RNA–Protein interactions for RNA: YHR108W

GGA2, Transcript of Protein that regulates Arf1p, Arf2p to facilitate Golgi trafficking, yeast

Gene GGA2, Length 1,758 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
GGA2	YHR108W	TY1B-LR1	Q12088	1755 aa	Known RBP	11.91	□□□□□ -0.5
GGA2	YHR108W	TY1B-NL1	Q12112	1755 aa		11.91	□□□□□ -0.5
GGA2	YHR108W	TY1B-GR1	Q12141	1755 aa		11.91	□□□□□ -0.5
GGA2	YHR108W	TY1B-BL	Q12490	1755 aa		11.91	□□□□□ -0.5
GGA2	YHR108W	NUP170	P38181	1502 aa		11.89	□□□□□ -0.51
GGA2	YHR108W	RPA190	P10964	1664 aa	Known RBP	11.85	□□□□□ -0.51
GGA2	YHR108W	DNF1	P32660	1571 aa		11.84	□□□□□ -0.51
GGA2	YHR108W	RTT106	P40161	455 aa		11.84	□□□□□ -0.51
GGA2	YHR108W	NTE1	Q04958	1679 aa		11.84	□□□□□ -0.51
GGA2	YHR108W	GEA2	P39993	1459 aa	Known RBP	11.82	□□□□□ -0.52
GGA2	YHR108W	SSM4	P40318	1319 aa		11.81	□□□□□ -0.52
GGA2	YHR108W	RPO21	P04050	1733 aa	Known RBP	11.8	□□□□□ -0.52
GGA2	YHR108W	TY3B-G	Q99315	1547 aa		11.79	□□□□□ -0.52
GGA2	YHR108W	IRC20	Q06554	1556 aa		11.76	□□□□□ -0.53
GGA2	YHR108W	CAT8	P39113	1433 aa		11.75	□□□□□ -0.53
GGA2	YHR108W	NUP159	P40477	1460 aa		11.75	□□□□□ -0.53
GGA2	YHR108W	VPS15	P22219	1454 aa		11.74	□□□□□ -0.53
GGA2	YHR108W	YBT1	P32386	1661 aa		11.72	□□□□□ -0.53
GGA2	YHR108W	MET10	P39692	1035 aa		11.64	□□□□□ -0.55
GGA2	YHR108W	MET5	P47169	1442 aa		11.64	□□□□□ -0.55
GGA2	YHR108W	PDR12	Q02785	1511 aa		11.63	□□□□□ -0.55
GGA2	YHR108W	SRB8	P25648	1427 aa		11.61	□□□□□ -0.55
GGA2	YHR108W	PDR10	P51533	1564 aa		11.61	□□□□□ -0.55
GGA2	YHR108W	GDB1	Q06625	1536 aa		11.58	□□□□□ -0.55
GGA2	YHR108W	ARO1	P08566	1588 aa	Known RBP	11.58	□□□□□ -0.56
GGA2	YHR108W	SPO14	P36126	1683 aa		11.58	□□□□□ -0.56
GGA2	YHR108W	YRF1-1	P0CX20	1796 aa		11.58	□□□□□ -0.56
GGA2	YHR108W	YRF1-5	P0CX21	1796 aa		11.58	□□□□□ -0.56
GGA2	YHR108W	YRF1-8	P0CX22	1796 aa		11.58	□□□□□ -0.56
GGA2	YHR108W	NUP157	P40064	1391 aa	Known RBP	11.58	□□□□□ -0.56
GGA2	YHR108W	CKB1	P43639	278 aa		11.57	□□□□□ -0.56
GGA2	YHR108W	MMS1	Q06211	1407 aa		11.47	□□□□□ -0.57
GGA2	YHR108W	BUD21	Q08492	214 aa	Predicted RBP	11.46	□□□□□ -0.57
GGA2	YHR108W	BUD3	P25558	1636 aa		11.45	□□□□□ -0.58
GGA2	YHR108W	GCN2	P15442	1659 aa		11.45	□□□□□ -0.58
GGA2	YHR108W	IQG1	Q12280	1495 aa		11.44	□□□□□ -0.58
GGA2	YHR108W	YSP2	Q06681	1438 aa		11.43	□□□□□ -0.58
GGA2	YHR108W	POL5	P39985	1022 aa	Known RBP	11.38	□□□□□ -0.59
GGA2	YHR108W	LTE1	P07866	1435 aa		11.34	□□□□□ -0.59
GGA2	YHR108W	BNR1	P40450	1375 aa		11.34	□□□□□ -0.59
GGA2	YHR108W	NOP7	P53261	605 aa	Known RBP	11.34	□□□□□ -0.59
GGA2	YHR108W	PAF1	P38351	445 aa		11.3	□□□□□ -0.6
GGA2	YHR108W	SEC7	P11075	2009 aa	Known RBP	11.3	□□□□□ -0.6
GGA2	YHR108W	TRM3	Q07527	1436 aa		11.27	□□□□□ -0.61
GGA2	YHR108W	YOR093C	Q12275	1648 aa		11.26	□□□□□ -0.61
GGA2	YHR108W	DRS2	P39524	1355 aa		11.25	□□□□□ -0.61
GGA2	YHR108W	PDR5	P33302	1511 aa	Known RBP	11.24	□□□□□ -0.61
GGA2	YHR108W	DOP1	Q03921	1698 aa		11.24	□□□□□ -0.61
GGA2	YHR108W	CHC1	P22137	1653 aa	Known RBP	11.23	□□□□□ -0.61
