RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000379915.4

AC009690.1-201, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene AC009690.1, Length 4,374 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AC009690.1-201ENST00000379915 MAP3K5Q99683 1374 aa16■□□□□ 0.15
AC009690.1-201ENST00000379915 CLTAP09496 248 aa16■□□□□ 0.15
AC009690.1-201ENST00000379915 CWF19L2Q2TBE0 894 aaKnown RBP16■□□□□ 0.15
AC009690.1-201ENST00000379915 NCOA7Q8NI08 942 aa16■□□□□ 0.15
AC009690.1-201ENST00000379915 PPP2R2CQ9Y2T4 447 aa16■□□□□ 0.15
AC009690.1-201ENST00000379915 CD163L1Q9NR16 1453 aa16■□□□□ 0.15
AC009690.1-201ENST00000379915 CCDC194A0A1B0GVG4 234 aa15.99■□□□□ 0.15
AC009690.1-201ENST00000379915 PTPROQ16827 1216 aa15.99■□□□□ 0.15
AC009690.1-201ENST00000379915 VEZTQ9HBM0 779 aa15.99■□□□□ 0.15
AC009690.1-201ENST00000379915 SAMD15Q9P1V8 674 aa15.99■□□□□ 0.15
AC009690.1-201ENST00000379915 PRDM4Q9UKN5 801 aa15.99■□□□□ 0.15
AC009690.1-201ENST00000379915 ZBTB43O43298 467 aa15.99■□□□□ 0.15
AC009690.1-201ENST00000379915 PRC1O43663 620 aa15.99■□□□□ 0.15
AC009690.1-201ENST00000379915 KRT13P13646 458 aa15.99■□□□□ 0.15
AC009690.1-201ENST00000379915 CABP4P57796 275 aa15.99■□□□□ 0.15
AC009690.1-201ENST00000379915 KRT83P78385 493 aa15.99■□□□□ 0.15
AC009690.1-201ENST00000379915 PPP1R7Q15435 360 aa15.99■□□□□ 0.15
AC009690.1-201ENST00000379915 C8orf74Q6P047 294 aa15.99■□□□□ 0.15
AC009690.1-201ENST00000379915 VPS36Q86VN1 386 aa15.99■□□□□ 0.15
AC009690.1-201ENST00000379915 CCDC155Q8N6L0 562 aa15.99■□□□□ 0.15
AC009690.1-201ENST00000379915 KLHDC4Q8TBB5 520 aa15.99■□□□□ 0.15
AC009690.1-201ENST00000379915 FTOQ9C0B1 505 aaKnown RBP eCLIP15.99■□□□□ 0.15
AC009690.1-201ENST00000379915 EFCC1Q9HA90 598 aa15.99■□□□□ 0.15
AC009690.1-201ENST00000379915 ZBTB16Q05516 673 aa15.99■□□□□ 0.15
AC009690.1-201ENST00000379915 C11orf57Q6ZUT1 292 aaPredicted RBP15.99■□□□□ 0.15
AC009690.1-201ENST00000379915 USP28Q96RU2 1077 aa15.99■□□□□ 0.15
AC009690.1-201ENST00000379915 PARD6BQ9BYG5 372 aa15.99■□□□□ 0.15
AC009690.1-201ENST00000379915 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa15.99■□□□□ 0.15
AC009690.1-201ENST00000379915 USP27XA6NNY8 438 aa15.98■□□□□ 0.15
AC009690.1-201ENST00000379915 KANK3Q6NY19 840 aa15.98■□□□□ 0.15
AC009690.1-201ENST00000379915 NLRP1Q9C000 1473 aa15.98■□□□□ 0.15
AC009690.1-201ENST00000379915 CCDC196A0A1B0GTZ2 297 aa15.98■□□□□ 0.15
