RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000320238.3

NHLH2-201, Transcript of nescient helix-loop-helix 2, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene NHLH2, Length 2,512 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NHLH2-201ENST00000320238 LRP6O75581 1613 aa22.26■■□□□ 1.15
NHLH2-201ENST00000320238 DISP2A7MBM2 1401 aa22.26■■□□□ 1.15
NHLH2-201ENST00000320238 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa22.25■■□□□ 1.15
NHLH2-201ENST00000320238 BTBD18B2RXH4 712 aa22.25■■□□□ 1.15
NHLH2-201ENST00000320238 AKNAD1Q5T1N1 836 aa22.25■■□□□ 1.15
NHLH2-201ENST00000320238 ITGB4P16144 1822 aa22.25■■□□□ 1.15
NHLH2-201ENST00000320238 CHRNDQ07001 517 aa22.25■■□□□ 1.15
NHLH2-201ENST00000320238 ATRNO75882 1429 aa22.25■■□□□ 1.15
NHLH2-201ENST00000320238 MYH15Q9Y2K3 1946 aa22.24■■□□□ 1.15
NHLH2-201ENST00000320238 LOC102724428A0A0B4J2F2 783 aa22.24■■□□□ 1.15
NHLH2-201ENST00000320238 ATP1A3P13637 1013 aa22.24■■□□□ 1.15
NHLH2-201ENST00000320238 IGHMBP2P38935 993 aaKnown RBP22.24■■□□□ 1.15
NHLH2-201ENST00000320238 GYG1P46976 350 aa22.24■■□□□ 1.15
NHLH2-201ENST00000320238 SIK1P57059 783 aa22.24■■□□□ 1.15
NHLH2-201ENST00000320238 DDB1Q16531 1140 aa22.24■■□□□ 1.15
NHLH2-201ENST00000320238 SSRP1Q08945 709 aaKnown RBP22.24■■□□□ 1.15
NHLH2-201ENST00000320238 PTPAQ15257 358 aa22.24■■□□□ 1.15
NHLH2-201ENST00000320238 HSP90AA4PQ58FG1 418 aa22.24■■□□□ 1.15
NHLH2-201ENST00000320238 GNL3Q9BVP2 549 aaKnown RBP eCLIP22.24■■□□□ 1.15
NHLH2-201ENST00000320238 STRCQ7RTU9 1775 aa22.24■■□□□ 1.15
NHLH2-201ENST00000320238 CAMTA2O94983 1202 aa22.23■■□□□ 1.15
NHLH2-201ENST00000320238 GRIN1Q05586 938 aa22.23■■□□□ 1.15
NHLH2-201ENST00000320238 BICDL1Q6ZP65 573 aa22.23■■□□□ 1.15
NHLH2-201ENST00000320238 MAP3K14Q99558 947 aa22.23■■□□□ 1.15
NHLH2-201ENST00000320238 hCG_1642624A0A1W2PR95 340 aa22.23■■□□□ 1.15
NHLH2-201ENST00000320238 FOXN1O15353 648 aa22.23■■□□□ 1.15
NHLH2-201ENST00000320238 KCNQ2O43526 872 aa22.23■■□□□ 1.15
NHLH2-201ENST00000320238 CCDC152Q4G0S7 254 aa22.23■■□□□ 1.15
NHLH2-201ENST00000320238 C3orf67Q6ZVT6 689 aa22.23■■□□□ 1.15
NHLH2-201ENST00000320238 TMC6Q7Z403 805 aa22.23■■□□□ 1.15
NHLH2-201ENST00000320238 CCZ1BP86790 482 aa22.22■■□□□ 1.15
