RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000635438.1

TUBBP5-204, Transcript of tubulin beta pseudogene 5, humanhuman

TSL 4 BASIC

Gene TUBBP5, Length 565 nt, Biotype processed transcript.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBBP5-204ENST00000635438 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa39.72■■■■□ 3.95
TUBBP5-204ENST00000635438 CUL7Q14999 1698 aa39.69■■■■□ 3.94
TUBBP5-204ENST00000635438 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa39.64■■■■□ 3.94
TUBBP5-204ENST00000635438 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa39.59■■■■□ 3.93
TUBBP5-204ENST00000635438 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP39.3■■■■□ 3.88
TUBBP5-204ENST00000635438 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa39.29■■■■□ 3.88
TUBBP5-204ENST00000635438 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP39.26■■■■□ 3.88
TUBBP5-204ENST00000635438 IQGAP2Q13576 1575 aa39.25■■■■□ 3.87
TUBBP5-204ENST00000635438 ADCY10Q96PN6 1610 aa39.22■■■■□ 3.87
TUBBP5-204ENST00000635438 PTPRGP23470 1445 aa39.21■■■■□ 3.87
TUBBP5-204ENST00000635438 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa39.2■■■■□ 3.87
TUBBP5-204ENST00000635438 TNIKQ9UKE5 1360 aa39.14■■■■□ 3.86
TUBBP5-204ENST00000635438 FAM69CQ0P6D2 419 aa39.08■■■■□ 3.85
TUBBP5-204ENST00000635438 KIF13AQ9H1H9 1805 aa39.07■■■■□ 3.85
TUBBP5-204ENST00000635438 DISP1Q96F81 1524 aa39.07■■■■□ 3.84
TUBBP5-204ENST00000635438 MAPKBP1O60336 1514 aa39.05■■■■□ 3.84
TUBBP5-204ENST00000635438 ABCC10Q5T3U5 1492 aa39.03■■■■□ 3.84
TUBBP5-204ENST00000635438 UGGT2Q9NYU1 1516 aa39■■■■□ 3.83
TUBBP5-204ENST00000635438 PRXQ9BXM0 1461 aa38.98■■■■□ 3.83
TUBBP5-204ENST00000635438 DIP2BQ9P265 1576 aa38.91■■■■□ 3.82
TUBBP5-204ENST00000635438 ABCC2Q92887 1545 aa38.9■■■■□ 3.82
TUBBP5-204ENST00000635438 UACAQ9BZF9 1416 aa38.89■■■■□ 3.82
TUBBP5-204ENST00000635438 KIAA0556O60303 1618 aa38.89■■■■□ 3.82
TUBBP5-204ENST00000635438 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa38.87■■■■□ 3.81
TUBBP5-204ENST00000635438 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa38.84■■■■□ 3.81
TUBBP5-204ENST00000635438 CSRNP3Q8WYN3 585 aa38.83■■■■□ 3.81
TUBBP5-204ENST00000635438 ASXL2Q76L83 1435 aa38.77■■■■□ 3.8
TUBBP5-204ENST00000635438 GOLGA3Q08378 1498 aa38.73■■■■□ 3.79
TUBBP5-204ENST00000635438 PLB1Q6P1J6 1458 aa38.7■■■■□ 3.79
TUBBP5-204ENST00000635438 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP38.69■■■■□ 3.78
TUBBP5-204ENST00000635438 KDM5BQ9UGL1 1544 aa38.68■■■■□ 3.78
TUBBP5-204ENST00000635438 TSPOAP1O95153 1857 aa38.65■■■■□ 3.78
TUBBP5-204ENST00000635438 P3H3Q8IVL6 736 aa38.62■■■■□ 3.77
TUBBP5-204ENST00000635438 EEA1Q15075 1411 aa38.62■■■■□ 3.77
TUBBP5-204ENST00000635438 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP38.6■■■■□ 3.77
TUBBP5-204ENST00000635438 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP38.54■■■■□ 3.76
TUBBP5-204ENST00000635438 GLI2P10070 1586 aa38.53■■■■□ 3.76
TUBBP5-204ENST00000635438 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP38.52■■■■□ 3.76
TUBBP5-204ENST00000635438 ABCA8O94911 1581 aa38.52■■■■□ 3.76
TUBBP5-204ENST00000635438 KDM6BO15054 1643 aa38.49■■■■□ 3.75
TUBBP5-204ENST00000635438 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP38.48■■■■□ 3.75
TUBBP5-204ENST00000635438 CHIC1Q5VXU3 224 aa38.47■■■■□ 3.75
TUBBP5-204ENST00000635438 ARID3CA6NKF2 412 aa38.42■■■■□ 3.74
TUBBP5-204ENST00000635438 WDR7Q9Y4E6 1490 aa38.41■■■■□ 3.74
TUBBP5-204ENST00000635438 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP38.4■■■■□ 3.74
TUBBP5-204ENST00000635438 SAMD9Q5K651 1589 aa38.37■■■■□ 3.73
TUBBP5-204ENST00000635438 KCNH8Q96L42 1107 aa38.37■■■■□ 3.73
TUBBP5-204ENST00000635438 EHMT2Q96KQ7 1210 aa38.34■■■■□ 3.73
TUBBP5-204ENST00000635438 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa38.34■■■■□ 3.73
TUBBP5-204ENST00000635438 KIF21BO75037 1637 aa38.28■■■■□ 3.72
