RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000635438.1

TUBBP5-204, Transcript of tubulin beta pseudogene 5, humanhuman

TSL 4 BASIC

Gene TUBBP5, Length 565 nt, Biotype processed transcript.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBBP5-204ENST00000635438 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa39.72■■■■□ 3.95
TUBBP5-204ENST00000635438 CUL7Q14999 1698 aa39.69■■■■□ 3.94
TUBBP5-204ENST00000635438 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa39.64■■■■□ 3.94
TUBBP5-204ENST00000635438 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa39.59■■■■□ 3.93
TUBBP5-204ENST00000635438 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP39.3■■■■□ 3.88
TUBBP5-204ENST00000635438 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa39.29■■■■□ 3.88
TUBBP5-204ENST00000635438 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP39.26■■■■□ 3.88
TUBBP5-204ENST00000635438 IQGAP2Q13576 1575 aa39.25■■■■□ 3.87
TUBBP5-204ENST00000635438 ADCY10Q96PN6 1610 aa39.22■■■■□ 3.87
TUBBP5-204ENST00000635438 PTPRGP23470 1445 aa39.21■■■■□ 3.87
TUBBP5-204ENST00000635438 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa39.2■■■■□ 3.87
TUBBP5-204ENST00000635438 TNIKQ9UKE5 1360 aa39.14■■■■□ 3.86
TUBBP5-204ENST00000635438 FAM69CQ0P6D2 419 aa39.08■■■■□ 3.85
TUBBP5-204ENST00000635438 KIF13AQ9H1H9 1805 aa39.07■■■■□ 3.85
TUBBP5-204ENST00000635438 DISP1Q96F81 1524 aa39.07■■■■□ 3.84
TUBBP5-204ENST00000635438 MAPKBP1O60336 1514 aa39.05■■■■□ 3.84
TUBBP5-204ENST00000635438 ABCC10Q5T3U5 1492 aa39.03■■■■□ 3.84
TUBBP5-204ENST00000635438 UGGT2Q9NYU1 1516 aa39■■■■□ 3.83
TUBBP5-204ENST00000635438 PRXQ9BXM0 1461 aa38.98■■■■□ 3.83
TUBBP5-204ENST00000635438 DIP2BQ9P265 1576 aa38.91■■■■□ 3.82
TUBBP5-204ENST00000635438 ABCC2Q92887 1545 aa38.9■■■■□ 3.82
TUBBP5-204ENST00000635438 UACAQ9BZF9 1416 aa38.89■■■■□ 3.82
TUBBP5-204ENST00000635438 KIAA0556O60303 1618 aa38.89■■■■□ 3.82
TUBBP5-204ENST00000635438 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa38.87■■■■□ 3.81
TUBBP5-204ENST00000635438 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa38.84■■■■□ 3.81
TUBBP5-204ENST00000635438 CSRNP3Q8WYN3 585 aa38.83■■■■□ 3.81
TUBBP5-204ENST00000635438 ASXL2Q76L83 1435 aa38.77■■■■□ 3.8
TUBBP5-204ENST00000635438 GOLGA3Q08378 1498 aa38.73■■■■□ 3.79
TUBBP5-204ENST00000635438 PLB1Q6P1J6 1458 aa38.7■■■■□ 3.79
TUBBP5-204ENST00000635438 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP38.69■■■■□ 3.78
TUBBP5-204ENST00000635438 KDM5BQ9UGL1 1544 aa38.68■■■■□ 3.78
TUBBP5-204ENST00000635438 TSPOAP1O95153 1857 aa38.65■■■■□ 3.78
TUBBP5-204ENST00000635438 P3H3Q8IVL6 736 aa38.62■■■■□ 3.77
TUBBP5-204ENST00000635438 EEA1Q15075 1411 aa38.62■■■■□ 3.77
TUBBP5-204ENST00000635438 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP38.6■■■■□ 3.77
TUBBP5-204ENST00000635438 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP38.54■■■■□ 3.76
TUBBP5-204ENST00000635438 GLI2P10070 1586 aa38.53■■■■□ 3.76
TUBBP5-204ENST00000635438 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP38.52■■■■□ 3.76
TUBBP5-204ENST00000635438 ABCA8O94911 1581 aa38.52■■■■□ 3.76
TUBBP5-204ENST00000635438 KDM6BO15054 1643 aa38.49■■■■□ 3.75
TUBBP5-204ENST00000635438 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP38.48■■■■□ 3.75
TUBBP5-204ENST00000635438 CHIC1Q5VXU3 224 aa38.47■■■■□ 3.75
TUBBP5-204ENST00000635438 ARID3CA6NKF2 412 aa38.42■■■■□ 3.74
TUBBP5-204ENST00000635438 WDR7Q9Y4E6 1490 aa38.41■■■■□ 3.74
TUBBP5-204ENST00000635438 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP38.4■■■■□ 3.74
TUBBP5-204ENST00000635438 SAMD9Q5K651 1589 aa38.37■■■■□ 3.73
TUBBP5-204ENST00000635438 KCNH8Q96L42 1107 aa38.37■■■■□ 3.73
TUBBP5-204ENST00000635438 EHMT2Q96KQ7 1210 aa38.34■■■■□ 3.73
TUBBP5-204ENST00000635438 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa38.34■■■■□ 3.73
TUBBP5-204ENST00000635438 KIF21BO75037 1637 aa38.28■■■■□ 3.72
