RNA–Protein interactions for RNA: YHR175W-A

YHR175W-A, Transcript of Putative protein of unknown function, yeastyeast

Gene YHR175W-A, Length 150 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YHR175W-AYHR175W-A PTC4P38089 393 aa9.86□□□□□ -0.83
YHR175W-AYHR175W-A YEL023CP39992 682 aa9.85□□□□□ -0.83
YHR175W-AYHR175W-A CHL1P22516 861 aaPredicted RBP9.79□□□□□ -0.84
YHR175W-AYHR175W-A PRE3P38624 215 aa9.77□□□□□ -0.85
YHR175W-AYHR175W-A BCK2P33306 851 aa9.76□□□□□ -0.85
YHR175W-AYHR175W-A GRE2Q12068 342 aaKnown RBP9.75□□□□□ -0.85
YHR175W-AYHR175W-A MAK11P20484 414 aaKnown RBP9.73□□□□□ -0.85
YHR175W-AYHR175W-A RAM2P29703 316 aa9.72□□□□□ -0.85
YHR175W-AYHR175W-A EDS1P38073 919 aa9.7□□□□□ -0.86
YHR175W-AYHR175W-A MIF2P35201 549 aa9.68□□□□□ -0.86
YHR175W-AYHR175W-A PTC3P34221 468 aaKnown RBP9.67□□□□□ -0.86
YHR175W-AYHR175W-A GUT1P32190 709 aa9.66□□□□□ -0.86
YHR175W-AYHR175W-A PML39Q03760 334 aa9.66□□□□□ -0.86
YHR175W-AYHR175W-A YDR344CQ05510 147 aa9.66□□□□□ -0.86
YHR175W-AYHR175W-A ATH1P48016 1211 aa9.65□□□□□ -0.86
YHR175W-AYHR175W-A NST1P53935 1240 aa9.65□□□□□ -0.86
YHR175W-AYHR175W-A COQ8P27697 501 aa9.58□□□□□ -0.88
YHR175W-AYHR175W-A SOL3P38858 249 aa9.58□□□□□ -0.88
YHR175W-AYHR175W-A VRP1P37370 817 aa9.55□□□□□ -0.88
YHR175W-AYHR175W-A ELP4Q02884 456 aaKnown RBP9.55□□□□□ -0.88
YHR175W-AYHR175W-A XDJ1P39102 459 aa9.54□□□□□ -0.88
YHR175W-AYHR175W-A MID1P41821 548 aa9.53□□□□□ -0.88
YHR175W-AYHR175W-A ARH1P48360 493 aa9.53□□□□□ -0.88
YHR175W-AYHR175W-A MPH3P0CE00 602 aa9.51□□□□□ -0.89
YHR175W-AYHR175W-A AI4P03878 556 aa9.5□□□□□ -0.89
YHR175W-AYHR175W-A ILV3P39522 585 aaKnown RBP9.46□□□□□ -0.9
YHR175W-AYHR175W-A NOP53Q12080 455 aaKnown RBP9.45□□□□□ -0.9
YHR175W-AYHR175W-A SPT23P35210 1082 aa9.41□□□□□ -0.9
YHR175W-AYHR175W-A YGR273CP53329 174 aa9.4□□□□□ -0.9
YHR175W-AYHR175W-A PEX29Q03370 554 aa9.39□□□□□ -0.91
YHR175W-AYHR175W-A HAP5Q02516 242 aa9.37□□□□□ -0.91
YHR175W-AYHR175W-A BNI4P53858 892 aa9.33□□□□□ -0.92
YHR175W-AYHR175W-A DPS1P04802 557 aaKnown RBP9.32□□□□□ -0.92
YHR175W-AYHR175W-A MPC54Q08550 464 aa9.32□□□□□ -0.92
YHR175W-AYHR175W-A YML082WQ04533 649 aaKnown RBP9.3□□□□□ -0.92
YHR175W-AYHR175W-A SLI15P38283 698 aa9.27□□□□□ -0.93
YHR175W-AYHR175W-A PTC2P39966 464 aaKnown RBP9.25□□□□□ -0.93
YHR175W-AYHR175W-A NMA111P53920 997 aa9.25□□□□□ -0.93
YHR175W-AYHR175W-A DPL1Q05567 589 aa9.22□□□□□ -0.93
YHR175W-AYHR175W-A KEX1P09620 729 aa9.18□□□□□ -0.94
YHR175W-AYHR175W-A SRC1Q03707 834 aa9.17□□□□□ -0.94
YHR175W-AYHR175W-A YPR015CQ12531 247 aa9.13□□□□□ -0.95
YHR175W-AYHR175W-A RAM1P22007 431 aa9.12□□□□□ -0.95
YHR175W-AYHR175W-A SET1P38827 1080 aaKnown RBP9.11□□□□□ -0.95
YHR175W-AYHR175W-A ISU2Q12056 156 aa9.11□□□□□ -0.95
YHR175W-AYHR175W-A UBP14P38237 781 aaKnown RBP9.09□□□□□ -0.95
YHR175W-AYHR175W-A YLR326WQ06170 240 aaKnown RBP9.09□□□□□ -0.95
YHR175W-AYHR175W-A CDC73Q06697 393 aa9.08□□□□□ -0.96
YHR175W-AYHR175W-A RAS1P01119 309 aa9.03□□□□□ -0.96
