RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000612413.4

ANAPC11-223, Transcript of anaphase promoting complex subunit 11, human

TSL 3 BASIC

Gene ANAPC11, Length 964 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ANAPC11-223	ENST00000612413	CYB5RL	Q6IPT4	315 aa		33.62	■■■□□ 2.97
ANAPC11-223	ENST00000612413	EEA1	Q15075	1411 aa		33.62	■■■□□ 2.97
ANAPC11-223	ENST00000612413	CHIC1	Q5VXU3	224 aa		33.59	■■■□□ 2.97
ANAPC11-223	ENST00000612413	JPH4	Q96JJ6	628 aa		33.59	■■■□□ 2.97
ANAPC11-223	ENST00000612413	PRX	Q9BXM0	1461 aa		33.56	■■■□□ 2.96
ANAPC11-223	ENST00000612413	ERCC6L2	Q5T890	1561 aa		33.55	■■■□□ 2.96
ANAPC11-223	ENST00000612413	PRG4	Q92954	1404 aa	Predicted RBP	33.54	■■■□□ 2.96
ANAPC11-223	ENST00000612413	IQGAP2	Q13576	1575 aa		33.46	■■■□□ 2.95
ANAPC11-223	ENST00000612413	CSRNP3	Q8WYN3	585 aa		33.45	■■■□□ 2.95
ANAPC11-223	ENST00000612413	UGGT2	Q9NYU1	1516 aa		33.32	■■■□□ 2.92
ANAPC11-223	ENST00000612413	CARMIL2	Q6F5E8	1435 aa		33.31	■■■□□ 2.92
ANAPC11-223	ENST00000612413	CTTNBP2	Q8WZ74	1663 aa		33.3	■■■□□ 2.92
ANAPC11-223	ENST00000612413	DISP1	Q96F81	1524 aa		33.22	■■■□□ 2.91
ANAPC11-223	ENST00000612413	KIF21B	O75037	1637 aa		33.21	■■■□□ 2.91
ANAPC11-223	ENST00000612413	TNIK	Q9UKE5	1360 aa		33.2	■■■□□ 2.9
ANAPC11-223	ENST00000612413	FAM9A	Q8IZU1	332 aa	Predicted RBP	33.17	■■■□□ 2.9
ANAPC11-223	ENST00000612413	PTPRG	P23470	1445 aa		33.15	■■■□□ 2.9
ANAPC11-223	ENST00000612413	KIAA0556	O60303	1618 aa		33.14	■■■□□ 2.9
ANAPC11-223	ENST00000612413	GOLGA3	Q08378	1498 aa		33.13	■■■□□ 2.89
ANAPC11-223	ENST00000612413	ADCY10	Q96PN6	1610 aa		33.04	■■■□□ 2.88
ANAPC11-223	ENST00000612413	UHRF1BP1L	A0JNW5	1464 aa		32.99	■■■□□ 2.87
ANAPC11-223	ENST00000612413	UACA	Q9BZF9	1416 aa		32.95	■■■□□ 2.87
ANAPC11-223	ENST00000612413	SAMD9	Q5K651	1589 aa		32.93	■■■□□ 2.86
ANAPC11-223	ENST00000612413	NPM1	P06748	294 aa	Known RBP eCLIP	32.93	■■■□□ 2.86
ANAPC11-223	ENST00000612413	MAPKBP1	O60336	1514 aa		32.92	■■■□□ 2.86
ANAPC11-223	ENST00000612413	TRH	P20396	242 aa	Predicted RBP	32.91	■■■□□ 2.86
ANAPC11-223	ENST00000612413	ABCC2	Q92887	1545 aa		32.91	■■■□□ 2.86
ANAPC11-223	ENST00000612413	TTBK1	Q5TCY1	1321 aa	Predicted RBP	32.86	■■■□□ 2.85
ANAPC11-223	ENST00000612413	EFCAB5	A4FU69	1503 aa		32.82	■■■□□ 2.85
ANAPC11-223	ENST00000612413	UBTF	P17480	764 aa	Known RBP	32.8	■■■□□ 2.84
ANAPC11-223	ENST00000612413	KDM5B	Q9UGL1	1544 aa		32.8	■■■□□ 2.84
ANAPC11-223	ENST00000612413	ABCA8	O94911	1581 aa		32.79	■■■□□ 2.84
