RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000372616.1

CTPS1-201, Transcript of CTP synthase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene CTPS1, Length 2,037 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTPS1-201ENST00000372616 KCNB2Q92953 911 aa8.39□□□□□ -1.07
CTPS1-201ENST00000372616 C16orf45Q96MC5 204 aaPredicted RBP8.39□□□□□ -1.07
CTPS1-201ENST00000372616 NUDT12Q9BQG2 462 aa8.39□□□□□ -1.07
CTPS1-201ENST00000372616 NBPF3Q9H094 633 aa8.39□□□□□ -1.07
CTPS1-201ENST00000372616 NAT10Q9H0A0 1025 aaKnown RBP8.39□□□□□ -1.07
CTPS1-201ENST00000372616 CLSTN2Q9H4D0 955 aa8.39□□□□□ -1.07
CTPS1-201ENST00000372616 PDRG1Q9NUG6 133 aa8.39□□□□□ -1.07
CTPS1-201ENST00000372616 EVA1BQ9NVM1 165 aa8.39□□□□□ -1.07
CTPS1-201ENST00000372616 ARGLU1Q9NWB6 273 aaPredicted RBP8.39□□□□□ -1.07
CTPS1-201ENST00000372616 HYPKQ9NX55 129 aa8.39□□□□□ -1.07
CTPS1-201ENST00000372616 TMOD3Q9NYL9 352 aa8.39□□□□□ -1.07
CTPS1-201ENST00000372616 DBF4Q9UBU7 674 aaPredicted RBP8.39□□□□□ -1.07
CTPS1-201ENST00000372616 CLIP2Q9UDT6 1046 aa8.39□□□□□ -1.07
CTPS1-201ENST00000372616 LAMB4A4D0S4 1761 aa8.39□□□□□ -1.07
CTPS1-201ENST00000372616 ITGB4P16144 1822 aa8.38□□□□□ -1.07
CTPS1-201ENST00000372616 MAGEB6P1A0A0J9YX57 407 aa8.38□□□□□ -1.07
CTPS1-201ENST00000372616 TPM1P09493 284 aa8.38□□□□□ -1.07
CTPS1-201ENST00000372616 SNRPA1P09661 255 aaKnown RBP8.38□□□□□ -1.07
CTPS1-201ENST00000372616 UBTFL1P0CB47 393 aaPredicted RBP8.38□□□□□ -1.07
CTPS1-201ENST00000372616 DNM1Q05193 864 aaKnown RBP8.38□□□□□ -1.07
CTPS1-201ENST00000372616 OCLNQ16625 522 aa8.38□□□□□ -1.07
CTPS1-201ENST00000372616 FOXD4L6Q3SYB3 417 aaPredicted RBP8.38□□□□□ -1.07
CTPS1-201ENST00000372616 LARP1BQ659C4 914 aaKnown RBP8.38□□□□□ -1.07
CTPS1-201ENST00000372616 ATL3Q6DD88 541 aa8.38□□□□□ -1.07
CTPS1-201ENST00000372616 PDXDC2PQ6P474 469 aa8.38□□□□□ -1.07
CTPS1-201ENST00000372616 FOXD4L3Q6VB84 417 aaPredicted RBP8.38□□□□□ -1.07
CTPS1-201ENST00000372616 LAPTM4BQ86VI4 370 aa8.38□□□□□ -1.07
CTPS1-201ENST00000372616 C17orf53Q8N3J3 647 aaPredicted RBP8.38□□□□□ -1.07
CTPS1-201ENST00000372616 FAM160A2Q8N612 972 aaPredicted RBP8.38□□□□□ -1.07
CTPS1-201ENST00000372616 CHAMP1Q96JM3 812 aa8.38□□□□□ -1.07
