RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000173740.1

Lgr5-208, Transcript of Leucine-rich repeat-containing G-protein coupled receptor 5, mouse

TSL 5 BASIC

Gene Lgr5, Length 2,508 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
Lgr5-208	ENSMUST00000173740	Olfr118	Q7TRJ6	321 aa		13.44	□□□□□ -0.26
Lgr5-208	ENSMUST00000173740	Iars	Q8BU30	1262 aa		13.44	□□□□□ -0.26
Lgr5-208	ENSMUST00000173740	Tango6	Q8C3S2	1079 aa		13.44	□□□□□ -0.26
Lgr5-208	ENSMUST00000173740	Pes1	Q9EQ61	584 aa	Known RBP	13.44	□□□□□ -0.26
Lgr5-208	ENSMUST00000173740	Myoz2	Q9JJW5	264 aa		13.44	□□□□□ -0.26
Lgr5-208	ENSMUST00000173740	U2af2	P26369	475 aa	Known RBP	13.44	□□□□□ -0.26
Lgr5-208	ENSMUST00000173740	Zfp113	Q8C689	439 aa		13.44	□□□□□ -0.26
Lgr5-208	ENSMUST00000173740	Bloc1s2	Q9CWG9	143 aa		13.44	□□□□□ -0.26
Lgr5-208	ENSMUST00000173740	Ptf1a	Q9QX98	324 aa		13.44	□□□□□ -0.26
Lgr5-208	ENSMUST00000173740	Tnni2	P13412	182 aa		13.43	□□□□□ -0.26
Lgr5-208	ENSMUST00000173740	Fsd1	Q7TPM6	496 aa		13.43	□□□□□ -0.26
Lgr5-208	ENSMUST00000173740	Gtf2i	Q9ESZ8	998 aa	Known RBP	13.43	□□□□□ -0.26
Lgr5-208	ENSMUST00000173740	Vsig10	D3YX43	558 aa		13.43	□□□□□ -0.26
Lgr5-208	ENSMUST00000173740	Usp17lb	E9Q9U0	468 aa		13.43	□□□□□ -0.26
Lgr5-208	ENSMUST00000173740	Rgs9	O54828	675 aa		13.43	□□□□□ -0.26
Lgr5-208	ENSMUST00000173740	Gadd45b	P22339	160 aa		13.43	□□□□□ -0.26
Lgr5-208	ENSMUST00000173740	Terf1	P70371	421 aa		13.43	□□□□□ -0.26
Lgr5-208	ENSMUST00000173740	Sirt2	Q8VDQ8	389 aa		13.43	□□□□□ -0.26
Lgr5-208	ENSMUST00000173740	Aox1	O54754	1333 aa		13.43	□□□□□ -0.26
Lgr5-208	ENSMUST00000173740	Kcng1	A2BDX4	514 aa		13.42	□□□□□ -0.26
Lgr5-208	ENSMUST00000173740	Lmnb1	P14733	588 aa	Known RBP	13.42	□□□□□ -0.26
Lgr5-208	ENSMUST00000173740	Ptma	P26350	111 aa		13.42	□□□□□ -0.26
Lgr5-208	ENSMUST00000173740	Nell2	Q61220	819 aa		13.42	□□□□□ -0.26
Lgr5-208	ENSMUST00000173740	Slc44a1	Q6X893	653 aa		13.42	□□□□□ -0.26
Lgr5-208	ENSMUST00000173740	Iffo2	Q8R2V2	512 aa		13.42	□□□□□ -0.26
Lgr5-208	ENSMUST00000173740	Krt84	Q99M73	603 aa		13.42	□□□□□ -0.26
Lgr5-208	ENSMUST00000173740	Odf2l	Q9D478	642 aa		13.42	□□□□□ -0.26
Lgr5-208	ENSMUST00000173740	Zfp646	Q6NV66	1788 aa		13.42	□□□□□ -0.26
Lgr5-208	ENSMUST00000173740	Kifc2	O08672	792 aa		13.42	□□□□□ -0.26
Lgr5-208	ENSMUST00000173740	Abl1	P00520	1123 aa		13.42	□□□□□ -0.26
Lgr5-208	ENSMUST00000173740	Rpusd2	Q149F1	553 aa		13.42	□□□□□ -0.26