ANAPC11-223	ENST00000612413	PLB1	Q6P1J6	1458 aa		32.78	■■■□□ 2.84
ANAPC11-223	ENST00000612413	ABCC10	Q5T3U5	1492 aa		32.74	■■■□□ 2.83
ANAPC11-223	ENST00000612413	P3H3	Q8IVL6	736 aa		32.7	■■■□□ 2.83
ANAPC11-223	ENST00000612413	FHOD3	Q2V2M9	1422 aa		32.66	■■■□□ 2.82
ANAPC11-223	ENST00000612413	DIP2B	Q9P265	1576 aa		32.66	■■■□□ 2.82
ANAPC11-223	ENST00000612413	ZCCHC11	Q5TAX3	1644 aa	Known RBP	32.66	■■■□□ 2.82
ANAPC11-223	ENST00000612413	ASXL2	Q76L83	1435 aa		32.65	■■■□□ 2.82
ANAPC11-223	ENST00000612413	KIF13A	Q9H1H9	1805 aa		32.65	■■■□□ 2.82
ANAPC11-223	ENST00000612413	EHMT2	Q96KQ7	1210 aa		32.64	■■■□□ 2.82
ANAPC11-223	ENST00000612413	RANGAP1	P46060	587 aa	Predicted RBP	32.62	■■■□□ 2.81
ANAPC11-223	ENST00000612413	RAPGEF6	Q8TEU7	1601 aa		32.59	■■■□□ 2.81
ANAPC11-223	ENST00000612413	ARHGAP35	Q9NRY4	1499 aa		32.57	■■■□□ 2.8
ANAPC11-223	ENST00000612413	FAM69C	Q0P6D2	419 aa		32.57	■■■□□ 2.8
ANAPC11-223	ENST00000612413	GLI2	P10070	1586 aa		32.53	■■■□□ 2.8
ANAPC11-223	ENST00000612413	WDR7	Q9Y4E6	1490 aa		32.52	■■■□□ 2.8
ANAPC11-223	ENST00000612413	FMN1	Q68DA7	1419 aa		32.51	■■■□□ 2.79
ANAPC11-223	ENST00000612413	ATP10B	O94823	1461 aa		32.48	■■■□□ 2.79
ANAPC11-223	ENST00000612413	NUP153	P49790	1475 aa	Known RBP	32.48	■■■□□ 2.79
ANAPC11-223	ENST00000612413	EPRS	P07814	1512 aa	Known RBP	32.48	■■■□□ 2.79
ANAPC11-223	ENST00000612413	CLIP1	P30622	1438 aa		32.37	■■■□□ 2.77
ANAPC11-223	ENST00000612413	MAP3K4	Q9Y6R4	1608 aa		32.33	■■■□□ 2.77
ANAPC11-223	ENST00000612413	HECW1	Q76N89	1606 aa		32.32	■■■□□ 2.76
ANAPC11-223	ENST00000612413	ARID3C	A6NKF2	412 aa		32.31	■■■□□ 2.76
ANAPC11-223	ENST00000612413	PPRC1	Q5VV67	1664 aa	Known RBP	32.24	■■■□□ 2.75
ANAPC11-223	ENST00000612413	CFAP43	Q8NDM7	1665 aa		32.24	■■■□□ 2.75
ANAPC11-223	ENST00000612413	HNRNPUL2-BSCL2	H3BQZ7	746 aa	Predicted RBP	32.24	■■■□□ 2.75
ANAPC11-223	ENST00000612413	HNRNPUL2	Q1KMD3	747 aa	Known RBP	32.24	■■■□□ 2.75
ANAPC11-223	ENST00000612413	TEX14	Q8IWB6	1497 aa		32.23	■■■□□ 2.75
ANAPC11-223	ENST00000612413	TSPOAP1	O95153	1857 aa		32.23	■■■□□ 2.75
ANAPC11-223	ENST00000612413	CASKIN1	Q8WXD9	1431 aa		32.23	■■■□□ 2.75
ANAPC11-223	ENST00000612413	CEP162	Q5TB80	1403 aa		32.21	■■■□□ 2.75
ANAPC11-223	ENST00000612413	KCNH8	Q96L42	1107 aa		32.21	■■■□□ 2.75
ANAPC11-223	ENST00000612413	PLEKHD1	A6NEE1	506 aa		32.19	■■■□□ 2.74
ANAPC11-223	ENST00000612413	MAGI3	Q5TCQ9	1506 aa		32.19	■■■□□ 2.74
ANAPC11-223	ENST00000612413	CD109	Q6YHK3	1445 aa		32.18	■■■□□ 2.74
