RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000023363.6

Rrn3-201, Transcript of RNA polymerase I-specific transcription initiation factor RRN3, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Rrn3, Length 3,597 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrn3-201ENSMUST00000023363 Myo1bP46735 1107 aa11.22□□□□□ -0.61
Rrn3-201ENSMUST00000023363 SrprbP47758 269 aa11.22□□□□□ -0.61
Rrn3-201ENSMUST00000023363 1700013D24RikQ0P521 120 aa11.22□□□□□ -0.61
Rrn3-201ENSMUST00000023363 HelbQ6NVF4 1074 aa11.22□□□□□ -0.61
Rrn3-201ENSMUST00000023363 Drc7Q6V3W6 876 aa11.22□□□□□ -0.61
Rrn3-201ENSMUST00000023363 Pcdhb22Q91XZ8 794 aa11.22□□□□□ -0.61
Rrn3-201ENSMUST00000023363 Nop2Q922K7 793 aaKnown RBP11.22□□□□□ -0.61
Rrn3-201ENSMUST00000023363 Dph6Q9CQ28 267 aa11.22□□□□□ -0.61
Rrn3-201ENSMUST00000023363 Slc7a3P70423 618 aa11.22□□□□□ -0.61
Rrn3-201ENSMUST00000023363 Taf3Q5HZG4 932 aa11.22□□□□□ -0.61
Rrn3-201ENSMUST00000023363 Tmem59lQ7TNI2 337 aa11.22□□□□□ -0.61
Rrn3-201ENSMUST00000023363 Otud6bQ8K2H2 294 aa11.22□□□□□ -0.61
Rrn3-201ENSMUST00000023363 Sumf1Q8R0F3 372 aa11.22□□□□□ -0.61
Rrn3-201ENSMUST00000023363 Galntl5Q9D4M9 431 aa11.22□□□□□ -0.61
Rrn3-201ENSMUST00000023363 Pcdhb9E9Q5G2 828 aa11.21□□□□□ -0.61
Rrn3-201ENSMUST00000023363 Map3k12Q60700 888 aa11.21□□□□□ -0.61
Rrn3-201ENSMUST00000023363 Dhx40Q6PE54 779 aaKnown RBP11.21□□□□□ -0.61
Rrn3-201ENSMUST00000023363 Zfp202Q8C879 641 aa11.21□□□□□ -0.61
Rrn3-201ENSMUST00000023363 Iqca1Q9CUL5 857 aa11.21□□□□□ -0.61
Rrn3-201ENSMUST00000023363 Dynll2Q9D0M5 89 aa11.21□□□□□ -0.61
Rrn3-201ENSMUST00000023363 Acot9Q9R0X4 439 aaKnown RBP11.21□□□□□ -0.61
Rrn3-201ENSMUST00000023363 NfixP70257 488 aa11.21□□□□□ -0.62
Rrn3-201ENSMUST00000023363 Frat1P70339 274 aa11.21□□□□□ -0.62
Rrn3-201ENSMUST00000023363 Lrit1Q8K099 624 aa11.21□□□□□ -0.62
Rrn3-201ENSMUST00000023363 Evc2Q8K1G2 1220 aa11.21□□□□□ -0.62
Rrn3-201ENSMUST00000023363 Mei1Q9D4I2 1268 aa11.21□□□□□ -0.62
Rrn3-201ENSMUST00000023363 WtapQ9ER69 396 aa11.21□□□□□ -0.62
Rrn3-201ENSMUST00000023363 Pramel3A2AHA7 463 aa11.21□□□□□ -0.62
Rrn3-201ENSMUST00000023363 Gm7903A2AWL1 463 aa11.21□□□□□ -0.62
Rrn3-201ENSMUST00000023363 AV320801A2AWL3 467 aa11.21□□□□□ -0.62
Rrn3-201ENSMUST00000023363 Gm15023L7MUB4 467 aa11.21□□□□□ -0.62