TUBBP5-204ENST00000635438 ATP10BO94823 1461 aa38.25■■■■□ 3.71
TUBBP5-204ENST00000635438 FHOD3Q2V2M9 1422 aa38.23■■■■□ 3.71
TUBBP5-204ENST00000635438 TEX14Q8IWB6 1497 aa38.22■■■■□ 3.71
TUBBP5-204ENST00000635438 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP38.22■■■■□ 3.71
TUBBP5-204ENST00000635438 CD109Q6YHK3 1445 aa38.19■■■■□ 3.7
TUBBP5-204ENST00000635438 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa38.16■■■■□ 3.7
TUBBP5-204ENST00000635438 UBTFP17480 764 aaKnown RBP38.15■■■■□ 3.7
TUBBP5-204ENST00000635438 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP38.14■■■■□ 3.7
TUBBP5-204ENST00000635438 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP38.14■■■■□ 3.7
TUBBP5-204ENST00000635438 CFAP43Q8NDM7 1665 aa38.08■■■■□ 3.69
TUBBP5-204ENST00000635438 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa38.07■■■■□ 3.69
TUBBP5-204ENST00000635438 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP38.07■■■■□ 3.68
TUBBP5-204ENST00000635438 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa38.06■■■■□ 3.68
TUBBP5-204ENST00000635438 EFCAB5A4FU69 1503 aa38.04■■■■□ 3.68
TUBBP5-204ENST00000635438 ABCA9Q8IUA7 1624 aa37.9■■■■□ 3.66
TUBBP5-204ENST00000635438 PLEKHD1A6NEE1 506 aa37.87■■■■□ 3.65
TUBBP5-204ENST00000635438 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa37.84■■■■□ 3.65
TUBBP5-204ENST00000635438 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP37.83■■■■□ 3.65
TUBBP5-204ENST00000635438 ADGRL1O94910 1474 aa37.78■■■■□ 3.64
TUBBP5-204ENST00000635438 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP37.77■■■■□ 3.64
TUBBP5-204ENST00000635438 ARAP3Q8WWN8 1544 aa37.77■■■■□ 3.64
TUBBP5-204ENST00000635438 FMN1Q68DA7 1419 aa37.74■■■■□ 3.63
TUBBP5-204ENST00000635438 PHLDB1Q86UU1 1377 aa37.7■■■■□ 3.63
TUBBP5-204ENST00000635438 RAPGEF3O95398 923 aa37.7■■■■□ 3.63
TUBBP5-204ENST00000635438 NEO1Q92859 1461 aa37.67■■■■□ 3.62
TUBBP5-204ENST00000635438 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP37.65■■■■□ 3.62
TUBBP5-204ENST00000635438 HECW1Q76N89 1606 aa37.62■■■■□ 3.61
TUBBP5-204ENST00000635438 TTC37Q6PGP7 1564 aa37.59■■■■□ 3.61
TUBBP5-204ENST00000635438 FANCAO15360 1455 aa37.54■■■■□ 3.6
TUBBP5-204ENST00000635438 AKNAQ7Z591 1439 aa37.53■■■■□ 3.6
TUBBP5-204ENST00000635438 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP37.51■■■■□ 3.6
TUBBP5-204ENST00000635438 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa37.5■■■■□ 3.59
TUBBP5-204ENST00000635438 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP37.45■■■■□ 3.59
TUBBP5-204ENST00000635438 PLCH2O75038 1416 aa37.42■■■■□ 3.58
TUBBP5-204ENST00000635438 CFAP74Q9C0B2 1584 aa37.42■■■■□ 3.58
TUBBP5-204ENST00000635438 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa37.41■■■■□ 3.58
TUBBP5-204ENST00000635438 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP37.4■■■■□ 3.58
TUBBP5-204ENST00000635438 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP37.39■■■■□ 3.58
TUBBP5-204ENST00000635438 CLIP1P30622 1438 aa37.39■■■■□ 3.58
TUBBP5-204ENST00000635438 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa37.39■■■■□ 3.58
TUBBP5-204ENST00000635438 KIF14Q15058 1648 aa37.38■■■■□ 3.57
TUBBP5-204ENST00000635438 RICTORQ6R327 1708 aa37.35■■■■□ 3.57
TUBBP5-204ENST00000635438 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP37.33■■■■□ 3.57
TUBBP5-204ENST00000635438 SCAPERQ9BY12 1400 aa37.31■■■■□ 3.56
TUBBP5-204ENST00000635438 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa37.31■■■■□ 3.56
TUBBP5-204ENST00000635438 MYO5CQ9NQX4 1742 aa37.27■■■■□ 3.56
TUBBP5-204ENST00000635438 CCDC18Q5T9S5 1454 aa37.27■■■■□ 3.56
TUBBP5-204ENST00000635438 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa37.25■■■■□ 3.55
TUBBP5-204ENST00000635438 FYCO1Q9BQS8 1478 aa37.24■■■■□ 3.55
TUBBP5-204ENST00000635438 YEATS2Q9ULM3 1422 aa37.22■■■■□ 3.55
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 13.4 ms