AC009690.1-201ENST00000379915 AP1ARQ63HQ0 302 aa15.98■□□□□ 0.15
AC009690.1-201ENST00000379915 RASEFQ8IZ41 740 aa15.98■□□□□ 0.15
AC009690.1-201ENST00000379915 EDC3Q96F86 508 aaKnown RBP15.98■□□□□ 0.15
AC009690.1-201ENST00000379915 VAT1LQ9HCJ6 419 aa15.98■□□□□ 0.15
AC009690.1-201ENST00000379915 PPP1R1BQ9UD71 204 aaPredicted RBP15.98■□□□□ 0.15
AC009690.1-201ENST00000379915 ARHGEF28Q8N1W1 1705 aaKnown RBP15.98■□□□□ 0.15
AC009690.1-201ENST00000379915 ENC1O14682 589 aa15.98■□□□□ 0.15
AC009690.1-201ENST00000379915 POLR2DO15514 142 aaKnown RBP15.98■□□□□ 0.15
AC009690.1-201ENST00000379915 MXRA7P84157 204 aa15.98■□□□□ 0.15
AC009690.1-201ENST00000379915 CNGA4Q8IV77 575 aa15.98■□□□□ 0.15
AC009690.1-201ENST00000379915 KLHL7Q8IXQ5 586 aa15.98■□□□□ 0.15
AC009690.1-201ENST00000379915 DBF4Q9UBU7 674 aaPredicted RBP15.98■□□□□ 0.15
AC009690.1-201ENST00000379915 CPSF1Q10570 1443 aaKnown RBP15.98■□□□□ 0.15
AC009690.1-201ENST00000379915 TUBBP07437 444 aa15.98■□□□□ 0.15
AC009690.1-201ENST00000379915 IFT88Q13099 833 aa15.98■□□□□ 0.15
AC009690.1-201ENST00000379915 ODF2LQ9ULJ1 636 aa15.98■□□□□ 0.15
AC009690.1-201ENST00000379915 MYO5BQ9ULV0 1848 aa15.97■□□□□ 0.15
AC009690.1-201ENST00000379915 CDK12Q9NYV4 1490 aaPredicted RBP15.97■□□□□ 0.15
AC009690.1-201ENST00000379915 BRD3Q15059 726 aa15.97■□□□□ 0.15
AC009690.1-201ENST00000379915 MCMDC2Q4G0Z9 681 aa15.97■□□□□ 0.15
AC009690.1-201ENST00000379915 IMPACTQ9P2X3 320 aa15.97■□□□□ 0.15
AC009690.1-201ENST00000379915 ARHGAP25P42331 645 aa15.97■□□□□ 0.15
AC009690.1-201ENST00000379915 MRPS25P82663 173 aaKnown RBP15.97■□□□□ 0.15
AC009690.1-201ENST00000379915 PNOCQ13519 176 aa15.97■□□□□ 0.15
AC009690.1-201ENST00000379915 CEP63Q96MT8 703 aa15.97■□□□□ 0.15
AC009690.1-201ENST00000379915 SLC27A2O14975 620 aa15.97■□□□□ 0.15
AC009690.1-201ENST00000379915 AMOTQ4VCS5 1084 aa15.97■□□□□ 0.15
AC009690.1-201ENST00000379915 CAPS2Q9BXY5 557 aa15.97■□□□□ 0.15
AC009690.1-201ENST00000379915 FANCLQ9NW38 375 aa15.97■□□□□ 0.15
AC009690.1-201ENST00000379915 TAB2Q9NYJ8 693 aa15.97■□□□□ 0.15
AC009690.1-201ENST00000379915 WDR3Q9UNX4 943 aaKnown RBP eCLIP15.97■□□□□ 0.15
AC009690.1-201ENST00000379915 MYO3AQ8NEV4 1616 aa15.97■□□□□ 0.15
AC009690.1-201ENST00000379915 LACTBP83111 547 aaPredicted RBP15.96■□□□□ 0.15
AC009690.1-201ENST00000379915 DHX32Q7L7V1 743 aaKnown RBP15.96■□□□□ 0.15
