RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000329276.9

NOP56-201, Transcript of NOP56 ribonucleoprotein, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene NOP56, Length 2,400 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOP56-201ENST00000329276 PAXIP1Q6ZW49 1069 aaPredicted RBP22.04■■□□□ 1.12
NOP56-201ENST00000329276 FOXP4Q8IVH2 680 aaPredicted RBP22.04■■□□□ 1.12
NOP56-201ENST00000329276 TRIML1Q8N9V2 468 aa22.04■■□□□ 1.12
NOP56-201ENST00000329276 CCDC102AQ96A19 550 aa22.04■■□□□ 1.12
NOP56-201ENST00000329276 MYCBPQ99417 103 aaPredicted RBP22.04■■□□□ 1.12
NOP56-201ENST00000329276 PDE4BQ07343 736 aa22.04■■□□□ 1.12
NOP56-201ENST00000329276 LONRF3Q496Y0 759 aa22.04■■□□□ 1.12
NOP56-201ENST00000329276 NT5DC1Q5TFE4 455 aa22.04■■□□□ 1.12
NOP56-201ENST00000329276 DEF6Q9H4E7 631 aa22.04■■□□□ 1.12
NOP56-201ENST00000329276 RNF113AO15541 343 aaKnown RBP22.03■■□□□ 1.12
NOP56-201ENST00000329276 CHRM1P11229 460 aaPredicted RBP22.03■■□□□ 1.12
NOP56-201ENST00000329276 ATP2B1P20020 1258 aa22.03■■□□□ 1.12
NOP56-201ENST00000329276 BMP6P22004 513 aa22.03■■□□□ 1.12
NOP56-201ENST00000329276 KIF4BQ2VIQ3 1234 aa22.03■■□□□ 1.12
NOP56-201ENST00000329276 VPS37DQ86XT2 251 aa22.03■■□□□ 1.12
NOP56-201ENST00000329276 SUGP1Q8IWZ8 645 aaKnown RBP22.03■■□□□ 1.12
NOP56-201ENST00000329276 CTCFLQ8NI51 663 aaPredicted RBP22.03■■□□□ 1.12
NOP56-201ENST00000329276 GNL3Q9BVP2 549 aaKnown RBP eCLIP22.03■■□□□ 1.12
NOP56-201ENST00000329276 LZTFL1Q9NQ48 299 aa22.03■■□□□ 1.12
NOP56-201ENST00000329276 SIPA1L3O60292 1781 aaPredicted RBP22.03■■□□□ 1.12
NOP56-201ENST00000329276 A0A0G2JLW4 131 aa22.02■■□□□ 1.12
NOP56-201ENST00000329276 A0A1B0GTH6 734 aa22.02■■□□□ 1.12
NOP56-201ENST00000329276 PRAMEF22A3QJZ6 481 aa22.02■■□□□ 1.12
NOP56-201ENST00000329276 CTAGE15A4D2H0 777 aa22.02■■□□□ 1.12
NOP56-201ENST00000329276 PRC1O43663 620 aa22.02■■□□□ 1.12
NOP56-201ENST00000329276 CTAGE8P0CG41 777 aa22.02■■□□□ 1.12
NOP56-201ENST00000329276 IMMTQ16891 758 aaKnown RBP22.02■■□□□ 1.12
NOP56-201ENST00000329276 WDR93Q6P2C0 686 aa22.02■■□□□ 1.12
NOP56-201ENST00000329276 RASGRP2Q7LDG7 609 aa22.02■■□□□ 1.12
NOP56-201ENST00000329276 CTAGE6Q86UF2 777 aa22.02■■□□□ 1.12
NOP56-201ENST00000329276 CTAGE4Q8IX94 777 aa22.02■■□□□ 1.12
NOP56-201ENST00000329276 MAP3K14Q99558 947 aa22.02■■□□□ 1.12
NOP56-201ENST00000329276 IRX2Q9BZI1 471 aaPredicted RBP22.02■■□□□ 1.12
NOP56-201ENST00000329276 GPR108Q9NPR9 543 aa22.02■■□□□ 1.12
NOP56-201ENST00000329276 MYO1AQ9UBC5 1043 aa22.02■■□□□ 1.12
NOP56-201ENST00000329276 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP22.02■■□□□ 1.12
NOP56-201ENST00000329276 LMTK3Q96Q04 1460 aa22.02■■□□□ 1.12
NOP56-201ENST00000329276 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa22.02■■□□□ 1.12
NOP56-201ENST00000329276 CDC27P30260 824 aa22.02■■□□□ 1.12
NOP56-201ENST00000329276 HSPA2P54652 639 aa22.02■■□□□ 1.12
NOP56-201ENST00000329276 MDM2Q00987 491 aaPredicted RBP22.02■■□□□ 1.12
NOP56-201ENST00000329276 FOXR1Q6PIV2 292 aa22.02■■□□□ 1.12
NOP56-201ENST00000329276 TTF2Q9UNY4 1162 aaKnown RBP22.02■■□□□ 1.12
NOP56-201ENST00000329276 CDKL5O76039 1030 aa22.01■■□□□ 1.11
NOP56-201ENST00000329276 AARSP49588 968 aaKnown RBP eCLIP22.01■■□□□ 1.112e-7■□□□□ 10.8
NOP56-201ENST00000329276 VSNL1P62760 191 aa22.01■■□□□ 1.11
NOP56-201ENST00000329276 MB21D2Q8IYB1 491 aaPredicted RBP22.01■■□□□ 1.11
