RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000261407.8

LPCAT3-201, Transcript of lysophosphatidylcholine acyltransferase 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene LPCAT3, Length 2,268 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LPCAT3-201ENST00000261407 SLC3A2P08195 630 aaKnown RBP22.29■■□□□ 1.16
LPCAT3-201ENST00000261407 CMA1P23946 247 aa22.29■■□□□ 1.16
LPCAT3-201ENST00000261407 GYG1P46976 350 aa22.29■■□□□ 1.16
LPCAT3-201ENST00000261407 ABCF2Q9UG63 623 aa22.29■■□□□ 1.16
LPCAT3-201ENST00000261407 CCDC69A6NI79 296 aa22.28■■□□□ 1.16
LPCAT3-201ENST00000261407 ZNF710Q8N1W2 664 aa22.28■■□□□ 1.16
LPCAT3-201ENST00000261407 PLCH1Q4KWH8 1693 aa22.28■■□□□ 1.16
LPCAT3-201ENST00000261407 LIFRP42702 1097 aa22.28■■□□□ 1.16
LPCAT3-201ENST00000261407 GNL3Q9BVP2 549 aaKnown RBP eCLIP22.28■■□□□ 1.16
LPCAT3-201ENST00000261407 KCNJ14Q9UNX9 436 aa22.28■■□□□ 1.16
LPCAT3-201ENST00000261407 ARAP2Q8WZ64 1704 aa22.27■■□□□ 1.16
LPCAT3-201ENST00000261407 NUTM2BA6NNL0 878 aaPredicted RBP22.27■■□□□ 1.16
LPCAT3-201ENST00000261407 NUTM2EB1AL46 878 aaPredicted RBP22.27■■□□□ 1.16
LPCAT3-201ENST00000261407 CPLX2Q6PUV4 134 aaKnown RBP22.27■■□□□ 1.16
LPCAT3-201ENST00000261407 NBPF11Q86T75 865 aa22.27■■□□□ 1.16
LPCAT3-201ENST00000261407 NUTM2AQ8IVF1 878 aaPredicted RBP22.27■■□□□ 1.16
LPCAT3-201ENST00000261407 USP27XA6NNY8 438 aa22.27■■□□□ 1.16
LPCAT3-201ENST00000261407 PARP10Q53GL7 1025 aa22.27■■□□□ 1.16
LPCAT3-201ENST00000261407 SPECC1Q5M775 1068 aa22.27■■□□□ 1.16
LPCAT3-201ENST00000261407 BTBD18B2RXH4 712 aa22.26■■□□□ 1.15
LPCAT3-201ENST00000261407 U2AF2P26368 475 aaKnown RBP eCLIP22.26■■□□□ 1.15
LPCAT3-201ENST00000261407 GTF2F1P35269 517 aaKnown RBP eCLIP22.26■■□□□ 1.15
LPCAT3-201ENST00000261407 ERFEQ4G0M1 354 aa22.26■■□□□ 1.15
LPCAT3-201ENST00000261407 DOCK2Q92608 1830 aa22.26■■□□□ 1.15
LPCAT3-201ENST00000261407 CYP7A1P22680 504 aa22.26■■□□□ 1.15
LPCAT3-201ENST00000261407 SSRP1Q08945 709 aaKnown RBP22.26■■□□□ 1.15
LPCAT3-201ENST00000261407 NAT10Q9H0A0 1025 aaKnown RBP22.26■■□□□ 1.15
LPCAT3-201ENST00000261407 TAF1P21675 1872 aa22.25■■□□□ 1.15
LPCAT3-201ENST00000261407 MINDY4BA8MYZ0 360 aa22.25■■□□□ 1.15
LPCAT3-201ENST00000261407 SYKP43405 635 aa22.25■■□□□ 1.15
LPCAT3-201ENST00000261407 BICDL1Q6ZP65 573 aa22.25■■□□□ 1.15
LPCAT3-201ENST00000261407 STAG1Q8WVM7 1258 aa22.25■■□□□ 1.15
LPCAT3-201ENST00000261407 ECM29Q5VYK3 1845 aa22.25■■□□□ 1.15
LPCAT3-201ENST00000261407 FMNL1O95466 1100 aaPredicted RBP22.24■■□□□ 1.15
LPCAT3-201ENST00000261407 KRT23Q9C075 422 aa22.24■■□□□ 1.15
LPCAT3-201ENST00000261407 PNPLA7Q6ZV29 1317 aa22.24■■□□□ 1.15
LPCAT3-201ENST00000261407 PNOCQ13519 176 aa22.24■■□□□ 1.15
LPCAT3-201ENST00000261407 TRIM29Q14134 588 aa22.24■■□□□ 1.15
LPCAT3-201ENST00000261407 ZRSR1Q15695 479 aaKnown RBP22.24■■□□□ 1.15
LPCAT3-201ENST00000261407 NUP133Q8WUM0 1156 aa22.24■■□□□ 1.15
LPCAT3-201ENST00000261407 CNNM2Q9H8M5 875 aa22.24■■□□□ 1.15
LPCAT3-201ENST00000261407 HPSEQ9Y251 543 aa22.24■■□□□ 1.15
LPCAT3-201ENST00000261407 WNK3Q9BYP7 1800 aa22.24■■□□□ 1.15
LPCAT3-201ENST00000261407 CYP2D7A0A087X1C5 515 aa22.23■■□□□ 1.15
LPCAT3-201ENST00000261407 NLRP12P59046 1061 aa22.23■■□□□ 1.15
LPCAT3-201ENST00000261407 GRIN1Q05586 938 aa22.23■■□□□ 1.15
