RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000639439.1

PTPRVP-204, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type V, pseudogene, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PTPRVP, Length 821 nt, Biotype processed transcript.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRVP-204ENST00000639439 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP26.8■■□□□ 1.88
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PTPRVP-204ENST00000639439 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa26.73■■□□□ 1.87
PTPRVP-204ENST00000639439 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa26.73■■□□□ 1.87
PTPRVP-204ENST00000639439 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa26.52■■□□□ 1.84
PTPRVP-204ENST00000639439 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP26.5■■□□□ 1.83
PTPRVP-204ENST00000639439 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa26.48■■□□□ 1.83
PTPRVP-204ENST00000639439 IQGAP2Q13576 1575 aa26.48■■□□□ 1.83
PTPRVP-204ENST00000639439 PTPRGP23470 1445 aa26.44■■□□□ 1.82
PTPRVP-204ENST00000639439 TNIKQ9UKE5 1360 aa26.42■■□□□ 1.82
PTPRVP-204ENST00000639439 ADCY10Q96PN6 1610 aa26.4■■□□□ 1.82
PTPRVP-204ENST00000639439 MAPKBP1O60336 1514 aa26.38■■□□□ 1.81
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PTPRVP-204ENST00000639439 ABCC10Q5T3U5 1492 aa26.32■■□□□ 1.8
PTPRVP-204ENST00000639439 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP26.32■■□□□ 1.8
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PTPRVP-204ENST00000639439 KIF13AQ9H1H9 1805 aa26.3■■□□□ 1.8
PTPRVP-204ENST00000639439 FAM69CQ0P6D2 419 aa26.3■■□□□ 1.8
PTPRVP-204ENST00000639439 ABCC2Q92887 1545 aa26.25■■□□□ 1.79
PTPRVP-204ENST00000639439 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa26.25■■□□□ 1.79
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PTPRVP-204ENST00000639439 DIP2BQ9P265 1576 aa26.23■■□□□ 1.79
PTPRVP-204ENST00000639439 KIAA0556O60303 1618 aa26.22■■□□□ 1.79
PTPRVP-204ENST00000639439 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa26.22■■□□□ 1.79
PTPRVP-204ENST00000639439 GOLGA3Q08378 1498 aa26.19■■□□□ 1.78
PTPRVP-204ENST00000639439 CSRNP3Q8WYN3 585 aa26.19■■□□□ 1.78
PTPRVP-204ENST00000639439 EEA1Q15075 1411 aa26.16■■□□□ 1.78
PTPRVP-204ENST00000639439 PLB1Q6P1J6 1458 aa26.15■■□□□ 1.78
PTPRVP-204ENST00000639439 ASXL2Q76L83 1435 aa26.13■■□□□ 1.77
PTPRVP-204ENST00000639439 KDM5BQ9UGL1 1544 aa26.11■■□□□ 1.77
PTPRVP-204ENST00000639439 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP26.03■■□□□ 1.76
PTPRVP-204ENST00000639439 GLI2P10070 1586 aa26.03■■□□□ 1.76
PTPRVP-204ENST00000639439 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP26■■□□□ 1.75
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PTPRVP-204ENST00000639439 TSPOAP1O95153 1857 aa25.97■■□□□ 1.75
PTPRVP-204ENST00000639439 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP25.96■■□□□ 1.75
PTPRVP-204ENST00000639439 KDM6BO15054 1643 aa25.94■■□□□ 1.74
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PTPRVP-204ENST00000639439 WDR7Q9Y4E6 1490 aa25.91■■□□□ 1.74
PTPRVP-204ENST00000639439 P3H3Q8IVL6 736 aa25.91■■□□□ 1.74
PTPRVP-204ENST00000639439 CHIC1Q5VXU3 224 aa25.9■■□□□ 1.74
PTPRVP-204ENST00000639439 SAMD9Q5K651 1589 aa25.89■■□□□ 1.73
PTPRVP-204ENST00000639439 KIF21BO75037 1637 aa25.86■■□□□ 1.73
PTPRVP-204ENST00000639439 TEX14Q8IWB6 1497 aa25.85■■□□□ 1.73
PTPRVP-204ENST00000639439 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa25.85■■□□□ 1.73
PTPRVP-204ENST00000639439 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP25.84■■□□□ 1.73
