RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000627604.1

POLR1D-210, Transcript of RNA polymerase I and III subunit D, humanhuman

TSL 4

Gene POLR1D, Length 565 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1D-210ENST00000627604 PRXQ9BXM0 1461 aa37.13■■■■□ 3.54
POLR1D-210ENST00000627604 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa37.08■■■■□ 3.53
POLR1D-210ENST00000627604 CSRNP3Q8WYN3 585 aa36.98■■■■□ 3.51
POLR1D-210ENST00000627604 CYB5RLQ6IPT4 315 aa36.95■■■■□ 3.51
POLR1D-210ENST00000627604 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa36.95■■■■□ 3.51
POLR1D-210ENST00000627604 ARAP1Q96P48 1450 aa36.94■■■■□ 3.5
POLR1D-210ENST00000627604 IQGAP2Q13576 1575 aa36.93■■■■□ 3.5
POLR1D-210ENST00000627604 KIF21BO75037 1637 aa36.88■■■■□ 3.5
POLR1D-210ENST00000627604 ERCC6L2Q5T890 1561 aa36.88■■■■□ 3.49
POLR1D-210ENST00000627604 JPH4Q96JJ6 628 aa36.86■■■■□ 3.49
POLR1D-210ENST00000627604 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP36.82■■■■□ 3.48
POLR1D-210ENST00000627604 UGGT2Q9NYU1 1516 aa36.76■■■■□ 3.48
POLR1D-210ENST00000627604 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP36.68■■■■□ 3.46
POLR1D-210ENST00000627604 DISP1Q96F81 1524 aa36.63■■■■□ 3.45
POLR1D-210ENST00000627604 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa36.61■■■■□ 3.45
POLR1D-210ENST00000627604 KIAA0556O60303 1618 aa36.59■■■■□ 3.45
POLR1D-210ENST00000627604 GOLGA3Q08378 1498 aa36.56■■■■□ 3.44
POLR1D-210ENST00000627604 TNIKQ9UKE5 1360 aa36.48■■■■□ 3.43
POLR1D-210ENST00000627604 SAMD9Q5K651 1589 aa36.46■■■■□ 3.43
POLR1D-210ENST00000627604 TRHP20396 242 aaPredicted RBP36.44■■■■□ 3.42
POLR1D-210ENST00000627604 PTPRGP23470 1445 aa36.39■■■■□ 3.42
POLR1D-210ENST00000627604 ADCY10Q96PN6 1610 aa36.36■■■■□ 3.41
POLR1D-210ENST00000627604 EFCAB5A4FU69 1503 aa36.32■■■■□ 3.4
POLR1D-210ENST00000627604 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa36.28■■■■□ 3.4
POLR1D-210ENST00000627604 ABCC2Q92887 1545 aa36.23■■■■□ 3.39
POLR1D-210ENST00000627604 UBTFP17480 764 aaKnown RBP36.22■■■■□ 3.39
POLR1D-210ENST00000627604 UACAQ9BZF9 1416 aa36.21■■■■□ 3.39
POLR1D-210ENST00000627604 ABCA8O94911 1581 aa36.19■■■■□ 3.38
POLR1D-210ENST00000627604 MAPKBP1O60336 1514 aa36.14■■■■□ 3.38
POLR1D-210ENST00000627604 KDM5BQ9UGL1 1544 aa36.08■■■■□ 3.37
POLR1D-210ENST00000627604 PLB1Q6P1J6 1458 aa36.08■■■■□ 3.37
POLR1D-210ENST00000627604 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa36.07■■■■□ 3.37
POLR1D-210ENST00000627604 EHMT2Q96KQ7 1210 aa36.05■■■■□ 3.36
POLR1D-210ENST00000627604 FHOD3Q2V2M9 1422 aa36.05■■■■□ 3.36
POLR1D-210ENST00000627604 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP36.02■■■■□ 3.36
POLR1D-210ENST00000627604 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa36.01■■■■□ 3.36
POLR1D-210ENST00000627604 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP36.01■■■■□ 3.35
POLR1D-210ENST00000627604 P3H3Q8IVL6 736 aa35.99■■■■□ 3.35
POLR1D-210ENST00000627604 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP35.98■■■■□ 3.35
POLR1D-210ENST00000627604 KIF13AQ9H1H9 1805 aa35.94■■■■□ 3.34
POLR1D-210ENST00000627604 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP35.92■■■■□ 3.34
POLR1D-210ENST00000627604 FMN1Q68DA7 1419 aa35.89■■■■□ 3.34
POLR1D-210ENST00000627604 DIP2BQ9P265 1576 aa35.87■■■■□ 3.33
POLR1D-210ENST00000627604 ABCC10Q5T3U5 1492 aa35.86■■■■□ 3.33
POLR1D-210ENST00000627604 CLIP1P30622 1438 aa35.85■■■■□ 3.33
POLR1D-210ENST00000627604 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP35.84■■■■□ 3.33
POLR1D-210ENST00000627604 ASXL2Q76L83 1435 aa35.83■■■■□ 3.33
POLR1D-210ENST00000627604 ATP10BO94823 1461 aa35.79■■■■□ 3.32
POLR1D-210ENST00000627604 GLI2P10070 1586 aa35.76■■■■□ 3.31
POLR1D-210ENST00000627604 HECW1Q76N89 1606 aa35.75■■■■□ 3.31
POLR1D-210ENST00000627604 CEP162Q5TB80 1403 aa35.75■■■■□ 3.31
