RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000619939.4

LHX1-204, Transcript of LIM homeobox 1, humanhuman

TSL 2

Gene LHX1, Length 1,840 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX1-204ENST00000619939 EHMT2Q96KQ7 1210 aa24.63■■□□□ 1.53
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LHX1-204ENST00000619939 SHROOM2Q13796 1616 aa24.51■■□□□ 1.51
LHX1-204ENST00000619939 IGF1RP08069 1367 aa24.5■■□□□ 1.51
LHX1-204ENST00000619939 KIF21BO75037 1637 aa24.5■■□□□ 1.51
LHX1-204ENST00000619939 GOLGA3Q08378 1498 aa24.47■■□□□ 1.51
LHX1-204ENST00000619939 PRXQ9BXM0 1461 aa24.45■■□□□ 1.5
LHX1-204ENST00000619939 JPH4Q96JJ6 628 aa24.45■■□□□ 1.5
LHX1-204ENST00000619939 ERCC6L2Q5T890 1561 aa24.44■■□□□ 1.5
LHX1-204ENST00000619939 UBTFP17480 764 aaKnown RBP24.42■■□□□ 1.5
LHX1-204ENST00000619939 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa24.41■■□□□ 1.5
LHX1-204ENST00000619939 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP24.4■■□□□ 1.5
LHX1-204ENST00000619939 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa24.4■■□□□ 1.5
LHX1-204ENST00000619939 CUL7Q14999 1698 aa24.37■■□□□ 1.49
LHX1-204ENST00000619939 TNIKQ9UKE5 1360 aa24.33■■□□□ 1.48
LHX1-204ENST00000619939 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa24.29■■□□□ 1.48
LHX1-204ENST00000619939 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP24.27■■□□□ 1.48
LHX1-204ENST00000619939 CEP162Q5TB80 1403 aa24.17■■□□□ 1.46
LHX1-204ENST00000619939 MAPKBP1O60336 1514 aa24.12■■□□□ 1.45
LHX1-204ENST00000619939 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP24.12■■□□□ 1.45
LHX1-204ENST00000619939 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP24.11■■□□□ 1.45
LHX1-204ENST00000619939 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa24.1■■□□□ 1.45
LHX1-204ENST00000619939 KIF13AQ9H1H9 1805 aa24.1■■□□□ 1.45
LHX1-204ENST00000619939 ABCC10Q5T3U5 1492 aa24.1■■□□□ 1.45
LHX1-204ENST00000619939 FAM69CQ0P6D2 419 aa24.07■■□□□ 1.44
LHX1-204ENST00000619939 PTPRGP23470 1445 aa24.07■■□□□ 1.44
LHX1-204ENST00000619939 CLIP1P30622 1438 aa24.07■■□□□ 1.44
LHX1-204ENST00000619939 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa24.06■■□□□ 1.44
LHX1-204ENST00000619939 ADCY10Q96PN6 1610 aa24.06■■□□□ 1.44
LHX1-204ENST00000619939 IQGAP2Q13576 1575 aa24.01■■□□□ 1.43
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LHX1-204ENST00000619939 ABCC2Q92887 1545 aa23.91■■□□□ 1.42
LHX1-204ENST00000619939 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa23.89■■□□□ 1.41
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LHX1-204ENST00000619939 UACAQ9BZF9 1416 aa23.88■■□□□ 1.41
LHX1-204ENST00000619939 PLB1Q6P1J6 1458 aa23.88■■□□□ 1.41
LHX1-204ENST00000619939 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP23.87■■□□□ 1.41
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LHX1-204ENST00000619939 EFCAB5A4FU69 1503 aa23.84■■□□□ 1.41
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LHX1-204ENST00000619939 P3H3Q8IVL6 736 aa23.81■■□□□ 1.4
LHX1-204ENST00000619939 VPS8Q8N3P4 1428 aa23.8■■□□□ 1.4
LHX1-204ENST00000619939 GLI2P10070 1586 aa23.79■■□□□ 1.4
LHX1-204ENST00000619939 KDM6BO15054 1643 aa23.79■■□□□ 1.4
LHX1-204ENST00000619939 KDM5BQ9UGL1 1544 aa23.77■■□□□ 1.4
LHX1-204ENST00000619939 SAMD9Q5K651 1589 aa23.77■■□□□ 1.4
LHX1-204ENST00000619939 KIAA0556O60303 1618 aa23.76■■□□□ 1.39
LHX1-204ENST00000619939 TSPOAP1O95153 1857 aa23.75■■□□□ 1.39
LHX1-204ENST00000619939 FHOD3Q2V2M9 1422 aa23.75■■□□□ 1.39
LHX1-204ENST00000619939 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP23.66■■□□□ 1.38
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LHX1-204ENST00000619939 FMN1Q68DA7 1419 aa23.65■■□□□ 1.38
LHX1-204ENST00000619939 TEX14Q8IWB6 1497 aa23.64■■□□□ 1.38
LHX1-204ENST00000619939 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP23.64■■□□□ 1.38
LHX1-204ENST00000619939 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP23.6■■□□□ 1.37
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LHX1-204ENST00000619939 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP23.57■■□□□ 1.36
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LHX1-204ENST00000619939 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa23.48■■□□□ 1.35
LHX1-204ENST00000619939 CD109Q6YHK3 1445 aa23.47■■□□□ 1.35
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LHX1-204ENST00000619939 KCNH8Q96L42 1107 aa23.46■■□□□ 1.35
LHX1-204ENST00000619939 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP23.45■■□□□ 1.34
LHX1-204ENST00000619939 HECW1Q76N89 1606 aa23.43■■□□□ 1.34
LHX1-204ENST00000619939 TIAM1Q13009 1591 aa23.43■■□□□ 1.34
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LHX1-204ENST00000619939 ATP10BO94823 1461 aa23.38■■□□□ 1.33
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LHX1-204ENST00000619939 ADGRL1O94910 1474 aa23.35■■□□□ 1.33
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LHX1-204ENST00000619939 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP23.28■■□□□ 1.32
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LHX1-204ENST00000619939 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP23.27■■□□□ 1.32
LHX1-204ENST00000619939 PCGF6Q9BYE7 350 aa23.26■■□□□ 1.31
LHX1-204ENST00000619939 ABCA9Q8IUA7 1624 aa23.26■■□□□ 1.31
LHX1-204ENST00000619939 MTUS2Q5JR59 1369 aa23.26■■□□□ 1.31
LHX1-204ENST00000619939 NEO1Q92859 1461 aa23.22■■□□□ 1.31
LHX1-204ENST00000619939 PLEKHD1A6NEE1 506 aa23.22■■□□□ 1.31
LHX1-204ENST00000619939 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP23.21■■□□□ 1.31
LHX1-204ENST00000619939 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa23.19■■□□□ 1.3
LHX1-204ENST00000619939 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP23.13■■□□□ 1.29
LHX1-204ENST00000619939 NCOA2Q15596 1464 aa23.09■■□□□ 1.29
LHX1-204ENST00000619939 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP23.08■■□□□ 1.29
LHX1-204ENST00000619939 RAPGEF3O95398 923 aa23.07■■□□□ 1.28
LHX1-204ENST00000619939 CFAP74Q9C0B2 1584 aa23.05■■□□□ 1.28
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