RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000636018.1

QARS-247, Transcript of glutaminyl-tRNA synthetase, humanhuman

TSL 5

Gene QARS, Length 2,171 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
QARS-247ENST00000636018 VPS8Q8N3P4 1428 aa16.44■□□□□ 0.22
QARS-247ENST00000636018 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP16.44■□□□□ 0.22
QARS-247ENST00000636018 ERICH3Q5RHP9 1530 aa16.42■□□□□ 0.22
QARS-247ENST00000636018 PRXQ9BXM0 1461 aa16.41■□□□□ 0.22
QARS-247ENST00000636018 KIF27Q86VH2 1401 aa16.41■□□□□ 0.22
QARS-247ENST00000636018 OSCARQ8IYS5 282 aa16.4■□□□□ 0.22
QARS-247ENST00000636018 ADAMTS12P58397 1594 aa16.4■□□□□ 0.22
QARS-247ENST00000636018 SYNJ2O15056 1496 aa16.39■□□□□ 0.21
QARS-247ENST00000636018 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP16.38■□□□□ 0.21
QARS-247ENST00000636018 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP16.37■□□□□ 0.21
QARS-247ENST00000636018 IGF1RP08069 1367 aa16.32■□□□□ 0.2
QARS-247ENST00000636018 FHAD1B1AJZ9 1412 aa16.32■□□□□ 0.2
QARS-247ENST00000636018 APLP2Q06481 763 aa16.31■□□□□ 0.2
QARS-247ENST00000636018 GRIN2AQ12879 1464 aa16.31■□□□□ 0.2
QARS-247ENST00000636018 ARAP1Q96P48 1450 aa16.31■□□□□ 0.2
QARS-247ENST00000636018 CUL7Q14999 1698 aa16.28■□□□□ 0.2
QARS-247ENST00000636018 CEP170Q5SW79 1584 aa16.26■□□□□ 0.19
QARS-247ENST00000636018 CLASP1Q7Z460 1538 aa16.25■□□□□ 0.19
QARS-247ENST00000636018 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa16.23■□□□□ 0.19
QARS-247ENST00000636018 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP16.21■□□□□ 0.19
QARS-247ENST00000636018 NUP160Q12769 1436 aa16.21■□□□□ 0.19
QARS-247ENST00000636018 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa16.2■□□□□ 0.18
QARS-247ENST00000636018 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa16.2■□□□□ 0.18
QARS-247ENST00000636018 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa16.2■□□□□ 0.18
QARS-247ENST00000636018 ARHGEF11O15085 1522 aa16.2■□□□□ 0.18
QARS-247ENST00000636018 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP16.17■□□□□ 0.18
QARS-247ENST00000636018 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa16.16■□□□□ 0.18
QARS-247ENST00000636018 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP16.16■□□□□ 0.18
QARS-247ENST00000636018 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP16.13■□□□□ 0.17
QARS-247ENST00000636018 ERCC6L2Q5T890 1561 aa16.11■□□□□ 0.17
QARS-247ENST00000636018 SHROOM2Q13796 1616 aa16.09■□□□□ 0.17
QARS-247ENST00000636018 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP16.09■□□□□ 0.17
QARS-247ENST00000636018 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP16.09■□□□□ 0.17
QARS-247ENST00000636018 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa16.07■□□□□ 0.16
QARS-247ENST00000636018 JPH4Q96JJ6 628 aa16.04■□□□□ 0.16
QARS-247ENST00000636018 IQGAP2Q13576 1575 aa16.04■□□□□ 0.16
QARS-247ENST00000636018 CYB5RLQ6IPT4 315 aa16.04■□□□□ 0.16
QARS-247ENST00000636018 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa16.04■□□□□ 0.16
QARS-247ENST00000636018 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP16.03■□□□□ 0.16
QARS-247ENST00000636018 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP16.03■□□□□ 0.16
QARS-247ENST00000636018 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP16.02■□□□□ 0.15
QARS-247ENST00000636018 NEUROD1Q13562 356 aa16.02■□□□□ 0.15
QARS-247ENST00000636018 MAP3K1Q13233 1512 aa16.01■□□□□ 0.15
QARS-247ENST00000636018 TIAM1Q13009 1591 aa16■□□□□ 0.15
QARS-247ENST00000636018 CLSPNQ9HAW4 1339 aa15.97■□□□□ 0.15
QARS-247ENST00000636018 CFAP43Q8NDM7 1665 aa15.95■□□□□ 0.14
QARS-247ENST00000636018 CCNB3Q8WWL7 1395 aa15.94■□□□□ 0.14
QARS-247ENST00000636018 P3H3Q8IVL6 736 aa15.93■□□□□ 0.14
QARS-247ENST00000636018 UGGT2Q9NYU1 1516 aa15.91■□□□□ 0.14
