RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000616237.1

LHX1-202, Transcript of LIM homeobox 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene LHX1, Length 1,364 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX1-202ENST00000616237 JPH4Q96JJ6 628 aa28.94■■■□□ 2.22
LHX1-202ENST00000616237 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa28.89■■■□□ 2.22
LHX1-202ENST00000616237 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP28.89■■■□□ 2.22
LHX1-202ENST00000616237 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa28.83■■■□□ 2.21
LHX1-202ENST00000616237 PRXQ9BXM0 1461 aa28.74■■■□□ 2.19
LHX1-202ENST00000616237 CHIC1Q5VXU3 224 aa28.72■■■□□ 2.19
LHX1-202ENST00000616237 IQGAP2Q13576 1575 aa28.69■■■□□ 2.18
LHX1-202ENST00000616237 CSRNP3Q8WYN3 585 aa28.65■■■□□ 2.18
LHX1-202ENST00000616237 EEA1Q15075 1411 aa28.59■■■□□ 2.17
LHX1-202ENST00000616237 TRHP20396 242 aaPredicted RBP28.57■■■□□ 2.16
LHX1-202ENST00000616237 DISP1Q96F81 1524 aa28.56■■■□□ 2.16
LHX1-202ENST00000616237 UGGT2Q9NYU1 1516 aa28.56■■■□□ 2.16
LHX1-202ENST00000616237 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa28.55■■■□□ 2.16
LHX1-202ENST00000616237 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP28.54■■■□□ 2.16
LHX1-202ENST00000616237 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa28.53■■■□□ 2.16
LHX1-202ENST00000616237 TNIKQ9UKE5 1360 aa28.51■■■□□ 2.15
LHX1-202ENST00000616237 PTPRGP23470 1445 aa28.51■■■□□ 2.15
LHX1-202ENST00000616237 ADCY10Q96PN6 1610 aa28.48■■■□□ 2.15
LHX1-202ENST00000616237 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP28.46■■■□□ 2.15
LHX1-202ENST00000616237 KIAA0556O60303 1618 aa28.44■■■□□ 2.14
LHX1-202ENST00000616237 KIF21BO75037 1637 aa28.34■■■□□ 2.13
LHX1-202ENST00000616237 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP28.33■■■□□ 2.13
LHX1-202ENST00000616237 GOLGA3Q08378 1498 aa28.33■■■□□ 2.13
LHX1-202ENST00000616237 UACAQ9BZF9 1416 aa28.32■■■□□ 2.12
LHX1-202ENST00000616237 MAPKBP1O60336 1514 aa28.3■■■□□ 2.12
LHX1-202ENST00000616237 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa28.29■■■□□ 2.12
LHX1-202ENST00000616237 ABCC2Q92887 1545 aa28.27■■■□□ 2.12
LHX1-202ENST00000616237 KIF13AQ9H1H9 1805 aa28.22■■■□□ 2.11
LHX1-202ENST00000616237 P3H3Q8IVL6 736 aa28.22■■■□□ 2.11
LHX1-202ENST00000616237 ABCC10Q5T3U5 1492 aa28.21■■■□□ 2.11
LHX1-202ENST00000616237 PLB1Q6P1J6 1458 aa28.21■■■□□ 2.11
LHX1-202ENST00000616237 SAMD9Q5K651 1589 aa28.21■■■□□ 2.11
LHX1-202ENST00000616237 EHMT2Q96KQ7 1210 aa28.2■■■□□ 2.1
LHX1-202ENST00000616237 KDM5BQ9UGL1 1544 aa28.17■■■□□ 2.1
LHX1-202ENST00000616237 ABCA8O94911 1581 aa28.16■■■□□ 2.1
LHX1-202ENST00000616237 DIP2BQ9P265 1576 aa28.16■■■□□ 2.1
LHX1-202ENST00000616237 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP28.15■■■□□ 2.1
LHX1-202ENST00000616237 FAM69CQ0P6D2 419 aa28.15■■■□□ 2.1
LHX1-202ENST00000616237 ASXL2Q76L83 1435 aa28.12■■■□□ 2.09
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LHX1-202ENST00000616237 FHOD3Q2V2M9 1422 aa28.06■■■□□ 2.08
LHX1-202ENST00000616237 EFCAB5A4FU69 1503 aa28.01■■■□□ 2.07
LHX1-202ENST00000616237 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP27.96■■■□□ 2.07
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LHX1-202ENST00000616237 ARID3CA6NKF2 412 aa27.95■■■□□ 2.06
LHX1-202ENST00000616237 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa27.95■■■□□ 2.06
LHX1-202ENST00000616237 WDR7Q9Y4E6 1490 aa27.94■■■□□ 2.06
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LHX1-202ENST00000616237 TEX14Q8IWB6 1497 aa27.66■■■□□ 2.02
LHX1-202ENST00000616237 CLIP1P30622 1438 aa27.66■■■□□ 2.02
LHX1-202ENST00000616237 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP27.65■■■□□ 2.02
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LHX1-202ENST00000616237 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa27.27■■□□□ 1.96
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LHX1-202ENST00000616237 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa27.2■■□□□ 1.94
LHX1-202ENST00000616237 RICTORQ6R327 1708 aa27.2■■□□□ 1.94
LHX1-202ENST00000616237 ADGRL1O94910 1474 aa27.19■■□□□ 1.94
LHX1-202ENST00000616237 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP27.19■■□□□ 1.94
LHX1-202ENST00000616237 VPS8Q8N3P4 1428 aa27.18■■□□□ 1.94
LHX1-202ENST00000616237 ARHGAP5Q13017 1502 aa27.17■■□□□ 1.94
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