RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000613876.1

CCL23-202, Transcript of C-C motif chemokine ligand 23, humanhuman

TSL 3

Gene CCL23, Length 402 nt, Biotype nonsense mediated decay.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL23-202ENST00000613876 GRIN2AQ12879 1464 aa8.41□□□□□ -1.06
CCL23-202ENST00000613876 FBLN2P98095 1184 aa8.41□□□□□ -1.06
CCL23-202ENST00000613876 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa8.4□□□□□ -1.06
CCL23-202ENST00000613876 ARAP1Q96P48 1450 aa8.38□□□□□ -1.07
CCL23-202ENST00000613876 P3H3Q8IVL6 736 aa8.38□□□□□ -1.07
CCL23-202ENST00000613876 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa8.38□□□□□ -1.07
CCL23-202ENST00000613876 NUP160Q12769 1436 aa8.37□□□□□ -1.07
CCL23-202ENST00000613876 VPS8Q8N3P4 1428 aa8.37□□□□□ -1.07
CCL23-202ENST00000613876 IQGAP2Q13576 1575 aa8.36□□□□□ -1.07
CCL23-202ENST00000613876 CEP170Q5SW79 1584 aa8.35□□□□□ -1.07
CCL23-202ENST00000613876 EFCAB5A4FU69 1503 aa8.34□□□□□ -1.07
CCL23-202ENST00000613876 CHD1O14646 1710 aa8.34□□□□□ -1.07
CCL23-202ENST00000613876 UGGT2Q9NYU1 1516 aa8.34□□□□□ -1.08
CCL23-202ENST00000613876 FHOD3Q2V2M9 1422 aa8.33□□□□□ -1.08
CCL23-202ENST00000613876 SAMD9Q5K651 1589 aa8.33□□□□□ -1.08
CCL23-202ENST00000613876 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP8.33□□□□□ -1.08
CCL23-202ENST00000613876 JPH4Q96JJ6 628 aa8.33□□□□□ -1.08
CCL23-202ENST00000613876 APLP2Q06481 763 aa8.31□□□□□ -1.08
CCL23-202ENST00000613876 DISP1Q96F81 1524 aa8.29□□□□□ -1.08
CCL23-202ENST00000613876 FMN1Q68DA7 1419 aa8.29□□□□□ -1.08
CCL23-202ENST00000613876 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP8.28□□□□□ -1.08
CCL23-202ENST00000613876 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP8.27□□□□□ -1.09
CCL23-202ENST00000613876 KIAA0556O60303 1618 aa8.27□□□□□ -1.09
CCL23-202ENST00000613876 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa8.27□□□□□ -1.09
CCL23-202ENST00000613876 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa8.27□□□□□ -1.09
CCL23-202ENST00000613876 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP8.26□□□□□ -1.09
CCL23-202ENST00000613876 OSCARQ8IYS5 282 aa8.26□□□□□ -1.09
CCL23-202ENST00000613876 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP8.26□□□□□ -1.09
CCL23-202ENST00000613876 CLASP1Q7Z460 1538 aa8.25□□□□□ -1.09
CCL23-202ENST00000613876 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP8.25□□□□□ -1.09
CCL23-202ENST00000613876 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP8.25□□□□□ -1.09
CCL23-202ENST00000613876 MAP3K1Q13233 1512 aa8.24□□□□□ -1.09
CCL23-202ENST00000613876 PCGF6Q9BYE7 350 aa8.24□□□□□ -1.09
CCL23-202ENST00000613876 SHROOM2Q13796 1616 aa8.24□□□□□ -1.09
CCL23-202ENST00000613876 FYCO1Q9BQS8 1478 aa8.24□□□□□ -1.09
CCL23-202ENST00000613876 TIAM1Q13009 1591 aa8.22□□□□□ -1.09
CCL23-202ENST00000613876 PTPRGP23470 1445 aa8.2□□□□□ -1.1
CCL23-202ENST00000613876 ERCC6L2Q5T890 1561 aa8.2□□□□□ -1.1
CCL23-202ENST00000613876 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa8.2□□□□□ -1.1
CCL23-202ENST00000613876 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa8.19□□□□□ -1.1
CCL23-202ENST00000613876 HECW1Q76N89 1606 aa8.19□□□□□ -1.1
CCL23-202ENST00000613876 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa8.19□□□□□ -1.1
CCL23-202ENST00000613876 CFAP43Q8NDM7 1665 aa8.19□□□□□ -1.1
CCL23-202ENST00000613876 PLB1Q6P1J6 1458 aa8.19□□□□□ -1.1
CCL23-202ENST00000613876 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP8.19□□□□□ -1.1
CCL23-202ENST00000613876 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP8.18□□□□□ -1.1
CCL23-202ENST00000613876 CCDC18Q5T9S5 1454 aa8.18□□□□□ -1.1
CCL23-202ENST00000613876 ARID3CA6NKF2 412 aa8.17□□□□□ -1.1
CCL23-202ENST00000613876 ABCA8O94911 1581 aa8.17□□□□□ -1.1
CCL23-202ENST00000613876 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP8.15□□□□□ -1.1
