RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000629930.1

SRP68-213, Transcript of signal recognition particle 68, human

TSL 5 BASIC

Gene SRP68, Length 165 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SRP68-213	ENST00000629930	PRG4	Q92954	1404 aa	Predicted RBP	43.48	■■■■■ 4.55
SRP68-213	ENST00000629930	JPH4	Q96JJ6	628 aa		43.48	■■■■■ 4.55
SRP68-213	ENST00000629930	KIAA0586	Q9BVV6	1533 aa		43.39	■■■■■ 4.54
SRP68-213	ENST00000629930	CARMIL1	Q5VZK9	1371 aa		43.37	■■■■■ 4.53
SRP68-213	ENST00000629930	RAPGEF2	Q9Y4G8	1499 aa		43.05	■■■■■ 4.48
SRP68-213	ENST00000629930	IQGAP2	Q13576	1575 aa		43.03	■■■■■ 4.48
SRP68-213	ENST00000629930	ADCY10	Q96PN6	1610 aa		42.96	■■■■■ 4.47
SRP68-213	ENST00000629930	CARMIL2	Q6F5E8	1435 aa		42.89	■■■■■ 4.46
SRP68-213	ENST00000629930	PTPRG	P23470	1445 aa		42.86	■■■■■ 4.45
SRP68-213	ENST00000629930	MAPKBP1	O60336	1514 aa		42.85	■■■■■ 4.45
SRP68-213	ENST00000629930	TNIK	Q9UKE5	1360 aa		42.84	■■■■■ 4.45
SRP68-213	ENST00000629930	KIF13A	Q9H1H9	1805 aa		42.83	■■■■■ 4.45
SRP68-213	ENST00000629930	DISP1	Q96F81	1524 aa		42.81	■■■■■ 4.44
SRP68-213	ENST00000629930	UGGT2	Q9NYU1	1516 aa		42.81	■■■■■ 4.44
SRP68-213	ENST00000629930	NPM1	P06748	294 aa	Known RBP eCLIP	42.79	■■■■■ 4.44
SRP68-213	ENST00000629930	PRX	Q9BXM0	1461 aa		42.77	■■■■■ 4.44
SRP68-213	ENST00000629930	ABCC10	Q5T3U5	1492 aa		42.73	■■■■■ 4.43
SRP68-213	ENST00000629930	CTTNBP2	Q8WZ74	1663 aa		42.68	■■■■■ 4.42
SRP68-213	ENST00000629930	KIAA0556	O60303	1618 aa		42.64	■■■■■ 4.42
SRP68-213	ENST00000629930	DIP2B	Q9P265	1576 aa		42.64	■■■■■ 4.42
SRP68-213	ENST00000629930	ABCC2	Q92887	1545 aa		42.62	■■■■■ 4.41
SRP68-213	ENST00000629930	TTBK1	Q5TCY1	1321 aa	Predicted RBP	42.62	■■■■■ 4.41
SRP68-213	ENST00000629930	UHRF1BP1L	A0JNW5	1464 aa		42.62	■■■■■ 4.41
SRP68-213	ENST00000629930	FAM69C	Q0P6D2	419 aa		42.58	■■■■■ 4.41
SRP68-213	ENST00000629930	UACA	Q9BZF9	1416 aa		42.56	■■■■■ 4.4
SRP68-213	ENST00000629930	CSRNP3	Q8WYN3	585 aa		42.47	■■■■■ 4.39
SRP68-213	ENST00000629930	GOLGA3	Q08378	1498 aa		42.46	■■■■■ 4.39
SRP68-213	ENST00000629930	EEA1	Q15075	1411 aa		42.43	■■■■■ 4.38
SRP68-213	ENST00000629930	KDM5B	Q9UGL1	1544 aa		42.41	■■■■■ 4.38
SRP68-213	ENST00000629930	ASXL2	Q76L83	1435 aa		42.39	■■■■■ 4.38
SRP68-213	ENST00000629930	PLB1	Q6P1J6	1458 aa		42.38	■■■■■ 4.38
SRP68-213	ENST00000629930	ZCCHC11	Q5TAX3	1644 aa	Known RBP	42.28	■■■■■ 4.36