PTPRVP-204ENST00000639439 KCNH8Q96L42 1107 aa25.78■■□□□ 1.72
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PTPRVP-204ENST00000639439 ATP10BO94823 1461 aa25.77■■□□□ 1.72
PTPRVP-204ENST00000639439 CD109Q6YHK3 1445 aa25.74■■□□□ 1.71
PTPRVP-204ENST00000639439 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa25.74■■□□□ 1.71
PTPRVP-204ENST00000639439 FHOD3Q2V2M9 1422 aa25.73■■□□□ 1.71
PTPRVP-204ENST00000639439 ARID3CA6NKF2 412 aa25.73■■□□□ 1.71
PTPRVP-204ENST00000639439 EFCAB5A4FU69 1503 aa25.73■■□□□ 1.71
PTPRVP-204ENST00000639439 CFAP43Q8NDM7 1665 aa25.72■■□□□ 1.71
PTPRVP-204ENST00000639439 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa25.72■■□□□ 1.71
PTPRVP-204ENST00000639439 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP25.69■■□□□ 1.7
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PTPRVP-204ENST00000639439 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP25.66■■□□□ 1.7
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PTPRVP-204ENST00000639439 ABCA9Q8IUA7 1624 aa25.57■■□□□ 1.68
PTPRVP-204ENST00000639439 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa25.57■■□□□ 1.68
PTPRVP-204ENST00000639439 PLEKHD1A6NEE1 506 aa25.56■■□□□ 1.68
PTPRVP-204ENST00000639439 PHLDB1Q86UU1 1377 aa25.55■■□□□ 1.68
PTPRVP-204ENST00000639439 FMN1Q68DA7 1419 aa25.53■■□□□ 1.68
PTPRVP-204ENST00000639439 ARAP3Q8WWN8 1544 aa25.51■■□□□ 1.67
PTPRVP-204ENST00000639439 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa25.5■■□□□ 1.67
PTPRVP-204ENST00000639439 NEO1Q92859 1461 aa25.47■■□□□ 1.67
PTPRVP-204ENST00000639439 ADGRL1O94910 1474 aa25.43■■□□□ 1.66
PTPRVP-204ENST00000639439 HECW1Q76N89 1606 aa25.41■■□□□ 1.66
PTPRVP-204ENST00000639439 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP25.4■■□□□ 1.66
PTPRVP-204ENST00000639439 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP25.4■■□□□ 1.66
PTPRVP-204ENST00000639439 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP25.38■■□□□ 1.65
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PTPRVP-204ENST00000639439 FANCAO15360 1455 aa25.31■■□□□ 1.64
PTPRVP-204ENST00000639439 CFAP74Q9C0B2 1584 aa25.31■■□□□ 1.64
PTPRVP-204ENST00000639439 AKNAQ7Z591 1439 aa25.3■■□□□ 1.64
PTPRVP-204ENST00000639439 TTC37Q6PGP7 1564 aa25.3■■□□□ 1.64
PTPRVP-204ENST00000639439 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP25.28■■□□□ 1.64
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PTPRVP-204ENST00000639439 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa25.25■■□□□ 1.63
PTPRVP-204ENST00000639439 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa25.24■■□□□ 1.63
PTPRVP-204ENST00000639439 CLIP1P30622 1438 aa25.23■■□□□ 1.63
PTPRVP-204ENST00000639439 CCDC18Q5T9S5 1454 aa25.21■■□□□ 1.63
PTPRVP-204ENST00000639439 KIF14Q15058 1648 aa25.19■■□□□ 1.62
PTPRVP-204ENST00000639439 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa25.19■■□□□ 1.62
PTPRVP-204ENST00000639439 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP25.18■■□□□ 1.62
PTPRVP-204ENST00000639439 RICTORQ6R327 1708 aa25.17■■□□□ 1.62
PTPRVP-204ENST00000639439 FYCO1Q9BQS8 1478 aa25.16■■□□□ 1.62
PTPRVP-204ENST00000639439 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa25.15■■□□□ 1.62
PTPRVP-204ENST00000639439 MYO5CQ9NQX4 1742 aa25.15■■□□□ 1.62
PTPRVP-204ENST00000639439 SCAPERQ9BY12 1400 aa25.14■■□□□ 1.62
PTPRVP-204ENST00000639439 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa25.13■■□□□ 1.61
PTPRVP-204ENST00000639439 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa25.13■■□□□ 1.61
PTPRVP-204ENST00000639439 MAGI2Q86UL8 1455 aa25.13■■□□□ 1.61
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