POLR1D-210ENST00000627604 WDR7Q9Y4E6 1490 aa35.73■■■■□ 3.31
POLR1D-210ENST00000627604 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa35.68■■■■□ 3.3
POLR1D-210ENST00000627604 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP35.67■■■■□ 3.3
POLR1D-210ENST00000627604 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP35.65■■■■□ 3.3
POLR1D-210ENST00000627604 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa35.64■■■■□ 3.3
POLR1D-210ENST00000627604 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa35.64■■■■□ 3.3
POLR1D-210ENST00000627604 FYCO1Q9BQS8 1478 aa35.6■■■■□ 3.29
POLR1D-210ENST00000627604 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa35.6■■■■□ 3.29
POLR1D-210ENST00000627604 FAM69CQ0P6D2 419 aa35.58■■■■□ 3.29
POLR1D-210ENST00000627604 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP35.55■■■■□ 3.28
POLR1D-210ENST00000627604 CFAP43Q8NDM7 1665 aa35.55■■■■□ 3.28
POLR1D-210ENST00000627604 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP35.52■■■■□ 3.28
POLR1D-210ENST00000627604 CCDC18Q5T9S5 1454 aa35.51■■■■□ 3.28
POLR1D-210ENST00000627604 ABCA9Q8IUA7 1624 aa35.48■■■■□ 3.27
POLR1D-210ENST00000627604 TSPOAP1O95153 1857 aa35.48■■■■□ 3.27
POLR1D-210ENST00000627604 ARID3CA6NKF2 412 aa35.47■■■■□ 3.27
POLR1D-210ENST00000627604 PLEKHD1A6NEE1 506 aa35.38■■■■□ 3.25
POLR1D-210ENST00000627604 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP35.38■■■■□ 3.25
POLR1D-210ENST00000627604 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP35.38■■■■□ 3.25
POLR1D-210ENST00000627604 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa35.37■■■■□ 3.25
POLR1D-210ENST00000627604 VPS8Q8N3P4 1428 aa35.36■■■■□ 3.25
POLR1D-210ENST00000627604 TEX14Q8IWB6 1497 aa35.33■■■■□ 3.25
POLR1D-210ENST00000627604 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP35.32■■■■□ 3.24
POLR1D-210ENST00000627604 KCNH8Q96L42 1107 aa35.31■■■■□ 3.24
POLR1D-210ENST00000627604 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP35.31■■■■□ 3.24
POLR1D-210ENST00000627604 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP35.31■■■■□ 3.24
POLR1D-210ENST00000627604 CD109Q6YHK3 1445 aa35.31■■■■□ 3.24
POLR1D-210ENST00000627604 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP35.29■■■■□ 3.24
POLR1D-210ENST00000627604 KIF14Q15058 1648 aa35.27■■■■□ 3.24
POLR1D-210ENST00000627604 TTC37Q6PGP7 1564 aa35.25■■■■□ 3.23
POLR1D-210ENST00000627604 KDM6BO15054 1643 aa35.18■■■■□ 3.22
POLR1D-210ENST00000627604 MYO5CQ9NQX4 1742 aa35.17■■■■□ 3.22
POLR1D-210ENST00000627604 MAP3K1Q13233 1512 aa35.16■■■■□ 3.22
POLR1D-210ENST00000627604 ARAP3Q8WWN8 1544 aa35.16■■■■□ 3.22
POLR1D-210ENST00000627604 TIAM1Q13009 1591 aa35.15■■■■□ 3.22
POLR1D-210ENST00000627604 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP35.14■■■■□ 3.22
POLR1D-210ENST00000627604 CFAP74Q9C0B2 1584 aa35.13■■■■□ 3.21
POLR1D-210ENST00000627604 NEO1Q92859 1461 aa35.12■■■■□ 3.21
POLR1D-210ENST00000627604 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa35.11■■■■□ 3.21
POLR1D-210ENST00000627604 PHLDB1Q86UU1 1377 aa35.11■■■■□ 3.21
POLR1D-210ENST00000627604 PLCH2O75038 1416 aa35.06■■■■□ 3.2
POLR1D-210ENST00000627604 PREX2Q70Z35 1606 aa35.04■■■■□ 3.2
POLR1D-210ENST00000627604 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa35.03■■■■□ 3.2
POLR1D-210ENST00000627604 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa35.02■■■■□ 3.2
POLR1D-210ENST00000627604 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP35.02■■■■□ 3.2
POLR1D-210ENST00000627604 MTUS2Q5JR59 1369 aa35.01■■■■□ 3.2
POLR1D-210ENST00000627604 FANCAO15360 1455 aa34.99■■■■□ 3.19
POLR1D-210ENST00000627604 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP34.96■■■■□ 3.19
POLR1D-210ENST00000627604 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa34.95■■■■□ 3.19
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 12.7 ms