RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000619976.1

SYNRG-227, Transcript of synergin gamma, humanhuman

TSL 2

Gene SYNRG, Length 1,375 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNRG-227ENST00000619976 JPH4Q96JJ6 628 aa47.57■■■■■ 5.21
SYNRG-227ENST00000619976 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP47.52■■■■■ 5.2
SYNRG-227ENST00000619976 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa47.46■■■■■ 5.19
SYNRG-227ENST00000619976 TRHP20396 242 aaPredicted RBP47.41■■■■■ 5.18
SYNRG-227ENST00000619976 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa47.23■■■■■ 5.15
SYNRG-227ENST00000619976 IQGAP2Q13576 1575 aa47.12■■■■■ 5.13
SYNRG-227ENST00000619976 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa46.98■■■■■ 5.11
SYNRG-227ENST00000619976 PRXQ9BXM0 1461 aa46.91■■■■■ 5.1
SYNRG-227ENST00000619976 PTPRGP23470 1445 aa46.88■■■■■ 5.1
SYNRG-227ENST00000619976 ADCY10Q96PN6 1610 aa46.88■■■■■ 5.1
SYNRG-227ENST00000619976 TNIKQ9UKE5 1360 aa46.86■■■■■ 5.09
SYNRG-227ENST00000619976 UGGT2Q9NYU1 1516 aa46.84■■■■■ 5.09
SYNRG-227ENST00000619976 DISP1Q96F81 1524 aa46.83■■■■■ 5.09
SYNRG-227ENST00000619976 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP46.82■■■■■ 5.09
SYNRG-227ENST00000619976 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa46.82■■■■■ 5.09
SYNRG-227ENST00000619976 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP46.8■■■■■ 5.08
SYNRG-227ENST00000619976 CSRNP3Q8WYN3 585 aa46.75■■■■■ 5.07
SYNRG-227ENST00000619976 EEA1Q15075 1411 aa46.69■■■■■ 5.06
SYNRG-227ENST00000619976 MAPKBP1O60336 1514 aa46.68■■■■■ 5.06
SYNRG-227ENST00000619976 KIAA0556O60303 1618 aa46.67■■■■■ 5.06
SYNRG-227ENST00000619976 KIF13AQ9H1H9 1805 aa46.65■■■■■ 5.06
SYNRG-227ENST00000619976 ABCC10Q5T3U5 1492 aa46.55■■■■■ 5.04
SYNRG-227ENST00000619976 UACAQ9BZF9 1416 aa46.54■■■■■ 5.04
SYNRG-227ENST00000619976 CHIC1Q5VXU3 224 aa46.54■■■■■ 5.04
SYNRG-227ENST00000619976 ABCC2Q92887 1545 aa46.54■■■■■ 5.04
SYNRG-227ENST00000619976 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa46.54■■■■■ 5.04
SYNRG-227ENST00000619976 GOLGA3Q08378 1498 aa46.53■■■■■ 5.04
SYNRG-227ENST00000619976 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP46.49■■■■■ 5.03
SYNRG-227ENST00000619976 FAM69CQ0P6D2 419 aa46.48■■■■■ 5.03
SYNRG-227ENST00000619976 DIP2BQ9P265 1576 aa46.46■■■■■ 5.03
SYNRG-227ENST00000619976 KDM5BQ9UGL1 1544 aa46.31■■■■■ 5
SYNRG-227ENST00000619976 ASXL2Q76L83 1435 aa46.3■■■■■ 5
SYNRG-227ENST00000619976 PLB1Q6P1J6 1458 aa46.28■■■■■ 5
SYNRG-227ENST00000619976 KIF21BO75037 1637 aa46.26■■■■■ 5
SYNRG-227ENST00000619976 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP46.24■■■■■ 4.99
SYNRG-227ENST00000619976 ABCA8O94911 1581 aa46.2■■■■■ 4.99
SYNRG-227ENST00000619976 P3H3Q8IVL6 736 aa46.2■■■■■ 4.99
SYNRG-227ENST00000619976 SAMD9Q5K651 1589 aa46.17■■■■■ 4.98
SYNRG-227ENST00000619976 TSPOAP1O95153 1857 aa46.13■■■■■ 4.98
SYNRG-227ENST00000619976 GLI2P10070 1586 aa46.09■■■■■ 4.97
SYNRG-227ENST00000619976 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP46.05■■■■■ 4.96
SYNRG-227ENST00000619976 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP46.03■■■■■ 4.96
SYNRG-227ENST00000619976 WDR7Q9Y4E6 1490 aa45.97■■■■■ 4.95
SYNRG-227ENST00000619976 EHMT2Q96KQ7 1210 aa45.95■■■■■ 4.95
SYNRG-227ENST00000619976 UBTFP17480 764 aaKnown RBP45.9■■■■■ 4.94
SYNRG-227ENST00000619976 FHOD3Q2V2M9 1422 aa45.89■■■■■ 4.94
SYNRG-227ENST00000619976 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP45.89■■■■■ 4.94
SYNRG-227ENST00000619976 KDM6BO15054 1643 aa45.87■■■■■ 4.93
SYNRG-227ENST00000619976 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa45.86■■■■■ 4.93
SYNRG-227ENST00000619976 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa45.86■■■■■ 4.93
