RNA–Protein interactions for RNA: YJL033W

HCA4, Transcript of DEAD box RNA helicase, yeastyeast

Gene HCA4, Length 2,313 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
HCA4YJL033W ULI1P43604 169 aa7.16□□□□□ -1.26
HCA4YJL033W TRP5P00931 707 aaKnown RBP7.14□□□□□ -1.27
HCA4YJL033W REF2P42073 533 aaPredicted RBP7.11□□□□□ -1.27
HCA4YJL033W IOC2Q12072 812 aa7.11□□□□□ -1.27
HCA4YJL033W YGR273CP53329 174 aa7.11□□□□□ -1.27
HCA4YJL033W YEL023CP39992 682 aa7.1□□□□□ -1.27
HCA4YJL033W SOL3P38858 249 aa7.1□□□□□ -1.27
HCA4YJL033W JIP4Q03361 876 aa7.09□□□□□ -1.28
HCA4YJL033W SPB4P25808 606 aaPredicted RBP7.08□□□□□ -1.28
HCA4YJL033W PTC4P38089 393 aa7.08□□□□□ -1.28
HCA4YJL033W LDB19Q12502 818 aa7.07□□□□□ -1.28
HCA4YJL033W NST1P53935 1240 aa7.07□□□□□ -1.28
HCA4YJL033W PBS2P08018 668 aa7.06□□□□□ -1.28
HCA4YJL033W YNL035CP53962 389 aaKnown RBP7.06□□□□□ -1.28
HCA4YJL033W UBP14P38237 781 aaKnown RBP7.05□□□□□ -1.28
HCA4YJL033W VHR2P40041 505 aa7.05□□□□□ -1.28
HCA4YJL033W MAK21Q12176 1025 aaKnown RBP7.05□□□□□ -1.28
HCA4YJL033W AI4P03878 556 aa7.04□□□□□ -1.28
HCA4YJL033W MPH3P0CE00 602 aa7.04□□□□□ -1.28
HCA4YJL033W YLR326WQ06170 240 aaKnown RBP7.03□□□□□ -1.28
HCA4YJL033W RTG1P32607 177 aa7.02□□□□□ -1.28
HCA4YJL033W DSF2P38213 736 aa7.02□□□□□ -1.28
HCA4YJL033W DAN4P47179 1161 aa7.02□□□□□ -1.28
HCA4YJL033W KEX1P09620 729 aa7.02□□□□□ -1.29
HCA4YJL033W COX6P00427 148 aa7.01□□□□□ -1.29
HCA4YJL033W SEC61P32915 480 aa7.01□□□□□ -1.29
HCA4YJL033W LEU3P08638 886 aa7.01□□□□□ -1.29
HCA4YJL033W SIS1P25294 352 aaKnown RBP7□□□□□ -1.29
HCA4YJL033W KIC1P38692 1080 aa6.99□□□□□ -1.29
HCA4YJL033W YDR090CQ03193 310 aa6.99□□□□□ -1.29
HCA4YJL033W RAD54P32863 898 aa6.99□□□□□ -1.29
HCA4YJL033W MAM3Q12296 706 aa6.98□□□□□ -1.29
HCA4YJL033W FKH1P40466 484 aa6.98□□□□□ -1.29
HCA4YJL033W TFG1P41895 735 aaPredicted RBP6.98□□□□□ -1.29
HCA4YJL033W NCR1Q12200 1170 aa6.98□□□□□ -1.29
HCA4YJL033W PCS60P38137 543 aaKnown RBP RIP-Chip data6.96□□□□□ -1.29not detected
HCA4YJL033W ILV3P39522 585 aaKnown RBP6.96□□□□□ -1.29
HCA4YJL033W PML39Q03760 334 aa6.93□□□□□ -1.3
HCA4YJL033W SLI15P38283 698 aa6.93□□□□□ -1.3
HCA4YJL033W AIR2Q12476 344 aaKnown RBP6.93□□□□□ -1.3
HCA4YJL033W IES2P40154 320 aa6.92□□□□□ -1.3
HCA4YJL033W YDL129WQ07555 291 aa6.91□□□□□ -1.3
HCA4YJL033W RPP1BP10622 106 aaKnown RBP6.89□□□□□ -1.31
HCA4YJL033W MID1P41821 548 aa6.88□□□□□ -1.31
HCA4YJL033W NUP42P49686 430 aaKnown RBP6.88□□□□□ -1.31
HCA4YJL033W YJL171CP46992 396 aa6.87□□□□□ -1.31
HCA4YJL033W RPN1P38764 993 aaKnown RBP6.85□□□□□ -1.31
HCA4YJL033W PEX29Q03370 554 aa6.85□□□□□ -1.31
