RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000638876.1

SLC35A3-211, Transcript of solute carrier family 35 member A3, humanhuman

TSL 5

Gene SLC35A3, Length 1,005 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC35A3-211ENST00000638876 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa37.08■■■■□ 3.53
SLC35A3-211ENST00000638876 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP37.06■■■■□ 3.52
SLC35A3-211ENST00000638876 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa37.02■■■■□ 3.52
SLC35A3-211ENST00000638876 TRHP20396 242 aaPredicted RBP36.98■■■■□ 3.51
SLC35A3-211ENST00000638876 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa36.85■■■■□ 3.49
SLC35A3-211ENST00000638876 IQGAP2Q13576 1575 aa36.72■■■■□ 3.47
SLC35A3-211ENST00000638876 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa36.67■■■■□ 3.46
SLC35A3-211ENST00000638876 PRXQ9BXM0 1461 aa36.6■■■■□ 3.45
SLC35A3-211ENST00000638876 PTPRGP23470 1445 aa36.59■■■■□ 3.45
SLC35A3-211ENST00000638876 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP36.58■■■■□ 3.45
SLC35A3-211ENST00000638876 TNIKQ9UKE5 1360 aa36.57■■■■□ 3.45
SLC35A3-211ENST00000638876 UGGT2Q9NYU1 1516 aa36.51■■■■□ 3.44
SLC35A3-211ENST00000638876 CSRNP3Q8WYN3 585 aa36.51■■■■□ 3.44
SLC35A3-211ENST00000638876 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP36.51■■■■□ 3.43
SLC35A3-211ENST00000638876 ADCY10Q96PN6 1610 aa36.49■■■■□ 3.43
SLC35A3-211ENST00000638876 DISP1Q96F81 1524 aa36.49■■■■□ 3.43
SLC35A3-211ENST00000638876 EEA1Q15075 1411 aa36.47■■■■□ 3.43
SLC35A3-211ENST00000638876 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa36.42■■■■□ 3.42
SLC35A3-211ENST00000638876 MAPKBP1O60336 1514 aa36.38■■■■□ 3.41
SLC35A3-211ENST00000638876 KIAA0556O60303 1618 aa36.36■■■■□ 3.41
SLC35A3-211ENST00000638876 CHIC1Q5VXU3 224 aa36.33■■■■□ 3.41
SLC35A3-211ENST00000638876 GOLGA3Q08378 1498 aa36.32■■■■□ 3.41
SLC35A3-211ENST00000638876 UACAQ9BZF9 1416 aa36.32■■■■□ 3.4
SLC35A3-211ENST00000638876 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa36.29■■■■□ 3.4
SLC35A3-211ENST00000638876 ABCC10Q5T3U5 1492 aa36.29■■■■□ 3.4
SLC35A3-211ENST00000638876 ABCC2Q92887 1545 aa36.29■■■■□ 3.4
SLC35A3-211ENST00000638876 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP36.28■■■■□ 3.4
SLC35A3-211ENST00000638876 FAM69CQ0P6D2 419 aa36.26■■■■□ 3.4
SLC35A3-211ENST00000638876 KIF13AQ9H1H9 1805 aa36.24■■■■□ 3.39
SLC35A3-211ENST00000638876 DIP2BQ9P265 1576 aa36.16■■■■□ 3.38
SLC35A3-211ENST00000638876 KDM5BQ9UGL1 1544 aa36.11■■■■□ 3.37
SLC35A3-211ENST00000638876 PLB1Q6P1J6 1458 aa36.11■■■■□ 3.37
SLC35A3-211ENST00000638876 ASXL2Q76L83 1435 aa36.09■■■■□ 3.37
SLC35A3-211ENST00000638876 KIF21BO75037 1637 aa36.06■■■■□ 3.36
SLC35A3-211ENST00000638876 P3H3Q8IVL6 736 aa36.04■■■■□ 3.36
SLC35A3-211ENST00000638876 ABCA8O94911 1581 aa36■■■■□ 3.35
SLC35A3-211ENST00000638876 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP35.98■■■■□ 3.35
SLC35A3-211ENST00000638876 SAMD9Q5K651 1589 aa35.97■■■■□ 3.35
SLC35A3-211ENST00000638876 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP35.94■■■■□ 3.34
SLC35A3-211ENST00000638876 GLI2P10070 1586 aa35.92■■■■□ 3.34
SLC35A3-211ENST00000638876 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP35.88■■■■□ 3.33
SLC35A3-211ENST00000638876 UBTFP17480 764 aaKnown RBP35.86■■■■□ 3.33
SLC35A3-211ENST00000638876 WDR7Q9Y4E6 1490 aa35.85■■■■□ 3.33
SLC35A3-211ENST00000638876 TSPOAP1O95153 1857 aa35.84■■■■□ 3.33
SLC35A3-211ENST00000638876 EHMT2Q96KQ7 1210 aa35.84■■■■□ 3.33
SLC35A3-211ENST00000638876 FHOD3Q2V2M9 1422 aa35.79■■■■□ 3.32
SLC35A3-211ENST00000638876 EFCAB5A4FU69 1503 aa35.78■■■■□ 3.32
SLC35A3-211ENST00000638876 ARID3CA6NKF2 412 aa35.75■■■■□ 3.31
SLC35A3-211ENST00000638876 ATP10BO94823 1461 aa35.73■■■■□ 3.31
SLC35A3-211ENST00000638876 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa35.72■■■■□ 3.31
SLC35A3-211ENST00000638876 KDM6BO15054 1643 aa35.72■■■■□ 3.31
