RNA–Protein interactions for RNA: YBR257W

POP4, Transcript of Subunit of both RNase MRP and nuclear RNase P, yeastyeast

Gene POP4, Length 840 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
POP4YBR257W JIP4Q03361 876 aa10.61□□□□□ -0.71
POP4YBR257W YEL023CP39992 682 aa10.59□□□□□ -0.71
POP4YBR257W PTC3P34221 468 aaKnown RBP10.58□□□□□ -0.72
POP4YBR257W GRE2Q12068 342 aaKnown RBP10.58□□□□□ -0.72
POP4YBR257W COQ8P27697 501 aa10.56□□□□□ -0.72
POP4YBR257W PTC4P38089 393 aa10.53□□□□□ -0.72
POP4YBR257W NST1P53935 1240 aa10.53□□□□□ -0.72
POP4YBR257W SAP30P38429 201 aa10.51□□□□□ -0.73
POP4YBR257W YDL129WQ07555 291 aa10.5□□□□□ -0.73
POP4YBR257W GUT1P32190 709 aa10.48□□□□□ -0.73
POP4YBR257W SOL3P38858 249 aa10.48□□□□□ -0.73
POP4YBR257W ATH1P48016 1211 aa10.48□□□□□ -0.73
POP4YBR257W TFG1P41895 735 aaPredicted RBP10.46□□□□□ -0.73
POP4YBR257W YDR344CQ05510 147 aa10.46□□□□□ -0.73
POP4YBR257W ILV3P39522 585 aaKnown RBP10.39□□□□□ -0.75
POP4YBR257W PML39Q03760 334 aa10.37□□□□□ -0.75
POP4YBR257W PRE3P38624 215 aa10.33□□□□□ -0.76
POP4YBR257W MPH3P0CE00 602 aa10.31□□□□□ -0.76
POP4YBR257W CHL1P22516 861 aaPredicted RBP10.31□□□□□ -0.76
POP4YBR257W MID1P41821 548 aa10.31□□□□□ -0.76
POP4YBR257W NOP53Q12080 455 aaKnown RBP10.31□□□□□ -0.76
POP4YBR257W AI4P03878 556 aa10.29□□□□□ -0.76
POP4YBR257W YGR273CP53329 174 aa10.28□□□□□ -0.76
POP4YBR257W BCK2P33306 851 aa10.22□□□□□ -0.77
POP4YBR257W SET1P38827 1080 aaKnown RBP10.18□□□□□ -0.78
POP4YBR257W ARH1P48360 493 aa10.18□□□□□ -0.78
POP4YBR257W ELP4Q02884 456 aaKnown RBP10.17□□□□□ -0.78
POP4YBR257W PEX29Q03370 554 aa10.13□□□□□ -0.79
POP4YBR257W SLI15P38283 698 aa10.12□□□□□ -0.79
POP4YBR257W MPC54Q08550 464 aa10.11□□□□□ -0.79
POP4YBR257W KEX1P09620 729 aa10.08□□□□□ -0.8
POP4YBR257W VRP1P37370 817 aa10.08□□□□□ -0.8
POP4YBR257W RGA2Q06407 1009 aa10.08□□□□□ -0.8
POP4YBR257W HAP5Q02516 242 aa10.05□□□□□ -0.8
POP4YBR257W YLR326WQ06170 240 aaKnown RBP10.05□□□□□ -0.8
POP4YBR257W UBP14P38237 781 aaKnown RBP10.04□□□□□ -0.8
POP4YBR257W SPT23P35210 1082 aa10.03□□□□□ -0.8
POP4YBR257W XDJ1P39102 459 aa10□□□□□ -0.81
POP4YBR257W VHR2P40041 505 aa10□□□□□ -0.81
POP4YBR257W BNI4P53858 892 aa10□□□□□ -0.81
POP4YBR257W NMA111P53920 997 aa9.98□□□□□ -0.81
POP4YBR257W DPL1Q05567 589 aa9.98□□□□□ -0.81
POP4YBR257W PCS60P38137 543 aaKnown RBP RIP-Chip data9.95□□□□□ -0.82not detected
POP4YBR257W CDC73Q06697 393 aa9.95□□□□□ -0.82
POP4YBR257W YML082WQ04533 649 aaKnown RBP9.92□□□□□ -0.82
POP4YBR257W YPR148CQ06523 435 aa9.92□□□□□ -0.82
POP4YBR257W YPR015CQ12531 247 aa9.92□□□□□ -0.82
POP4YBR257W YDR090CQ03193 310 aa9.91□□□□□ -0.82
POP4YBR257W RAM1P22007 431 aa9.89□□□□□ -0.83
