RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000615959.1

MIR3648-1-201, Transcript of microRNA 3648-1, humanhuman

BASIC

Gene MIR3648-1, Length 180 nt, Biotype miRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MIR3648-1-201ENST00000615959 CUL7Q14999 1698 aa44.39■■■■■ 4.7
MIR3648-1-201ENST00000615959 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa44.37■■■■■ 4.69
MIR3648-1-201ENST00000615959 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa44.26■■■■■ 4.68
MIR3648-1-201ENST00000615959 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa44.24■■■■■ 4.67
MIR3648-1-201ENST00000615959 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa43.88■■■■■ 4.61
MIR3648-1-201ENST00000615959 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP43.85■■■■■ 4.61
MIR3648-1-201ENST00000615959 IQGAP2Q13576 1575 aa43.84■■■■■ 4.61
MIR3648-1-201ENST00000615959 ADCY10Q96PN6 1610 aa43.82■■■■■ 4.61
MIR3648-1-201ENST00000615959 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa43.79■■■■■ 4.6
MIR3648-1-201ENST00000615959 PTPRGP23470 1445 aa43.78■■■■■ 4.6
MIR3648-1-201ENST00000615959 KIF13AQ9H1H9 1805 aa43.74■■■■■ 4.59
MIR3648-1-201ENST00000615959 TNIKQ9UKE5 1360 aa43.72■■■■■ 4.59
MIR3648-1-201ENST00000615959 MAPKBP1O60336 1514 aa43.7■■■■■ 4.59
MIR3648-1-201ENST00000615959 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP43.67■■■■■ 4.58
MIR3648-1-201ENST00000615959 ABCC10Q5T3U5 1492 aa43.64■■■■■ 4.58
MIR3648-1-201ENST00000615959 DISP1Q96F81 1524 aa43.63■■■■■ 4.58
MIR3648-1-201ENST00000615959 FAM69CQ0P6D2 419 aa43.61■■■■■ 4.57
MIR3648-1-201ENST00000615959 UGGT2Q9NYU1 1516 aa43.6■■■■■ 4.57
MIR3648-1-201ENST00000615959 PRXQ9BXM0 1461 aa43.52■■■■■ 4.56
MIR3648-1-201ENST00000615959 DIP2BQ9P265 1576 aa43.5■■■■■ 4.55
MIR3648-1-201ENST00000615959 ABCC2Q92887 1545 aa43.48■■■■■ 4.55
MIR3648-1-201ENST00000615959 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa43.46■■■■■ 4.55
MIR3648-1-201ENST00000615959 UACAQ9BZF9 1416 aa43.45■■■■■ 4.55
MIR3648-1-201ENST00000615959 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa43.45■■■■■ 4.55
MIR3648-1-201ENST00000615959 KIAA0556O60303 1618 aa43.43■■■■■ 4.54
MIR3648-1-201ENST00000615959 CSRNP3Q8WYN3 585 aa43.32■■■■■ 4.53
MIR3648-1-201ENST00000615959 ASXL2Q76L83 1435 aa43.29■■■■■ 4.52
MIR3648-1-201ENST00000615959 GOLGA3Q08378 1498 aa43.28■■■■■ 4.52
MIR3648-1-201ENST00000615959 PLB1Q6P1J6 1458 aa43.27■■■■■ 4.52
MIR3648-1-201ENST00000615959 KDM5BQ9UGL1 1544 aa43.25■■■■■ 4.51
MIR3648-1-201ENST00000615959 TSPOAP1O95153 1857 aa43.2■■■■■ 4.51
MIR3648-1-201ENST00000615959 EEA1Q15075 1411 aa43.16■■■■■ 4.5
MIR3648-1-201ENST00000615959 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP43.13■■■■■ 4.49
MIR3648-1-201ENST00000615959 GLI2P10070 1586 aa43.12■■■■■ 4.49
MIR3648-1-201ENST00000615959 ABCA8O94911 1581 aa43.03■■■■■ 4.48
MIR3648-1-201ENST00000615959 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP43.03■■■■■ 4.48
MIR3648-1-201ENST00000615959 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP43.02■■■■■ 4.48
MIR3648-1-201ENST00000615959 KDM6BO15054 1643 aa43.02■■■■■ 4.48
MIR3648-1-201ENST00000615959 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP42.98■■■■■ 4.47
MIR3648-1-201ENST00000615959 P3H3Q8IVL6 736 aa42.97■■■■■ 4.47
MIR3648-1-201ENST00000615959 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP42.95■■■■■ 4.47
MIR3648-1-201ENST00000615959 WDR7Q9Y4E6 1490 aa42.92■■■■■ 4.46
MIR3648-1-201ENST00000615959 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa42.89■■■■■ 4.46
MIR3648-1-201ENST00000615959 SAMD9Q5K651 1589 aa42.87■■■■■ 4.45
MIR3648-1-201ENST00000615959 CHIC1Q5VXU3 224 aa42.84■■■■■ 4.45
MIR3648-1-201ENST00000615959 KIF21BO75037 1637 aa42.77■■■■■ 4.44
MIR3648-1-201ENST00000615959 TEX14Q8IWB6 1497 aa42.75■■■■■ 4.43
MIR3648-1-201ENST00000615959 KCNH8Q96L42 1107 aa42.75■■■■■ 4.43
MIR3648-1-201ENST00000615959 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP42.73■■■■■ 4.43
MIR3648-1-201ENST00000615959 ATP10BO94823 1461 aa42.71■■■■■ 4.43
