RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000615505.4

SURF1-205, Transcript of SURF1, cytochrome c oxidase assembly factor, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SURF1, Length 991 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SURF1-205ENST00000615505 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa42.58■■■■■ 4.41
SURF1-205ENST00000615505 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa42.57■■■■■ 4.41
SURF1-205ENST00000615505 CHIC1Q5VXU3 224 aa42.56■■■■■ 4.4
SURF1-205ENST00000615505 ERCC6L2Q5T890 1561 aa42.49■■■■■ 4.39
SURF1-205ENST00000615505 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP42.49■■■■■ 4.39
SURF1-205ENST00000615505 EEA1Q15075 1411 aa42.41■■■■■ 4.38
SURF1-205ENST00000615505 CSRNP3Q8WYN3 585 aa42.4■■■■■ 4.38
SURF1-205ENST00000615505 PRXQ9BXM0 1461 aa42.38■■■■■ 4.38
SURF1-205ENST00000615505 IQGAP2Q13576 1575 aa42.3■■■■■ 4.36
SURF1-205ENST00000615505 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP42.24■■■■■ 4.35
SURF1-205ENST00000615505 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa42.17■■■■■ 4.34
SURF1-205ENST00000615505 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa42.09■■■■■ 4.33
SURF1-205ENST00000615505 UGGT2Q9NYU1 1516 aa42.07■■■■■ 4.33
SURF1-205ENST00000615505 TNIKQ9UKE5 1360 aa42.01■■■■■ 4.32
SURF1-205ENST00000615505 PTPRGP23470 1445 aa42.01■■■■■ 4.32
SURF1-205ENST00000615505 DISP1Q96F81 1524 aa42■■■■■ 4.31
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SURF1-205ENST00000615505 KIAA0556O60303 1618 aa41.87■■■■■ 4.29
SURF1-205ENST00000615505 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP41.85■■■■■ 4.29
SURF1-205ENST00000615505 ADCY10Q96PN6 1610 aa41.79■■■■■ 4.28
SURF1-205ENST00000615505 UACAQ9BZF9 1416 aa41.7■■■■■ 4.27
SURF1-205ENST00000615505 EHMT2Q96KQ7 1210 aa41.69■■■■■ 4.26
SURF1-205ENST00000615505 UBTFP17480 764 aaKnown RBP41.68■■■■■ 4.26
SURF1-205ENST00000615505 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa41.65■■■■■ 4.26
SURF1-205ENST00000615505 P3H3Q8IVL6 736 aa41.62■■■■■ 4.25
SURF1-205ENST00000615505 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP41.61■■■■■ 4.25
SURF1-205ENST00000615505 ABCC2Q92887 1545 aa41.59■■■■■ 4.25
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SURF1-205ENST00000615505 SAMD9Q5K651 1589 aa41.56■■■■■ 4.24
SURF1-205ENST00000615505 PLB1Q6P1J6 1458 aa41.5■■■■■ 4.23
SURF1-205ENST00000615505 KDM5BQ9UGL1 1544 aa41.44■■■■■ 4.23
SURF1-205ENST00000615505 ABCA8O94911 1581 aa41.43■■■■■ 4.22
SURF1-205ENST00000615505 ABCC10Q5T3U5 1492 aa41.41■■■■■ 4.22
SURF1-205ENST00000615505 EFCAB5A4FU69 1503 aa41.41■■■■■ 4.22
SURF1-205ENST00000615505 FAM69CQ0P6D2 419 aa41.39■■■■■ 4.22
SURF1-205ENST00000615505 FHOD3Q2V2M9 1422 aa41.36■■■■■ 4.21
SURF1-205ENST00000615505 ASXL2Q76L83 1435 aa41.35■■■■■ 4.21
SURF1-205ENST00000615505 KIF13AQ9H1H9 1805 aa41.33■■■■■ 4.21
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SURF1-205ENST00000615505 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa41.18■■■■■ 4.18
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SURF1-205ENST00000615505 WDR7Q9Y4E6 1490 aa41.12■■■■■ 4.17
SURF1-205ENST00000615505 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP41.09■■■■■ 4.17
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SURF1-205ENST00000615505 FMN1Q68DA7 1419 aa41.08■■■■■ 4.17
SURF1-205ENST00000615505 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP41.06■■■■■ 4.16
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SURF1-205ENST00000615505 TSPOAP1O95153 1857 aa40.95■■■■■ 4.15
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SURF1-205ENST00000615505 CD109Q6YHK3 1445 aa40.78■■■■■ 4.12
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SURF1-205ENST00000615505 CFAP43Q8NDM7 1665 aa40.76■■■■■ 4.12
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SURF1-205ENST00000615505 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP40.11■■■■■ 4.01
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SURF1-205ENST00000615505 SCAPERQ9BY12 1400 aa40.03■■■■■ 4
SURF1-205ENST00000615505 PREX2Q70Z35 1606 aa40.01■■■■■ 4
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