NHLH2-201ENST00000320238 CCZ1P86791 482 aaPredicted RBP22.22■■□□□ 1.15
NHLH2-201ENST00000320238 SGMS1Q86VZ5 419 aa22.22■■□□□ 1.15
NHLH2-201ENST00000320238 CCDC94Q9BW85 323 aaPredicted RBP22.22■■□□□ 1.15
NHLH2-201ENST00000320238 CYP2D7A0A087X1C5 515 aa22.22■■□□□ 1.15
NHLH2-201ENST00000320238 CYP7A1P22680 504 aa22.22■■□□□ 1.15
NHLH2-201ENST00000320238 NLRP12P59046 1061 aa22.22■■□□□ 1.15
NHLH2-201ENST00000320238 NR5A1Q13285 461 aa22.22■■□□□ 1.15
NHLH2-201ENST00000320238 LONRF3Q496Y0 759 aa22.22■■□□□ 1.15
NHLH2-201ENST00000320238 NUTM2BA6NNL0 878 aaPredicted RBP22.21■■□□□ 1.15
NHLH2-201ENST00000320238 NUTM2EB1AL46 878 aaPredicted RBP22.21■■□□□ 1.15
NHLH2-201ENST00000320238 WTAPQ15007 396 aa22.21■■□□□ 1.15
NHLH2-201ENST00000320238 NUTM2AQ8IVF1 878 aaPredicted RBP22.21■■□□□ 1.15
NHLH2-201ENST00000320238 MARCH10Q8NA82 808 aaPredicted RBP22.21■■□□□ 1.15
NHLH2-201ENST00000320238 RAI14Q9P0K7 980 aa22.21■■□□□ 1.15
NHLH2-201ENST00000320238 PRDM1O75626 825 aa22.21■■□□□ 1.15
NHLH2-201ENST00000320238 NCAPHQ15003 741 aa22.21■■□□□ 1.15
NHLH2-201ENST00000320238 NTSR2O95665 410 aa22.2■■□□□ 1.14
NHLH2-201ENST00000320238 ALX1Q15699 326 aa22.2■■□□□ 1.14
NHLH2-201ENST00000320238 SMAP1Q8IYB5 467 aaPredicted RBP22.2■■□□□ 1.14
NHLH2-201ENST00000320238 DIS3L2Q8IYB7 885 aaKnown RBP22.2■■□□□ 1.14
NHLH2-201ENST00000320238 NACAP1Q9BZK3 213 aa22.2■■□□□ 1.14
NHLH2-201ENST00000320238 LIFRP42702 1097 aa22.2■■□□□ 1.14
NHLH2-201ENST00000320238 CCDC24Q8N4L8 307 aa22.2■■□□□ 1.14
NHLH2-201ENST00000320238 NUP98P52948 1817 aa22.19■■□□□ 1.14
NHLH2-201ENST00000320238 U2AF2P26368 475 aaKnown RBP eCLIP22.19■■□□□ 1.14
NHLH2-201ENST00000320238 RTN1Q16799 776 aa22.19■■□□□ 1.14
NHLH2-201ENST00000320238 CEP135Q66GS9 1140 aa22.19■■□□□ 1.14
NHLH2-201ENST00000320238 FOXP4Q8IVH2 680 aaPredicted RBP22.19■■□□□ 1.14
NHLH2-201ENST00000320238 MYH7P12883 1935 aa22.19■■□□□ 1.14
NHLH2-201ENST00000320238 EVX2Q03828 476 aa22.19■■□□□ 1.14
NHLH2-201ENST00000320238 OXER1Q8TDS5 423 aa22.19■■□□□ 1.14
NHLH2-201ENST00000320238 KRT23Q9C075 422 aa22.19■■□□□ 1.14
NHLH2-201ENST00000320238 FMNL1O95466 1100 aaPredicted RBP22.18■■□□□ 1.14
NHLH2-201ENST00000320238 TOB1P50616 345 aaPredicted RBP22.18■■□□□ 1.14
