RNA–Protein interactions for RNA: YLR449W

FPR4, Transcript of Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase (PPIase), yeastyeast

Gene FPR4, Length 1,179 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
FPR4YLR449W TY1B-BLQ12490 1755 aa19.31■□□□□ 0.68
FPR4YLR449W RPA190P10964 1664 aaKnown RBP19.3■□□□□ 0.68
FPR4YLR449W ESC1Q03661 1658 aaKnown RBP19.28■□□□□ 0.68
FPR4YLR449W GEA1P47102 1408 aaPredicted RBP19.27■□□□□ 0.68
FPR4YLR449W IKI3Q06706 1349 aaKnown RBP19.25■□□□□ 0.67
FPR4YLR449W GEA2P39993 1459 aaKnown RBP19.16■□□□□ 0.66
FPR4YLR449W NUP170P38181 1502 aa19.15■□□□□ 0.66
FPR4YLR449W NTE1Q04958 1679 aa19.14■□□□□ 0.66
FPR4YLR449W MET5P47169 1442 aa19.14■□□□□ 0.65
FPR4YLR449W IFH1P39520 1085 aa19.13■□□□□ 0.65
FPR4YLR449W RPO21P04050 1733 aaKnown RBP19.12■□□□□ 0.65
FPR4YLR449W NUP159P40477 1460 aa19.11■□□□□ 0.65
FPR4YLR449W IRC20Q06554 1556 aa19.06■□□□□ 0.64
FPR4YLR449W RTT106P40161 455 aa19.06■□□□□ 0.64
FPR4YLR449W TY3B-GQ99315 1547 aa19.05■□□□□ 0.64
FPR4YLR449W CAT8P39113 1433 aa19.02■□□□□ 0.64
FPR4YLR449W VPS15P22219 1454 aa18.98■□□□□ 0.63
FPR4YLR449W PDR12Q02785 1511 aa18.97■□□□□ 0.63
FPR4YLR449W MET10P39692 1035 aa18.93■□□□□ 0.62
FPR4YLR449W SSM4P40318 1319 aa18.89■□□□□ 0.61
FPR4YLR449W YBT1P32386 1661 aa18.86■□□□□ 0.61
FPR4YLR449W YRF1-1P0CX20 1796 aa18.86■□□□□ 0.61
FPR4YLR449W YRF1-5P0CX21 1796 aa18.86■□□□□ 0.61
FPR4YLR449W YRF1-8P0CX22 1796 aa18.86■□□□□ 0.61
FPR4YLR449W PDR10P51533 1564 aa18.81■□□□□ 0.6
FPR4YLR449W GDB1Q06625 1536 aa18.81■□□□□ 0.6
FPR4YLR449W SPO14P36126 1683 aa18.76■□□□□ 0.59
FPR4YLR449W NUP157P40064 1391 aaKnown RBP18.75■□□□□ 0.59
FPR4YLR449W SRB8P25648 1427 aa18.71■□□□□ 0.59
FPR4YLR449W ARO1P08566 1588 aaKnown RBP18.7■□□□□ 0.58
FPR4YLR449W LTE1P07866 1435 aa18.66■□□□□ 0.58
FPR4YLR449W IQG1Q12280 1495 aa18.59■□□□□ 0.57
FPR4YLR449W YSP2Q06681 1438 aa18.59■□□□□ 0.57
FPR4YLR449W BUD3P25558 1636 aa18.57■□□□□ 0.56
FPR4YLR449W MMS1Q06211 1407 aa18.56■□□□□ 0.56
FPR4YLR449W CKB1P43639 278 aa18.55■□□□□ 0.56
FPR4YLR449W BUD21Q08492 214 aaPredicted RBP18.4■□□□□ 0.54
FPR4YLR449W TRM3Q07527 1436 aa18.4■□□□□ 0.54
FPR4YLR449W DRS2P39524 1355 aa18.37■□□□□ 0.53
FPR4YLR449W SEC7P11075 2009 aaKnown RBP18.35■□□□□ 0.53
FPR4YLR449W BNR1P40450 1375 aa18.35■□□□□ 0.53
FPR4YLR449W GCN2P15442 1659 aa18.34■□□□□ 0.53
FPR4YLR449W ITT1Q04638 464 aa18.33■□□□□ 0.52
FPR4YLR449W BNI1P41832 1953 aa18.32■□□□□ 0.52
FPR4YLR449W DOP1Q03921 1698 aa18.25■□□□□ 0.51
FPR4YLR449W MIF2P35201 549 aa18.22■□□□□ 0.51
FPR4YLR449W CHC1P22137 1653 aaKnown RBP18.15■□□□□ 0.5
FPR4YLR449W PDR5P33302 1511 aaKnown RBP18.14■□□□□ 0.49
FPR4YLR449W YOR093CQ12275 1648 aa18.1■□□□□ 0.49