SRP68-213	ENST00000629930	GLI2	P10070	1586 aa		42.28	■■■■■ 4.36
SRP68-213	ENST00000629930	ABCA8	O94911	1581 aa		42.24	■■■■■ 4.35
SRP68-213	ENST00000629930	TSPOAP1	O95153	1857 aa		42.23	■■■■■ 4.35
SRP68-213	ENST00000629930	EPRS	P07814	1512 aa	Known RBP	42.16	■■■■■ 4.34
SRP68-213	ENST00000629930	SAMD9	Q5K651	1589 aa		42.14	■■■■■ 4.34
SRP68-213	ENST00000629930	PPRC1	Q5VV67	1664 aa	Known RBP	42.12	■■■■■ 4.33
SRP68-213	ENST00000629930	CHIC1	Q5VXU3	224 aa		42.1	■■■■■ 4.33
SRP68-213	ENST00000629930	KDM6B	O15054	1643 aa		42.09	■■■■■ 4.33
SRP68-213	ENST00000629930	FAM9A	Q8IZU1	332 aa	Predicted RBP	42.08	■■■■■ 4.33
SRP68-213	ENST00000629930	KIF21B	O75037	1637 aa		42.08	■■■■■ 4.33
SRP68-213	ENST00000629930	WDR7	Q9Y4E6	1490 aa		42.07	■■■■■ 4.33
SRP68-213	ENST00000629930	MAP3K4	Q9Y6R4	1608 aa		42.05	■■■■■ 4.32
SRP68-213	ENST00000629930	P3H3	Q8IVL6	736 aa		42.01	■■■■■ 4.32
SRP68-213	ENST00000629930	ATP10B	O94823	1461 aa		41.86	■■■■■ 4.29
SRP68-213	ENST00000629930	TEX14	Q8IWB6	1497 aa		41.85	■■■■■ 4.29
SRP68-213	ENST00000629930	RAPGEF6	Q8TEU7	1601 aa		41.84	■■■■■ 4.29
SRP68-213	ENST00000629930	AEBP2	Q6ZN18	517 aa	Predicted RBP	41.82	■■■■■ 4.29
SRP68-213	ENST00000629930	FHOD3	Q2V2M9	1422 aa		41.8	■■■■■ 4.28
SRP68-213	ENST00000629930	CFAP43	Q8NDM7	1665 aa		41.79	■■■■■ 4.28
SRP68-213	ENST00000629930	EFCAB5	A4FU69	1503 aa		41.79	■■■■■ 4.28
SRP68-213	ENST00000629930	COL17A1	Q9UMD9	1497 aa	Predicted RBP	41.78	■■■■■ 4.28
SRP68-213	ENST00000629930	RANGAP1	P46060	587 aa	Predicted RBP	41.76	■■■■■ 4.28
SRP68-213	ENST00000629930	KCNH8	Q96L42	1107 aa		41.75	■■■■■ 4.27
SRP68-213	ENST00000629930	MAGI3	Q5TCQ9	1506 aa		41.74	■■■■■ 4.27
SRP68-213	ENST00000629930	CD109	Q6YHK3	1445 aa		41.73	■■■■■ 4.27
SRP68-213	ENST00000629930	ARID3C	A6NKF2	412 aa		41.73	■■■■■ 4.27
SRP68-213	ENST00000629930	NUP153	P49790	1475 aa	Known RBP	41.72	■■■■■ 4.27
SRP68-213	ENST00000629930	UBTF	P17480	764 aa	Known RBP	41.6	■■■■■ 4.25
SRP68-213	ENST00000629930	ABCA9	Q8IUA7	1624 aa		41.58	■■■■■ 4.25
SRP68-213	ENST00000629930	EHMT2	Q96KQ7	1210 aa		41.54	■■■■■ 4.24
SRP68-213	ENST00000629930	KDM4F	A0A1W2PPD8	638 aa		41.48	■■■■■ 4.23
SRP68-213	ENST00000629930	HNRNPUL2-BSCL2	H3BQZ7	746 aa	Predicted RBP	41.48	■■■■■ 4.23
SRP68-213	ENST00000629930	HNRNPUL2	Q1KMD3	747 aa	Known RBP	41.48	■■■■■ 4.23
SRP68-213	ENST00000629930	ARHGAP35	Q9NRY4	1499 aa		41.47	■■■■■ 4.23