LPCAT3-201ENST00000261407 NCAPHQ15003 741 aa22.23■■□□□ 1.15
LPCAT3-201ENST00000261407 WTAPQ15007 396 aa22.23■■□□□ 1.15
LPCAT3-201ENST00000261407 NACAP1Q9BZK3 213 aa22.23■■□□□ 1.15
LPCAT3-201ENST00000261407 RAI14Q9P0K7 980 aa22.23■■□□□ 1.15
LPCAT3-201ENST00000261407 PHLPP1O60346 1717 aa22.23■■□□□ 1.15
LPCAT3-201ENST00000261407 SKILP12757 684 aa22.23■■□□□ 1.15
LPCAT3-201ENST00000261407 IFNAR1P17181 557 aa22.23■■□□□ 1.15
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LPCAT3-201ENST00000261407 BCL9LQ86UU0 1499 aa22.23■■□□□ 1.15
LPCAT3-201ENST00000261407 CHD4Q14839 1912 aa22.22■■□□□ 1.15
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LPCAT3-201ENST00000261407 RTN1Q16799 776 aa22.22■■□□□ 1.15
LPCAT3-201ENST00000261407 LONRF3Q496Y0 759 aa22.22■■□□□ 1.15
LPCAT3-201ENST00000261407 PTF1AQ7RTS3 328 aa22.22■■□□□ 1.15
LPCAT3-201ENST00000261407 BCL2L12Q9HB09 334 aa22.22■■□□□ 1.15
LPCAT3-201ENST00000261407 IFNKQ9P0W0 207 aa22.22■■□□□ 1.15
LPCAT3-201ENST00000261407 COL1A1P02452 1464 aaPredicted RBP22.22■■□□□ 1.15
LPCAT3-201ENST00000261407 FOXN1O15353 648 aa22.22■■□□□ 1.15
LPCAT3-201ENST00000261407 TNNT1P13805 278 aa22.22■■□□□ 1.15
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LPCAT3-201ENST00000261407 CCZ1BP86790 482 aa22.22■■□□□ 1.15
LPCAT3-201ENST00000261407 CCZ1P86791 482 aaPredicted RBP22.22■■□□□ 1.15
LPCAT3-201ENST00000261407 EVX2Q03828 476 aa22.22■■□□□ 1.15
LPCAT3-201ENST00000261407 TPD52L1Q16890 204 aaPredicted RBP22.22■■□□□ 1.15
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LPCAT3-201ENST00000261407 CDCA7Q9BWT1 371 aaPredicted RBP22.22■■□□□ 1.15
LPCAT3-201ENST00000261407 BCL11BQ9C0K0 894 aaPredicted RBP22.22■■□□□ 1.15
LPCAT3-201ENST00000261407 GNAT2P19087 354 aa22.21■■□□□ 1.15
LPCAT3-201ENST00000261407 RBM6P78332 1123 aaKnown RBP22.21■■□□□ 1.15
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LPCAT3-201ENST00000261407 NOSTRINQ8IVI9 506 aa22.21■■□□□ 1.15
LPCAT3-201ENST00000261407 DIS3L2Q8IYB7 885 aaKnown RBP22.21■■□□□ 1.15
LPCAT3-201ENST00000261407 LINC00116Q8NCU8 138 aa22.21■■□□□ 1.15
LPCAT3-201ENST00000261407 UBE2Q2Q8WVN8 375 aa22.21■■□□□ 1.15
LPCAT3-201ENST00000261407 SMC2O95347 1197 aa22.2■■□□□ 1.15
LPCAT3-201ENST00000261407 ATP1A3P13637 1013 aa22.2■■□□□ 1.15
LPCAT3-201ENST00000261407 KLRK1P26718 216 aa22.2■■□□□ 1.15
LPCAT3-201ENST00000261407 LMOD1P29536 600 aaPredicted RBP22.2■■□□□ 1.15
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LPCAT3-201ENST00000261407 CCDC24Q8N4L8 307 aa22.2■■□□□ 1.15
LPCAT3-201ENST00000261407 OXER1Q8TDS5 423 aa22.2■■□□□ 1.15
LPCAT3-201ENST00000261407 ZNF384Q8TF68 577 aa22.2■■□□□ 1.15
LPCAT3-201ENST00000261407 HSD3B7Q9H2F3 369 aa22.2■■□□□ 1.15
LPCAT3-201ENST00000261407 hCG_1642624A0A1W2PR95 340 aa22.2■■□□□ 1.14
LPCAT3-201ENST00000261407 PRDM1O75626 825 aa22.2■■□□□ 1.14
LPCAT3-201ENST00000261407 MMP1P03956 469 aa22.2■■□□□ 1.14
LPCAT3-201ENST00000261407 METTL16Q86W50 562 aaKnown RBP22.2■■□□□ 1.14
LPCAT3-201ENST00000261407 CELF1Q92879 486 aaKnown RBP22.2■■□□□ 1.14
LPCAT3-201ENST00000261407 SHISA4Q96DD7 197 aa22.2■■□□□ 1.14
LPCAT3-201ENST00000261407 TRMT1Q9NXH9 659 aaKnown RBP22.2■■□□□ 1.14
LPCAT3-201ENST00000261407 THRAP3Q9Y2W1 955 aaKnown RBP22.2■■□□□ 1.14
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