RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000107060.7

Eftud2-202, Transcript of 116 kDa U5 small nuclear ribonucleoprotein component, mousemouse

TSL 1 (best) BASIC

Gene Eftud2, Length 3,339 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Znf638Q61464 1960 aaKnown RBP17.33■□□□□ 0.36
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Cspp1B2RX88 1205 aa17.33■□□□□ 0.36
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Gzf1Q4VBD9 706 aa17.33■□□□□ 0.36
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Stk38Q91VJ4 465 aa17.33■□□□□ 0.36
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Tmed8Q3UHI4 326 aa17.32■□□□□ 0.36
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Ctr9Q62018 1173 aaKnown RBP17.32■□□□□ 0.36
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Arid3aQ62431 601 aa17.32■□□□□ 0.36
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Ppp2r5bQ6PD28 497 aa17.32■□□□□ 0.36
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Dhx40Q6PE54 779 aaKnown RBP17.32■□□□□ 0.36
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Glis3Q6XP49 780 aa17.32■□□□□ 0.36
Eftud2-202ENSMUST00000107060 IqcgQ80W32 419 aa17.32■□□□□ 0.36
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Amhr2Q8K592 568 aa17.32■□□□□ 0.36
Eftud2-202ENSMUST00000107060 HelbQ6NVF4 1074 aa17.32■□□□□ 0.36
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Sox30Q8CGW4 782 aa17.32■□□□□ 0.36
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Ccer1Q9CQL2 403 aa17.32■□□□□ 0.36
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Oas2E9Q9A9 742 aa17.32■□□□□ 0.36
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Tpm3P21107 285 aaKnown RBP17.32■□□□□ 0.36
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Wasf1Q8R5H6 559 aa17.32■□□□□ 0.36
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Lrrc2Q8VDB8 371 aa17.32■□□□□ 0.36
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Ppp1r21Q3TDD9 780 aa17.31■□□□□ 0.36
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Otop3Q80UF9 577 aa17.31■□□□□ 0.36
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Pcdhb14Q6PB90 796 aa17.31■□□□□ 0.36
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Rtn1Q8K0T0 780 aa17.31■□□□□ 0.36
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Eif4enif1Q9EST3 983 aaKnown RBP17.31■□□□□ 0.36
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Gm7347D3YYI9 267 aa17.31■□□□□ 0.36
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Speer4aF8VPX6 267 aa17.31■□□□□ 0.36
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Mapkapk5O54992 473 aa17.31■□□□□ 0.36
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Golph3lQ8R088 285 aaKnown RBP17.31■□□□□ 0.36
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Dnm1P39053 867 aa17.3■□□□□ 0.36
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Atxn2lQ7TQH0 1049 aaKnown RBP17.3■□□□□ 0.36
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Efcc1Q9JJF6 558 aa17.3■□□□□ 0.36
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Bend4P86174 541 aa17.3■□□□□ 0.36
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Polr3gQ6NXY9 223 aa17.3■□□□□ 0.36
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Pfkfb1P70266 471 aa17.29■□□□□ 0.36
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Fam170aQ66LM6 333 aa17.29■□□□□ 0.36
Eftud2-202ENSMUST00000107060 CerkQ8K4Q7 531 aa17.29■□□□□ 0.36
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Stk39Q9Z1W9 556 aa17.29■□□□□ 0.36
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Tsc2Q61037 1814 aa17.29■□□□□ 0.36
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Sh3tc1G3X9F6 1346 aa17.29■□□□□ 0.36
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Atp2b1G5E829 1220 aa17.29■□□□□ 0.36
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Nop14Q8R3N1 860 aaKnown RBP17.29■□□□□ 0.36
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Slfn1Q9Z0I7 337 aa17.29■□□□□ 0.36
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Arhgef16Q3U5C8 713 aa17.29■□□□□ 0.36
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Nup188Q6ZQH8 1759 aa17.28■□□□□ 0.36
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Zfp202Q8C879 641 aa17.28■□□□□ 0.36
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Ints4Q8CIM8 964 aa17.28■□□□□ 0.36
Eftud2-202ENSMUST00000107060 XpcP51612 930 aa17.28■□□□□ 0.36
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Pus7lQ8CE46 702 aa17.28■□□□□ 0.36
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Acot9Q9R0X4 439 aaKnown RBP17.28■□□□□ 0.36