SRP68-213	ENST00000629930	ARAP3	Q8WWN8	1544 aa		41.41	■■■■■ 4.22
SRP68-213	ENST00000629930	FMN1	Q68DA7	1419 aa		41.38	■■■■■ 4.22
SRP68-213	ENST00000629930	PLEKHD1	A6NEE1	506 aa		41.36	■■■■■ 4.21
SRP68-213	ENST00000629930	PHLDB1	Q86UU1	1377 aa		41.36	■■■■■ 4.21
SRP68-213	ENST00000629930	CDK13	Q14004	1512 aa	Known RBP	41.32	■■■■■ 4.2
SRP68-213	ENST00000629930	NEO1	Q92859	1461 aa		41.3	■■■■■ 4.2
SRP68-213	ENST00000629930	HECW1	Q76N89	1606 aa		41.27	■■■■■ 4.2
SRP68-213	ENST00000629930	ADGRL1	O94910	1474 aa		41.27	■■■■■ 4.2
SRP68-213	ENST00000629930	GEMIN5	Q8TEQ6	1508 aa	Known RBP eCLIP	41.23	■■■■■ 4.19
SRP68-213	ENST00000629930	TTC37	Q6PGP7	1564 aa		41.18	■■■■■ 4.18
SRP68-213	ENST00000629930	FRMPD1	Q5SYB0	1578 aa		41.11	■■■■■ 4.17
SRP68-213	ENST00000629930	RAPGEF3	O95398	923 aa		41.09	■■■■■ 4.17
SRP68-213	ENST00000629930	ATP1B4	Q9UN42	357 aa	Predicted RBP	41.09	■■■■■ 4.17
SRP68-213	ENST00000629930	FANCA	O15360	1455 aa		41.08	■■■■■ 4.17
SRP68-213	ENST00000629930	CFAP74	Q9C0B2	1584 aa		41.07	■■■■■ 4.16
SRP68-213	ENST00000629930	LRRIQ1	Q96JM4	1722 aa		41.07	■■■■■ 4.16
SRP68-213	ENST00000629930	AKNA	Q7Z591	1439 aa		41.04	■■■■■ 4.16
SRP68-213	ENST00000629930	CDK11A	Q9UQ88	783 aa	Predicted RBP	41.02	■■■■■ 4.16
SRP68-213	ENST00000629930	CASKIN1	Q8WXD9	1431 aa		41.01	■■■■■ 4.15
SRP68-213	ENST00000629930	PCF11	O94913	1555 aa	Known RBP	40.99	■■■■■ 4.15
SRP68-213	ENST00000629930	PLCH2	O75038	1416 aa		40.98	■■■■■ 4.15
SRP68-213	ENST00000629930	TRO	Q12816	1431 aa	Predicted RBP	40.98	■■■■■ 4.15
SRP68-213	ENST00000629930	RICTOR	Q6R327	1708 aa		40.98	■■■■■ 4.15
SRP68-213	ENST00000629930	DENND4B	O75064	1496 aa	Predicted RBP	40.97	■■■■■ 4.15
SRP68-213	ENST00000629930	CLIP1	P30622	1438 aa		40.95	■■■■■ 4.15
SRP68-213	ENST00000629930	KIF14	Q15058	1648 aa		40.94	■■■■■ 4.14
SRP68-213	ENST00000629930	CCDC18	Q5T9S5	1454 aa		40.9	■■■■■ 4.14
SRP68-213	ENST00000629930	MYO5C	Q9NQX4	1742 aa		40.89	■■■■■ 4.14
SRP68-213	ENST00000629930	FYCO1	Q9BQS8	1478 aa		40.87	■■■■■ 4.13
SRP68-213	ENST00000629930	ZMYM4	Q5VZL5	1548 aa		40.85	■■■■■ 4.13
SRP68-213	ENST00000629930	ARHGEF40	Q8TER5	1519 aa		40.85	■■■■■ 4.13
SRP68-213	ENST00000629930	SCAPER	Q9BY12	1400 aa		40.78	■■■■■ 4.12
SRP68-213	ENST00000629930	POGZ	Q7Z3K3	1410 aa		40.77	■■■■■ 4.12
SRP68-213	ENST00000629930	EFCAB2	Q5VUJ9	269 aa		40.77	■■■■■ 4.12

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 7.6 ms