YHR175W-AYHR175W-A VHR2P40041 505 aa9.02□□□□□ -0.97
YHR175W-AYHR175W-A PCS60P38137 543 aaKnown RBP RIP-Chip data9.01□□□□□ -0.97not detected
YHR175W-AYHR175W-A PDR1P12383 1068 aa8.98□□□□□ -0.97
YHR175W-AYHR175W-A RAD54P32863 898 aa8.96□□□□□ -0.98
YHR175W-AYHR175W-A GYP1Q08484 637 aa8.95□□□□□ -0.98
YHR175W-AYHR175W-A SDH2P21801 266 aa8.92□□□□□ -0.98
YHR175W-AYHR175W-A AMS1P22855 1083 aa8.92□□□□□ -0.98
YHR175W-AYHR175W-A YDR090CQ03193 310 aa8.92□□□□□ -0.98
YHR175W-AYHR175W-A SAS4Q04003 481 aa8.91□□□□□ -0.98
YHR175W-AYHR175W-A RPP1BP10622 106 aaKnown RBP8.89□□□□□ -0.99
YHR175W-AYHR175W-A IFH1P39520 1085 aa8.86□□□□□ -0.99
YHR175W-AYHR175W-A GAP1P19145 602 aaPredicted RBP8.85□□□□□ -0.99
YHR175W-AYHR175W-A RGA2Q06407 1009 aa8.83□□□□□ -1
YHR175W-AYHR175W-A TRK1P12685 1235 aa8.82□□□□□ -1
YHR175W-AYHR175W-A RGA1P39083 1007 aa8.82□□□□□ -1
YHR175W-AYHR175W-A BUD20Q08004 166 aaPredicted RBP8.82□□□□□ -1
YHR175W-AYHR175W-A YPR148CQ06523 435 aa8.8□□□□□ -1
YHR175W-AYHR175W-A YRR1Q12172 810 aa8.8□□□□□ -1
YHR175W-AYHR175W-A KIC1P38692 1080 aa8.79□□□□□ -1
YHR175W-AYHR175W-A YEL077CQ3E7X8 1277 aa8.78□□□□□ -1
YHR175W-AYHR175W-A REF2P42073 533 aaPredicted RBP8.77□□□□□ -1.01
YHR175W-AYHR175W-A STR2P47164 639 aa8.77□□□□□ -1.01
YHR175W-AYHR175W-A CSC1Q06538 782 aa8.77□□□□□ -1.01
YHR175W-AYHR175W-A TFB4Q12004 338 aa8.77□□□□□ -1.01
YHR175W-AYHR175W-A PRT1P06103 763 aaKnown RBP8.76□□□□□ -1.01
YHR175W-AYHR175W-A PEX21P50091 288 aa8.76□□□□□ -1.01
YHR175W-AYHR175W-A MRF1P30775 413 aaPredicted RBP8.75□□□□□ -1.01
YHR175W-AYHR175W-A ISM1P48526 1002 aa8.75□□□□□ -1.01
YHR175W-AYHR175W-A ORC6P38826 435 aa8.73□□□□□ -1.01
YHR175W-AYHR175W-A NUD1P32336 851 aa8.71□□□□□ -1.02
YHR175W-AYHR175W-A TUM1Q08686 304 aaKnown RBP8.71□□□□□ -1.02
YHR175W-AYHR175W-A TY1A-DR4O74302 440 aa8.64□□□□□ -1.03
YHR175W-AYHR175W-A COX6P00427 148 aa8.64□□□□□ -1.03
YHR175W-AYHR175W-A TY1A-HP0C2I4 478 aaKnown RBP8.64□□□□□ -1.03
YHR175W-AYHR175W-A TY1A-AP0CX57 440 aa8.64□□□□□ -1.03
YHR175W-AYHR175W-A TY1A-PR1P0CX58 440 aa8.64□□□□□ -1.03
YHR175W-AYHR175W-A TY1A-ORP0CX59 440 aa8.64□□□□□ -1.03
YHR175W-AYHR175W-A TY1A-PR2P0CX60 440 aa8.64□□□□□ -1.03
YHR175W-AYHR175W-A TY1A-DR5P0CX65 440 aa8.64□□□□□ -1.03
YHR175W-AYHR175W-A TY1A-ER2P0CX66 440 aa8.64□□□□□ -1.03
YHR175W-AYHR175W-A TY1A-GR3P0CX67 440 aa8.64□□□□□ -1.03
YHR175W-AYHR175W-A TY1A-LR1P0CX68 440 aa8.64□□□□□ -1.03
YHR175W-AYHR175W-A TY1A-MR2P0CX69 440 aa8.64□□□□□ -1.03
YHR175W-AYHR175W-A TY1A-JR2P47099 440 aa8.64□□□□□ -1.03
YHR175W-AYHR175W-A TY1A-DR1Q03856 440 aa8.64□□□□□ -1.03
YHR175W-AYHR175W-A TY1A-ML1Q04706 440 aaKnown RBP8.64□□□□□ -1.03
YHR175W-AYHR175W-A TY1A-BRQ12217 440 aa8.64□□□□□ -1.03
YHR175W-AYHR175W-A TY1A-NL2Q12470 440 aa8.64□□□□□ -1.03
YHR175W-AYHR175W-A TY1A-GR2Q12485 440 aa8.64□□□□□ -1.03
YHR175W-AYHR175W-A ERG12P07277 443 aa8.63□□□□□ -1.03
YHR175W-AYHR175W-A MAK21Q12176 1025 aaKnown RBP8.63□□□□□ -1.03
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 13.8 ms