AC009690.1-201ENST00000379915 FMNL3Q8IVF7 1028 aa15.96■□□□□ 0.15
AC009690.1-201ENST00000379915 N4BP2L2Q92802 583 aaPredicted RBP15.96■□□□□ 0.15
AC009690.1-201ENST00000379915 SPTLC3Q9NUV7 552 aa15.96■□□□□ 0.15
AC009690.1-201ENST00000379915 EIF4E1BA6NMX2 242 aaKnown RBP15.96■□□□□ 0.15
AC009690.1-201ENST00000379915 COBLO75128 1261 aa15.96■□□□□ 0.15
AC009690.1-201ENST00000379915 NBPF7P0C2Y1 421 aaPredicted RBP15.96■□□□□ 0.15
AC009690.1-201ENST00000379915 SPAG1Q07617 926 aa15.96■□□□□ 0.15
AC009690.1-201ENST00000379915 MRRFQ96E11 262 aaKnown RBP15.96■□□□□ 0.15
AC009690.1-201ENST00000379915 KCNH3Q9ULD8 1083 aa15.96■□□□□ 0.15
AC009690.1-201ENST00000379915 FGFR1OPO95684 399 aaKnown RBP15.96■□□□□ 0.14
AC009690.1-201ENST00000379915 RPS6KB1P23443 525 aa15.96■□□□□ 0.14
AC009690.1-201ENST00000379915 UNC5CLQ8IV45 518 aa15.96■□□□□ 0.14
AC009690.1-201ENST00000379915 NSRP1Q9H0G5 558 aaKnown RBP15.96■□□□□ 0.14
AC009690.1-201ENST00000379915 ZBTB3Q9H5J0 574 aa15.96■□□□□ 0.14
AC009690.1-201ENST00000379915 DIP2BQ9P265 1576 aa15.96■□□□□ 0.14
AC009690.1-201ENST00000379915 EIF3CLB5ME19 914 aaKnown RBP15.95■□□□□ 0.14
AC009690.1-201ENST00000379915 PTH1RQ03431 593 aa15.95■□□□□ 0.14
AC009690.1-201ENST00000379915 GRIPAP1Q4V328 841 aa15.95■□□□□ 0.14
AC009690.1-201ENST00000379915 NFATC2IPQ8NCF5 419 aa15.95■□□□□ 0.14
AC009690.1-201ENST00000379915 NGLY1Q96IV0 654 aa15.95■□□□□ 0.14
AC009690.1-201ENST00000379915 EIF3CQ99613 913 aaKnown RBP15.95■□□□□ 0.14
AC009690.1-201ENST00000379915 TSG101Q99816 390 aa15.95■□□□□ 0.14
AC009690.1-201ENST00000379915 TPCN1Q9ULQ1 816 aa15.95■□□□□ 0.14
AC009690.1-201ENST00000379915 STAT6P42226 847 aa15.95■□□□□ 0.14
AC009690.1-201ENST00000379915 MRFAP1L1Q96HT8 127 aa15.95■□□□□ 0.14
AC009690.1-201ENST00000379915 KIAA1468Q9P260 1216 aa15.95■□□□□ 0.14
AC009690.1-201ENST00000379915 TPX2Q9ULW0 747 aaKnown RBP15.95■□□□□ 0.14
AC009690.1-201ENST00000379915 BEND3Q5T5X7 828 aa15.95■□□□□ 0.14
AC009690.1-201ENST00000379915 ELP1O95163 1332 aa15.95■□□□□ 0.14
AC009690.1-201ENST00000379915 RNF40O75150 1001 aa15.94■□□□□ 0.14
AC009690.1-201ENST00000379915 PPFIA1Q13136 1202 aa15.94■□□□□ 0.14
AC009690.1-201ENST00000379915 ADCK5Q3MIX3 580 aa15.94■□□□□ 0.14
AC009690.1-201ENST00000379915 ANO1Q5XXA6 986 aa15.94■□□□□ 0.14
AC009690.1-201ENST00000379915 TAOK3Q9H2K8 898 aa15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.8 ms