Lgr5-208	ENSMUST00000173740	Gpr101	Q80T62	511 aa		13.42	□□□□□ -0.26
Lgr5-208	ENSMUST00000173740	Stn1	Q8K2X3	378 aa		13.42	□□□□□ -0.26
Lgr5-208	ENSMUST00000173740	Col20a1	Q923P0	1320 aa		13.42	□□□□□ -0.26
Lgr5-208	ENSMUST00000173740	Wdpcp	Q8C456	722 aa		13.41	□□□□□ -0.26
Lgr5-208	ENSMUST00000173740	Rufy2	Q8R4C2	606 aa		13.41	□□□□□ -0.26
Lgr5-208	ENSMUST00000173740	Ptms	Q9D0J8	101 aa	Known RBP	13.41	□□□□□ -0.26
Lgr5-208	ENSMUST00000173740	Ccdc39	Q9D5Y1	937 aa		13.41	□□□□□ -0.26
Lgr5-208	ENSMUST00000173740	Cyp26a1	O55127	497 aa		13.41	□□□□□ -0.26
Lgr5-208	ENSMUST00000173740	Aaas	P58742	546 aa		13.41	□□□□□ -0.26
Lgr5-208	ENSMUST00000173740	Ppp4c	P97470	307 aa		13.41	□□□□□ -0.26
Lgr5-208	ENSMUST00000173740	Limch1	Q3UH68	1057 aa		13.41	□□□□□ -0.26
Lgr5-208	ENSMUST00000173740	Babam1	Q3UI43	333 aa		13.41	□□□□□ -0.26
Lgr5-208	ENSMUST00000173740	Dym	Q8CHY3	669 aa		13.41	□□□□□ -0.26
Lgr5-208	ENSMUST00000173740	Cep57l1	Q8VDS7	400 aa		13.41	□□□□□ -0.26
Lgr5-208	ENSMUST00000173740	Zwint	Q9CQU5	252 aa		13.41	□□□□□ -0.26
Lgr5-208	ENSMUST00000173740	Naaladl2	A0A0N4SUJ3	795 aa		13.4	□□□□□ -0.26
Lgr5-208	ENSMUST00000173740	Gm36210	A0A1B0GS00	229 aa		13.4	□□□□□ -0.26
Lgr5-208	ENSMUST00000173740	Ncbp1	Q3UYV9	790 aa	Known RBP	13.4	□□□□□ -0.26
Lgr5-208	ENSMUST00000173740	Atp2b4	Q6Q477	1205 aa		13.4	□□□□□ -0.26
Lgr5-208	ENSMUST00000173740	Pdzph1	Q8BGR1	1238 aa		13.4	□□□□□ -0.26
Lgr5-208	ENSMUST00000173740	Tpcn2	Q8BWC0	731 aa		13.4	□□□□□ -0.26
Lgr5-208	ENSMUST00000173740	Inpp5b	Q8K337	993 aa		13.4	□□□□□ -0.26
Lgr5-208	ENSMUST00000173740	Trim59	Q922Y2	403 aa		13.4	□□□□□ -0.26
Lgr5-208	ENSMUST00000173740	Suclg2	Q9Z2I8	433 aa		13.4	□□□□□ -0.26
Lgr5-208	ENSMUST00000173740	Ltbp2	O08999	1813 aa		13.4	□□□□□ -0.26
Lgr5-208	ENSMUST00000173740	Dync1i1	O88485	628 aa		13.4	□□□□□ -0.26
Lgr5-208	ENSMUST00000173740	Llgl2	Q3TJ91	1027 aa		13.4	□□□□□ -0.26
Lgr5-208	ENSMUST00000173740	Cnnm2	Q3TWN3	875 aa		13.4	□□□□□ -0.26
Lgr5-208	ENSMUST00000173740	Aak1	Q3UHJ0	959 aa		13.4	□□□□□ -0.26
Lgr5-208	ENSMUST00000173740	Leo1	Q5XJE5	667 aa		13.4	□□□□□ -0.26
Lgr5-208	ENSMUST00000173740	Tm4sf1	Q64302	202 aa		13.4	□□□□□ -0.26
Lgr5-208	ENSMUST00000173740	Ccdc66	Q6NS45	935 aa		13.4	□□□□□ -0.26
Lgr5-208	ENSMUST00000173740	Ccar2	Q8VDP4	922 aa	Known RBP	13.4	□□□□□ -0.26
Lgr5-208	ENSMUST00000173740	Gpr108	Q91WD0	569 aa		13.4	□□□□□ -0.26
Lgr5-208	ENSMUST00000173740	Txnrd3	Q99MD6	652 aa		13.4	□□□□□ -0.26
