-201ENST00000384376 GOLM1Q8NBJ4 401 aa5□□□□□ -1.61
RNU6-434P-201ENST00000384376 RNF214Q8ND24 703 aa5□□□□□ -1.61
RNU6-434P-201ENST00000384376 KCNF1Q9H3M0 494 aa5□□□□□ -1.61
RNU6-434P-201ENST00000384376 SEMA6BQ9H3T3 888 aa5□□□□□ -1.61
RNU6-434P-201ENST00000384376 STOML1Q9UBI4 398 aa5□□□□□ -1.61
RNU6-434P-201ENST00000384376 DDX41Q9UJV9 622 aaKnown RBP5□□□□□ -1.61
RNU6-434P-201ENST00000384376 PCDHGB7Q9Y5F8 929 aa5□□□□□ -1.61
RNU6-434P-201ENST00000384376 SNCAIPQ9Y6H5 919 aa5□□□□□ -1.61
RNU6-434P-201ENST00000384376 FAM95CA0A1B0GW59 222 aa4.99□□□□□ -1.61
RNU6-434P-201ENST00000384376 LMNB1P20700 586 aa4.99□□□□□ -1.61
RNU6-434P-201ENST00000384376 RXRBP28702 533 aa4.99□□□□□ -1.61
RNU6-434P-201ENST00000384376 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP4.99□□□□□ -1.61
RNU6-434P-201ENST00000384376 RPL6Q02878 288 aaKnown RBP4.99□□□□□ -1.61
RNU6-434P-201ENST00000384376 NFKBIBQ15653 356 aa4.99□□□□□ -1.61
RNU6-434P-201ENST00000384376 ZBTB37Q5TC79 503 aa4.99□□□□□ -1.61
RNU6-434P-201ENST00000384376 HDXQ7Z353 690 aa4.99□□□□□ -1.61
RNU6-434P-201ENST00000384376 SMYD4Q8IYR2 804 aaPredicted RBP4.99□□□□□ -1.61
RNU6-434P-201ENST00000384376 FBXO27Q8NI29 283 aa4.99□□□□□ -1.61
RNU6-434P-201ENST00000384376 ZNF296Q8WUU4 475 aaPredicted RBP4.99□□□□□ -1.61
RNU6-434P-201ENST00000384376 GATAD2BQ8WXI9 593 aa4.99□□□□□ -1.61
RNU6-434P-201ENST00000384376 GATA6Q92908 595 aa4.99□□□□□ -1.61
RNU6-434P-201ENST00000384376 ISL2Q96A47 359 aa4.99□□□□□ -1.61
RNU6-434P-201ENST00000384376 ELMO3Q96BJ8 720 aa4.99□□□□□ -1.61
RNU6-434P-201ENST00000384376 C1GALT1Q9NS00 363 aa4.99□□□□□ -1.61
RNU6-434P-201ENST00000384376 IGSF5Q9NSI5 407 aa4.99□□□□□ -1.61
RNU6-434P-201ENST00000384376 FANCGO15287 622 aa4.98□□□□□ -1.61
RNU6-434P-201ENST00000384376 RNGTTO60942 597 aaKnown RBP4.98□□□□□ -1.61
RNU6-434P-201ENST00000384376 FSTP19883 344 aa4.98□□□□□ -1.61
RNU6-434P-201ENST00000384376 ADMP35318 185 aa4.98□□□□□ -1.61
RNU6-434P-201ENST00000384376 RAD51AP2Q09MP3 1159 aa4.98□□□□□ -1.61
RNU6-434P-201ENST00000384376 PRSS36Q5K4E3 855 aa4.98□□□□□ -1.61
RNU6-434P-201ENST00000384376 SNAP47Q5SQN1 464 aa4.98□□□□□ -1.61
RNU6-434P-201ENST00000384376 RNF43Q68DV7 783 aa4.98□□□□□ -1.61
RNU6-434P-201ENST00000384376 FAM196AQ6ZSG2 479 aa4.98□□□□□ -1.61
RNU6-434P-201ENST00000384376 USP48Q86UV5 1035 aa4.98□□□□□ -1.61
RNU6-434P-201ENST00000384376 NT5DC4Q86YG4 428 aa4.98□□□□□ -1.61
RNU6-434P-201ENST00000384376 LGR6Q9HBX8 967 aa4.98□□□□□ -1.61
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18.6 ms