TUBBP5-204ENST00000635438 ATP10BO94823 1461 aa38.25■■■■□ 3.71
TUBBP5-204ENST00000635438 FHOD3Q2V2M9 1422 aa38.23■■■■□ 3.71
TUBBP5-204ENST00000635438 TEX14Q8IWB6 1497 aa38.22■■■■□ 3.71
TUBBP5-204ENST00000635438 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP38.22■■■■□ 3.71
TUBBP5-204ENST00000635438 CD109Q6YHK3 1445 aa38.19■■■■□ 3.7
TUBBP5-204ENST00000635438 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa38.16■■■■□ 3.7
TUBBP5-204ENST00000635438 UBTFP17480 764 aaKnown RBP38.15■■■■□ 3.7
TUBBP5-204ENST00000635438 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP38.14■■■■□ 3.7
TUBBP5-204ENST00000635438 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP38.14■■■■□ 3.7
TUBBP5-204ENST00000635438 CFAP43Q8NDM7 1665 aa38.08■■■■□ 3.69
TUBBP5-204ENST00000635438 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa38.07■■■■□ 3.69
TUBBP5-204ENST00000635438 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP38.07■■■■□ 3.68
TUBBP5-204ENST00000635438 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa38.06■■■■□ 3.68
TUBBP5-204ENST00000635438 EFCAB5A4FU69 1503 aa38.04■■■■□ 3.68
TUBBP5-204ENST00000635438 ABCA9Q8IUA7 1624 aa37.9■■■■□ 3.66
TUBBP5-204ENST00000635438 PLEKHD1A6NEE1 506 aa37.87■■■■□ 3.65
TUBBP5-204ENST00000635438 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa37.84■■■■□ 3.65
TUBBP5-204ENST00000635438 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP37.83■■■■□ 3.65
TUBBP5-204ENST00000635438 ADGRL1O94910 1474 aa37.78■■■■□ 3.64
TUBBP5-204ENST00000635438 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP37.77■■■■□ 3.64
TUBBP5-204ENST00000635438 ARAP3Q8WWN8 1544 aa37.77■■■■□ 3.64
TUBBP5-204ENST00000635438 FMN1Q68DA7 1419 aa37.74■■■■□ 3.63
TUBBP5-204ENST00000635438 PHLDB1Q86UU1 1377 aa37.7■■■■□ 3.63
TUBBP5-204ENST00000635438 RAPGEF3O95398 923 aa37.7■■■■□ 3.63
TUBBP5-204ENST00000635438 NEO1Q92859 1461 aa37.67■■■■□ 3.62
TUBBP5-204ENST00000635438 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP37.65■■■■□ 3.62
TUBBP5-204ENST00000635438 HECW1Q76N89 1606 aa37.62■■■■□ 3.61
TUBBP5-204ENST00000635438 TTC37Q6PGP7 1564 aa37.59■■■■□ 3.61
TUBBP5-204ENST00000635438 FANCAO15360 1455 aa37.54■■■■□ 3.6
TUBBP5-204ENST00000635438 AKNAQ7Z591 1439 aa37.53■■■■□ 3.6
TUBBP5-204ENST00000635438 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP37.51■■■■□ 3.6
TUBBP5-204ENST00000635438 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa37.5■■■■□ 3.59
TUBBP5-204ENST00000635438 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP37.45■■■■□ 3.59
TUBBP5-204ENST00000635438 PLCH2O75038 1416 aa37.42■■■■□ 3.58
TUBBP5-204ENST00000635438 CFAP74Q9C0B2 1584 aa37.42■■■■□ 3.58
TUBBP5-204ENST00000635438 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa37.41■■■■□ 3.58
TUBBP5-204ENST00000635438 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP37.4■■■■□ 3.58
TUBBP5-204ENST00000635438 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP37.39■■■■□ 3.58
TUBBP5-204ENST00000635438 CLIP1P30622 1438 aa37.39■■■■□ 3.58
TUBBP5-204ENST00000635438 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa37.39■■■■□ 3.58
TUBBP5-204ENST00000635438 KIF14Q15058 1648 aa37.38■■■■□ 3.57
TUBBP5-204ENST00000635438 RICTORQ6R327 1708 aa37.35■■■■□ 3.57
TUBBP5-204ENST00000635438 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP37.33■■■■□ 3.57
TUBBP5-204ENST00000635438 SCAPERQ9BY12 1400 aa37.31■■■■□ 3.56
TUBBP5-204ENST00000635438 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa37.31■■■■□ 3.56
TUBBP5-204ENST00000635438 MYO5CQ9NQX4 1742 aa37.27■■■■□ 3.56
TUBBP5-204ENST00000635438 CCDC18Q5T9S5 1454 aa37.27■■■■□ 3.56
TUBBP5-204ENST00000635438 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa37.25■■■■□ 3.55
TUBBP5-204ENST00000635438 FYCO1Q9BQS8 1478 aa37.24■■■■□ 3.55
TUBBP5-204ENST00000635438 YEATS2Q9ULM3 1422 aa37.22■■■■□ 3.55
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 8.6 ms