RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000622018.4

HPCAL1-208, Transcript of hippocalcin like 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene HPCAL1, Length 1,535 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPCAL1-208ENST00000622018 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP26.8■■□□□ 1.88
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HPCAL1-208ENST00000622018 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa26.74■■□□□ 1.87
HPCAL1-208ENST00000622018 CEP162Q5TB80 1403 aa26.72■■□□□ 1.87
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HPCAL1-208ENST00000622018 OSCARQ8IYS5 282 aa26.66■■□□□ 1.86
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HPCAL1-208ENST00000622018 FMN1Q68DA7 1419 aa26.29■■□□□ 1.8
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HPCAL1-208ENST00000622018 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa26.12■■□□□ 1.77
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HPCAL1-208ENST00000622018 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa26.11■■□□□ 1.77
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HPCAL1-208ENST00000622018 APLP2Q06481 763 aa26.09■■□□□ 1.77
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HPCAL1-208ENST00000622018 ARID3CA6NKF2 412 aa26.08■■□□□ 1.77
HPCAL1-208ENST00000622018 HECW1Q76N89 1606 aa26.08■■□□□ 1.76
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HPCAL1-208ENST00000622018 ABCC2Q92887 1545 aa26■■□□□ 1.75
HPCAL1-208ENST00000622018 CYB5RLQ6IPT4 315 aa26■■□□□ 1.75
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HPCAL1-208ENST00000622018 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP25.99■■□□□ 1.75
HPCAL1-208ENST00000622018 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa25.98■■□□□ 1.75
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HPCAL1-208ENST00000622018 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP25.98■■□□□ 1.75
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HPCAL1-208ENST00000622018 MTUS2Q5JR59 1369 aa25.84■■□□□ 1.73
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HPCAL1-208ENST00000622018 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP25.83■■□□□ 1.72
HPCAL1-208ENST00000622018 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP25.82■■□□□ 1.72
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HPCAL1-208ENST00000622018 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa25.77■■□□□ 1.72
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HPCAL1-208ENST00000622018 WDR7Q9Y4E6 1490 aa25.66■■□□□ 1.7
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HPCAL1-208ENST00000622018 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP25.39■■□□□ 1.66
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HPCAL1-208ENST00000622018 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP25.38■■□□□ 1.65
HPCAL1-208ENST00000622018 MYO5CQ9NQX4 1742 aa25.38■■□□□ 1.65
HPCAL1-208ENST00000622018 PLCH2O75038 1416 aa25.37■■□□□ 1.65
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HPCAL1-208ENST00000622018 ARHGAP5Q13017 1502 aa25.36■■□□□ 1.65
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