NHLH2-201ENST00000320238 PPP4R3BQ5MIZ7 849 aa22.18■■□□□ 1.14
NHLH2-201ENST00000320238 NOSTRINQ8IVI9 506 aa22.18■■□□□ 1.14
NHLH2-201ENST00000320238 PDILTQ8N807 584 aa22.18■■□□□ 1.14
NHLH2-201ENST00000320238 DYNLL1P63167 89 aaKnown RBP22.18■■□□□ 1.14
NHLH2-201ENST00000320238 METTL16Q86W50 562 aaKnown RBP22.18■■□□□ 1.14
NHLH2-201ENST00000320238 CNNM2Q9H8M5 875 aa22.18■■□□□ 1.14
NHLH2-201ENST00000320238 KCNH3Q9ULD8 1083 aa22.18■■□□□ 1.14
NHLH2-201ENST00000320238 HPSEQ9Y251 543 aa22.18■■□□□ 1.14
NHLH2-201ENST00000320238 ERICH2A1L162 156 aa22.17■■□□□ 1.14
NHLH2-201ENST00000320238 PPP6R2O75170 966 aa22.17■■□□□ 1.14
NHLH2-201ENST00000320238 RBM6P78332 1123 aaKnown RBP22.17■■□□□ 1.14
NHLH2-201ENST00000320238 PPARAQ07869 468 aa22.17■■□□□ 1.14
NHLH2-201ENST00000320238 GOLGA8FQ08AF8 430 aa22.17■■□□□ 1.14
NHLH2-201ENST00000320238 GOLGA8DPQ0D2H9 430 aa22.17■■□□□ 1.14
NHLH2-201ENST00000320238 ERFEQ4G0M1 354 aa22.17■■□□□ 1.14
NHLH2-201ENST00000320238 ARMCX5Q6P1M9 558 aa22.17■■□□□ 1.14
NHLH2-201ENST00000320238 GRAMD1CQ8IYS0 662 aa22.17■■□□□ 1.14
NHLH2-201ENST00000320238 JMYQ8N9B5 988 aa22.17■■□□□ 1.14
NHLH2-201ENST00000320238 CNNM3Q8NE01 707 aa22.17■■□□□ 1.14
NHLH2-201ENST00000320238 DPF2Q92785 391 aa22.17■■□□□ 1.14
NHLH2-201ENST00000320238 NOL12Q9UGY1 213 aaKnown RBP eCLIP22.17■■□□□ 1.14
NHLH2-201ENST00000320238 V9GYY5 206 aaPredicted RBP22.17■■□□□ 1.14
NHLH2-201ENST00000320238 C4AP0C0L4 1744 aa22.17■■□□□ 1.14
NHLH2-201ENST00000320238 C4BP0C0L5 1744 aa22.17■■□□□ 1.14
NHLH2-201ENST00000320238 RESP18Q5W5W9 173 aa22.17■■□□□ 1.14
NHLH2-201ENST00000320238 HSD3B7Q9H2F3 369 aa22.17■■□□□ 1.14
NHLH2-201ENST00000320238 PRDM10Q9NQV6 1147 aa22.17■■□□□ 1.14
NHLH2-201ENST00000320238 MMP1P03956 469 aa22.16■■□□□ 1.14
NHLH2-201ENST00000320238 IFNAR1P17181 557 aa22.16■■□□□ 1.14
NHLH2-201ENST00000320238 SART3Q15020 963 aaKnown RBP22.16■■□□□ 1.14
NHLH2-201ENST00000320238 PTPN14Q15678 1187 aa22.16■■□□□ 1.14
NHLH2-201ENST00000320238 SLC4A8Q2Y0W8 1093 aa22.16■■□□□ 1.14
NHLH2-201ENST00000320238 CCDC112Q8NEF3 446 aa22.16■■□□□ 1.14
NHLH2-201ENST00000320238 STAG1Q8WVM7 1258 aa22.16■■□□□ 1.14
NHLH2-201ENST00000320238 UBAC1Q9BSL1 405 aa22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 8.5 ms