POP4YBR257W PTC2P39966 464 aaKnown RBP9.89□□□□□ -0.83
POP4YBR257W RAD54P32863 898 aa9.87□□□□□ -0.83
POP4YBR257W IFH1P39520 1085 aa9.84□□□□□ -0.83
POP4YBR257W ISU2Q12056 156 aa9.84□□□□□ -0.83
POP4YBR257W DPS1P04802 557 aaKnown RBP9.8□□□□□ -0.84
POP4YBR257W PDR1P12383 1068 aa9.8□□□□□ -0.84
POP4YBR257W REF2P42073 533 aaPredicted RBP9.76□□□□□ -0.85
POP4YBR257W GAP1P19145 602 aaPredicted RBP9.75□□□□□ -0.85
POP4YBR257W VPS70P47161 811 aa9.75□□□□□ -0.85
POP4YBR257W SRC1Q03707 834 aa9.71□□□□□ -0.86
POP4YBR257W ORC6P38826 435 aa9.69□□□□□ -0.86
POP4YBR257W KIC1P38692 1080 aa9.67□□□□□ -0.86
POP4YBR257W SDH2P21801 266 aa9.66□□□□□ -0.86
POP4YBR257W RAS1P01119 309 aa9.64□□□□□ -0.87
POP4YBR257W YRR1Q12172 810 aa9.64□□□□□ -0.87
POP4YBR257W RPP1BP10622 106 aaKnown RBP9.62□□□□□ -0.87
POP4YBR257W COX6P00427 148 aa9.61□□□□□ -0.87
POP4YBR257W STR2P47164 639 aa9.61□□□□□ -0.87
POP4YBR257W CSC1Q06538 782 aa9.6□□□□□ -0.87
POP4YBR257W BUD20Q08004 166 aaPredicted RBP9.6□□□□□ -0.87
POP4YBR257W TFB4Q12004 338 aa9.59□□□□□ -0.87
POP4YBR257W GYP1Q08484 637 aa9.58□□□□□ -0.88
POP4YBR257W MAK21Q12176 1025 aaKnown RBP9.58□□□□□ -0.88
POP4YBR257W ISM1P48526 1002 aa9.57□□□□□ -0.88
POP4YBR257W TUM1Q08686 304 aaKnown RBP9.56□□□□□ -0.88
POP4YBR257W NUD1P32336 851 aa9.54□□□□□ -0.88
POP4YBR257W PEX21P50091 288 aa9.54□□□□□ -0.88
POP4YBR257W DMA1P38823 416 aa9.52□□□□□ -0.89
POP4YBR257W MVP1P40959 511 aaKnown RBP9.52□□□□□ -0.89
POP4YBR257W AMS1P22855 1083 aa9.51□□□□□ -0.89
POP4YBR257W SAS4Q04003 481 aa9.51□□□□□ -0.89
POP4YBR257W TY1A-DR4O74302 440 aa9.5□□□□□ -0.89
POP4YBR257W TY1A-HP0C2I4 478 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
POP4YBR257W TY1A-AP0CX57 440 aa9.5□□□□□ -0.89
POP4YBR257W TY1A-PR1P0CX58 440 aa9.5□□□□□ -0.89
POP4YBR257W TY1A-ORP0CX59 440 aa9.5□□□□□ -0.89
POP4YBR257W TY1A-PR2P0CX60 440 aa9.5□□□□□ -0.89
POP4YBR257W TY1A-DR5P0CX65 440 aa9.5□□□□□ -0.89
POP4YBR257W TY1A-ER2P0CX66 440 aa9.5□□□□□ -0.89
POP4YBR257W TY1A-GR3P0CX67 440 aa9.5□□□□□ -0.89
POP4YBR257W TY1A-LR1P0CX68 440 aa9.5□□□□□ -0.89
POP4YBR257W TY1A-MR2P0CX69 440 aa9.5□□□□□ -0.89
POP4YBR257W TY1A-JR2P47099 440 aa9.5□□□□□ -0.89
POP4YBR257W TY1A-DR1Q03856 440 aa9.5□□□□□ -0.89
POP4YBR257W TY1A-ML1Q04706 440 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
POP4YBR257W TY1A-BRQ12217 440 aa9.5□□□□□ -0.89
POP4YBR257W TY1A-NL2Q12470 440 aa9.5□□□□□ -0.89
POP4YBR257W TY1A-GR2Q12485 440 aa9.5□□□□□ -0.89
POP4YBR257W RGR1P19263 1082 aa9.49□□□□□ -0.89
POP4YBR257W RGA1P39083 1007 aa9.49□□□□□ -0.89
POP4YBR257W SAS10Q12136 610 aaPredicted RBP9.48□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 11.9 ms