RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000620944.4

NME4-211, Transcript of NME/NM23 nucleoside diphosphate kinase 4, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene NME4, Length 1,193 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME4-211ENST00000620944 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa37.11■■■■□ 3.53
NME4-211ENST00000620944 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP37.09■■■■□ 3.53
NME4-211ENST00000620944 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa37.08■■■■□ 3.53
NME4-211ENST00000620944 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa37■■■■□ 3.51
NME4-211ENST00000620944 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa36.82■■■■□ 3.49
NME4-211ENST00000620944 IQGAP2Q13576 1575 aa36.72■■■■□ 3.47
NME4-211ENST00000620944 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa36.69■■■■□ 3.46
NME4-211ENST00000620944 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP36.64■■■■□ 3.46
NME4-211ENST00000620944 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP36.62■■■■□ 3.45
NME4-211ENST00000620944 PTPRGP23470 1445 aa36.6■■■■□ 3.45
NME4-211ENST00000620944 TNIKQ9UKE5 1360 aa36.57■■■■□ 3.45
NME4-211ENST00000620944 PRXQ9BXM0 1461 aa36.54■■■■□ 3.44
NME4-211ENST00000620944 ADCY10Q96PN6 1610 aa36.5■■■■□ 3.43
NME4-211ENST00000620944 UGGT2Q9NYU1 1516 aa36.48■■■■□ 3.43
NME4-211ENST00000620944 CSRNP3Q8WYN3 585 aa36.47■■■■□ 3.43
NME4-211ENST00000620944 DISP1Q96F81 1524 aa36.47■■■■□ 3.43
NME4-211ENST00000620944 EEA1Q15075 1411 aa36.42■■■■□ 3.42
NME4-211ENST00000620944 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa36.39■■■■□ 3.42
NME4-211ENST00000620944 MAPKBP1O60336 1514 aa36.38■■■■□ 3.41
NME4-211ENST00000620944 KIAA0556O60303 1618 aa36.35■■■■□ 3.41
NME4-211ENST00000620944 GOLGA3Q08378 1498 aa36.32■■■■□ 3.41
NME4-211ENST00000620944 FAM69CQ0P6D2 419 aa36.32■■■■□ 3.4
NME4-211ENST00000620944 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP36.32■■■■□ 3.4
NME4-211ENST00000620944 UACAQ9BZF9 1416 aa36.32■■■■□ 3.4
NME4-211ENST00000620944 ABCC10Q5T3U5 1492 aa36.3■■■■□ 3.4
NME4-211ENST00000620944 ABCC2Q92887 1545 aa36.29■■■■□ 3.4
NME4-211ENST00000620944 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa36.26■■■■□ 3.4
NME4-211ENST00000620944 CHIC1Q5VXU3 224 aa36.25■■■■□ 3.39
NME4-211ENST00000620944 KIF13AQ9H1H9 1805 aa36.22■■■■□ 3.39
NME4-211ENST00000620944 DIP2BQ9P265 1576 aa36.19■■■■□ 3.38
NME4-211ENST00000620944 ASXL2Q76L83 1435 aa36.13■■■■□ 3.37
NME4-211ENST00000620944 PLB1Q6P1J6 1458 aa36.11■■■■□ 3.37
NME4-211ENST00000620944 KDM5BQ9UGL1 1544 aa36.08■■■■□ 3.37
NME4-211ENST00000620944 P3H3Q8IVL6 736 aa36.07■■■■□ 3.36
NME4-211ENST00000620944 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP36.02■■■■□ 3.36
NME4-211ENST00000620944 KIF21BO75037 1637 aa36■■■■□ 3.35
NME4-211ENST00000620944 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP36■■■■□ 3.35
NME4-211ENST00000620944 ABCA8O94911 1581 aa35.97■■■■□ 3.35
NME4-211ENST00000620944 EHMT2Q96KQ7 1210 aa35.93■■■■□ 3.34
NME4-211ENST00000620944 SAMD9Q5K651 1589 aa35.93■■■■□ 3.34
NME4-211ENST00000620944 GLI2P10070 1586 aa35.89■■■■□ 3.34
NME4-211ENST00000620944 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP35.88■■■■□ 3.33
NME4-211ENST00000620944 UBTFP17480 764 aaKnown RBP35.88■■■■□ 3.33
NME4-211ENST00000620944 WDR7Q9Y4E6 1490 aa35.87■■■■□ 3.33
NME4-211ENST00000620944 TSPOAP1O95153 1857 aa35.86■■■■□ 3.33
NME4-211ENST00000620944 ARID3CA6NKF2 412 aa35.82■■■■□ 3.32
NME4-211ENST00000620944 FHOD3Q2V2M9 1422 aa35.8■■■■□ 3.32
NME4-211ENST00000620944 KDM6BO15054 1643 aa35.78■■■■□ 3.32
NME4-211ENST00000620944 KCNH8Q96L42 1107 aa35.77■■■■□ 3.32
NME4-211ENST00000620944 EFCAB5A4FU69 1503 aa35.75■■■■□ 3.31
NME4-211ENST00000620944 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa35.72■■■■□ 3.31