Rrn3-201ENSMUST00000023363 Cyp26a1O55127 497 aa11.21□□□□□ -0.62
Rrn3-201ENSMUST00000023363 Plcb3P51432 1234 aaKnown RBP11.21□□□□□ -0.62
Rrn3-201ENSMUST00000023363 Telo2Q9DC40 840 aaKnown RBP11.21□□□□□ -0.62
Rrn3-201ENSMUST00000023363 Tcof1O08784 1320 aaKnown RBP11.21□□□□□ -0.62
Rrn3-201ENSMUST00000023363 Card6E9PWH2 1175 aa11.2□□□□□ -0.62
Rrn3-201ENSMUST00000023363 Cyp2d9P11714 504 aa11.2□□□□□ -0.62
Rrn3-201ENSMUST00000023363 Cep63Q3UPP8 700 aa11.2□□□□□ -0.62
Rrn3-201ENSMUST00000023363 Ift122Q6NWV3 1182 aa11.2□□□□□ -0.62
Rrn3-201ENSMUST00000023363 Ehd2Q8BH64 543 aa11.2□□□□□ -0.62
Rrn3-201ENSMUST00000023363 Xpo4Q9ESJ0 1151 aa11.2□□□□□ -0.62
Rrn3-201ENSMUST00000023363 Gm43638A0A0J9YU36 694 aa11.2□□□□□ -0.62
Rrn3-201ENSMUST00000023363 Izumo3A6PWV3 263 aa11.2□□□□□ -0.62
Rrn3-201ENSMUST00000023363 XpcP51612 930 aa11.2□□□□□ -0.62
Rrn3-201ENSMUST00000023363 Pfkfb1P70266 471 aa11.2□□□□□ -0.62
Rrn3-201ENSMUST00000023363 Tekt3Q6X6Z7 490 aa11.2□□□□□ -0.62
Rrn3-201ENSMUST00000023363 Pramel6Q810Y9 485 aa11.2□□□□□ -0.62
Rrn3-201ENSMUST00000023363 Clic6Q8BHB9 596 aa11.2□□□□□ -0.62
Rrn3-201ENSMUST00000023363 Emilin2Q8K482 1074 aa11.2□□□□□ -0.62
Rrn3-201ENSMUST00000023363 Ube3bQ9ES34 1070 aa11.2□□□□□ -0.62
Rrn3-201ENSMUST00000023363 Mroh6V9GX81 722 aa11.2□□□□□ -0.62
Rrn3-201ENSMUST00000023363 Gm30191A0A0U1RNT7 187 aa11.2□□□□□ -0.62
Rrn3-201ENSMUST00000023363 Prl3d1P18121 224 aa11.2□□□□□ -0.62
Rrn3-201ENSMUST00000023363 C87499Q3UX49 493 aa11.2□□□□□ -0.62
Rrn3-201ENSMUST00000023363 Gtf2iQ9ESZ8 998 aaKnown RBP11.2□□□□□ -0.62
Rrn3-201ENSMUST00000023363 Zscan20B2KFW1 1030 aa11.19□□□□□ -0.62
Rrn3-201ENSMUST00000023363 Nfil3O08750 462 aa11.19□□□□□ -0.62
Rrn3-201ENSMUST00000023363 Mtx1P47802 317 aa11.19□□□□□ -0.62
Rrn3-201ENSMUST00000023363 Eif5P59325 429 aaKnown RBP11.19□□□□□ -0.62
Rrn3-201ENSMUST00000023363 Lrrc43Q3V0L5 667 aa11.19□□□□□ -0.62
Rrn3-201ENSMUST00000023363 Cep120Q7TSG1 988 aa11.19□□□□□ -0.62
Rrn3-201ENSMUST00000023363 CpzQ8R4V4 654 aa11.19□□□□□ -0.62
Rrn3-201ENSMUST00000023363 Washc1Q8VDD8 475 aa11.19□□□□□ -0.62
Rrn3-201ENSMUST00000023363 Hps4Q99KG7 671 aa11.19□□□□□ -0.62
Rrn3-201ENSMUST00000023363 Cep89Q9CZX2 791 aa11.19□□□□□ -0.62
Rrn3-201ENSMUST00000023363 A0A1Y7VML8 143 aa11.19□□□□□ -0.62