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Peak1Q69Z38 1735 aa17.28■□□□□ 0.36
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Scn9aQ62205 1984 aa17.28■□□□□ 0.36
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Epb41l2O70318 988 aaKnown RBP17.27■□□□□ 0.36
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Eva1cP58659 440 aa17.27■□□□□ 0.36
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Cfap69Q8BH53 942 aa17.27■□□□□ 0.36
Eftud2-202ENSMUST00000107060 QarsQ8BML9 775 aa17.27■□□□□ 0.36
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Tspyl4Q8VD63 406 aa17.27■□□□□ 0.36
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Tbc1d8bA3KGB4 1114 aa17.27■□□□□ 0.36
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Prss40A6H6T1 365 aa17.27■□□□□ 0.36
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Dnaaf2Q8BPI1 814 aa17.27■□□□□ 0.36
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Q8BZJ8 459 aa17.27■□□□□ 0.36
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Inpp5bQ8K337 993 aa17.27■□□□□ 0.36
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Col4a5Q63ZW6 1691 aa17.27■□□□□ 0.36
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Kif1bpQ6ZPU9 617 aa17.27■□□□□ 0.35
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Tbc1d5Q80XQ2 815 aa17.27■□□□□ 0.35
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Evc2Q8K1G2 1220 aa17.27■□□□□ 0.35
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Filip1Q9CS72 1211 aa17.27■□□□□ 0.35
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Epb41l3Q9WV92 929 aa17.27■□□□□ 0.35
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Dydc2Q9D3X8 139 aa17.26■□□□□ 0.35
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Letm1Q9Z2I0 738 aa17.26■□□□□ 0.35
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Atp8b5A3FIN4 1183 aa17.26■□□□□ 0.35
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Ampd3O08739 766 aa17.26■□□□□ 0.35
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Cavin1O54724 392 aa17.26■□□□□ 0.35
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Tnni2P13412 182 aa17.26■□□□□ 0.35
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Cdk4P30285 303 aa17.26■□□□□ 0.35
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Tlcd1Q99JT6 247 aa17.26■□□□□ 0.35
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Tob2Q9JM55 345 aa17.26■□□□□ 0.35
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Col20a1Q923P0 1320 aa17.26■□□□□ 0.35
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Cplx1P63040 134 aa17.26■□□□□ 0.35
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Nucb2P81117 420 aa17.26■□□□□ 0.35
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Prl2c1Q5SVL9 228 aa17.26■□□□□ 0.35
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Adck5Q80V03 582 aa17.26■□□□□ 0.35
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Tcp11l1Q8BTG3 509 aa17.26■□□□□ 0.35
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Prpf3Q922U1 683 aaKnown RBP17.26■□□□□ 0.35
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Rbm6S4R1W5 1118 aaKnown RBP17.26■□□□□ 0.35
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Tpm2P58774 284 aa17.25■□□□□ 0.35
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Fxr1Q61584 677 aaKnown RBP17.25■□□□□ 0.35
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Haus7Q8BKT8 364 aa17.25■□□□□ 0.35
Eftud2-202ENSMUST00000107060 CrebrfQ8CDG5 640 aaKnown RBP17.25■□□□□ 0.35
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Etnk1Q9D4V0 363 aa17.25■□□□□ 0.35
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Ltbp2O08999 1813 aa17.25■□□□□ 0.35
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Cyp3a25O09158 503 aa17.25■□□□□ 0.35
Eftud2-202ENSMUST00000107060 CebpaP53566 359 aa17.25■□□□□ 0.35
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Fam83bQ0VBM2 1012 aa17.25■□□□□ 0.35
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Strip1Q8C079 837 aa17.25■□□□□ 0.35
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Zfp831A2ADM8 1628 aa17.25■□□□□ 0.35
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Fam89aQ14BJ1 175 aa17.24■□□□□ 0.35
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Kif22Q3V300 660 aa17.24■□□□□ 0.35
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Ttll4Q80UG8 1193 aa17.24■□□□□ 0.35
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Ano10Q8BH79 659 aa17.24■□□□□ 0.35
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Q8BT18 775 aa17.24■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 23.5 ms