RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000619989.1

CCL3L3-203, Transcript of C-C motif chemokine ligand 3 like 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCL3L3, Length 784 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL3L3-203ENST00000619989 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa22.9■■□□□ 1.26
CCL3L3-203ENST00000619989 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa22.9■■□□□ 1.26
CCL3L3-203ENST00000619989 NUP160Q12769 1436 aa22.9■■□□□ 1.26
CCL3L3-203ENST00000619989 CEP170Q5SW79 1584 aa22.89■■□□□ 1.26
CCL3L3-203ENST00000619989 CUL7Q14999 1698 aa22.89■■□□□ 1.25
CCL3L3-203ENST00000619989 CYB5RLQ6IPT4 315 aa22.82■■□□□ 1.24
CCL3L3-203ENST00000619989 JPH4Q96JJ6 628 aa22.77■■□□□ 1.24
CCL3L3-203ENST00000619989 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP22.76■■□□□ 1.23
CCL3L3-203ENST00000619989 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa22.76■■□□□ 1.23
CCL3L3-203ENST00000619989 CSRNP3Q8WYN3 585 aa22.74■■□□□ 1.23
CCL3L3-203ENST00000619989 ARAP1Q96P48 1450 aa22.73■■□□□ 1.23
CCL3L3-203ENST00000619989 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa22.72■■□□□ 1.23
CCL3L3-203ENST00000619989 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP22.69■■□□□ 1.22
CCL3L3-203ENST00000619989 SHROOM2Q13796 1616 aa22.68■■□□□ 1.22
CCL3L3-203ENST00000619989 ERCC6L2Q5T890 1561 aa22.68■■□□□ 1.22
CCL3L3-203ENST00000619989 EEA1Q15075 1411 aa22.68■■□□□ 1.22
CCL3L3-203ENST00000619989 PRXQ9BXM0 1461 aa22.66■■□□□ 1.22
CCL3L3-203ENST00000619989 PIAS4Q8N2W9 510 aaPredicted RBP22.64■■□□□ 1.21
CCL3L3-203ENST00000619989 IQGAP2Q13576 1575 aa22.57■■□□□ 1.2
CCL3L3-203ENST00000619989 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP22.53■■□□□ 1.2
CCL3L3-203ENST00000619989 EHMT2Q96KQ7 1210 aa22.52■■□□□ 1.2
CCL3L3-203ENST00000619989 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa22.5■■□□□ 1.19
CCL3L3-203ENST00000619989 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa22.47■■□□□ 1.19
CCL3L3-203ENST00000619989 UGGT2Q9NYU1 1516 aa22.44■■□□□ 1.18
CCL3L3-203ENST00000619989 PTPRGP23470 1445 aa22.43■■□□□ 1.18
CCL3L3-203ENST00000619989 TNIKQ9UKE5 1360 aa22.43■■□□□ 1.18
CCL3L3-203ENST00000619989 DISP1Q96F81 1524 aa22.42■■□□□ 1.18
CCL3L3-203ENST00000619989 KIF21BO75037 1637 aa22.41■■□□□ 1.18
CCL3L3-203ENST00000619989 UBTFP17480 764 aaKnown RBP22.4■■□□□ 1.18
CCL3L3-203ENST00000619989 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP22.4■■□□□ 1.18
CCL3L3-203ENST00000619989 TRHP20396 242 aaPredicted RBP22.37■■□□□ 1.17
CCL3L3-203ENST00000619989 MSH5O43196 834 aa22.36■■□□□ 1.17
CCL3L3-203ENST00000619989 P3H3Q8IVL6 736 aa22.36■■□□□ 1.17
CCL3L3-203ENST00000619989 GOLGA3Q08378 1498 aa22.35■■□□□ 1.17
CCL3L3-203ENST00000619989 KIAA0556O60303 1618 aa22.35■■□□□ 1.17
CCL3L3-203ENST00000619989 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP22.34■■□□□ 1.17
CCL3L3-203ENST00000619989 ADCY10Q96PN6 1610 aa22.28■■□□□ 1.16
CCL3L3-203ENST00000619989 UACAQ9BZF9 1416 aa22.25■■□□□ 1.15
CCL3L3-203ENST00000619989 SAMD9Q5K651 1589 aa22.19■■□□□ 1.14
CCL3L3-203ENST00000619989 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa22.18■■□□□ 1.14
CCL3L3-203ENST00000619989 PLB1Q6P1J6 1458 aa22.18■■□□□ 1.14
CCL3L3-203ENST00000619989 ABCC2Q92887 1545 aa22.17■■□□□ 1.14
CCL3L3-203ENST00000619989 FHOD3Q2V2M9 1422 aa22.15■■□□□ 1.14
CCL3L3-203ENST00000619989 ABCA8O94911 1581 aa22.11■■□□□ 1.13
CCL3L3-203ENST00000619989 EFCAB5A4FU69 1503 aa22.11■■□□□ 1.13
CCL3L3-203ENST00000619989 MAPKBP1O60336 1514 aa22.11■■□□□ 1.13
CCL3L3-203ENST00000619989 ARID3CA6NKF2 412 aa22.1■■□□□ 1.13
CCL3L3-203ENST00000619989 FAM69CQ0P6D2 419 aa22.09■■□□□ 1.13
CCL3L3-203ENST00000619989 KDM5BQ9UGL1 1544 aa22.08■■□□□ 1.13
CCL3L3-203ENST00000619989 ASXL2Q76L83 1435 aa22.06■■□□□ 1.12
CCL3L3-203ENST00000619989 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa22.05■■□□□ 1.12