SLC35A3-211ENST00000638876 KCNH8Q96L42 1107 aa35.71■■■■□ 3.31
SLC35A3-211ENST00000638876 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa35.7■■■■□ 3.31
SLC35A3-211ENST00000638876 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP35.67■■■■□ 3.3
SLC35A3-211ENST00000638876 TEX14Q8IWB6 1497 aa35.65■■■■□ 3.3
SLC35A3-211ENST00000638876 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP35.62■■■■□ 3.29
SLC35A3-211ENST00000638876 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP35.62■■■■□ 3.29
SLC35A3-211ENST00000638876 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP35.61■■■■□ 3.29
SLC35A3-211ENST00000638876 CD109Q6YHK3 1445 aa35.58■■■■□ 3.29
SLC35A3-211ENST00000638876 CFAP43Q8NDM7 1665 aa35.54■■■■□ 3.28
SLC35A3-211ENST00000638876 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa35.53■■■■□ 3.28
SLC35A3-211ENST00000638876 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa35.52■■■■□ 3.28
SLC35A3-211ENST00000638876 FMN1Q68DA7 1419 aa35.49■■■■□ 3.27
SLC35A3-211ENST00000638876 PLEKHD1A6NEE1 506 aa35.45■■■■□ 3.27
SLC35A3-211ENST00000638876 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP35.45■■■■□ 3.27
SLC35A3-211ENST00000638876 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP35.44■■■■□ 3.26
SLC35A3-211ENST00000638876 ABCA9Q8IUA7 1624 aa35.39■■■■□ 3.26
SLC35A3-211ENST00000638876 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP35.36■■■■□ 3.25
SLC35A3-211ENST00000638876 HECW1Q76N89 1606 aa35.32■■■■□ 3.24
SLC35A3-211ENST00000638876 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP35.31■■■■□ 3.24
SLC35A3-211ENST00000638876 PHLDB1Q86UU1 1377 aa35.27■■■■□ 3.24
SLC35A3-211ENST00000638876 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP35.23■■■■□ 3.23
SLC35A3-211ENST00000638876 ARAP3Q8WWN8 1544 aa35.22■■■■□ 3.23
SLC35A3-211ENST00000638876 CLIP1P30622 1438 aa35.21■■■■□ 3.23
SLC35A3-211ENST00000638876 NEO1Q92859 1461 aa35.2■■■■□ 3.23
SLC35A3-211ENST00000638876 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP35.16■■■■□ 3.22
SLC35A3-211ENST00000638876 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa35.15■■■■□ 3.22
SLC35A3-211ENST00000638876 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa35.12■■■■□ 3.21
SLC35A3-211ENST00000638876 TTC37Q6PGP7 1564 aa35.08■■■■□ 3.21
SLC35A3-211ENST00000638876 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP35.08■■■■□ 3.21
SLC35A3-211ENST00000638876 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP35.06■■■■□ 3.2
SLC35A3-211ENST00000638876 FANCAO15360 1455 aa35.05■■■■□ 3.2
SLC35A3-211ENST00000638876 CCDC18Q5T9S5 1454 aa35.05■■■■□ 3.2
SLC35A3-211ENST00000638876 RAPGEF3O95398 923 aa35.04■■■■□ 3.2
SLC35A3-211ENST00000638876 FYCO1Q9BQS8 1478 aa35.03■■■■□ 3.2
SLC35A3-211ENST00000638876 AKNAQ7Z591 1439 aa35.02■■■■□ 3.2
SLC35A3-211ENST00000638876 CFAP74Q9C0B2 1584 aa35.01■■■■□ 3.2
SLC35A3-211ENST00000638876 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa35.01■■■■□ 3.19
SLC35A3-211ENST00000638876 PLCH2O75038 1416 aa35■■■■□ 3.19
SLC35A3-211ENST00000638876 KIF14Q15058 1648 aa34.98■■■■□ 3.19
SLC35A3-211ENST00000638876 ADGRL1O94910 1474 aa34.97■■■■□ 3.19
SLC35A3-211ENST00000638876 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP34.96■■■■□ 3.19
SLC35A3-211ENST00000638876 CEP162Q5TB80 1403 aa34.94■■■■□ 3.18
SLC35A3-211ENST00000638876 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa34.91■■■■□ 3.18
SLC35A3-211ENST00000638876 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa34.9■■■■□ 3.18
SLC35A3-211ENST00000638876 MYO5CQ9NQX4 1742 aa34.87■■■■□ 3.17
SLC35A3-211ENST00000638876 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa34.84■■■■□ 3.17
SLC35A3-211ENST00000638876 SCAPERQ9BY12 1400 aa34.82■■■■□ 3.17
SLC35A3-211ENST00000638876 RICTORQ6R327 1708 aa34.81■■■■□ 3.16
SLC35A3-211ENST00000638876 ARHGAP5Q13017 1502 aa34.8■■■■□ 3.16
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