SYNRG-227ENST00000619976 EFCAB5A4FU69 1503 aa45.86■■■■■ 4.93
SYNRG-227ENST00000619976 ARID3CA6NKF2 412 aa45.84■■■■■ 4.93
SYNRG-227ENST00000619976 ATP10BO94823 1461 aa45.83■■■■■ 4.93
SYNRG-227ENST00000619976 KCNH8Q96L42 1107 aa45.76■■■■■ 4.92
SYNRG-227ENST00000619976 TEX14Q8IWB6 1497 aa45.69■■■■■ 4.9
SYNRG-227ENST00000619976 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP45.68■■■■■ 4.9
SYNRG-227ENST00000619976 CFAP43Q8NDM7 1665 aa45.65■■■■■ 4.9
SYNRG-227ENST00000619976 CD109Q6YHK3 1445 aa45.62■■■■■ 4.89
SYNRG-227ENST00000619976 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP45.6■■■■■ 4.89
SYNRG-227ENST00000619976 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP45.6■■■■■ 4.89
SYNRG-227ENST00000619976 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa45.56■■■■■ 4.88
SYNRG-227ENST00000619976 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa45.55■■■■■ 4.88
SYNRG-227ENST00000619976 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP45.5■■■■■ 4.87
SYNRG-227ENST00000619976 FMN1Q68DA7 1419 aa45.45■■■■■ 4.87
SYNRG-227ENST00000619976 ABCA9Q8IUA7 1624 aa45.44■■■■■ 4.87
SYNRG-227ENST00000619976 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP45.44■■■■■ 4.86
SYNRG-227ENST00000619976 PLEKHD1A6NEE1 506 aa45.38■■■■■ 4.86
SYNRG-227ENST00000619976 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP45.31■■■■■ 4.84
SYNRG-227ENST00000619976 HECW1Q76N89 1606 aa45.3■■■■■ 4.84
SYNRG-227ENST00000619976 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP45.29■■■■■ 4.84
SYNRG-227ENST00000619976 ARAP3Q8WWN8 1544 aa45.17■■■■■ 4.82
SYNRG-227ENST00000619976 PHLDB1Q86UU1 1377 aa45.16■■■■■ 4.82
SYNRG-227ENST00000619976 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP45.14■■■■■ 4.82
SYNRG-227ENST00000619976 NEO1Q92859 1461 aa45.12■■■■■ 4.81
SYNRG-227ENST00000619976 CLIP1P30622 1438 aa45.11■■■■■ 4.81
SYNRG-227ENST00000619976 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa45.08■■■■■ 4.81
SYNRG-227ENST00000619976 TTC37Q6PGP7 1564 aa45.07■■■■■ 4.81
SYNRG-227ENST00000619976 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP45.07■■■■■ 4.8
SYNRG-227ENST00000619976 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa45.06■■■■■ 4.8
SYNRG-227ENST00000619976 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP45.04■■■■■ 4.8
SYNRG-227ENST00000619976 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa45.03■■■■■ 4.8
SYNRG-227ENST00000619976 FANCAO15360 1455 aa44.94■■■■■ 4.79
SYNRG-227ENST00000619976 RAPGEF3O95398 923 aa44.94■■■■■ 4.78
SYNRG-227ENST00000619976 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP44.93■■■■■ 4.78
SYNRG-227ENST00000619976 CFAP74Q9C0B2 1584 aa44.93■■■■■ 4.78
SYNRG-227ENST00000619976 CCDC18Q5T9S5 1454 aa44.91■■■■■ 4.78
SYNRG-227ENST00000619976 ADGRL1O94910 1474 aa44.9■■■■■ 4.78
SYNRG-227ENST00000619976 AKNAQ7Z591 1439 aa44.9■■■■■ 4.78
SYNRG-227ENST00000619976 FYCO1Q9BQS8 1478 aa44.89■■■■■ 4.78
SYNRG-227ENST00000619976 KIF14Q15058 1648 aa44.88■■■■■ 4.77
SYNRG-227ENST00000619976 PLCH2O75038 1416 aa44.86■■■■■ 4.77
SYNRG-227ENST00000619976 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa44.84■■■■■ 4.77
SYNRG-227ENST00000619976 MYO5CQ9NQX4 1742 aa44.81■■■■■ 4.76
SYNRG-227ENST00000619976 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP44.81■■■■■ 4.76
SYNRG-227ENST00000619976 CEP162Q5TB80 1403 aa44.77■■■■■ 4.76
SYNRG-227ENST00000619976 RICTORQ6R327 1708 aa44.76■■■■■ 4.76
SYNRG-227ENST00000619976 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa44.69■■■■■ 4.75
SYNRG-227ENST00000619976 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa44.66■■■■■ 4.74
SYNRG-227ENST00000619976 SCAPERQ9BY12 1400 aa44.64■■■■■ 4.74
SYNRG-227ENST00000619976 ARHGAP5Q13017 1502 aa44.62■■■■■ 4.73
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 10.9 ms