QARS-247ENST00000636018 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP15.91■□□□□ 0.14
QARS-247ENST00000636018 DISP1Q96F81 1524 aa15.91■□□□□ 0.14
QARS-247ENST00000636018 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa15.9■□□□□ 0.14
QARS-247ENST00000636018 KIAA0556O60303 1618 aa15.9■□□□□ 0.14
QARS-247ENST00000636018 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa15.89■□□□□ 0.13
QARS-247ENST00000636018 MIER1Q8N108 512 aa15.86■□□□□ 0.13
QARS-247ENST00000636018 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP15.85■□□□□ 0.13
QARS-247ENST00000636018 EFCAB5A4FU69 1503 aa15.85■□□□□ 0.13
QARS-247ENST00000636018 ITGAEP38570 1179 aa15.84■□□□□ 0.13
QARS-247ENST00000636018 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP15.84■□□□□ 0.13
QARS-247ENST00000636018 PTPRGP23470 1445 aa15.83■□□□□ 0.13
QARS-247ENST00000636018 FHOD3Q2V2M9 1422 aa15.83■□□□□ 0.12
QARS-247ENST00000636018 PHLDB1Q86UU1 1377 aa15.83■□□□□ 0.12
QARS-247ENST00000636018 MAPKBP1O60336 1514 aa15.82■□□□□ 0.12
QARS-247ENST00000636018 ADCY10Q96PN6 1610 aa15.81■□□□□ 0.12
QARS-247ENST00000636018 SAMD9Q5K651 1589 aa15.81■□□□□ 0.12
QARS-247ENST00000636018 FYCO1Q9BQS8 1478 aa15.8■□□□□ 0.12
QARS-247ENST00000636018 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa15.79■□□□□ 0.12
QARS-247ENST00000636018 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa15.79■□□□□ 0.12
QARS-247ENST00000636018 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa15.78■□□□□ 0.12
QARS-247ENST00000636018 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa15.78■□□□□ 0.12
QARS-247ENST00000636018 SETD5Q9C0A6 1442 aa15.74■□□□□ 0.11
QARS-247ENST00000636018 PLB1Q6P1J6 1458 aa15.74■□□□□ 0.11
QARS-247ENST00000636018 FMN1Q68DA7 1419 aa15.74■□□□□ 0.11
QARS-247ENST00000636018 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP15.73■□□□□ 0.11
QARS-247ENST00000636018 UACAQ9BZF9 1416 aa15.73■□□□□ 0.11
QARS-247ENST00000636018 ABCC2Q92887 1545 aa15.72■□□□□ 0.11
QARS-247ENST00000636018 TRHP20396 242 aaPredicted RBP15.7■□□□□ 0.1
QARS-247ENST00000636018 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP15.69■□□□□ 0.1
QARS-247ENST00000636018 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP15.69■□□□□ 0.1
QARS-247ENST00000636018 ABCA8O94911 1581 aa15.68■□□□□ 0.1
QARS-247ENST00000636018 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP15.68■□□□□ 0.1
QARS-247ENST00000636018 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa15.68■□□□□ 0.1
QARS-247ENST00000636018 ARID3CA6NKF2 412 aa15.67■□□□□ 0.1
QARS-247ENST00000636018 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP15.66■□□□□ 0.1
QARS-247ENST00000636018 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa15.65■□□□□ 0.1
QARS-247ENST00000636018 KDM5BQ9UGL1 1544 aa15.63■□□□□ 0.09
QARS-247ENST00000636018 FGD6Q6ZV73 1430 aa15.62■□□□□ 0.09
QARS-247ENST00000636018 MTUS2Q5JR59 1369 aa15.62■□□□□ 0.09
QARS-247ENST00000636018 KIF13AQ9H1H9 1805 aa15.61■□□□□ 0.09
QARS-247ENST00000636018 ASXL2Q76L83 1435 aa15.6■□□□□ 0.09
QARS-247ENST00000636018 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP15.58■□□□□ 0.08
QARS-247ENST00000636018 DIP2BQ9P265 1576 aa15.58■□□□□ 0.08
QARS-247ENST00000636018 PTPRKQ15262 1439 aa15.58■□□□□ 0.08
QARS-247ENST00000636018 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP15.57■□□□□ 0.08
QARS-247ENST00000636018 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa15.57■□□□□ 0.08
QARS-247ENST00000636018 ABCC10Q5T3U5 1492 aa15.56■□□□□ 0.08
QARS-247ENST00000636018 SIN3AQ96ST3 1273 aa15.56■□□□□ 0.08
QARS-247ENST00000636018 ATP10BO94823 1461 aa15.56■□□□□ 0.08
QARS-247ENST00000636018 NCOA2Q15596 1464 aa15.56■□□□□ 0.08
QARS-247ENST00000636018 PTPN23Q9H3S7 1636 aa15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.6 ms