CTPS1-201ENST00000372616 ARHGAP9Q9BRR9 750 aa8.38□□□□□ -1.07
CTPS1-201ENST00000372616 LSG1Q9H089 658 aaKnown RBP8.38□□□□□ -1.07
CTPS1-201ENST00000372616 IMPACTQ9P2X3 320 aa8.38□□□□□ -1.07
CTPS1-201ENST00000372616 CFAP45Q9UL16 551 aa8.38□□□□□ -1.07
CTPS1-201ENST00000372616 MRVI1Q9Y6F6 885 aa8.38□□□□□ -1.07
CTPS1-201ENST00000372616 TOGARAM1Q9Y4F4 1720 aa8.38□□□□□ -1.07
CTPS1-201ENST00000372616 ATP8B1O43520 1251 aa8.37□□□□□ -1.07
CTPS1-201ENST00000372616 SLU7O95391 586 aaKnown RBP8.37□□□□□ -1.07
CTPS1-201ENST00000372616 SLFN14P0C7P3 912 aa8.37□□□□□ -1.07
CTPS1-201ENST00000372616 CCNYL3P0C7X3 344 aa8.37□□□□□ -1.07
CTPS1-201ENST00000372616 CASTP20810 708 aaKnown RBP8.37□□□□□ -1.07
CTPS1-201ENST00000372616 ZNF165P49910 485 aa8.37□□□□□ -1.07
CTPS1-201ENST00000372616 BCAMP50895 628 aa8.37□□□□□ -1.07
CTPS1-201ENST00000372616 RUFY3Q7L099 469 aa8.37□□□□□ -1.07
CTPS1-201ENST00000372616 PURBQ96QR8 312 aaKnown RBP8.37□□□□□ -1.07
CTPS1-201ENST00000372616 HINFPQ9BQA5 517 aa8.37□□□□□ -1.07
CTPS1-201ENST00000372616 ZSCAN16Q9H4T2 348 aaPredicted RBP8.37□□□□□ -1.07
CTPS1-201ENST00000372616 FAM53CQ9NYF3 392 aa8.37□□□□□ -1.07
CTPS1-201ENST00000372616 TRPC5Q9UL62 973 aaPredicted RBP8.37□□□□□ -1.07
CTPS1-201ENST00000372616 VPS37CA5D8V6 355 aaPredicted RBP8.37□□□□□ -1.07
CTPS1-201ENST00000372616 SNPHO15079 494 aa8.37□□□□□ -1.07
CTPS1-201ENST00000372616 SWI5Q1ZZU3 235 aa8.37□□□□□ -1.07
CTPS1-201ENST00000372616 ANO6Q4KMQ2 910 aa8.37□□□□□ -1.07
CTPS1-201ENST00000372616 CCDC102BQ68D86 513 aa8.37□□□□□ -1.07
CTPS1-201ENST00000372616 PTCRAQ6ISU1 281 aaPredicted RBP8.37□□□□□ -1.07
CTPS1-201ENST00000372616 ZBTB33Q86T24 672 aa8.37□□□□□ -1.07
CTPS1-201ENST00000372616 ERC1Q8IUD2 1116 aa8.37□□□□□ -1.07
CTPS1-201ENST00000372616 TPCN2Q8NHX9 752 aa8.37□□□□□ -1.07
CTPS1-201ENST00000372616 SPATA32Q96LK8 384 aa8.37□□□□□ -1.07
CTPS1-201ENST00000372616 SRRTQ9BXP5 876 aaKnown RBP8.37□□□□□ -1.07
CTPS1-201ENST00000372616 TEX13AQ9BXU3 409 aaPredicted RBP8.37□□□□□ -1.07
CTPS1-201ENST00000372616 CBX8Q9HC52 389 aa8.37□□□□□ -1.07
CTPS1-201ENST00000372616 NOD1Q9Y239 953 aa8.37□□□□□ -1.07
CTPS1-201ENST00000372616 PCDHB3Q9Y5E6 796 aa8.37□□□□□ -1.07
CTPS1-201ENST00000372616 KCNQ3O43525 872 aa8.36□□□□□ -1.07