GGA2	YHR108W	BFR2	Q06631	534 aa	Known RBP	11.22	□□□□□ -0.61
GGA2	YHR108W	SEC3	P33332	1336 aa	Known RBP	11.16	□□□□□ -0.62
GGA2	YHR108W	RAV1	P47104	1357 aa		11.13	□□□□□ -0.63
GGA2	YHR108W	NUP188	P52593	1655 aa	Known RBP	11.12	□□□□□ -0.63
GGA2	YHR108W	NSR1	P27476	414 aa	Known RBP RIP-Chip data	11.12	□□□□□ -0.63	not detected
GGA2	YHR108W	VMR1	P38735	1592 aa		11.12	□□□□□ -0.63
GGA2	YHR108W	RTC1	Q08281	1341 aa		11.11	□□□□□ -0.63
GGA2	YHR108W	IML1	P47170	1584 aa		11.1	□□□□□ -0.63
GGA2	YHR108W	ITT1	Q04638	464 aa		11.09	□□□□□ -0.63
GGA2	YHR108W	PDR11	P40550	1411 aa		11.09	□□□□□ -0.63
GGA2	YHR108W	ENP1	P38333	483 aa	Known RBP	11.08	□□□□□ -0.64
GGA2	YHR108W	DNF2	Q12675	1612 aa		11.07	□□□□□ -0.64
GGA2	YHR108W	MHP1	P43638	1398 aa		11.06	□□□□□ -0.64
GGA2	YHR108W	SPT7	P35177	1332 aa		11.06	□□□□□ -0.64
GGA2	YHR108W	ORC1	P54784	914 aa	Predicted RBP	11.05	□□□□□ -0.64
GGA2	YHR108W	URN1	Q06525	465 aa	Known RBP	11.05	□□□□□ -0.64
GGA2	YHR108W	TY3B-I	Q7LHG5	1498 aa	Known RBP	11.05	□□□□□ -0.64
GGA2	YHR108W	BNI1	P41832	1953 aa		11.05	□□□□□ -0.64
GGA2	YHR108W	TAF5	P38129	798 aa		11.03	□□□□□ -0.64
GGA2	YHR108W	ESL2	P36168	1195 aa		11.02	□□□□□ -0.65
GGA2	YHR108W	SCT1	P32784	759 aa		10.98	□□□□□ -0.65
GGA2	YHR108W	IPL1	P38991	367 aa		10.98	□□□□□ -0.65
GGA2	YHR108W	KIP3	P53086	805 aa	Known RBP	10.95	□□□□□ -0.66
GGA2	YHR108W	YLR419W	Q06698	1435 aa	Known RBP	10.95	□□□□□ -0.66
GGA2	YHR108W	NUP192	P47054	1683 aa		10.94	□□□□□ -0.66
GGA2	YHR108W	TYS1	P36421	394 aa	Known RBP	10.94	□□□□□ -0.66
GGA2	YHR108W	YAP3	P38749	330 aa		10.91	□□□□□ -0.66
GGA2	YHR108W	PSD2	P53037	1138 aa	Known RBP	10.9	□□□□□ -0.66
GGA2	YHR108W	PDS5	Q04264	1277 aa		10.9	□□□□□ -0.66
GGA2	YHR108W	LEU3	P08638	886 aa		10.9	□□□□□ -0.67
GGA2	YHR108W	SPE2	P21182	396 aa		10.86	□□□□□ -0.67
GGA2	YHR108W	NOP2	P40991	618 aa	Known RBP	10.86	□□□□□ -0.67
GGA2	YHR108W	ALD4	P46367	519 aa	Known RBP	10.85	□□□□□ -0.67
GGA2	YHR108W	NAP1	P25293	417 aa	Known RBP	10.84	□□□□□ -0.67
GGA2	YHR108W	BCK1	Q01389	1478 aa		10.83	□□□□□ -0.68
GGA2	YHR108W	HAP1	P0CE41	1502 aa		10.83	□□□□□ -0.68
GGA2	YHR108W	TAF8	Q03750	510 aa		10.82	□□□□□ -0.68
GGA2	YHR108W	RAD9	P14737	1309 aa		10.82	□□□□□ -0.68
GGA2	YHR108W	CAB1	Q04430	367 aa		10.78	□□□□□ -0.68
GGA2	YHR108W	PRS1	P32895	427 aa	Known RBP	10.77	□□□□□ -0.68
GGA2	YHR108W	DNF3	Q12674	1656 aa		10.76	□□□□□ -0.69
GGA2	YHR108W	CHZ1	P40019	153 aa	Predicted RBP	10.75	□□□□□ -0.69
GGA2	YHR108W	MRX12	P47084	519 aa		10.75	□□□□□ -0.69
GGA2	YHR108W	MLP1	Q02455	1875 aa	Known RBP	10.72	□□□□□ -0.69
GGA2	YHR108W	RTG3	P38165	486 aa		10.72	□□□□□ -0.69
GGA2	YHR108W	NST1	P53935	1240 aa		10.72	□□□□□ -0.69
GGA2	YHR108W	FKH1	P40466	484 aa		10.7	□□□□□ -0.7
GGA2	YHR108W	KRE5	P22023	1365 aa		10.69	□□□□□ -0.7
GGA2	YHR108W	RIA1	P53893	1110 aa		10.67	□□□□□ -0.7
GGA2	YHR108W	MAK10	Q02197	733 aa		10.66	□□□□□ -0.7
GGA2	YHR108W	CFT1	Q06632	1357 aa	Known RBP	10.64	□□□□□ -0.71

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