Lgr5-208	ENSMUST00000173740	Tcof1	O08784	1320 aa	Known RBP	13.4	□□□□□ -0.26
Lgr5-208	ENSMUST00000173740	Ecm29	Q6PDI5	1840 aa		13.39	□□□□□ -0.27
Lgr5-208	ENSMUST00000173740	Asns	Q61024	561 aa		13.39	□□□□□ -0.27
Lgr5-208	ENSMUST00000173740	Ankrd13a	Q80UP5	588 aa		13.39	□□□□□ -0.27
Lgr5-208	ENSMUST00000173740	Hps6	Q8BLY7	805 aa		13.39	□□□□□ -0.27
Lgr5-208	ENSMUST00000173740	Fam177a1	Q8BR63	207 aa		13.39	□□□□□ -0.27
Lgr5-208	ENSMUST00000173740	9230110C19Rik	Q8CC70	267 aa		13.39	□□□□□ -0.27
Lgr5-208	ENSMUST00000173740	Plekhg6	Q8R0J1	787 aa		13.39	□□□□□ -0.27
Lgr5-208	ENSMUST00000173740	Trpc5	Q9QX29	975 aa		13.39	□□□□□ -0.27
Lgr5-208	ENSMUST00000173740	Psme4	Q5SSW2	1843 aa		13.39	□□□□□ -0.27
Lgr5-208	ENSMUST00000173740	Sall1	Q9ER74	1322 aa		13.39	□□□□□ -0.27
Lgr5-208	ENSMUST00000173740	Psen1	P49769	467 aa		13.39	□□□□□ -0.27
Lgr5-208	ENSMUST00000173740	Ttll4	Q80UG8	1193 aa		13.39	□□□□□ -0.27
Lgr5-208	ENSMUST00000173740	Terb1	Q8C0V1	768 aa		13.39	□□□□□ -0.27
Lgr5-208	ENSMUST00000173740	Myl6b	Q8CI43	207 aa		13.39	□□□□□ -0.27
Lgr5-208	ENSMUST00000173740	Cerk	Q8K4Q7	531 aa		13.39	□□□□□ -0.27
Lgr5-208	ENSMUST00000173740	Ciapin1	Q8WTY4	309 aa		13.39	□□□□□ -0.27
Lgr5-208	ENSMUST00000173740	Hps4	Q99KG7	671 aa		13.39	□□□□□ -0.27
Lgr5-208	ENSMUST00000173740	Mtmr2	Q9Z2D1	643 aa		13.39	□□□□□ -0.27
Lgr5-208	ENSMUST00000173740	Fosb	P13346	338 aa		13.38	□□□□□ -0.27
Lgr5-208	ENSMUST00000173740	Mmp14	P53690	582 aa		13.38	□□□□□ -0.27
Lgr5-208	ENSMUST00000173740	Dnajc2	P54103	621 aa	Known RBP	13.38	□□□□□ -0.27
Lgr5-208	ENSMUST00000173740	Sec23a	Q01405	765 aa		13.38	□□□□□ -0.27
Lgr5-208	ENSMUST00000173740	Ehmt1	Q5DW34	1296 aa		13.38	□□□□□ -0.27
Lgr5-208	ENSMUST00000173740	Ifit1	Q64282	463 aa		13.38	□□□□□ -0.27
Lgr5-208	ENSMUST00000173740	Pramel6	Q810Y9	485 aa		13.38	□□□□□ -0.27
Lgr5-208	ENSMUST00000173740	Bola3	Q8CEI1	110 aa		13.38	□□□□□ -0.27
Lgr5-208	ENSMUST00000173740	Oscar	Q8VBT3	265 aa		13.38	□□□□□ -0.27
Lgr5-208	ENSMUST00000173740	Rgs12	Q8CGE9	1381 aa		13.38	□□□□□ -0.27
Lgr5-208	ENSMUST00000173740	Nmt2	O70311	529 aa		13.38	□□□□□ -0.27
Lgr5-208	ENSMUST00000173740	Mtx1	P47802	317 aa		13.38	□□□□□ -0.27
Lgr5-208	ENSMUST00000173740	Znf18	Q810A1	556 aa		13.38	□□□□□ -0.27
Lgr5-208	ENSMUST00000173740	Ano1	Q8BHY3	960 aa		13.38	□□□□□ -0.27
Lgr5-208	ENSMUST00000173740	Tbc1d23	Q8K0F1	684 aa		13.38	□□□□□ -0.27

Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 17.2 ms