CTPS1-201ENST00000372616 TCF3P15923 654 aa8.36□□□□□ -1.07
CTPS1-201ENST00000372616 EIF2S2P20042 333 aaKnown RBP8.36□□□□□ -1.07
CTPS1-201ENST00000372616 PPP4CP60510 307 aa8.36□□□□□ -1.07
CTPS1-201ENST00000372616 TPM4P67936 248 aa8.36□□□□□ -1.07
CTPS1-201ENST00000372616 GTF2IP78347 998 aa8.36□□□□□ -1.07
CTPS1-201ENST00000372616 GPS2Q13227 327 aa8.36□□□□□ -1.07
CTPS1-201ENST00000372616 MARVELD3Q96A59 401 aa8.36□□□□□ -1.07
CTPS1-201ENST00000372616 HMG20BQ9P0W2 317 aa8.36□□□□□ -1.07
CTPS1-201ENST00000372616 DOLKQ9UPQ8 538 aa8.36□□□□□ -1.07
CTPS1-201ENST00000372616 AFF2P51816 1311 aa8.36□□□□□ -1.07
CTPS1-201ENST00000372616 DOT1LQ8TEK3 1739 aa8.36□□□□□ -1.07
CTPS1-201ENST00000372616 DDX58O95786 925 aaKnown RBP8.36□□□□□ -1.07
CTPS1-201ENST00000372616 ERCC3P19447 782 aa8.36□□□□□ -1.07
CTPS1-201ENST00000372616 MAPK1P28482 360 aa8.36□□□□□ -1.07
CTPS1-201ENST00000372616 SLC39A6Q13433 755 aa8.36□□□□□ -1.07
CTPS1-201ENST00000372616 KRT32Q14532 448 aa8.36□□□□□ -1.07
CTPS1-201ENST00000372616 STX1AQ16623 288 aa8.36□□□□□ -1.07
CTPS1-201ENST00000372616 NYAP1Q6ZVC0 841 aa8.36□□□□□ -1.07
CTPS1-201ENST00000372616 CCDC83Q8IWF9 413 aa8.36□□□□□ -1.07
CTPS1-201ENST00000372616 LRRC8AQ8IWT6 810 aa8.36□□□□□ -1.07
CTPS1-201ENST00000372616 CCDC24Q8N4L8 307 aa8.36□□□□□ -1.07
CTPS1-201ENST00000372616 PI4K2BQ8TCG2 481 aa8.36□□□□□ -1.07
CTPS1-201ENST00000372616 ZNF496Q96IT1 587 aaPredicted RBP8.36□□□□□ -1.07
CTPS1-201ENST00000372616 DDX21Q9NR30 783 aaKnown RBP eCLIP8.36□□□□□ -1.07
CTPS1-201ENST00000372616 V9GYY5 206 aaPredicted RBP8.36□□□□□ -1.07
CTPS1-201ENST00000372616 ZC3H4Q9UPT8 1303 aaKnown RBP8.35□□□□□ -1.07
CTPS1-201ENST00000372616 BCL9O00512 1426 aa8.35□□□□□ -1.07
CTPS1-201ENST00000372616 C5P01031 1676 aa8.35□□□□□ -1.07
CTPS1-201ENST00000372616 THSD7AQ9UPZ6 1657 aa8.35□□□□□ -1.07
CTPS1-201ENST00000372616 BECN2A8MW95 431 aa8.35□□□□□ -1.07
CTPS1-201ENST00000372616 ATRNO75882 1429 aa8.35□□□□□ -1.07
CTPS1-201ENST00000372616 FILIP1Q7Z7B0 1213 aa8.35□□□□□ -1.07
CTPS1-201ENST00000372616 LUZP1Q86V48 1076 aa8.35□□□□□ -1.07
CTPS1-201ENST00000372616 DZIP3Q86Y13 1208 aaKnown RBP8.35□□□□□ -1.07
CTPS1-201ENST00000372616 GLYCTKQ8IVS8 523 aa8.35□□□□□ -1.07
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