RNA–Protein interactions for RNA: YKL033W

TTI1, Transcript of Subunit of the ASTRA complex, involved in chromatin remodeling, yeast

Gene TTI1, Length 3,117 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
TTI1	YKL033W	DAN4	P47179	1161 aa		3.68	□□□□□ -1.82
TTI1	YKL033W	JIP4	Q03361	876 aa		3.68	□□□□□ -1.82
TTI1	YKL033W	MAK11	P20484	414 aa	Known RBP	3.67	□□□□□ -1.82
TTI1	YKL033W	YEL023C	P39992	682 aa		3.67	□□□□□ -1.82
TTI1	YKL033W	GRE2	Q12068	342 aa	Known RBP	3.67	□□□□□ -1.82
TTI1	YKL033W	YDL129W	Q07555	291 aa		3.66	□□□□□ -1.82
TTI1	YKL033W	PTC3	P34221	468 aa	Known RBP	3.65	□□□□□ -1.82
TTI1	YKL033W	PTC4	P38089	393 aa		3.65	□□□□□ -1.82
TTI1	YKL033W	ATH1	P48016	1211 aa		3.65	□□□□□ -1.83
TTI1	YKL033W	COQ8	P27697	501 aa		3.64	□□□□□ -1.83
TTI1	YKL033W	GUT1	P32190	709 aa		3.62	□□□□□ -1.83
TTI1	YKL033W	PML39	Q03760	334 aa		3.61	□□□□□ -1.83
TTI1	YKL033W	YDR344C	Q05510	147 aa		3.61	□□□□□ -1.83
TTI1	YKL033W	CHL1	P22516	861 aa	Predicted RBP	3.59	□□□□□ -1.83
TTI1	YKL033W	PRE3	P38624	215 aa		3.59	□□□□□ -1.84
TTI1	YKL033W	SOL3	P38858	249 aa		3.59	□□□□□ -1.84
TTI1	YKL033W	MID1	P41821	548 aa		3.58	□□□□□ -1.84
TTI1	YKL033W	NST1	P53935	1240 aa		3.58	□□□□□ -1.84
TTI1	YKL033W	ILV3	P39522	585 aa	Known RBP	3.57	□□□□□ -1.84
TTI1	YKL033W	ELP4	Q02884	456 aa	Known RBP	3.57	□□□□□ -1.84
TTI1	YKL033W	MON2	P48563	1636 aa	Predicted RBP	3.57	□□□□□ -1.84
TTI1	YKL033W	BCK2	P33306	851 aa		3.56	□□□□□ -1.84
TTI1	YKL033W	PEX29	Q03370	554 aa		3.55	□□□□□ -1.84
TTI1	YKL033W	MPH3	P0CE00	602 aa		3.54	□□□□□ -1.84
TTI1	YKL033W	AI4	P03878	556 aa		3.54	□□□□□ -1.84
TTI1	YKL033W	YGR273C	P53329	174 aa		3.53	□□□□□ -1.84
TTI1	YKL033W	NOP53	Q12080	455 aa	Known RBP	3.53	□□□□□ -1.85
TTI1	YKL033W	VRP1	P37370	817 aa		3.52	□□□□□ -1.85
TTI1	YKL033W	ARH1	P48360	493 aa		3.52	□□□□□ -1.85
TTI1	YKL033W	SET1	P38827	1080 aa	Known RBP	3.5	□□□□□ -1.85
TTI1	YKL033W	MPC54	Q08550	464 aa		3.5	□□□□□ -1.85
TTI1	YKL033W	HAP5	Q02516	242 aa		3.48	□□□□□ -1.85
TTI1	YKL033W	SPT23	P35210	1082 aa		3.48	□□□□□ -1.85
TTI1	YKL033W	SLI15	P38283	698 aa		3.48	□□□□□ -1.85
TTI1	YKL033W	XDJ1	P39102	459 aa		3.47	□□□□□ -1.85
TTI1	YKL033W	KEX1	P09620	729 aa		3.47	□□□□□ -1.85
TTI1	YKL033W	NMA111	P53920	997 aa		3.46	□□□□□ -1.85
TTI1	YKL033W	VHR2	P40041	505 aa		3.46	□□□□□ -1.86
TTI1	YKL033W	BNI4	P53858	892 aa		3.45	□□□□□ -1.86
TTI1	YKL033W	DPL1	Q05567	589 aa		3.45	□□□□□ -1.86
TTI1	YKL033W	PTC2	P39966	464 aa	Known RBP	3.44	□□□□□ -1.86
TTI1	YKL033W	YLR326W	Q06170	240 aa	Known RBP	3.44	□□□□□ -1.86
TTI1	YKL033W	UBP14	P38237	781 aa	Known RBP	3.44	□□□□□ -1.86
TTI1	YKL033W	CDC73	Q06697	393 aa		3.44	□□□□□ -1.86
TTI1	YKL033W	RAD54	P32863	898 aa		3.42	□□□□□ -1.86
TTI1	YKL033W	DPS1	P04802	557 aa	Known RBP	3.41	□□□□□ -1.86
TTI1	YKL033W	PCS60	P38137	543 aa	Known RBP RIP-Chip data	3.41	□□□□□ -1.86	RIP-Chip
TTI1	YKL033W	YML082W	Q04533	649 aa	Known RBP	3.41	□□□□□ -1.86
