RNA–Protein interactions for RNA: YER128W

VFA1, Transcript of Protein that interacts with Vps4p and has a role in vacuolar sorting, yeastyeast

Gene VFA1, Length 612 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
VFA1YER128W YEL023CP39992 682 aa8□□□□□ -1.13
VFA1YER128W PTC4P38089 393 aa7.99□□□□□ -1.13
VFA1YER128W CHL1P22516 861 aaPredicted RBP7.95□□□□□ -1.14
VFA1YER128W BCK2P33306 851 aa7.93□□□□□ -1.14
VFA1YER128W GRE2Q12068 342 aaKnown RBP7.93□□□□□ -1.14
VFA1YER128W PRE3P38624 215 aa7.92□□□□□ -1.14
VFA1YER128W MIF2P35201 549 aa7.9□□□□□ -1.14
VFA1YER128W MAK11P20484 414 aaKnown RBP7.87□□□□□ -1.15
VFA1YER128W ATH1P48016 1211 aa7.86□□□□□ -1.15
VFA1YER128W RAM2P29703 316 aa7.84□□□□□ -1.15
VFA1YER128W PML39Q03760 334 aa7.84□□□□□ -1.15
VFA1YER128W GUT1P32190 709 aa7.83□□□□□ -1.16
VFA1YER128W PTC3P34221 468 aaKnown RBP7.83□□□□□ -1.16
VFA1YER128W EDS1P38073 919 aa7.81□□□□□ -1.16
VFA1YER128W ELP4Q02884 456 aaKnown RBP7.79□□□□□ -1.16
VFA1YER128W COQ8P27697 501 aa7.76□□□□□ -1.17
VFA1YER128W VRP1P37370 817 aa7.76□□□□□ -1.17
VFA1YER128W YDR344CQ05510 147 aa7.76□□□□□ -1.17
VFA1YER128W XDJ1P39102 459 aa7.73□□□□□ -1.17
VFA1YER128W MID1P41821 548 aa7.72□□□□□ -1.17
VFA1YER128W ARH1P48360 493 aa7.71□□□□□ -1.18
VFA1YER128W NST1P53935 1240 aa7.71□□□□□ -1.18
VFA1YER128W PEX29Q03370 554 aa7.7□□□□□ -1.18
VFA1YER128W SOL3P38858 249 aa7.69□□□□□ -1.18
VFA1YER128W AI4P03878 556 aa7.68□□□□□ -1.18
VFA1YER128W MPH3P0CE00 602 aa7.67□□□□□ -1.18
VFA1YER128W SPT23P35210 1082 aa7.64□□□□□ -1.19
VFA1YER128W NOP53Q12080 455 aaKnown RBP7.62□□□□□ -1.19
VFA1YER128W ILV3P39522 585 aaKnown RBP7.6□□□□□ -1.19
VFA1YER128W HAP5Q02516 242 aa7.6□□□□□ -1.19
VFA1YER128W DPS1P04802 557 aaKnown RBP7.59□□□□□ -1.19
VFA1YER128W YGR273CP53329 174 aa7.59□□□□□ -1.19
VFA1YER128W BNI4P53858 892 aa7.55□□□□□ -1.2
VFA1YER128W MPC54Q08550 464 aa7.55□□□□□ -1.2
VFA1YER128W PTC2P39966 464 aaKnown RBP7.53□□□□□ -1.2
VFA1YER128W YML082WQ04533 649 aaKnown RBP7.51□□□□□ -1.21
VFA1YER128W SLI15P38283 698 aa7.5□□□□□ -1.21
VFA1YER128W NMA111P53920 997 aa7.49□□□□□ -1.21
VFA1YER128W DPL1Q05567 589 aa7.47□□□□□ -1.21
VFA1YER128W KEX1P09620 729 aa7.42□□□□□ -1.22
VFA1YER128W ISU2Q12056 156 aa7.39□□□□□ -1.23
VFA1YER128W SET1P38827 1080 aaKnown RBP7.38□□□□□ -1.23
VFA1YER128W SRC1Q03707 834 aa7.37□□□□□ -1.23
VFA1YER128W CDC73Q06697 393 aa7.35□□□□□ -1.23
VFA1YER128W YPR015CQ12531 247 aa7.35□□□□□ -1.23
VFA1YER128W RAM1P22007 431 aa7.33□□□□□ -1.24
VFA1YER128W VHR2P40041 505 aa7.33□□□□□ -1.24
VFA1YER128W YLR326WQ06170 240 aaKnown RBP7.33□□□□□ -1.24
VFA1YER128W UBP14P38237 781 aaKnown RBP7.32□□□□□ -1.24
VFA1YER128W GYP1Q08484 637 aa7.32□□□□□ -1.24
