RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000008297.4

Clstn3-201, Transcript of Calsyntenin-3, mousemouse

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene Clstn3, Length 4,014 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Ercc6lQ8BHK9 1240 aa10.68□□□□□ -0.7
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Ranbp6Q8BIV3 1105 aa10.68□□□□□ -0.7
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Tfcp2Q9ERA0 502 aa10.68□□□□□ -0.7
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Ube3bQ9ES34 1070 aa10.68□□□□□ -0.7
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Prr16A3KMN5 304 aa10.67□□□□□ -0.7
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Cnga2Q62398 664 aa10.67□□□□□ -0.7
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Tacc1Q6Y685 774 aa10.67□□□□□ -0.7
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Kiaa1524Q8BWY9 907 aa10.67□□□□□ -0.7
Clstn3-201ENSMUST00000008297 ChmQ9QXG2 665 aa10.67□□□□□ -0.7
Clstn3-201ENSMUST00000008297 DonsonQ9QXP4 560 aa10.67□□□□□ -0.7
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Large1Q9Z1M7 756 aa10.67□□□□□ -0.7
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Cdhr2E9Q7P9 1308 aa10.67□□□□□ -0.7
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Pramel3A2AHA7 463 aa10.67□□□□□ -0.7
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Gm7903A2AWL1 463 aa10.67□□□□□ -0.7
Clstn3-201ENSMUST00000008297 AV320801A2AWL3 467 aa10.67□□□□□ -0.7
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Gm15023L7MUB4 467 aa10.67□□□□□ -0.7
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Exosc10P56960 887 aaKnown RBP10.67□□□□□ -0.7
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Ttll12Q3UDE2 639 aa10.67□□□□□ -0.7
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Ppp2r2cQ8BG02 447 aa10.67□□□□□ -0.7
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Trim59Q922Y2 403 aa10.67□□□□□ -0.7
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Trim30cD3YVI9 513 aa10.67□□□□□ -0.7
Clstn3-201ENSMUST00000008297 AK157302I3ITR1 129 aa10.67□□□□□ -0.7
Clstn3-201ENSMUST00000008297 EmbP21995 330 aa10.67□□□□□ -0.7
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Ovgp1Q62010 721 aa10.67□□□□□ -0.7
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Adck5Q80V03 582 aa10.67□□□□□ -0.7
Clstn3-201ENSMUST00000008297 LarsQ8BMJ2 1178 aa10.67□□□□□ -0.7
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Mylk2Q8VCR8 613 aa10.67□□□□□ -0.7
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Lrrc59Q922Q8 307 aaKnown RBP10.67□□□□□ -0.7
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Lonrf3Q9D4H7 753 aa10.67□□□□□ -0.7
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Isca1Q9D924 129 aa10.67□□□□□ -0.7
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Homer1Q9Z2Y3 366 aa10.67□□□□□ -0.7
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Surf1P09925 306 aa10.66□□□□□ -0.7
Clstn3-201ENSMUST00000008297 SsbP32067 415 aaKnown RBP10.66□□□□□ -0.7
Clstn3-201ENSMUST00000008297 RragbQ6NTA4 374 aa10.66□□□□□ -0.7
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Tekt3Q6X6Z7 490 aa10.66□□□□□ -0.7
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Tnrc6bQ8BKI2 1810 aaKnown RBP10.66□□□□□ -0.7
Clstn3-201ENSMUST00000008297 DlatQ8BMF4 642 aa10.66□□□□□ -0.7
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Ccdc73Q8CDM4 1066 aa10.66□□□□□ -0.7
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Sde2Q8K1J5 448 aaKnown RBP10.66□□□□□ -0.7
Clstn3-201ENSMUST00000008297 CltaO08585 235 aa10.66□□□□□ -0.7
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Pip4k2aO70172 405 aa10.66□□□□□ -0.7
Clstn3-201ENSMUST00000008297 MarcksP26645 309 aaKnown RBP10.66□□□□□ -0.7
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Spg7Q3ULF4 781 aa10.66□□□□□ -0.7
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Cep63Q3UPP8 700 aa10.66□□□□□ -0.7
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Cdcp1Q5U462 833 aa10.66□□□□□ -0.7
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Pold4Q9CWP8 107 aa10.66□□□□□ -0.7
Clstn3-201ENSMUST00000008297 1700029H14RikE9PY36 240 aa10.66□□□□□ -0.7
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Cyp2d10P24456 504 aa10.66□□□□□ -0.7
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Q66JV7 365 aa10.66□□□□□ -0.7
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Igsf3Q6ZQA6 1194 aa10.66□□□□□ -0.7