TTI1	YKL033W	ISU2	Q12056	156 aa		3.41	□□□□□ -1.86
TTI1	YKL033W	YPR015C	Q12531	247 aa		3.4	□□□□□ -1.86
TTI1	YKL033W	PDR1	P12383	1068 aa		3.39	□□□□□ -1.87
TTI1	YKL033W	IFH1	P39520	1085 aa		3.38	□□□□□ -1.87
TTI1	YKL033W	RAM1	P22007	431 aa		3.37	□□□□□ -1.87
TTI1	YKL033W	YDR090C	Q03193	310 aa		3.37	□□□□□ -1.87
TTI1	YKL033W	KIC1	P38692	1080 aa		3.37	□□□□□ -1.87
TTI1	YKL033W	VPS70	P47161	811 aa		3.37	□□□□□ -1.87
TTI1	YKL033W	RPP1B	P10622	106 aa	Known RBP	3.36	□□□□□ -1.87
TTI1	YKL033W	REF2	P42073	533 aa	Predicted RBP	3.36	□□□□□ -1.87
TTI1	YKL033W	TY1B-DR4	Q07793	1604 aa		3.35	□□□□□ -1.87
TTI1	YKL033W	YPR148C	Q06523	435 aa		3.35	□□□□□ -1.87
TTI1	YKL033W	GYP1	Q08484	637 aa		3.35	□□□□□ -1.87
TTI1	YKL033W	RAS1	P01119	309 aa		3.34	□□□□□ -1.87
TTI1	YKL033W	YRR1	Q12172	810 aa		3.34	□□□□□ -1.87
TTI1	YKL033W	PEX21	P50091	288 aa		3.33	□□□□□ -1.88
TTI1	YKL033W	SRC1	Q03707	834 aa		3.33	□□□□□ -1.88
TTI1	YKL033W	TUM1	Q08686	304 aa	Known RBP	3.32	□□□□□ -1.88
TTI1	YKL033W	CSC1	Q06538	782 aa		3.31	□□□□□ -1.88
TTI1	YKL033W	SDH2	P21801	266 aa		3.3	□□□□□ -1.88
TTI1	YKL033W	ISM1	P48526	1002 aa		3.3	□□□□□ -1.88
TTI1	YKL033W	BUD20	Q08004	166 aa	Predicted RBP	3.3	□□□□□ -1.88
TTI1	YKL033W	GAP1	P19145	602 aa	Predicted RBP	3.3	□□□□□ -1.88
TTI1	YKL033W	ORC6	P38826	435 aa		3.3	□□□□□ -1.88
TTI1	YKL033W	STR2	P47164	639 aa		3.3	□□□□□ -1.88
TTI1	YKL033W	TFB4	Q12004	338 aa		3.3	□□□□□ -1.88
TTI1	YKL033W	NUD1	P32336	851 aa		3.3	□□□□□ -1.88
TTI1	YKL033W	AMS1	P22855	1083 aa		3.29	□□□□□ -1.88
TTI1	YKL033W	COX6	P00427	148 aa		3.29	□□□□□ -1.88
TTI1	YKL033W	SAS4	Q04003	481 aa		3.29	□□□□□ -1.88
TTI1	YKL033W	MAK21	Q12176	1025 aa	Known RBP	3.28	□□□□□ -1.88
TTI1	YKL033W	PRT1	P06103	763 aa	Known RBP	3.28	□□□□□ -1.88
TTI1	YKL033W	GCD11	P32481	527 aa	Known RBP	3.27	□□□□□ -1.89
TTI1	YKL033W	NPL4	P33755	580 aa		3.27	□□□□□ -1.89
TTI1	YKL033W	MVP1	P40959	511 aa	Known RBP	3.27	□□□□□ -1.89
TTI1	YKL033W	YPR109W	Q06104	294 aa		3.27	□□□□□ -1.89
TTI1	YKL033W	YEL077C	Q3E7X8	1277 aa		3.26	□□□□□ -1.89
TTI1	YKL033W	SWR1	Q05471	1514 aa		3.26	□□□□□ -1.89
TTI1	YKL033W	RGR1	P19263	1082 aa		3.25	□□□□□ -1.89
TTI1	YKL033W	DMA1	P38823	416 aa		3.25	□□□□□ -1.89
TTI1	YKL033W	PBS2	P08018	668 aa		3.25	□□□□□ -1.89
TTI1	YKL033W	TRK1	P12685	1235 aa		3.25	□□□□□ -1.89
TTI1	YKL033W	TY1A-DR4	O74302	440 aa		3.24	□□□□□ -1.89
TTI1	YKL033W	TY1A-H	P0C2I4	478 aa	Known RBP	3.24	□□□□□ -1.89
TTI1	YKL033W	TY1A-A	P0CX57	440 aa		3.24	□□□□□ -1.89
TTI1	YKL033W	TY1A-PR1	P0CX58	440 aa		3.24	□□□□□ -1.89
TTI1	YKL033W	TY1A-OR	P0CX59	440 aa		3.24	□□□□□ -1.89
TTI1	YKL033W	TY1A-PR2	P0CX60	440 aa		3.24	□□□□□ -1.89
TTI1	YKL033W	TY1A-DR5	P0CX65	440 aa		3.24	□□□□□ -1.89
TTI1	YKL033W	TY1A-ER2	P0CX66	440 aa		3.24	□□□□□ -1.89
TTI1	YKL033W	TY1A-GR3	P0CX67	440 aa		3.24	□□□□□ -1.89
TTI1	YKL033W	TY1A-LR1	P0CX68	440 aa		3.24	□□□□□ -1.89

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