NOP56-201ENST00000329276 C4AP0C0L4 1744 aa22.01■■□□□ 1.11
NOP56-201ENST00000329276 C4BP0C0L5 1744 aa22.01■■□□□ 1.11
NOP56-201ENST00000329276 SOWAHDA6NJG2 315 aa22.01■■□□□ 1.11
NOP56-201ENST00000329276 CT47A1Q5JQC4 288 aaPredicted RBP22.01■■□□□ 1.11
NOP56-201ENST00000329276 MYD88Q99836 296 aa22.01■■□□□ 1.11
NOP56-201ENST00000329276 MAN1B1Q9UKM7 699 aa22.01■■□□□ 1.11
NOP56-201ENST00000329276 MCM3P25205 808 aa22■■□□□ 1.11
NOP56-201ENST00000329276 MTF1Q14872 753 aa22■■□□□ 1.11
NOP56-201ENST00000329276 DNAJC21Q5F1R6 531 aaKnown RBP22■■□□□ 1.11
NOP56-201ENST00000329276 ZNF569Q5MCW4 686 aa22■■□□□ 1.11
NOP56-201ENST00000329276 PPFIBP1Q86W92 1011 aa22■■□□□ 1.11
NOP56-201ENST00000329276 FAM204AQ9H8W3 233 aa22■■□□□ 1.11
NOP56-201ENST00000329276 GPHNQ9NQX3 736 aaPredicted RBP22■■□□□ 1.11
NOP56-201ENST00000329276 GJB4Q9NTQ9 266 aa22■■□□□ 1.11
NOP56-201ENST00000329276 POSTNQ15063 836 aa22■■□□□ 1.11
NOP56-201ENST00000329276 CCDC51Q96ER9 411 aa22■■□□□ 1.11
NOP56-201ENST00000329276 ERCC5P28715 1186 aaPredicted RBP21.99■■□□□ 1.11
NOP56-201ENST00000329276 EIF5P55010 431 aaKnown RBP21.99■■□□□ 1.11
NOP56-201ENST00000329276 RAD9BQ6WBX8 426 aa21.99■■□□□ 1.11
NOP56-201ENST00000329276 NCOA7Q8NI08 942 aa21.99■■□□□ 1.11
NOP56-201ENST00000329276 NAPGQ99747 312 aaPredicted RBP21.99■■□□□ 1.11
NOP56-201ENST00000329276 ALG1Q9BT22 464 aa21.99■■□□□ 1.11
NOP56-201ENST00000329276 PHRF1Q9P1Y6 1649 aaKnown RBP21.99■■□□□ 1.11
NOP56-201ENST00000329276 SARSP49591 514 aaKnown RBP21.99■■□□□ 1.11
NOP56-201ENST00000329276 FMR1Q06787 632 aaKnown RBP eCLIP21.99■■□□□ 1.11
NOP56-201ENST00000329276 TTC39AQ5SRH9 613 aa21.99■■□□□ 1.11
NOP56-201ENST00000329276 TTLL5Q6EMB2 1281 aa21.99■■□□□ 1.11
NOP56-201ENST00000329276 SUGCTQ9HAC7 445 aa21.99■■□□□ 1.11
NOP56-201ENST00000329276 NFAT5O94916 1531 aa21.98■■□□□ 1.11
NOP56-201ENST00000329276 A0A087WUV0 522 aaPredicted RBP21.98■■□□□ 1.11
NOP56-201ENST00000329276 MORC3Q14149 939 aa21.98■■□□□ 1.11
NOP56-201ENST00000329276 KRI1Q8N9T8 703 aaKnown RBP21.98■■□□□ 1.11
NOP56-201ENST00000329276 AFAP1L1Q8TED9 768 aa21.98■■□□□ 1.11
NOP56-201ENST00000329276 PXDNQ92626 1479 aa21.98■■□□□ 1.11
NOP56-201ENST00000329276 ZMYM6O95789 1325 aa21.98■■□□□ 1.11
NOP56-201ENST00000329276 RHOXF2BP0C7M4 288 aa21.98■■□□□ 1.11
NOP56-201ENST00000329276 SWT1Q5T5J6 900 aaKnown RBP21.98■■□□□ 1.11
NOP56-201ENST00000329276 RALYLQ86SE5 291 aaKnown RBP21.98■■□□□ 1.11
NOP56-201ENST00000329276 CLIC6Q96NY7 704 aa21.98■■□□□ 1.11
NOP56-201ENST00000329276 RHOXF2Q9BQY4 288 aa21.98■■□□□ 1.11
NOP56-201ENST00000329276 CPDO75976 1380 aa21.97■■□□□ 1.11
NOP56-201ENST00000329276 FECHP22830 423 aa21.97■■□□□ 1.11
NOP56-201ENST00000329276 MAP9Q49MG5 647 aa21.97■■□□□ 1.11
NOP56-201ENST00000329276 HSP90AA4PQ58FG1 418 aa21.97■■□□□ 1.11
NOP56-201ENST00000329276 KRT40Q6A162 431 aa21.97■■□□□ 1.11
NOP56-201ENST00000329276 CPLX2Q6PUV4 134 aaKnown RBP21.97■■□□□ 1.11
NOP56-201ENST00000329276 TADA2BQ86TJ2 420 aa21.97■■□□□ 1.11
NOP56-201ENST00000329276 CNGA4Q8IV77 575 aa21.97■■□□□ 1.11
NOP56-201ENST00000329276 DRC1Q96MC2 740 aa21.97■■□□□ 1.11
NOP56-201ENST00000329276 TEX13AQ9BXU3 409 aaPredicted RBP21.97■■□□□ 1.11
NOP56-201ENST00000329276 NWD2Q9ULI1 1742 aa21.97■■□□□ 1.11
NOP56-201ENST00000329276 PLCD1P51178 756 aa21.97■■□□□ 1.11
NOP56-201ENST00000329276 WWC2Q6AWC2 1192 aa21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 16.1 ms