FPR4YLR449W PAF1P38351 445 aa18.03■□□□□ 0.48
FPR4YLR449W NOP7P53261 605 aaKnown RBP18.03■□□□□ 0.48
FPR4YLR449W ABP1P15891 592 aaKnown RBP17.99■□□□□ 0.47
FPR4YLR449W RAV1P47104 1357 aa17.97■□□□□ 0.47
FPR4YLR449W BFR2Q06631 534 aaKnown RBP17.97■□□□□ 0.47
FPR4YLR449W NUP188P52593 1655 aaKnown RBP17.96■□□□□ 0.47
FPR4YLR449W VMR1P38735 1592 aa17.96■□□□□ 0.46
FPR4YLR449W DNF2Q12675 1612 aa17.94■□□□□ 0.46
FPR4YLR449W POL5P39985 1022 aaKnown RBP17.93■□□□□ 0.46
FPR4YLR449W PDR11P40550 1411 aa17.92■□□□□ 0.46
FPR4YLR449W URN1Q06525 465 aaKnown RBP17.91■□□□□ 0.46
FPR4YLR449W RTC1Q08281 1341 aa17.91■□□□□ 0.46
FPR4YLR449W IML1P47170 1584 aa17.89■□□□□ 0.45
FPR4YLR449W IPL1P38991 367 aa17.82■□□□□ 0.44
FPR4YLR449W HAP1P0CE41 1502 aa17.79■□□□□ 0.44
FPR4YLR449W YAP3P38749 330 aa17.77■□□□□ 0.44
FPR4YLR449W TY3B-IQ7LHG5 1498 aaKnown RBP17.75■□□□□ 0.43
FPR4YLR449W TYS1P36421 394 aaKnown RBP17.7■□□□□ 0.42
FPR4YLR449W ESL2P36168 1195 aa17.67■□□□□ 0.42
FPR4YLR449W SEC3P33332 1336 aaKnown RBP17.62■□□□□ 0.41
FPR4YLR449W NUP192P47054 1683 aa17.61■□□□□ 0.41
FPR4YLR449W YFR006WP43590 535 aa17.6■□□□□ 0.41
FPR4YLR449W MHP1P43638 1398 aa17.58■□□□□ 0.4
FPR4YLR449W TAF5P38129 798 aa17.56■□□□□ 0.4
FPR4YLR449W SCT1P32784 759 aa17.54■□□□□ 0.4
FPR4YLR449W YLR419WQ06698 1435 aaKnown RBP17.51■□□□□ 0.39
FPR4YLR449W ALD4P46367 519 aaKnown RBP17.5■□□□□ 0.39
FPR4YLR449W DNF3Q12674 1656 aa17.5■□□□□ 0.39
FPR4YLR449W BCK1Q01389 1478 aa17.49■□□□□ 0.39
FPR4YLR449W KIP3P53086 805 aaKnown RBP17.46■□□□□ 0.39
FPR4YLR449W RAD9P14737 1309 aa17.42■□□□□ 0.38
FPR4YLR449W ENP1P38333 483 aaKnown RBP17.4■□□□□ 0.38
FPR4YLR449W ORC1P54784 914 aaPredicted RBP17.4■□□□□ 0.38
FPR4YLR449W SPE2P21182 396 aa17.39■□□□□ 0.37
FPR4YLR449W SPT7P35177 1332 aa17.39■□□□□ 0.37
FPR4YLR449W MAK10Q02197 733 aa17.37■□□□□ 0.37
FPR4YLR449W NSR1P27476 414 aaKnown RBP RIP-Chip data17.36■□□□□ 0.37not detected
FPR4YLR449W TAF8Q03750 510 aa17.35■□□□□ 0.37
FPR4YLR449W NAP1P25293 417 aaKnown RBP17.34■□□□□ 0.37
FPR4YLR449W PDS5Q04264 1277 aa17.32■□□□□ 0.36
FPR4YLR449W CAB1Q04430 367 aa17.32■□□□□ 0.36
FPR4YLR449W CFT1Q06632 1357 aaKnown RBP17.31■□□□□ 0.36
FPR4YLR449W MRX12P47084 519 aa17.25■□□□□ 0.35
FPR4YLR449W KRE5P22023 1365 aa17.23■□□□□ 0.35
FPR4YLR449W PSD2P53037 1138 aaKnown RBP17.22■□□□□ 0.35
FPR4YLR449W CHZ1P40019 153 aaPredicted RBP17.18■□□□□ 0.34
FPR4YLR449W FKH1P40466 484 aa17.17■□□□□ 0.34
FPR4YLR449W RIA1P53893 1110 aa17.16■□□□□ 0.34
FPR4YLR449W TY1B-NL2Q99337 1749 aaKnown RBP17.15■□□□□ 0.34
FPR4YLR449W PSK1P31374 1356 aa17.12■□□□□ 0.33
FPR4YLR449W YNR029CP53729 429 aaKnown RBP17.09■□□□□ 0.33
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