HCA4YJL033W LEO1P38439 464 aa6.85□□□□□ -1.31
HCA4YJL033W YNR021WP53723 404 aaKnown RBP6.85□□□□□ -1.31
HCA4YJL033W DIT2P21595 489 aa6.84□□□□□ -1.31
HCA4YJL033W SAP30P38429 201 aa6.84□□□□□ -1.31
HCA4YJL033W ORC6P38826 435 aa6.84□□□□□ -1.31
HCA4YJL033W MPC54Q08550 464 aa6.84□□□□□ -1.31
HCA4YJL033W BMT6Q12291 365 aa6.84□□□□□ -1.31
HCA4YJL033W DPL1Q05567 589 aa6.83□□□□□ -1.32
HCA4YJL033W CDC73Q06697 393 aa6.83□□□□□ -1.32
HCA4YJL033W PSE1P32337 1089 aaKnown RBP6.82□□□□□ -1.32
HCA4YJL033W CSC1Q06538 782 aa6.82□□□□□ -1.32
HCA4YJL033W GAP1P19145 602 aaPredicted RBP6.79□□□□□ -1.32
HCA4YJL033W PEX21P50091 288 aa6.78□□□□□ -1.32
HCA4YJL033W NMA111P53920 997 aa6.78□□□□□ -1.32
HCA4YJL033W MVP1P40959 511 aaKnown RBP6.78□□□□□ -1.32
HCA4YJL033W ARH1P48360 493 aa6.78□□□□□ -1.32
HCA4YJL033W TFB4Q12004 338 aa6.78□□□□□ -1.32
HCA4YJL033W ISU2Q12056 156 aa6.78□□□□□ -1.32
HCA4YJL033W RGR1P19263 1082 aa6.77□□□□□ -1.33
HCA4YJL033W GLC3P32775 704 aa6.77□□□□□ -1.33
HCA4YJL033W ATF2P53296 535 aa6.77□□□□□ -1.33
HCA4YJL033W AIM7Q12156 149 aa6.77□□□□□ -1.33
HCA4YJL033W HAP5Q02516 242 aa6.76□□□□□ -1.33
HCA4YJL033W ELP4Q02884 456 aaKnown RBP6.75□□□□□ -1.33
HCA4YJL033W CLB5P30283 435 aa6.73□□□□□ -1.33
HCA4YJL033W PRE3P38624 215 aa6.72□□□□□ -1.33
HCA4YJL033W TUM1Q08686 304 aaKnown RBP6.72□□□□□ -1.33
HCA4YJL033W TEA1P47988 759 aa6.72□□□□□ -1.33
HCA4YJL033W CHL1P22516 861 aaPredicted RBP6.71□□□□□ -1.33
HCA4YJL033W YDR344CQ05510 147 aa6.71□□□□□ -1.33
HCA4YJL033W YPR109WQ06104 294 aa6.71□□□□□ -1.33
HCA4YJL033W KIN1P13185 1064 aa6.7□□□□□ -1.34
HCA4YJL033W SPT23P35210 1082 aa6.7□□□□□ -1.34
HCA4YJL033W BNI4P53858 892 aa6.7□□□□□ -1.34
HCA4YJL033W YRR1Q12172 810 aa6.7□□□□□ -1.34
HCA4YJL033W PTC2P39966 464 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
HCA4YJL033W PDR1P12383 1068 aa6.64□□□□□ -1.35
HCA4YJL033W YML082WQ04533 649 aaKnown RBP6.62□□□□□ -1.35
HCA4YJL033W NUD1P32336 851 aa6.62□□□□□ -1.35
HCA4YJL033W NPL4P33755 580 aa6.61□□□□□ -1.35
HCA4YJL033W NIS1P53939 407 aa6.61□□□□□ -1.35
HCA4YJL033W RAM1P22007 431 aa6.6□□□□□ -1.35
HCA4YJL033W YMR196WQ04336 1088 aa6.6□□□□□ -1.35
HCA4YJL033W SIT4P20604 311 aa6.59□□□□□ -1.36
HCA4YJL033W FPK1P53739 893 aa6.59□□□□□ -1.36
HCA4YJL033W CSN12P47130 423 aa6.58□□□□□ -1.36
HCA4YJL033W STR2P47164 639 aa6.56□□□□□ -1.36
HCA4YJL033W ISM1P48526 1002 aa6.56□□□□□ -1.36
HCA4YJL033W RTF1P53064 558 aa6.56□□□□□ -1.36
HCA4YJL033W HST2P53686 357 aa6.56□□□□□ -1.36
HCA4YJL033W GUA1P38625 525 aaKnown RBP6.56□□□□□ -1.36
HCA4YJL033W YPR015CQ12531 247 aa6.56□□□□□ -1.36
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