CCL3L3-203ENST00000619989 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa22.05■■□□□ 1.12
CCL3L3-203ENST00000619989 ABCC10Q5T3U5 1492 aa22.04■■□□□ 1.12
CCL3L3-203ENST00000619989 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP22.04■■□□□ 1.12
CCL3L3-203ENST00000619989 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP22.01■■□□□ 1.11
CCL3L3-203ENST00000619989 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP22.01■■□□□ 1.11
CCL3L3-203ENST00000619989 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa22.01■■□□□ 1.11
CCL3L3-203ENST00000619989 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP21.99■■□□□ 1.11
CCL3L3-203ENST00000619989 KIF13AQ9H1H9 1805 aa21.99■■□□□ 1.11
CCL3L3-203ENST00000619989 ATP10BO94823 1461 aa21.98■■□□□ 1.11
CCL3L3-203ENST00000619989 DIP2BQ9P265 1576 aa21.97■■□□□ 1.11
CCL3L3-203ENST00000619989 KCNH8Q96L42 1107 aa21.97■■□□□ 1.11
CCL3L3-203ENST00000619989 CLIP1P30622 1438 aa21.96■■□□□ 1.11
CCL3L3-203ENST00000619989 FMN1Q68DA7 1419 aa21.96■■□□□ 1.11
CCL3L3-203ENST00000619989 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP21.94■■□□□ 1.1
CCL3L3-203ENST00000619989 WDR7Q9Y4E6 1490 aa21.92■■□□□ 1.1
CCL3L3-203ENST00000619989 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP21.9■■□□□ 1.1
CCL3L3-203ENST00000619989 PLEKHD1A6NEE1 506 aa21.86■■□□□ 1.09
CCL3L3-203ENST00000619989 CEP162Q5TB80 1403 aa21.86■■□□□ 1.09
CCL3L3-203ENST00000619989 GLI2P10070 1586 aa21.86■■□□□ 1.09
CCL3L3-203ENST00000619989 TSPOAP1O95153 1857 aa21.85■■□□□ 1.09
CCL3L3-203ENST00000619989 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP21.81■■□□□ 1.08
CCL3L3-203ENST00000619989 HECW1Q76N89 1606 aa21.81■■□□□ 1.08
CCL3L3-203ENST00000619989 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa21.78■■□□□ 1.08
CCL3L3-203ENST00000619989 CD109Q6YHK3 1445 aa21.77■■□□□ 1.08
CCL3L3-203ENST00000619989 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP21.76■■□□□ 1.07
CCL3L3-203ENST00000619989 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa21.76■■□□□ 1.07
CCL3L3-203ENST00000619989 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP21.75■■□□□ 1.07
CCL3L3-203ENST00000619989 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP21.71■■□□□ 1.07
CCL3L3-203ENST00000619989 FYCO1Q9BQS8 1478 aa21.71■■□□□ 1.07
CCL3L3-203ENST00000619989 CFAP43Q8NDM7 1665 aa21.7■■□□□ 1.06
CCL3L3-203ENST00000619989 TEX14Q8IWB6 1497 aa21.69■■□□□ 1.06
CCL3L3-203ENST00000619989 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa21.69■■□□□ 1.06
CCL3L3-203ENST00000619989 CCDC18Q5T9S5 1454 aa21.67■■□□□ 1.06
CCL3L3-203ENST00000619989 ABCA9Q8IUA7 1624 aa21.66■■□□□ 1.06
CCL3L3-203ENST00000619989 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa21.66■■□□□ 1.06
CCL3L3-203ENST00000619989 KDM6BO15054 1643 aa21.65■■□□□ 1.06
CCL3L3-203ENST00000619989 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP21.63■■□□□ 1.05
CCL3L3-203ENST00000619989 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP21.61■■□□□ 1.05
CCL3L3-203ENST00000619989 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP21.58■■□□□ 1.05
CCL3L3-203ENST00000619989 VPS8Q8N3P4 1428 aa21.58■■□□□ 1.05
CCL3L3-203ENST00000619989 TTC37Q6PGP7 1564 aa21.57■■□□□ 1.04
CCL3L3-203ENST00000619989 KIF14Q15058 1648 aa21.55■■□□□ 1.04
CCL3L3-203ENST00000619989 MTUS2Q5JR59 1369 aa21.53■■□□□ 1.04
CCL3L3-203ENST00000619989 PHLDB1Q86UU1 1377 aa21.51■■□□□ 1.03
CCL3L3-203ENST00000619989 PLCH2O75038 1416 aa21.51■■□□□ 1.03
CCL3L3-203ENST00000619989 NEO1Q92859 1461 aa21.51■■□□□ 1.03
CCL3L3-203ENST00000619989 FANCAO15360 1455 aa21.5■■□□□ 1.03
CCL3L3-203ENST00000619989 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa21.49■■□□□ 1.03
CCL3L3-203ENST00000619989 RAPGEF3O95398 923 aa21.48■■□□□ 1.03
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