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Ubac1Q8VDI7 409 aa10.66□□□□□ -0.7
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Klf15Q9EPW2 415 aa10.66□□□□□ -0.7
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Foxo3Q9WVH4 672 aa10.66□□□□□ -0.7
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Cyp2j7A0A140T8U1 504 aa10.65□□□□□ -0.7
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Nap1l1P28656 391 aaKnown RBP10.65□□□□□ -0.7
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Pald1P70261 859 aa10.65□□□□□ -0.7
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Ccdc174Q3U155 467 aa10.65□□□□□ -0.7
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Exoc8Q6PGF7 716 aa10.65□□□□□ -0.7
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Ppfibp1Q8C8U0 969 aaKnown RBP10.65□□□□□ -0.7
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Hip1rQ9JKY5 1068 aa10.65□□□□□ -0.7
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Stox1B2RQL2 990 aa10.65□□□□□ -0.7
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Pcdh10E9PXQ7 1057 aa10.65□□□□□ -0.7
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Gm42641I6L9G2 585 aa10.65□□□□□ -0.7
Clstn3-201ENSMUST00000008297 AtripQ8BMG1 785 aa10.65□□□□□ -0.7
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Myl6bQ8CI43 207 aa10.65□□□□□ -0.7
Clstn3-201ENSMUST00000008297 CerkQ8K4Q7 531 aa10.65□□□□□ -0.7
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Tmem132aQ922P8 1018 aa10.65□□□□□ -0.7
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Prr29B1ARI9 187 aa10.65□□□□□ -0.71
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Gm4340L7N2C4 268 aa10.65□□□□□ -0.71
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Slc4a1P04919 929 aa10.65□□□□□ -0.71
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Pafah1b1P63005 410 aaKnown RBP10.65□□□□□ -0.71
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Tbc1d2bQ3U0J8 965 aa10.65□□□□□ -0.71
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Slc5a4bQ91ZP4 660 aa10.65□□□□□ -0.71
Clstn3-201ENSMUST00000008297 AmfrQ9R049 643 aa10.65□□□□□ -0.71
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Suclg2Q9Z2I8 433 aa10.65□□□□□ -0.71
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Prr5lA2AVJ5 370 aa10.64□□□□□ -0.71
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Zfp597E9Q6S0 419 aa10.64□□□□□ -0.71
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Tom1O88746 492 aa10.64□□□□□ -0.71
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Usp5P56399 858 aaKnown RBP10.64□□□□□ -0.71
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Cdc37Q61081 379 aa10.64□□□□□ -0.71
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Map3k11Q80XI6 850 aa10.64□□□□□ -0.71
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Ints5Q8CHT3 1018 aa10.64□□□□□ -0.71
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Alg3Q8K2A8 438 aa10.64□□□□□ -0.71
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Telo2Q9DC40 840 aaKnown RBP10.64□□□□□ -0.71
Clstn3-201ENSMUST00000008297 CenphQ9QYM8 241 aa10.64□□□□□ -0.71
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Zbtb7aO88939 569 aaKnown RBP10.64□□□□□ -0.71
Clstn3-201ENSMUST00000008297 CebpaP53566 359 aa10.64□□□□□ -0.71
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Sptlc3Q8BG54 563 aa10.64□□□□□ -0.71
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Pde5aQ8CG03 865 aa10.64□□□□□ -0.71
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Nek9Q8K1R7 984 aa10.64□□□□□ -0.71
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Ccdc96Q9CR92 584 aa10.64□□□□□ -0.71
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Dbndd1Q9CZ00 160 aa10.64□□□□□ -0.71
Clstn3-201ENSMUST00000008297 IcoslgQ9JHJ8 322 aa10.64□□□□□ -0.71
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Kiaa0232Q80U59 1396 aaKnown RBP10.64□□□□□ -0.71
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Grin2dQ03391 1323 aa10.64□□□□□ -0.71
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Odf2A3KGV1 830 aaKnown RBP10.64□□□□□ -0.71
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Tmem109Q3UBX0 243 aa10.64□□□□□ -0.71
Clstn3-201ENSMUST00000008297 PsdQ5DTT2 1024 aa10.64□□□□□ -0.71
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Rufy1Q8BIJ7 712 aa10.64□□□□□ -0.71
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Slc13a4Q8BZ82 625 aa10.64□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 31.6 ms