NME4-211ENST00000620944 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP35.7■■■■□ 3.31
NME4-211ENST00000620944 ATP10BO94823 1461 aa35.7■■■■□ 3.31
NME4-211ENST00000620944 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP35.7■■■■□ 3.31
NME4-211ENST00000620944 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa35.69■■■■□ 3.3
NME4-211ENST00000620944 TEX14Q8IWB6 1497 aa35.69■■■■□ 3.3
NME4-211ENST00000620944 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP35.65■■■■□ 3.3
NME4-211ENST00000620944 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP35.62■■■■□ 3.29
NME4-211ENST00000620944 CD109Q6YHK3 1445 aa35.61■■■■□ 3.29
NME4-211ENST00000620944 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP35.6■■■■□ 3.29
NME4-211ENST00000620944 CFAP43Q8NDM7 1665 aa35.54■■■■□ 3.28
NME4-211ENST00000620944 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa35.51■■■■□ 3.27
NME4-211ENST00000620944 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa35.48■■■■□ 3.27
NME4-211ENST00000620944 FMN1Q68DA7 1419 aa35.48■■■■□ 3.27
NME4-211ENST00000620944 PLEKHD1A6NEE1 506 aa35.46■■■■□ 3.27
NME4-211ENST00000620944 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP35.45■■■■□ 3.27
NME4-211ENST00000620944 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP35.43■■■■□ 3.26
NME4-211ENST00000620944 ABCA9Q8IUA7 1624 aa35.38■■■■□ 3.25
NME4-211ENST00000620944 HECW1Q76N89 1606 aa35.32■■■■□ 3.25
NME4-211ENST00000620944 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP35.32■■■■□ 3.24
NME4-211ENST00000620944 PHLDB1Q86UU1 1377 aa35.25■■■■□ 3.23
NME4-211ENST00000620944 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP35.25■■■■□ 3.23
NME4-211ENST00000620944 ARAP3Q8WWN8 1544 aa35.21■■■■□ 3.23
NME4-211ENST00000620944 CLIP1P30622 1438 aa35.2■■■■□ 3.23
NME4-211ENST00000620944 NEO1Q92859 1461 aa35.2■■■■□ 3.23
NME4-211ENST00000620944 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa35.16■■■■□ 3.22
NME4-211ENST00000620944 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP35.16■■■■□ 3.221e-6■■■□□ 18.6
NME4-211ENST00000620944 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa35.11■■■■□ 3.21
NME4-211ENST00000620944 TTC37Q6PGP7 1564 aa35.09■■■■□ 3.21
NME4-211ENST00000620944 RAPGEF3O95398 923 aa35.08■■■■□ 3.21
NME4-211ENST00000620944 FANCAO15360 1455 aa35.08■■■■□ 3.21
NME4-211ENST00000620944 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP35.08■■■■□ 3.21
NME4-211ENST00000620944 ADGRL1O94910 1474 aa35.05■■■■□ 3.2
NME4-211ENST00000620944 CCDC18Q5T9S5 1454 aa35.04■■■■□ 3.2
NME4-211ENST00000620944 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP35.04■■■■□ 3.2
NME4-211ENST00000620944 CFAP74Q9C0B2 1584 aa35.04■■■■□ 3.2
NME4-211ENST00000620944 AKNAQ7Z591 1439 aa35.03■■■■□ 3.2
NME4-211ENST00000620944 FYCO1Q9BQS8 1478 aa35.01■■■■□ 3.19
NME4-211ENST00000620944 KIF14Q15058 1648 aa34.99■■■■□ 3.19
NME4-211ENST00000620944 PLCH2O75038 1416 aa34.98■■■■□ 3.19
NME4-211ENST00000620944 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP34.97■■■■□ 3.19
NME4-211ENST00000620944 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa34.94■■■■□ 3.18
NME4-211ENST00000620944 CEP162Q5TB80 1403 aa34.91■■■■□ 3.18
NME4-211ENST00000620944 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa34.91■■■■□ 3.18
NME4-211ENST00000620944 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa34.9■■■■□ 3.18
NME4-211ENST00000620944 MYO5CQ9NQX4 1742 aa34.86■■■■□ 3.17
NME4-211ENST00000620944 SCAPERQ9BY12 1400 aa34.84■■■■□ 3.17
NME4-211ENST00000620944 ARHGAP5Q13017 1502 aa34.83■■■■□ 3.17
NME4-211ENST00000620944 RICTORQ6R327 1708 aa34.8■■■■□ 3.16
NME4-211ENST00000620944 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP34.8■■■■□ 3.16
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 13.4 ms