ANAPC11-223	ENST00000612413	CDK13	Q14004	1512 aa	Known RBP	32.18	■■■□□ 2.74
ANAPC11-223	ENST00000612413	ABCA9	Q8IUA7	1624 aa		32.18	■■■□□ 2.74
ANAPC11-223	ENST00000612413	FYCO1	Q9BQS8	1478 aa		32.16	■■■□□ 2.74
ANAPC11-223	ENST00000612413	PCF11	O94913	1555 aa	Known RBP	32.16	■■■□□ 2.74
ANAPC11-223	ENST00000612413	CCDC18	Q5T9S5	1454 aa		32.13	■■■□□ 2.73
ANAPC11-223	ENST00000612413	KDM6B	O15054	1643 aa		32.11	■■■□□ 2.73
ANAPC11-223	ENST00000612413	CDK11A	Q9UQ88	783 aa	Predicted RBP	32.11	■■■□□ 2.73
ANAPC11-223	ENST00000612413	LOC105371045	A0A1W2PR82	267 aa		32.1	■■■□□ 2.73
ANAPC11-223	ENST00000612413	ATP1B4	Q9UN42	357 aa	Predicted RBP	32.1	■■■□□ 2.73
ANAPC11-223	ENST00000612413	LRRIQ1	Q96JM4	1722 aa		32.04	■■■□□ 2.72
ANAPC11-223	ENST00000612413	TRO	Q12816	1431 aa	Predicted RBP	32.01	■■■□□ 2.72
ANAPC11-223	ENST00000612413	PHLDB1	Q86UU1	1377 aa		32	■■■□□ 2.71
ANAPC11-223	ENST00000612413	GEMIN5	Q8TEQ6	1508 aa	Known RBP eCLIP	32	■■■□□ 2.71	2e-6	■■■■□ 20.7
ANAPC11-223	ENST00000612413	NEO1	Q92859	1461 aa		31.96	■■■□□ 2.71
ANAPC11-223	ENST00000612413	COL17A1	Q9UMD9	1497 aa	Predicted RBP	31.94	■■■□□ 2.7
ANAPC11-223	ENST00000612413	TTC37	Q6PGP7	1564 aa		31.94	■■■□□ 2.7
ANAPC11-223	ENST00000612413	KIF14	Q15058	1648 aa		31.93	■■■□□ 2.7
ANAPC11-223	ENST00000612413	ARAP3	Q8WWN8	1544 aa		31.92	■■■□□ 2.7
ANAPC11-223	ENST00000612413	VPS8	Q8N3P4	1428 aa		31.86	■■■□□ 2.69
ANAPC11-223	ENST00000612413	CFAP74	Q9C0B2	1584 aa		31.85	■■■□□ 2.69
ANAPC11-223	ENST00000612413	PLCH2	O75038	1416 aa		31.84	■■■□□ 2.69
ANAPC11-223	ENST00000612413	FANCA	O15360	1455 aa		31.83	■■■□□ 2.69
ANAPC11-223	ENST00000612413	MYO5C	Q9NQX4	1742 aa		31.78	■■■□□ 2.68
ANAPC11-223	ENST00000612413	AKNA	Q7Z591	1439 aa		31.75	■■■□□ 2.67
ANAPC11-223	ENST00000612413	MTUS2	Q5JR59	1369 aa		31.72	■■■□□ 2.67
ANAPC11-223	ENST00000612413	EHBP1L1	Q8N3D4	1523 aa		31.71	■■■□□ 2.67
ANAPC11-223	ENST00000612413	EFCAB2	Q5VUJ9	269 aa		31.69	■■■□□ 2.66
ANAPC11-223	ENST00000612413	DENND4B	O75064	1496 aa	Predicted RBP	31.68	■■■□□ 2.66
ANAPC11-223	ENST00000612413	MAP3K1	Q13233	1512 aa		31.67	■■■□□ 2.66
ANAPC11-223	ENST00000612413	PREX2	Q70Z35	1606 aa		31.67	■■■□□ 2.66
ANAPC11-223	ENST00000612413	ARHGAP5	Q13017	1502 aa		31.66	■■■□□ 2.66
ANAPC11-223	ENST00000612413	TIAM1	Q13009	1591 aa		31.66	■■■□□ 2.66
ANAPC11-223	ENST00000612413	ADGRL1	O94910	1474 aa		31.65	■■■□□ 2.66

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 63.6 ms