VFA1YER128W RAS1P01119 309 aa7.29□□□□□ -1.24
VFA1YER128W RPP1BP10622 106 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
VFA1YER128W RAD54P32863 898 aa7.29□□□□□ -1.24
VFA1YER128W PCS60P38137 543 aaKnown RBP RIP-Chip data7.28□□□□□ -1.24not detected
VFA1YER128W PDR1P12383 1068 aa7.26□□□□□ -1.25
VFA1YER128W RGA2Q06407 1009 aa7.26□□□□□ -1.25
VFA1YER128W AMS1P22855 1083 aa7.23□□□□□ -1.25
VFA1YER128W SAS4Q04003 481 aa7.23□□□□□ -1.25
VFA1YER128W KIC1P38692 1080 aa7.2□□□□□ -1.26
VFA1YER128W IFH1P39520 1085 aa7.2□□□□□ -1.26
VFA1YER128W TRK1P12685 1235 aa7.17□□□□□ -1.26
VFA1YER128W PEX21P50091 288 aa7.17□□□□□ -1.26
VFA1YER128W YDR090CQ03193 310 aa7.16□□□□□ -1.26
VFA1YER128W YEL077CQ3E7X8 1277 aa7.16□□□□□ -1.26
VFA1YER128W SDH2P21801 266 aa7.15□□□□□ -1.26
VFA1YER128W MRF1P30775 413 aaPredicted RBP7.15□□□□□ -1.26
VFA1YER128W YRR1Q12172 810 aa7.15□□□□□ -1.26
VFA1YER128W BUD20Q08004 166 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
VFA1YER128W PRT1P06103 763 aaKnown RBP7.11□□□□□ -1.27
VFA1YER128W RGA1P39083 1007 aa7.11□□□□□ -1.27
VFA1YER128W CSC1Q06538 782 aa7.11□□□□□ -1.27
VFA1YER128W TFB4Q12004 338 aa7.11□□□□□ -1.27
VFA1YER128W REF2P42073 533 aaPredicted RBP7.1□□□□□ -1.27
VFA1YER128W TUM1Q08686 304 aaKnown RBP7.09□□□□□ -1.27
VFA1YER128W GAP1P19145 602 aaPredicted RBP7.08□□□□□ -1.28
VFA1YER128W STR2P47164 639 aa7.08□□□□□ -1.28
VFA1YER128W NUD1P32336 851 aa7.07□□□□□ -1.28
VFA1YER128W YPR148CQ06523 435 aa7.07□□□□□ -1.28
VFA1YER128W ISM1P48526 1002 aa7.06□□□□□ -1.28
VFA1YER128W ERG12P07277 443 aa7.05□□□□□ -1.28
VFA1YER128W NPL4P33755 580 aa7.05□□□□□ -1.28
VFA1YER128W ORC6P38826 435 aa7.02□□□□□ -1.29
VFA1YER128W VPS70P47161 811 aa7.01□□□□□ -1.29
VFA1YER128W GCD11P32481 527 aaKnown RBP7□□□□□ -1.29
VFA1YER128W MAK21Q12176 1025 aaKnown RBP7□□□□□ -1.29
VFA1YER128W COX6P00427 148 aa6.98□□□□□ -1.29
VFA1YER128W SPT16P32558 1035 aaKnown RBP6.98□□□□□ -1.29
VFA1YER128W CST6P40535 587 aa6.97□□□□□ -1.29
VFA1YER128W MVP1P40959 511 aaKnown RBP6.97□□□□□ -1.29
VFA1YER128W TY1A-DR4O74302 440 aa6.95□□□□□ -1.3
VFA1YER128W TY1A-HP0C2I4 478 aaKnown RBP6.95□□□□□ -1.3
VFA1YER128W TY1A-AP0CX57 440 aa6.95□□□□□ -1.3
VFA1YER128W TY1A-PR1P0CX58 440 aa6.95□□□□□ -1.3
VFA1YER128W TY1A-ORP0CX59 440 aa6.95□□□□□ -1.3
VFA1YER128W TY1A-PR2P0CX60 440 aa6.95□□□□□ -1.3
VFA1YER128W TY1A-DR5P0CX65 440 aa6.95□□□□□ -1.3
VFA1YER128W TY1A-ER2P0CX66 440 aa6.95□□□□□ -1.3
VFA1YER128W TY1A-GR3P0CX67 440 aa6.95□□□□□ -1.3
VFA1YER128W TY1A-LR1P0CX68 440 aa6.95□□□□□ -1.3
VFA1YER128W TY1A-MR2P0CX69 440 aa6.95□□□□□ -1.3
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 16.9 ms