CCL23-202ENST00000613876 UACAQ9BZF9 1416 aa8.15□□□□□ -1.1
CCL23-202ENST00000613876 MTUS2Q5JR59 1369 aa8.15□□□□□ -1.1
CCL23-202ENST00000613876 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP8.15□□□□□ -1.1
CCL23-202ENST00000613876 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP8.15□□□□□ -1.1
CCL23-202ENST00000613876 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP8.14□□□□□ -1.11
CCL23-202ENST00000613876 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa8.13□□□□□ -1.11
CCL23-202ENST00000613876 ATP10BO94823 1461 aa8.13□□□□□ -1.11
CCL23-202ENST00000613876 PHLDB1Q86UU1 1377 aa8.12□□□□□ -1.11
CCL23-202ENST00000613876 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa8.12□□□□□ -1.11
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CCL23-202ENST00000613876 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP8.12□□□□□ -1.11
CCL23-202ENST00000613876 PLEKHD1A6NEE1 506 aa8.11□□□□□ -1.11
CCL23-202ENST00000613876 ABCC2Q92887 1545 aa8.11□□□□□ -1.11
CCL23-202ENST00000613876 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP8.1□□□□□ -1.11
CCL23-202ENST00000613876 NCOA2Q15596 1464 aa8.1□□□□□ -1.11
CCL23-202ENST00000613876 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP8.1□□□□□ -1.11
CCL23-202ENST00000613876 CCNB3Q8WWL7 1395 aa8.1□□□□□ -1.11
CCL23-202ENST00000613876 ARHGEF11O15085 1522 aa8.09□□□□□ -1.11
CCL23-202ENST00000613876 MYOM3Q5VTT5 1437 aa8.07□□□□□ -1.12
CCL23-202ENST00000613876 KDM5BQ9UGL1 1544 aa8.07□□□□□ -1.12
CCL23-202ENST00000613876 FGD6Q6ZV73 1430 aa8.06□□□□□ -1.12
CCL23-202ENST00000613876 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP8.06□□□□□ -1.12
CCL23-202ENST00000613876 ADCY10Q96PN6 1610 aa8.06□□□□□ -1.12
CCL23-202ENST00000613876 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP8.06□□□□□ -1.12
CCL23-202ENST00000613876 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP8.05□□□□□ -1.12
CCL23-202ENST00000613876 KIF14Q15058 1648 aa8.04□□□□□ -1.12
CCL23-202ENST00000613876 KCNH8Q96L42 1107 aa8.04□□□□□ -1.12
CCL23-202ENST00000613876 MIA2Q96PC5 1412 aa8.03□□□□□ -1.12
CCL23-202ENST00000613876 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa8.03□□□□□ -1.12
CCL23-202ENST00000613876 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa8.03□□□□□ -1.12
CCL23-202ENST00000613876 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa8.03□□□□□ -1.12
CCL23-202ENST00000613876 ABCC10Q5T3U5 1492 aa8.03□□□□□ -1.12
CCL23-202ENST00000613876 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP8.03□□□□□ -1.12
CCL23-202ENST00000613876 ITGAEP38570 1179 aa8.03□□□□□ -1.12
CCL23-202ENST00000613876 CYB5RLQ6IPT4 315 aa8.03□□□□□ -1.12
CCL23-202ENST00000613876 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP8.03□□□□□ -1.12
CCL23-202ENST00000613876 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP8.02□□□□□ -1.13
CCL23-202ENST00000613876 PTPN23Q9H3S7 1636 aa8.02□□□□□ -1.13
CCL23-202ENST00000613876 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP8.01□□□□□ -1.13
CCL23-202ENST00000613876 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP8.01□□□□□ -1.13
CCL23-202ENST00000613876 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP8□□□□□ -1.13
CCL23-202ENST00000613876 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa8□□□□□ -1.13
CCL23-202ENST00000613876 PTPRKQ15262 1439 aa7.99□□□□□ -1.13
CCL23-202ENST00000613876 ASXL2Q76L83 1435 aa7.99□□□□□ -1.13
CCL23-202ENST00000613876 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP7.99□□□□□ -1.13
CCL23-202ENST00000613876 WDR7Q9Y4E6 1490 aa7.99□□□□□ -1.13
CCL23-202ENST00000613876 ITSN2Q9NZM3 1697 aa7.98□□□□□ -1.13
CCL23-202ENST00000613876 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa7.97□□□□□ -1.13
CCL23-202ENST00000613876 TTC37Q6PGP7 1564 aa7.97□□□□□ -1.13
CCL23-202ENST00000613876 PLCH2O75038 1416 aa7.96□□□□□ -1.13
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