MIR3648-1-201ENST00000615959 ARID3CA6NKF2 412 aa42.7■■■■■ 4.43
MIR3648-1-201ENST00000615959 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP42.66■■■■■ 4.42
MIR3648-1-201ENST00000615959 CD109Q6YHK3 1445 aa42.64■■■■■ 4.42
MIR3648-1-201ENST00000615959 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa42.64■■■■■ 4.42
MIR3648-1-201ENST00000615959 CFAP43Q8NDM7 1665 aa42.63■■■■■ 4.41
MIR3648-1-201ENST00000615959 FHOD3Q2V2M9 1422 aa42.61■■■■■ 4.41
MIR3648-1-201ENST00000615959 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa42.58■■■■■ 4.41
MIR3648-1-201ENST00000615959 EFCAB5A4FU69 1503 aa42.52■■■■■ 4.4
MIR3648-1-201ENST00000615959 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa42.5■■■■■ 4.39
MIR3648-1-201ENST00000615959 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP42.49■■■■■ 4.39
MIR3648-1-201ENST00000615959 UBTFP17480 764 aaKnown RBP42.49■■■■■ 4.39
MIR3648-1-201ENST00000615959 EHMT2Q96KQ7 1210 aa42.49■■■■■ 4.39
MIR3648-1-201ENST00000615959 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP42.47■■■■■ 4.39
MIR3648-1-201ENST00000615959 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP42.47■■■■■ 4.39
MIR3648-1-201ENST00000615959 ABCA9Q8IUA7 1624 aa42.38■■■■■ 4.37
MIR3648-1-201ENST00000615959 PLEKHD1A6NEE1 506 aa42.28■■■■■ 4.36
MIR3648-1-201ENST00000615959 ARAP3Q8WWN8 1544 aa42.25■■■■■ 4.35
MIR3648-1-201ENST00000615959 PHLDB1Q86UU1 1377 aa42.23■■■■■ 4.35
MIR3648-1-201ENST00000615959 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa42.22■■■■■ 4.35
MIR3648-1-201ENST00000615959 ADGRL1O94910 1474 aa42.19■■■■■ 4.34
MIR3648-1-201ENST00000615959 FMN1Q68DA7 1419 aa42.17■■■■■ 4.34
MIR3648-1-201ENST00000615959 NEO1Q92859 1461 aa42.14■■■■■ 4.34
MIR3648-1-201ENST00000615959 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP42.1■■■■■ 4.33
MIR3648-1-201ENST00000615959 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP42.06■■■■■ 4.32
MIR3648-1-201ENST00000615959 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP42.05■■■■■ 4.32
MIR3648-1-201ENST00000615959 RAPGEF3O95398 923 aa42.03■■■■■ 4.32
MIR3648-1-201ENST00000615959 HECW1Q76N89 1606 aa42.02■■■■■ 4.32
MIR3648-1-201ENST00000615959 TTC37Q6PGP7 1564 aa41.95■■■■■ 4.31
MIR3648-1-201ENST00000615959 FANCAO15360 1455 aa41.92■■■■■ 4.3
MIR3648-1-201ENST00000615959 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP41.91■■■■■ 4.3
MIR3648-1-201ENST00000615959 AKNAQ7Z591 1439 aa41.91■■■■■ 4.3
MIR3648-1-201ENST00000615959 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa41.88■■■■■ 4.29
MIR3648-1-201ENST00000615959 CFAP74Q9C0B2 1584 aa41.87■■■■■ 4.29
MIR3648-1-201ENST00000615959 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP41.84■■■■■ 4.29
MIR3648-1-201ENST00000615959 PLCH2O75038 1416 aa41.81■■■■■ 4.28
MIR3648-1-201ENST00000615959 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa41.79■■■■■ 4.28
MIR3648-1-201ENST00000615959 RICTORQ6R327 1708 aa41.78■■■■■ 4.28
MIR3648-1-201ENST00000615959 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP41.76■■■■■ 4.28
MIR3648-1-201ENST00000615959 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa41.76■■■■■ 4.28
MIR3648-1-201ENST00000615959 KIF14Q15058 1648 aa41.71■■■■■ 4.27
MIR3648-1-201ENST00000615959 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP41.7■■■■■ 4.27
MIR3648-1-201ENST00000615959 CLIP1P30622 1438 aa41.69■■■■■ 4.26
MIR3648-1-201ENST00000615959 MYO5CQ9NQX4 1742 aa41.68■■■■■ 4.26
MIR3648-1-201ENST00000615959 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa41.66■■■■■ 4.26
MIR3648-1-201ENST00000615959 CCDC18Q5T9S5 1454 aa41.66■■■■■ 4.26
MIR3648-1-201ENST00000615959 SCAPERQ9BY12 1400 aa41.63■■■■■ 4.26
MIR3648-1-201ENST00000615959 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa41.63■■■■■ 4.25
MIR3648-1-201ENST00000615959 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa41.62■■■■■ 4.25
MIR3648-1-201ENST00000615959 ADAMTSL3P82987 1691 aa41.6■■■■■ 4.25
MIR3648-1-201ENST00000615959 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP41.6■■■■■ 4.25
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 14.1 ms