RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000167111.5

Rabggtb-202, Transcript of Geranylgeranyl transferase type-2 subunit beta, mousemouse

TSL 1 (best) BASIC

Gene Rabggtb, Length 1,418 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Garem2Q6PAJ3 880 aa13.61□□□□□ -0.23
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Sptlc3Q8BG54 563 aa13.61□□□□□ -0.23
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Ric3Q8BPM6 367 aa13.61□□□□□ -0.23
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Btnl4A2CG29 586 aa13.6□□□□□ -0.23
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Trim5E9PV98 497 aa13.6□□□□□ -0.23
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Zfp953Q3UPV7 304 aa13.6□□□□□ -0.23
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Mrs2Q5NCE8 434 aa13.6□□□□□ -0.23
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Tbc1d9bQ5SVR0 1263 aa13.6□□□□□ -0.23
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Acap3Q6NXL5 833 aa13.6□□□□□ -0.23
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Xrn2Q9DBR1 951 aaKnown RBP13.6□□□□□ -0.23
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Rbm6S4R1W5 1118 aaKnown RBP13.6□□□□□ -0.23
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Grem2O88273 168 aa13.59□□□□□ -0.23
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 DcxO88809 366 aa13.59□□□□□ -0.23
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 FlgP11088 336 aa13.59□□□□□ -0.23
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Sept1P42209 366 aa13.59□□□□□ -0.23
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Eif5P59325 429 aaKnown RBP13.59□□□□□ -0.23
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 G3bp1P97855 465 aaKnown RBP13.59□□□□□ -0.23
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 MarsQ68FL6 902 aaKnown RBP13.59□□□□□ -0.23
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Pram1Q6BCL1 675 aa13.59□□□□□ -0.23
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Senp6Q6P7W0 1132 aa13.59□□□□□ -0.23
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Ube2q1Q7TSS2 422 aa13.59□□□□□ -0.23
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Pof1bQ8K4L4 587 aa13.59□□□□□ -0.23
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Ero1aQ8R180 464 aa13.59□□□□□ -0.23
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Smc1bQ920F6 1248 aa13.59□□□□□ -0.23
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Slc27a3O88561 667 aa13.58□□□□□ -0.24
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Samd11Q1RNF8 542 aa13.58□□□□□ -0.24
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Ccdc30Q8BVF4 654 aa13.58□□□□□ -0.24
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Yipf1Q91VU1 306 aa13.58□□□□□ -0.24
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Snapc2Q91XA5 359 aa13.58□□□□□ -0.24
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Ciao1Q99KN2 339 aa13.58□□□□□ -0.24
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Mov10l1Q99MV5 1187 aa13.58□□□□□ -0.24
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 GrapQ9CX99 217 aa13.58□□□□□ -0.24
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Sept14Q9DA97 430 aa13.58□□□□□ -0.24
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Med23Q80YQ2 1367 aa13.58□□□□□ -0.24
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Arfgef1G3X9K3 1846 aaKnown RBP13.58□□□□□ -0.24
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 SrcapA0A087WQ44 3271 aa13.57□□□□□ -0.24
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 B020004C17RikJ3QP07 232 aa13.57□□□□□ -0.24
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Lamp1P11438 406 aaKnown RBP13.57□□□□□ -0.24
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Cavin2Q63918 418 aaKnown RBP13.57□□□□□ -0.24
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Ubap2lQ80X50 1107 aaKnown RBP13.57□□□□□ -0.24
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Nim1kQ8BHI9 436 aa13.57□□□□□ -0.24
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Anks4bQ8K3X6 423 aa13.57□□□□□ -0.24
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Traf7Q922B6 594 aa13.57□□□□□ -0.24
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 PfkpQ9WUA3 784 aaKnown RBP13.57□□□□□ -0.24
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 1700003F12RikA2AKE5 210 aa13.56□□□□□ -0.24
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Hcn4O70507 1186 aa13.56□□□□□ -0.24
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 GclcP97494 637 aa13.56□□□□□ -0.24
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 SfswapQ3USH5 945 aaKnown RBP13.56□□□□□ -0.24
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Ccne2Q9Z238 404 aa13.56□□□□□ -0.24
