RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000636228.1

CLN3-246, Transcript of CLN3, battenin, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene CLN3, Length 1,224 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN3-246ENST00000636228 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa28.21■■■□□ 2.11
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CLN3-246ENST00000636228 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP28.05■■■□□ 2.08
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CLN3-246ENST00000636228 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP27.4■■□□□ 1.98
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CLN3-246ENST00000636228 CD109Q6YHK3 1445 aa27.25■■□□□ 1.95
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CLN3-246ENST00000636228 KIF21BO75037 1637 aa26.85■■□□□ 1.89
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CLN3-246ENST00000636228 HECW2Q9P2P5 1572 aa26.8■■□□□ 1.88
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CLN3-246ENST00000636228 BCORL1Q5H9F3 1711 aa26.55■■□□□ 1.84
CLN3-246ENST00000636228 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa26.55■■□□□ 1.84
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CLN3-246ENST00000636228 MADDQ8WXG6 1647 aa26.53■■□□□ 1.84
CLN3-246ENST00000636228 MLECQ14165 292 aa26.51■■□□□ 1.83
CLN3-246ENST00000636228 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa26.51■■□□□ 1.83
CLN3-246ENST00000636228 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa26.49■■□□□ 1.83
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