Rrn3-201ENSMUST00000023363 Prr16A3KMN5 304 aa11.19□□□□□ -0.62
Rrn3-201ENSMUST00000023363 Oxr1Q4KMM3 866 aa11.19□□□□□ -0.62
Rrn3-201ENSMUST00000023363 ErmnQ5EBJ4 281 aa11.19□□□□□ -0.62
Rrn3-201ENSMUST00000023363 Ankrd13aQ80UP5 588 aa11.19□□□□□ -0.62
Rrn3-201ENSMUST00000023363 Yars2Q8BYL4 472 aaKnown RBP11.19□□□□□ -0.62
Rrn3-201ENSMUST00000023363 Ints4Q8CIM8 964 aa11.19□□□□□ -0.62
Rrn3-201ENSMUST00000023363 Stn1Q8K2X3 378 aa11.19□□□□□ -0.62
Rrn3-201ENSMUST00000023363 Ankrd1Q9CR42 319 aa11.19□□□□□ -0.62
Rrn3-201ENSMUST00000023363 Tnks1bp1P58871 1720 aa11.18□□□□□ -0.62
Rrn3-201ENSMUST00000023363 Mast3Q3U214 1321 aa11.18□□□□□ -0.62
Rrn3-201ENSMUST00000023363 Wdr19Q3UGF1 1341 aa11.18□□□□□ -0.62
Rrn3-201ENSMUST00000023363 Scaf8Q6DID3 1268 aa11.18□□□□□ -0.62
Rrn3-201ENSMUST00000023363 Ube2oQ6ZPJ3 1288 aa11.18□□□□□ -0.62
Rrn3-201ENSMUST00000023363 Ift57Q8BXG3 429 aa11.18□□□□□ -0.62
Rrn3-201ENSMUST00000023363 Ccng2O08918 344 aa11.18□□□□□ -0.62
Rrn3-201ENSMUST00000023363 Dapk3O54784 448 aa11.18□□□□□ -0.62
Rrn3-201ENSMUST00000023363 U2af2P26369 475 aaKnown RBP11.18□□□□□ -0.62
Rrn3-201ENSMUST00000023363 Shisa4Q8CA71 197 aa11.18□□□□□ -0.62
Rrn3-201ENSMUST00000023363 Bola3Q8CEI1 110 aa11.18□□□□□ -0.62
Rrn3-201ENSMUST00000023363 Chaf1aQ9QWF0 911 aa11.18□□□□□ -0.62
Rrn3-201ENSMUST00000023363 Usp5P56399 858 aaKnown RBP11.18□□□□□ -0.62
Rrn3-201ENSMUST00000023363 Kcnq5Q9JK45 933 aa11.18□□□□□ -0.62
Rrn3-201ENSMUST00000023363 Znf568E9PYI1 671 aa11.17□□□□□ -0.62
Rrn3-201ENSMUST00000023363 InhbeO08717 350 aa11.17□□□□□ -0.62
Rrn3-201ENSMUST00000023363 Slc1a4O35874 532 aa11.17□□□□□ -0.62
Rrn3-201ENSMUST00000023363 Dync1i1O88485 628 aa11.17□□□□□ -0.62
Rrn3-201ENSMUST00000023363 TfrcQ62351 763 aaKnown RBP11.17□□□□□ -0.62
Rrn3-201ENSMUST00000023363 Zfp397Q7TNK4 527 aa11.17□□□□□ -0.62
Rrn3-201ENSMUST00000023363 Slx1bQ8BX32 270 aa11.17□□□□□ -0.62
Rrn3-201ENSMUST00000023363 Mrc1Q61830 1456 aa11.17□□□□□ -0.62
Rrn3-201ENSMUST00000023363 Col4a1P02463 1669 aa11.17□□□□□ -0.62
Rrn3-201ENSMUST00000023363 Cyp3a59D3Z2W7 503 aa11.17□□□□□ -0.62
Rrn3-201ENSMUST00000023363 Sept1P42209 366 aa11.17□□□□□ -0.62
Rrn3-201ENSMUST00000023363 Ccdc96Q9CR92 584 aa11.17□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 28.5 ms