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 RptorQ8K4Q0 1335 aa13.56□□□□□ -0.24
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Palm3A2TJV2 734 aa13.56□□□□□ -0.24
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Cntnap5bQ0V8T8 1292 aa13.56□□□□□ -0.24
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Hs1bp3Q3TC93 395 aa13.56□□□□□ -0.24
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Sv2cQ69ZS6 727 aa13.56□□□□□ -0.24
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Slc9c1Q6UJY2 1175 aa13.56□□□□□ -0.24
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 PaoxQ8C0L6 504 aa13.56□□□□□ -0.24
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Taf5lQ91WQ5 589 aa13.56□□□□□ -0.24
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Ngly1Q9JI78 651 aa13.56□□□□□ -0.24
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Mms22lB1AUR6 1238 aa13.55□□□□□ -0.24
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Ankrd44B2RXR6 993 aa13.55□□□□□ -0.24
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Has3O08650 554 aa13.55□□□□□ -0.24
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 ThbdP15306 577 aa13.55□□□□□ -0.24
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Atp9bP98195 1146 aa13.55□□□□□ -0.24
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Dcaf15Q6PFH3 600 aa13.55□□□□□ -0.24
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Tmem87bQ8BKU8 555 aa13.55□□□□□ -0.24
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Piezo2Q8CD54 2822 aa13.54□□□□□ -0.24
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 SktA2AQ25 1946 aaKnown RBP13.54□□□□□ -0.24
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Pramef17A2ASJ1 475 aa13.54□□□□□ -0.24
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Cdcp1Q5U462 833 aa13.54□□□□□ -0.24
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Zfp90Q61967 636 aa13.54□□□□□ -0.24
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Mak16Q8BGS0 296 aaKnown RBP13.54□□□□□ -0.24
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Ift57Q8BXG3 429 aa13.54□□□□□ -0.24
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Dis3l2Q8CI75 870 aaKnown RBP13.54□□□□□ -0.24
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 HdlbpQ8VDJ3 1268 aaKnown RBP13.54□□□□□ -0.24
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Fam84aQ9D650 292 aa13.54□□□□□ -0.24
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Fam205a1D3YZF6 1314 aa13.53□□□□□ -0.24
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Ccdc171E9Q1U1 1324 aa13.53□□□□□ -0.24
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Jbts17Q8CE72 3214 aa13.53□□□□□ -0.24
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Cacna1fQ9JIS7 1985 aa13.53□□□□□ -0.24
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Gm9857F7CXR1 130 aa13.53□□□□□ -0.24
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Tuft1O08970 390 aa13.53□□□□□ -0.24
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Pa2g4P50580 394 aaKnown RBP13.53□□□□□ -0.24
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Cyp26b1Q811W2 512 aa13.53□□□□□ -0.24
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 MylipQ8BM54 445 aa13.53□□□□□ -0.24
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Prb1Q91X93 504 aa13.53□□□□□ -0.24
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Zbed3Q9D0L1 228 aa13.53□□□□□ -0.24
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Tceal9Q9DD24 104 aa13.53□□□□□ -0.24
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Rad9aQ9Z0F6 389 aa13.53□□□□□ -0.24
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Disp2Q8CIP5 1345 aa13.53□□□□□ -0.24
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Myh13B1AR69 1938 aa13.52□□□□□ -0.24
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Pnmal2G3X9N3 661 aa13.52□□□□□ -0.25
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Slc6a20bO88575 635 aa13.52□□□□□ -0.25
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Morf4l1P60762 362 aa13.52□□□□□ -0.25
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Fam83hQ148V8 1209 aa13.52□□□□□ -0.25
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Klhdc9Q3USL1 350 aa13.52□□□□□ -0.25
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Kiaa1211Q5PR69 1207 aa13.52□□□□□ -0.25
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Fxr1Q61584 677 aaKnown RBP13.52□□□□□ -0.25
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Fndc3bQ6NWW9 1207 aaKnown RBP13.52□□□□□ -0.25
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Dync1li2Q6PDL0 492 aaKnown RBP13.52□□□□□ -0.25
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Sbf1Q6ZPE2 1867 aa13.52□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 12.9 ms